La Metodologia della ricerca: dalla stesura della tesi ...€¦ · Non è ammesso l’utilizzo di cellulari, smartwatch, e qualsasi altro dispositivo elettronico e non per alterare

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La Metodologia della ricerca: dalla stesura della

tesi alla pubblicazione di uno studio clinico

Nicola Lamberti, MSc, PhD

[email protected]

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Link utili

CV docente

http://docente.unife.it/nicola.lamberti

Scheda del corso e materiale didattico (slides)

http://www.unife.it/medicina/scienzemotorie/minisiti-LM/la-

metodologia-della-ricerca/folder_contents

Pubmed docente

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=nicola+lamberti+ferra

ra



http://www.unife.it/medicina/scienzemotorie/minisiti-LM/la-metodologia-della-ricerca/folder_contents









https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=nicola+lamberti+ferrara



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Lezioni

Venerdì 03 Marzo ore 14-18, aula F9

Venerdì 10 Marzo ore 14-18, aula


Mercoledì 22 Marzo ore 14-17, aula



Lunedì 29 Maggio ore 14-17

Frequenza obbligatoria

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Esame

31 domande a risposta multipla

(4 opzioni per ogni domanda)

UNA SOLA risposta corretta

Risposta esatta: +1 punto

Risposta errata: 0 punti

Risposta mancante: 0 punti

Tempo: 45 minuti

L’ultima lezione frontale verrà effettuata una simulazione di esame

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Esame

Non è ammesso l’utilizzo di cellulari, smartwatch, e qualsasi altro

dispositivo elettronico e non per alterare i risultati del compito.

Non si esce dall’aula a prova iniziata.

A chi viene a sorpreso a «barare» viene istantaneamente annullato il

compito (voto = 0) e si dovrà presentare all’appello successivo

Preappello: lunedì 29 Maggio ore 14.00, aula

Appelli ufficiali: Giugno

Luglio

Settembre

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Esame

Iscrizione online sul sito

Per preappello 29 Maggio:

Iscrizione alla prova parziale. I risultati saranno visibili entro

poche ore ma non si potrà accettare/rifiutare il voto

Chi volesse rifiutare il voto deve mandare una mail al docente entro

una settimana dalla pubblicazione degli esiti.

In caso di accettazione NON scrivere nulla.

I risultati del preappello (per chi accetta) saranno pubblicati online

alla data del primo appello ufficiale (X Giugno), e dovranno essere

ACCETTATI!!!

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Esame

Iscrizione online sul sito.

Appelli ufficiali:

Iscrizione alla prova ufficiale che prevede accettazione/rifiuto del

voto.

In entrambi i casi, chi non è iscritto all’esame, non potrà

sostenerlo!!!

Quindi, controllate sempre di esservi iscritti!!! La lista d’esame

chiude il giorno prima dell’appello.

Non saranno accettate iscrizioni via e-mail.

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Programma del corso

È un corso di «Metodologia»

Vi vuole fornire gli strumenti utili per poter scrivere un elaborato

finale (tesi) adeguato alle vostre competenze fino alla sua possibile

pubblicazione come articolo scientifico.

Partendo dalle basi della ricerca bibliografica, fino alla definizione

di un’ipotesi sperimentale, alla conduzione dell’esperimento, alla

raccolta, classificazione, analisi e discussione dei risultati ottenuti.

Faremo cenni di statistica molto semplici, e vedremo un buon

numero di modalità di analisi, per darvi gli strumenti per fare un

buon lavoro.

Ci sarà spazio per discutere i vostri elaborati.

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Pronti??

Ultima cosa prima di partire.

Se avete domande, non capite qualcosa, mi fermate subito perché

dobbiamo trovare il massimo della chiarezza.

Non abbiate timore a chiedere anche la stessa cosa 4 volte.

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Parte 1. L’introduzione alla ricerca

Perché la vostra tesi è così importante?

Perché mi devo impegnare per cercare di fare un buon lavoro?

Cosa può darmi la mia tesi nell’ambito del mondo del lavoro?

Fino dove posso arrivare con la mia tesi?

Che cosa mi aspetto da questo corso?

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Introduction

Methods

Results (along with figures and

tables)

Discussion

References

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Quindi: cosa cambia fra una tesi ed un lavoro scientifico?

L’obiettivo della mia tesi è di avvicinarla il più possibile alla

struttura di un articolo scientifico.

Ma come posso farlo??

Nelle prossime slides analizzeremo le diverse parti.

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Parte 1. Introduzione

Come posso creare una introduzione «solida» che contenga le

informazioni essenziali riguardanti il problema che sto trattando?

Utilizzando le banche dati disponibili di letteratura scientifica per

recuperare tutte le informazioni rilevanti ai fini del problema che

andrò a discutere.

Cos’è una banca dati? Quali conoscete?

Da 0 a 10 quanto direste di sapervi destreggiare all’interno di una

banca dati?

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Parte 1. Il problema

Si chiama Infobesity

ovvero

La moderna patologia della troppa informazione

Si stima che ogni anno si pubblichino circa 2.500.000 articoli in

circa 30.000 riviste scientifiche

Sono approssimativamente 6.800 articoli al giorno!

Ma tra questi documenti, quanti sono realmente validi?

Il problema è quello di trovare, in quest’oceano d’informazioni,

l’informazione realmente valida e che mi serve.

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Parte 1. E poi c’è il falso…

Il falso in rete è un pericolo oggettivo, anche nell’ambito

dell’editoria scientifica.

Sembra che un articolo scientifico completamente falso sia riuscito

a farsi beffe di ben 157 riviste ad accesso aperto!

Tra le 157 riviste ce n’erano anche alcune pubblicate da editori

commerciali come Elsevier, Sage e Kluwer, quindi il marchio di

grossi editori non è per forza garanzia di qualità!

(tutta questa vicenda si trova in: John Bohannon (2013). Who's

Afraid of Peer Review? Science. 342,6154, pp. 60-65 DOI:

10.1126/science.342.6154.60

http://science.sciencemag.org/content/342/6154/60.full )

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Parte 1. Esistono molto documenti

enciclopedie: se ho bisogno di un primo inquadramento del

problema o di un’informazione sintetica

libri: se ho bisogno di una visione d’insieme, di informazioni su un

argomento vasto o generale.

articoli di riviste: per argomenti molto specifici, approfondimenti,

notizie aggiornate…

linee guida: se cerco un insieme di raccomandazioni sistematiche

per l’impostazione di certi comportamenti

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Parte 1. Articoli scientifici

Sono quelli di maggiore interesse per noi

La letteratura scientifica che li contiene, si divide in due grandi box

Primaria: riporta i risultati di ricerche originali (articoli, studi

clinici, brevetti, tesi, atti di convegni….)

Secondaria: Riporta dati ed esperienze di lavori primari già

pubblicati (reviews, systematic reviews, libri…)

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Parte 1. Articoli scientifici

Ma come si arriva ad un articolo scientifico?

L’autore invia un articolo a una rivista perché sia pubblicato

L’ articolo viene esaminato da uno o più esperti (peer reviewer)

degli argomenti trattati nell’articolo

Il peer reviewer e l’autore dell’articolo non vengono in contatto e

non si conoscono (chi deve giudicare non deve essere influenzato

dal nome dell’autore e quest’ultimo non deve esercitare pressioni).

Gli esperti decidono se il lavoro è accettato per la pubblicazione,

accettato dopo opportune modifiche che l’autore deve fare, oppure

rifiutato.

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Parte 1. Articoli scientifici – come cercarli?

Prima di cercare bisogna individuare una banca dati.

Le banche dati contengono una marea di informazioni, e

rispondono a dei criteri di scelta universali:

Le banche dati:

- sono composti da tante unità chiamate records

- ogni record corrisponde a un riferimento bibliografico

- I records sono organizzati in campi

- Titolo articolo

- Autore

- Titolo rivista

- Etc… (volume, anno, pagine)

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Parte 1. Articoli scientifici – come cercarli?

I criteri di scelta:

• Parole chiave (keywords)

• Operatori booleani

• Uso delle parentesi ( )

• Caratteri jolly

• Tags (= indicatori di campo)

• Ricerca per frase (“”)

Ne conoscete qualcuno??

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Parte 1. Articoli scientifici – parole chiave

• attenzione a sceglierle bene per non perdere dei risultati

• descrivono con efficacia l’oggetto della ricerca

• ci permettono di accedere più facilmente alle informazioni

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Parte 1. Articoli scientifici – operatori booleiani

• dal matematico inglese George Boole – 1815/1864): definiscono

le relazioni logiche tra i termini della ricerca

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Parte 1. Articoli scientifici – parentesi

• Quando si devono combinare diversi termini tra loro, è possibile

utilizzare le parentesi per stabilire un ordine di priorità nella

lettura della stringa di ricerca: in assenza di parentesi, il sistema

legge sequenzialmente da sinistra a destra e l’operatore AND e

NOT hanno la priorità su OR. La parentesi tonda indica al

sistema di processare prima quella ricerca

• Per esempio hockey or baseball and sports injuries – scritto

senza parentesi- viene eseguito come se fosse così: hockey or

(baseball and sports injuries), mentre noi vogliamo:

• (hockey OR baseball) AND sports injuries

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Parte 1. Articoli scientifici – parentesi

(digestive system AND liver) NOT (biliary tract OR pancreas):

recupera i documenti che contengono contemporaneamente

digestive system e liver, ma non quelli che contengono o biliary

tract, o pancreas.

Senza parentesi, digestive system AND liver NOT biliary tract OR

pancreas i documenti recuperati avrebbero contenuto

contemporaneamente digestive system e liver, con l'esclusione di

quelli contenenti biliary tract, oppure avrebbero contenuto

pancreas: un termine non voluto (pancreas), senza l'uso di parentesi

sarebbe stato incluso nei risultati.

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Parte 1. Articoli scientifici – tags

Tags = indicatori di campo = indicano al sistema in che campo

cercare (alcuni es. tratti da pubmed)

[AU] autore

[TI] titolo dell’articolo

[LA] lingua

[PL] luogo di pubblicazione

[TA] titolo del periodico

[TIAB] Title/Abstract

[PT] tipo di pubblicazione

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Parte 1. Articoli scientifici – Carattery jolly

* zero o più caratteri: *carbon*

= carbon, hydrocarbon, polycarbonate

$ zero o un carattere: colo$r

= color, colour

? un solo carattere: wom?n, cat?

= woman, women

= cat, cats

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Parte 1. Articoli scientifici – Ricerca per frase

Urinary infections o “Urinary infections”?

Quality of life o “Quality of life”?

Attenzione ad usare questa funzione perché

“Urinary infections” potrebbe escludere i documenti che

contengono Urinary tract infections!

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Parte 1. Si ma dove cercare?

Ogni documento ha il suo strumento di ricerca

Libri, DVD Cataloghi di monografie e riviste cartacee

(Biblioteca UNIFE)

Articoli di periodici Banche dati

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Parte 1. La biblioteca UNIFE

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Parte 1. Le banche dati

Cosa sono le banche dati??

• I cataloghi tradizionali delle biblioteche non ci danno

la possibilità di verificare i contenuti dei fascicoli delle

riviste, ci dicono solo se quella rivista è posseduta o

meno dalla biblioteca

• le principali banche dati, perciò, indicizzano articoli di

periodici

• si usano per cercare articoli, abstract ed eventualmente

testi pieni

• permettono strategie di ricerca molto complesse e

raffinate

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La medicina basata sulle evidenze scientifiche, cioè sulle

prove scientifiche

Le azioni debbono

essere basate

sulle informazioni

Saper cercare

l’informazione

biomedica

Saper valutare

l’informazione

biomedica

Saper integrare

nella pratica clinica

l’informazione

biomedica

Assunto di base

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Parte 1. LA banca dati: pubmed

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

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Cos’è PubMed?

Banca dati che contiene milioni di documenti nel campo

delle scienze biomediche: consente l’interrogazione di

MEDLINE (la più grande banca dati medica del mondo

prodotta dalla National Library of Medicine (USA) e di

molti altri database specializzati. Viene aggiornata

giornalmente

Lamberti Nicola 45


Cos’è PubMed?

Contiene studi primari, cioè studi che rispondono a un

obiettivo specifico, eseguiti con una metodologia specifica

e con il reclutamento di un campione di popolazione da

studiare;

Contiene anche molti studi secondari come revisioni,

revisioni sistematiche, linee guida… (cioè studi EBM

tratti da riviste EBM come la Cochrane) (soprattutto

PubMed Health)

Gli articoli provengono da riviste peer-reviewed che

dovrebbero garantire informazione di qualità

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Ricerca per argomento

Ricerca libera: ricerca in tutti i campi.

Recupera tutti documenti indicizzati con il rischio di:

- ottenere un numero eccessivo di risultati non pertinenti,

in quanto i termini inseriti possono essere presenti in

qualsiasi campo del record (autore, indirizzo, abstract,

titolo della rivista)

- escludere documenti descritti con sinonimi del termine

ricercato, oppure escludere singolare/plurale

Ricerca con l’uso di vocabolari controllati come soggettari

e thesauri: ricerca in apposite liste di termini.

Recupera documenti indicizzati da umani.

Perché secondo voi??

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La ricerca libera, cercando vi aiuta

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Ma se voglio proprio farmi del male…

Io volevo cercare:

«esercizio preventivo e rischio cardiovascolare»

È la maniera migliore??

Nella ricerca libera bisogna individuare e cercare anche i

sinonimi o i termini correlati

Non fare stringhe lunghe, ma cercare ogni termine e unirlo

coi giusti operatori booleani tramite il Pubmed Search

Builder nella pagina della ricerca avanzata

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Forse non è la strada giusta. Ma perché?

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Guardiamo i search details…

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Proviamo con la ricerca avanzata (in alto sotto la stringa

per la ricerca libera c’è la scritta Advanced

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La advanced search

Per ogni termine potete scegliere la menù a

tendina che c’è a sinistra, sia l’operatore

booleiano da usare che anche il tipo di parola

che state usando…

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E come è andata??

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Parte 1. La ricerca mediante i termini MeSH

Il Medical Subject Headings è il thesaurus (vocabolario

controllato) di PUBMED

Ad ogni articolo, nel giro di alcuni mesi dalla

pubblicazione in Pubmed e dalla sua indicizzazione

automatizzata, vengono applicati i soggetti del thesaurus

curato dalla NLM. Quest’operazione è compiuta da

indicizzatori esperti.

https://www.nlm.nih.gov/mesh/meshhome.html

(pagina esplicativa sui MeSH terms)



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Perché funziona la ricerca MeSH?

La ricerca nel thesaurus non riporta una serie di articoli

ma di voci (descrittori)

Ogni voce presenta delle sottocategorie da usare per

restringere la ricerca

Aggiungiamo ogni voce -eventualmente con le

sottocategorie- al pubmed search builder

Possiamo decidere di restringere la ricerca ai records in

cui il termine è il focus (Restrict to MESH Major topic)

Troviamo elencati i sinonimi che sono stati compresi nella

ricerca e la struttura ad albero permette di vedere i termini

più ampi e più ristretti e fare una ricerca partendo anche

da questi termini

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PRO: i risultati sono pertinenti e non devo preoccuparmi

dei sinonimi. Poco o niente “rumore”

CONTRO: non si trovano gli articoli più recenti, non

ancora indicizzati.

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PRO: i risultati sono pertinenti e non devo preoccuparmi

dei sinonimi. Poco o niente “rumore”

CONTRO: non si trovano gli articoli più recenti, non

ancora indicizzati.

Ora andiamo a cercare i nostri stessi quattro termini di

prima con la ricerca MeSH:

- Cardiovascular

- Risk

- Exercise

- Prevention

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Descrittori: leggiamo la nota per scegliere il

termine più appropriato

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Sinonimi: tutti gli altri termini che si trovano in

documenti che trattano lo stesso argomento . Il termine

«cardiovascular system» è stato scelto dal Thesaurus

come preferito.

Categorie

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Parte 1. Il secondo metodo: PICO

P = problem, patient/ population

qual è il problema? il quesito riguarda chi?

I = intervention/treatment/exposure

che cosa è stato fatto o succede ai pazienti?

C = comparison

che cosa potrebbe essere fatto in alternativa?

O = outcome

come influisce l’intervento, che esito ha?

Proviamo a pensare a qualche esempio…

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Parte 1. Ricerca coi tags

Se inseriamo un tag nella query box indichiamo a

Pubmed in che campo cercare

[AU] autore

[TI] titolo dell’articolo

[LA] lingua

[PL] luogo di pubblicazione

[TA] titolo del periodico

[TIAB] Title/Abstract

[PT] tipo di pubblicazione

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Parte 1. Ricerca per autore

White J K

White[au]

White

White JK

J K White

Quali fra questi sono corretti??

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Parte 1. La visualizzazione dei risultati

Usiamo in maniera intelligente i filtri.

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Usiamo in maniera intelligente i filtri.

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Parte 1. Altre banche dati multidisciplinari

SCOPUS

Enorme banca dati multidisciplinare (scienze,

matematica, ingegneria, medicina, scienze sociali,

etc.) banca dati bibliografica e citazionale.

Indicizza le citazioni e le bibliografie degli articoli

creando una rete di collegamenti tra di essi

permette di calcolare l’impatto che ha o ha avuto un

certo autore, articolo o rivista sulla comunità

scientifica (indice bibliometrico: H-index, impact

factor)

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Indice di Hirsch

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Impact factor

È l’importanza che ha una determinata rivista

all’interno di una determinata disciplina.

È dato dal numero medio di citazioni che ogni suo

articolo fa nei due anni successivi la pubblicazione.

> Impact Factor =

>numero di citazioni =

>numero di letture di un determinato articolo

>importanza di quella rivista che lo ha pubblicato

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Parte 1. I risultati della mia ricerca

Dalla mia ricerca, posso avere diverse tipologie di

articoli che rispondono ai miei quesiti:

- Case Report

- Articoli originali

- Revisioni della letteratura

- Revisioni sistematiche della letteratura

Quante ne conoscete??

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Parte 1. Il case report

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Parte 1. L’articolo originale

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Parte 1. La revisione della letteratura

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Parte 1. La revisione sistematica della letteratura

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Parte 1. La Cochrane library

Negli anni 70, Archibald Cochrane, epidemiologo

inglese, sosteneva che i risultati della ricerca

avevano un impatto molto limitato sulla pratica

clinica

«è causa di grande preoccupazione constatare come

la professione medica non abbia saputo organizzare

un sistema in grado di rendere disponibili e

costantemente aggiornate, delle revisioni critiche

sugli effetti dell’assistenza sanitaria»

Cochrane, consapevole delle risorse economiche

limitate, suggeriva al paziente di rendere disponibili

a tutti gli interventi sanitari di efficacia provata

Fonte: www.gimbe.org, Dott.ssa M. Bozzolan

http://www.gimbe.org/

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Malgrado il fascino e la rapida popolarità delle sue

idee, i risvolti pratici del messaggio di Cochrane

sono stati ridotti:

- Perché la valutazione degli interventi sanitari può

contrastare precisi interessi economici

- Sia perché la realizzazione di revisioni

sistematiche esulano dal compito del medico



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La Cochrane library contiene il cochrane database of

systematic reviews;

È il database che contiene le revisioni sistematiche

(o i protocolli di revisione sistematica) preparate dai

revisori della cochrane collaboration (diversi gruppi

di interesse)

Gli abstract sono gratuiti

I full-text sono a pagamento



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Parte 1. Una revisione sistematica

Una revisione che si basa su una domanda

chiaramente formulata, che usa metodi sistematici

ed espliciti per identificare, selezionare e valutare

criticamente la ricerca rilevante, e per raccogliere ed

analizzare i dati degli studi che sono inclusi nella

revisione. Per analizzare e riassumere i risultati

possono o meno essere utilizzati metodi statistici

(meta-analisi)



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Parte 1. Una revisione Cochrane

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Parte 1. Un abstract Cochrane

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Parte 1. Dentro una systematic review

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Apriamo la Cochrane in questione

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Parte 1. Le revisioni NON sistematiche

Sono articoli che raccolgono la letteratura scientifica

disponibile senza fare una ricerca sistematica in tutte

le banche dati.

Sono molto utili per conoscere lo stato dell’arte di

un problema, ma spesso non portano ad evidenze

scientifiche schiaccianti

Di seguito un esempio

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Parte 1. Le revisioni NON sistematiche

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Prima del finale, vorrei sapere da voi i vantaggi e gli

svantaggi di una accurata (o poco accurata) ricerca

bibliografica

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VANTAGGI

Aggiornato sullo stato

della ricerca in quel

campo

Prestigiosi studi

internazionali

Qualcuno ha già o non ha

già dimostrato quello che

voglio fare io

SVANTAGGI

Tempo enorme (articoli

molto lunghi)

Spesso difficoltà a

raggiungere evidenze

concrete

Difficoltà con il

linguaggio scientifico

tecnico

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Take Home Message

- Una BUONA ricerca bibliografica, riduce di 2/3

il tempo impiegato per fare il «punto della

situazione»

- Senza conoscere lo stato dell’arte di un

problema, non so mai effettivamente dove mi

posiziono con le mie idee

- L’Università vi mette a disposizione un sacco di

strumenti per poter avere tutto ciò che vi serve

per fare un buon lavoro

- Gli articoli hanno strutture simili, ma bisogna

saperli leggere

Documents

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