Laboratoires de Reference - Sciensano · 2013-07-02 · Avant-propos Ce document, à caractère informatif, présente par germe, dans l’ordre alpha- bétique, une fiche d’identification

SERVICE PUBLIC FEDERAL SANTE PUBLIQUE, SECURITE DE LA CHAINE ALIMENTAIRE ET ENVIRONNEMENT FEDERALE OVERHEIDSDIENST VOLKSGEZONDHEID, VEILIGHEID VAN DE VOEDSELKETEN EN LEEFMILIEU INSTITUT SCIENTIFIQUE DE LA SANTE PUBLIQUE RUE JULIETTE WYTSMAN, 14 – 1050 BRUXELLES WETENSCHAPPELIJK INSTITUUT VOLKSGEZONDHEID JULIETTE WYTSMANSTRAAT, 14 – 1050 BRUSSEL

Laboratoires de Référence :

leur rôle dans le cadre du

Réseau des Laboratoires Vigies

G. DUCOFFRE Section Epidémiologie

Février 2007

IPH/ EPIREPORTS, N° 2007-003

G. Ducoffre Laboratoires de Référence : leur rôle dans le cadre du Réseau des Laboratoires Vigies Section Epidémiologie, Février 2007; Bruxelles (Belgique) Institut Scientifique de la Santé Publique, IPH/EPI REPORTS N° 2007-003 N° de Dépôt : D/2007/2505/04

Laboratoires de Référence: leur rôle dans le cadre du Réseau des Laboratoires

Vigies

Institut Scientifique de la Santé Publique Section Epidémiologie 14, Rue Juliette Wytsman 1050 Bruxelles Belgique Tel 32 2 642 57 77 Fax : 32 2 652 54 10 email : [email protected] http://www.iph.fgov.be/epidemio/labo

IPH/EPI REPORTS N° 2007 – 003

Avant-propos Ce document, à caractère informatif, présente par germe, dans l’ordre alpha-bétique, une fiche d’identification qui a été complétée par le laboratoire de réfé-rence correspondant. Les objectifs sont :

1) au niveau pratique : • décrire les modalités pratiques à respecter lors de l’envoi d’une souche

au laboratoire de référence, • préciser les analyses qui seront effectuées sur les souches envoyées, • préciser le délai pour recevoir le résultat des analyses demandées et/ou

réalisées, • décrire les activités réalisées au niveau des laboratoires de référence;

2) au niveau santé publique : • stimuler l’envoi de souches aux laboratoires de référence, • améliorer la collaboration entre les laboratoires vigies et les laboratoires

de référence, • améliorer la qualité épidémiologique des informations sur la surveillance

des maladies infectieuses à diffuser au niveau national et international.

RESISTANCE AUX AMINOGLYCOSIDES

Responsable : Nom : Dr VANHOOF R. Hôpital / Laboratoire : WIV-ISP – DO Maladies transmissibles et infectieuses Service Maladies bactériennes Adresse : Engelandstraat, 642 - 1180 Brussel Tél. : 02/373.32.61 Fax : 02/373.32.78 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : isolement milieu de transport à utiliser : gélose profonde milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : /

délai d’envoi maximum : /

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic typage étude de résistance autre : détermination de la CMI Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 2-4 jours

Description des activités du Laboratoire de Référence : Services envers les Laboratoires :

• Détermination fénotype de résistance par détermination MIC. • Détection d’un mécanisme de résistance AG, e.a. par PCR.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : /

Buts précis en terme de Recherche et Développement : /

ANAPLASMA PHAGOCYTOPHILUM

Responsable : Nom : Dr VANDENVELDE C. Hôpital / Laboratoire : Hôp. Militaire Reine Astrid Adresse : Rue Bruyn 2 – 1120 Bruxelles Tél. : 02/264.40.44 Fax : 02/264.40.48 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum/plasma/sang complet (EDTA) milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : + 4 °C délai d’envoi maximum : 2 (à 3) jours

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande sérologie n q PCR q n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 3 à 5 jours délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 7 à 10 jours


• Dépistage IFA pour Anaplasma phagocytophylum IgG et IgM. • Confirmation d’infection récente (pour traitement) avec PCR sur 10 ml sang EDTA.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Mettre sur carte les cas avec leur code postal • Garder un ‘clinical registry’ avec quelques données de laboratoires + cliniques • Développer (tests de confirmation spéciaux) des cas cliniques particuliers

Buts précis en terme de Recherche et de Développement : • Publication de cas cliniques particuliers • Organisation de capture de tiques dans les environs du lieu d’habitation ou de travail

des cas sérologiquement confirmés.

BACILLUS ANTHRACIS

Responsable : Nom : Dr WATTIAU P. Hôpital / Laboratoire : CODA-CERVA Adresse : Groeselenberg 99 - 1180 Bruxelles Tél. : 02/379.04.41 Fax : 02/375.06.64 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : échantillons et souches suspects milieu de transport à utiliser : pas d’exigences spécifiques milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : l’emballage doit satisfaire aux exigences de biosécurité

pour les cultures délai d’envoi maximum : /

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic typage sous-espèce étude de résistance Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande



• Isolation et identification. Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique :

• Incidence de Bacillus anthracis chez l’homme et l’animal. Présence de B. anthracis dans l’environnement.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Développement d’un test de diagnostic rapide.

BARTONELLA HENSELAE

Responsable : Nom : Dr DELMEE M. – Ph. KABAMBA B. Hôpital / Laboratoire : Cliniques Universitaires St-Luc - Laboratoire de Microbiologie Adresse : Avenue Hippocrate, 10 Bte 5490 - 1200 Bruxelles Tél. : 02/764.94.41 – 02/764.67.26 Fax : 02/764.94.40 – 02/764.69.33 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum, biopsie et ponction ganglionnaires, ponction

abcès milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : envoi postal normal

délai d’envoi maximum : 7 jours

Analyse : Type d’analyse En routine sur demande confirmation du diagnostic typage étude de résistance Facturation des tests au patient qui fait la demande

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 3 à 7 jours


• Le principal service est surtout l’aide aux biologistes qui le souhaitent.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Regrouper des données séro-épidémiologiques et cliniques pour une meilleure

connaissance de la Maladie, province par province, et transmettre l’expérience aux autres laboratoires qui le désirent.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Depuis 2000 : technique de PCR-Bartonella henselae dans les ganglions.

BORDETELLA PERTUSSIS

Responsable : Nom : Prof. LAUWERS S. Hôpital / Laboratoire : UZ Brussel - Microbiologie Adresse : Avenue du Laarbeek, 101 - 1090 Bruxelles Tél. : 02/477.50.00 Fax : 02/477.50.15 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toutes les souches probables de B. (para)pertussis milieu de transport à utiliser : repiquage sur boite d’agar milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : tubes : double emballage; boîtes : enveloppe ouatée, en double emballage selon

les instructions de l’ISP (http://www.iph.fgov.be/ClinBiol/bckb33/what_is_new/envoi_echantillon/envoi_fr.htm)


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation de l’identification n q typage par PFGE q n Typage des facteurs de virulence (toxine pertussis, pertactine, facteur de colonisation de la trachée)

q n

Etude de résistance q n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Autre recherche : PCR sur des échantillons cliniques, voir guide du laboratoire : http://www.azvub.be/index.jsp?Tag=LABONL&MenuId=LABOGIDS

n q

Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q* q*

*provisoirement pas, mais la direction de l’UZ Brussel étudie le dossier.

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 10 jours délai pour recevoir le résultat d’une analyse PCR sur demande : 3 jours délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : prendre contact avec le labo de référence

Description des activités du Laboratoire de Référence :

Services envers les laboratoires : • Diagnostic moléculaire de la coqueluche • Confirmation de l’identification des souches envoyées par les techniques de

chromatographie gazeuse et d’immunofluorescence.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance de la fréquence de la coqueluche en Belgique et de l’efficacité de la

politique de vaccination.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Surveillance de la fréquence des différents types de toxine pertussis, de la pertactine

et du facteur de colonisation de la trachée après l’introduction du vaccin acellulaire.

BORRELIA BURGDORFERI

Responsable : Nom : Dr DELMEE M. – Ph. KABAMBA B. Hôpital / Laboratoire : Cliniques Universitaires St-Luc - Laboratoire de Microbiologie Adresse : Avenue Hippocrate, 10 Bte 5490 - 1200 Bruxelles Tél. : 02/764.94.41 – 02/764.67.26 Fax : 02/764.94.40 – 02/764.69.33 E-mail : [email protected] - [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum, LCR, liquide articulaire, biopsie peau milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : envoi postal normal


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage n q étude de résistance q q Facturation du WB au patient n q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

n q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 3 jours à 7 jours


• Le principal service est surtout l’aide aux biologistes qui le souhaitent vu le large choix des techniques proposées, leurs limites et leurs interprétations des résultats.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Regrouper des données séro-épidémiologiques et cliniques pour une meilleure

connaissance de la Maladie de Lyme, province par province, et transmettre l’expérience aux autres Laboratoires qui le désirent.

• Participer à des plaquettes préventives de l’ISP.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Depuis 1992 : technique de PCR-Borrelia burgdorferi sensu lato pour principalement

détecter les patients séronégatifs, surtout dans le domaine neurologique. • Depuis 1994 : technique de Western Blot à titre de recherche clinique pour évaluer

dans les sérums, LCR et liquides articulaires positifs quels types d’anticorps sont présents (intérêt pour connaître les meilleurs coûts sérologiques sensibles et spécifiques, pour le futur vaccin et pour le pattern global de Western Blot en accord avec l’espèce de Borrelia). Dés septembre 2006, le WB sera fait systématiquement comme test de confirmation.


Responsable : Nom : Dr GERIN V. Hôpital / Laboratoire : Clinique St-Pierre Adresse : Avenue Reine Fabiola 9 – 1340 Ottignies Tél. : 010/43.71.60 Fax : 010/43.71.88 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : envoi postal normal


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage q q étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

n q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : max 10 jours ouvrables


• Mise à disposition de la technique du Western Blot relative au Borrelia.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Regroupement de données séro-épidémiologiques relatives à la maladie de Lyme.



Responsable : Nom : Prof. VAN RANST M. Hôpital / Laboratoire : U.Z. CDG8 - Virologie Adresse : Herestraat, 49 - 3000 Leuven Tél. : 016/34.79.09 Fax : 016/34.79.31 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : standard


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage q q étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

n q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 1 semaine

Description des activités du Laboratoire de Référence : Services envers les Laboratoires : /

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Confirmation des résultats sérologiques.


BRUCELLA

Responsable : Nom : Dr WALRAVENS K. Hôpital / Laboratoire : CERVA Adresse : Groeselenberg, 99 – 1180 Bruxelles Tél. : 02/379.13.03 Fax : 02/379.13.37 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toute souche suspecte, sérum milieu de transport à utiliser : gélose sang, TSA, milieu de Farell, etc … milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : emballage étanche délai d’envoi maximum : /

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande sérologie n q bactériologie indentification n q typage des souches n q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande :

n (sérologie) q (bactériologie et typage)

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 2 jours ( sérologie)

délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 10 jours (bactériologie + typage)


Services envers les Laboratoires :

• Laboratoire de Référence Belge pour l’U.E. • Contrôle & Distribution d’antigènes et de séra de référence. • Manuel de prescriptions pour le diagnostic sérologique de la Brucellose.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique :

• Incidence des Brucellose animales en Belgique ainsi que leur impact en terme de zoonoses, par example :

- Brucella abortus : bovins; - Brucella suis : sangliers; - Brucella spp. : zoos et parcs animaliers.

• Incidence des Brucelloses humaines autochtones ou importées (Brucella melitensis, jamais isolées de prélèvements animaux en Belgique).

Buts précis en terme de Recherche et Développement :

• Diagnostic indirect de la Brucellose par mesure in vitro de l’immunité à médiation cellulaire.

• Validation de techniques PCR pour identification et biotypage sur cultures et/ou prélèvements.

• Epidémiologie moléculaire : MLVA

Complexe BURKHOLDERIA CEPACIA

Responsable : Nom : Prof. Dr VANDAMME P. Hôpital / Laboratoire : Universiteit Gent - Laboratorium voor Microbiologie Adresse : Ledeganckstraat 35 - 9000 Gent Tél. : 09/264.5113 Fax : 09/264.5092 E-mail : [email protected]

Envoi : Type d’échantillons à envoyer : soupçon de bactéries du complexe B. cepacia Milieu de transport à utiliser : cultures pures repiquées (datant de

préférence de 1 ou de 2 jours) Milieu disponible sur demande : non Conditionnement à utiliser : standard pour l’envoi de boîtes de Petri

Délai d’envoi maximum : 2 jours

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage q n analyse de la résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Résultats : Délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 3 semaines

Description des activités du laboratoire de référence : Services envers les laboratoires :

• Confirmation de l’état infectieux du complexe B. cepacia, d’importance médicale, sociale et psychologique, surtout pour les patients atteints de mucoviscidose. D’abord, il est essentiel de distinguer le complexe B. cepacia des nombreuses autres bactéries ayant faussement été identifiées comme telles. Ensuite, les isolements sont identifiés au niveau du génome ou de l’espèce au sein du complexe et les isolements sont typés afin de tracer la carte de l’épidémiologie des infections chez les patients atteints de mucoviscidose en Belgique.

Objectifs en terme de surveillance épidémiologique et de santé publique :

• Reconnaître les infections du complexe B. cepacia chez les patients atteints de mucoviscidose est essentiel pour contrôler l’infection et suivre le patient (en moindre mesure pour la thérapie individuelle du patient). La recherche a d’ailleurs démontré clairement que bon nombre de souches du complexe B. cepacia sont assez contagieuses, tandis que les infections sont difficiles à traiter et associées à une mortalité élevée (l’incidence reste toutefois peu élevée en Belgique). La transmission des isolements au sein des / entre les centres belges a par contre été démontrée dans différentes études de surveillance au niveau national, réalisées en collaboration avec l’Association Belge de Lutte contre la Mucoviscidose et les centres nationaux de mucoviscidose. Notre objectif est d’éviter la distribution de ces bactéries en les identifiant de façon rapide et précise.

Objectifs en terme de recherche et développement :

• Le diagnostic ainsi que l’épidémiologie du complexe B. cepacia et d’autres non-fermentants inhabituels à Gram négatif chez les patients atteints de mucoviscidose est le domaine le plus important de notre unité de recherche. Nos priorités concernent principalement la continuation des études de biodiversité en ce qui concerne ces organismes, l’optimalisation des procédures d’identification et l’analyse des réservoirs. Nous sommes impliqués dan plusieurs projets de séquençage du génome de l’espèce Burkholderia financés par l’Institut Sanger (UK) et le « Department of Energy » (USA). Sur le plan national, la recherche est financée par le FWO-Vlaanderen, les SSTC et le Bijzonder Onderzoeksfonds de la RUG.

CALICIVIRUS DE TYPE NORWALK

Responsable : Nom : Prof. Dr Marc Van Ranst Hôpital / Laboratoire : UZ Leuven - Virologie Adresse : Herestraat 49 – CDG7 – 3000 Leuven Tél. : 016/34.79.08 Fax : 016/34.79.00 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : Matières fécales milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : pot délai d’envoi maximum : 3 jours

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande Diagnostic

Typage moléculaire


Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine: 1 à 2 semaines


• Diagnostic par RT-PCR • Typage moléculaire


Evaluation de la situation en Belgique car à l'heure actuelle il n'y a aucune donnée disponible. Intérêt marqué au niveau européen car les calicivirus de type Norwalk sont des pathogènes émergents transmissibleS par l'alimentation.


Etude de l'épidémiologie moléculaire des types viraux circulant en Belgique

CAMPYLOBACTER sp.

Responsable : Nom : Dr VANDENBERG O. Hôpital / Laboratoire : C.H.U. St-Pierre – Dpt de Microbiologie Adresse : Rue Haute, 322 - 1000 Bruxelles Tél. : 02/535.45.31 Fax : 02/535.46.56 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : Campylobacter jejuni / coli : seulement prélèvement noble : hémoculture, liquide

céphalo-rachidien, etc Non jejuni / coli Campylobacter : tout prélèvement milieu de transport à utiliser : Wilkins-Chalgren anaerobe agar ou Mueller Hinton

agar + sang de mouton milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : enveloppe ouatée délai d’envoi maximum : milieu de transport : 48 à 72 heures milieu de culture : 24 heures

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q biotypage n q identification moléculaire q n diagnostic sérologique q n étude de résistance q n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q n* * pour analyse sur demande

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 1 à 2 semaines délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 2 à 4 semaines


• Identification conventionnelle

• Diagnostic sérologique

• Sensibilité aux antibiotiques

• Identification moléculaire des Campylobacter sp. et Arcobacter sp.


? Evolution de la résistance antimicrobienne.

? Formes cliniques de l’infection (entérites, septicémies, …).

Buts précis en terme de Recherche et Développement : / • Relation entre les infections humaines et les réservoirs possibles (animaux, aliments, …).

• Evaluation des kits et des tests commerciaux.

CHIKUNGUNYA

Responsable : Noms : Dr. VAN ESBROECK M.

Hôpital / Laboratoire : I.T.G. - Klinische Biologie Adresse : Kronenburgstraat 43/3 - 2000 Antwerpen Tél. : 03/247.64.45

Fax : 03/247.64.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser :

délai d’envoi maximum :

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic biotypage étude de résistance

autre : Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine :

1 semaine (PCR), 2 semaines (sérologie)


• Diagnostic par PCR ou par détection des anticoprs IgG (IFAT), en fonction du moment de l’infection.

Objectifs en termes de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance des infections humaines à virus Chikungunya. • Surveillance des infections humaines à virus Chikungunya attrapées en Belgique

(projets ‘Emerging threats’ et European Network for Diagnostics of ‘Imported’ Viral Diseases – ENIVD).

Buts précis en termes de Recherche et Développement : /

CHIKUNGUNYA

Responsable : Noms : Ir. GERARD C./Dr Vét. THOMAS I.

Hôpital / Laboratoire : ISP - Section Virologie Adresse : Rue Juliette Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.55.48 ou 50.74

Fax : 02/642.56.92 E-mail : [email protected]/[email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : Envoi à 4°C

délai d’envoi maximum : Endéans les 10 jours qui suivent l’apparition des symptômes



Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 2 semaines


• Confirmation du diagnostic par détection de l’acide nucléique dans le sérum par PCR.

Objectifs en termes de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance des infections humaines à virus Chikungunya. • Surveillance des infections humaines à virus Chikungunya non importées en Belgique

(projet ‘Emerging threats’). • Contrôle de la sécurité du sang et dérivés


CLOSTRIDIUM BOTULINUM

Responsable : Nom : Dr KIMPE A. Hôpital / Laboratoire : ISP – Dpt Institut Pasteur Adresse : Rue Engeland, 642 - 1180 Bruxelles Tél. : 02/373.33.10 Fax : 02/373.33.15 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : tout prélèvement permettant une confirmation par le

laboratoire d’une suspicion de botulisme (sang, selles, vomissement, contenu gastrique, lavement, pus, exsudat, aliments incriminés, ...). En cas de suspicion de botulisme, prendre contact par téléphone ou par fax, avant l’envoi de tout échantillon.

milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : les échantillons prélevés doivent être recueillis et

transportés dans des récipients stériles et étanches. Les aliments sont gardés de préférence dans leur contenant d’origine. Les échantillons sont soigneusement étiquetés de façon à permettre une identification rapide. Les récipients primaires sont emballés dans un récipient étanche secondaire.

délai d’envoi maximum : Les échantillons doivent être envoyés le plus rapidement possible. Ceux-ci doivent être réfrigérés (0 à 4°C) dès leur prélèvement et acheminés immédiatement vers le laboratoire de référence, égale-ment sous réfrigération. La congélation n’est pas recommandée.

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic q n typage q n étude de résistance q q

autre : recherche et typage de toxine botulique et/ou du germe dans les aliments, les prélèvements animaux, etc ...

Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande : clinique humaine autres

q q q n

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : selon la nature de

l’échantillon, la recherche effectuée et la présence ou non de toxine botulique et/ou du germe, 24 heures (résultat provisoire) à 4 semaines.


• Confirmation biologique en cas de suspicion clinique par la mise en évidence et le typage de toxine botulique d’une part et l’isolement, l’identification et le typage du germe d’autre part, à partir des aliments incriminés et de prélèvements chez les patients. Cette confirmation nécessite des examens in vivo sur souris.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Le botulisme est un problème de santé publique urgent. Les cas sont rares en

Belgique mais néanmoins toujours existants. Une confirmation rapide en cas de suspicion clinique est indispensable tant pour le patient (diagnostic différentiel et mise en place d’un traitement adéquat) que pour ses proches (si consommation de l’aliment incriminé), voire pour une plus large population (si aliment commercial largement diffusé).


CLOSTRIDIUM DIFFICILE

Responsable : Nom : Prof. DELMEE M. Hôpital / Laboratoire : U.C.L. 5492 - Microbiologie Adresse : Avenue Hippocrate, 54 - 1200 Bruxelles Tél. : 02/764.54.90 Fax : 02/764.94.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : souche de C. difficile milieu de transport à utiliser : boîte de petri en SACHET sous anaérobiose ou tube fermé avec milieu de culture milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser :


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic typage étude de résistance Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 1 – 2 semaines


• Typage des souches par ribotypage, toxinotypage, gènes toxA, toxB et toxine binaire ainsi que délétion tcdC.

• Identification des souches épidémiques hyper-virulentes du pulsotype NAP1/ribotype 027.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Evaluation de l’incidence des souches 027. • Epidémiologie locale et nationale.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Epidémiologie et prévention.

CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE

Responsable : Nom : Prof. Dr LAUWERS S. Hôpital / Laboratoire : UZ Brussel - Microbiologie Adresse : Avenue du Laarbeek, 101 - 1090 Bruxelles Tél. : 02/477.50.00 Fax : 02/477.50.15 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toutes les souches probables de C. diphtheriae milieu de transport à utiliser : agar au sang ou milieu au tellurite (inoculation fraîche) milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : tubes : double emballage boîtes : enveloppe ouatée, en double emballage selon

les instructions de l’ISSP (http://www.iph.fgov.be/ClinBiol/bckb33/what_is_new/envoi_echantillon/envoi_fr.htm)


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation de l’identification, incluant la détection de toxine

n q

biotypage n q étude de résistance q n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 7 jours délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 14 jours


• Confirmation de l’identification et recherche de production de toxine par PCR.



CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS

Responsable : Nom : Dr SYMOENS F. Hôpital / Laboratoire : WIV-ISP - Mycologie Adresse : Rue J. Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/6425630 Fax : 02/6425519 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : culture milieu de transport à utiliser : milieu agar milieu disponible sur demande : oui conditionnement à utiliser : /


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic typage résistance aux antifongiques Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 1 semaine/identification


• Mycologie médicale en général (routine-enseignement-recherche). • Diagnostic de la cryptococcose par la recherche d’antigènes solubles dans le sérum

et le L.C.R.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Le SIDA a été pendant plusieurs années le principal facteur prédisposant à la

cryptococcose. Mais les progrès en matière de traitements du SIDA ont provoquéune chute du nombre de cas de cryptococcose par an.

• D’autres facteurs semblent prendre le relais, entre autres l’administration decorticoïdes d’autant plus s’il s’agit de patients ayant de fréquents contacts avec lalevure comme les colombophiles. Cryptococcus neoformans var. neoformans et var. grubii se multiplient en effet dans les déjections de pigeons qui constituent donc unesource de contamination non négligeable.

• La cryptococcose étant donc une mycose opportuniste, le formulaire comporte unensemble de questions se rapportant aux facteurs favorisants. Une bonne connaissance de ces derniers permet de définir les groupes à risques et de lessoumettre à des contrôles réguliers.

• Il existe en effet un test de dépistage sérologique tout-à-fait fiable (latex sensibilisé)

qui permet le repérage des cas débutants ce qui permet de traiter la mycose dèsson apparition et donc avec plus d’efficacité.


• La cryptococcose demeure un des piliers de la mycologie médicale. Ses agents,Cryptococcus neoformans var. neoformans, var. grubii et var. gattii constituent des espèces de référence tant pour les études taxonomiques, que cliniques,épidémiologiques et thérapeutiques.

• Des souches sont isolées et étudiées dans le monde entier. Cataloguer les souches en rassemblant un maximum d’informations à leur sujet constitue donc un héritagepour les générations futures et dans ce contexte il faut savoir que la collectionBCCM/IHEM de l’I.S.P. comporte un ensemble de près de 3000 souches d’originesdifférentes qui constituent un vrai patrimoine national.

CRYPTOSPORIDIUM

Responsable : Nom : Dr VAN ESBROECK M. Hôpital / Laboratoire : I.T.G. - Klinische Biologie Adresse : Nationalestraat, 155 - 2000 Antwerpen Tél. : 03/247.64.45 Fax : 03/247.64.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : pour la confirmation d’un diagnostic : selles fixées ou

non (5% formol); pour le (sous)génotypage : minimum 10 gr de selles non fixées

milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : adapté à l’échantillon (normes légales)


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic � � biotypage � � étude de résistance � �

autre : détection immunologique des antigènes de Cryptosporidium Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

� �

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de ro utine : 5 jours

Description des activités du Laboratoire de Référen ce : Services envers les Laboratoires :

• Confirmation du diagnostic de Cryptosporidium.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Description des (sous)types des Cryptosporidium présents en Belgique.


CYCLOSPORA


Envoi : type d’échantillons à envoyer : selles milieu de transport à utiliser : éventuellement 5 à 10% formol milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : /




Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 2 jours


• Confirmation.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Confirmation du diagnostic par des laboratoires ayant des connaissances pratiques

limitées dans le domaine de la parasitologie.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Développement de nouvelles techniques de diagnostic.

DENGUE

Responsable : Nom : Dr VAN ESBROECK M. Hôpital / Laboratoire : I.M.T. – Biologie Clinique Adresse : Nationalestraat 155 - 2000 Antwerpen Tél. : 03/247.60.47 Fax : 03/247.64.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser :


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q biotypage q q étude de résistance q q


*sauf s’il s’agit d’une confirmation/d’un contrôle de résultat

n* q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : max. 5 jours ouvrables = max. 7 jours


• Diagnostic

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance nationale des cas importés d’infections virales de dengue en Belgique.


ECHINOCOCCUS MULTILO CULARIS : version 2002

Responsable : Nom : Prof. Dr Y. CARLIER Hôpital / Laboratoire : Hôpital Erasme – Laboratoire de Parasitologie Adresse : Route de Lennik, 808 - 1070 Bruxelles Tél. : 02/555.62.55 Fax : 02/555.61.28 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : /

délai d’envoi maximum : 24 à 48h

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande (confirmation du) diagnostic n o détection immunologique des anticorps

n o


n o



• Confirmation du diagnostic d’Echinococcus multilocularis.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Disposer de données dans un cadre national et international


ENTAMOEBA HISTOLYTICA


Envoi : type d’échantillons à envoyer : selles milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : adapté à l’échantillon (normes légales)


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande Confirmation du diagnostic Biotypage étude de résistance

autre : parasitologie : confirmation de la présence de kystes d’E. histolytica/E. dispas PCR : différenciation entre E. histolytica et E. dispas (seulement si selles non fixées et si des kystes ont été trouvés au microscope)

détection d’anticorps avec IFAT et agglutination indirecte en cas de suspicion d’amoébiose extra-intestinale)




• Confirmation de la présence de kystes d’E. histolytica/E. dispas. • Différenciation entre E. histolytica pathogène et E. dispas non pathogène. • Diagnostic d’amoébiose extra-intestinale par sérologie.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Confirmation de la présence de kystes d’E. histolytica/E. dispas pour les laboratoires

ayant des connaissances pratiques limitées dans le domaine de la parasitologie. • Distinction entre les infections cliniques importantes ou le portage d’E. histolytica/E.

dispas.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Développement de nouvelles techniques de diagnostic. • Evaluation de kits ou tests commerciaux.

ENTEROCOCCUS

Responsable : Nom : Prof. Dr GOOSSENS H. Hôpital / Laboratoire : U.Z. Antwerpen - Labo Microbiologie Adresse : Wilrijkstraat, 10 - 2650 Edegem Tél. : 03/821.37.89 Fax : 03/825.42.81 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : entérocoques invasifs milieu de transport à utiliser : agar au sang milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : post-pack


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic q n Typage q n étude de résistance q n

autre : entérocoques non invasifs Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 14 jours


• Rapport individuel par souche après délibération avec le laboratoire de référence. • Rapport annuel.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Service d’identification des entérocoques. • Suivi de la résistance aux glycopeptides.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Mise au point des méthodes d’identification et des techniques de détection de la

résistance. • Epidémiologie de la résistance aux glycopeptides en Belgique.

ESCHERICHIA COLI PRODUISANT DES VEROTOXINES

Responsable : Nom : Prof. Dr PIERARD D. Hôpital / Laboratoire : UZ Brussel - Microbiologie Adresse : Avenue du Laarbeek 101 - 1090 Bruxelles Tél. : 02/477.50.02 Fax : 02/477.50.15 E-mail : [email protected] (secrétariat)

[email protected] (personnel)

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toutes les souches probables d’E. coli productrices de

vérotoxine (VTEC) (synonymes : E. coli entérohémorragique, EHEC; E. coli productrice de Shigatoxine, STEC).

milieu de transport à utiliser : gélose nutritive milieu disponible sur demande : oui, au 02/642.50.82 ou au 02/642.50.81

conditionnement à utiliser : placer la gélose dans une gaine en plastique selon les instructions de l’ISP (http://www.iph.fgov.be/ClinBiol/bckb33/

what_is_new/envoi_echantillon/envoi_fr.htm) délai d’envoi maximum : 1 semaine

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic (seulement si le gène VT est présent)

recherche et typage de gènes VT recherche du gène eae recherche du gène d’entérohémolysine agglutination pour les principaux sérogroupes O

phagotypage des souches O157 sérotypage des souches non O157 recherche de la résistance Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

Autres analyses : recherche de VTEC dans les selles de patients avec le syndrome urémique hémolytique (SUH), une diarrhée sanguinolente ou faisant partie d’une épidémie de diarrhée

Voir site internet : http://webhost.ua.ac.be/cmd/index.html


*

* provisoirement pas, mais la direction de UZ Brussel étudie le dossier.

Autres analyses : recherche d’anticorps contre l’antigène LPS des sérogroupes les plus fréquents de VTEC dans le SUH, uniquement dans le sérum de patients avec ce syndrome


Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 5 jours délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : contacter le laboratoire de référence


• Confirmation de la production de vérotoxines, sous-typage des vérotoxines et recherche des facteurs de virulence supplémentaires par PCR. Sur base des facteurs de virulence, les souches sont réparties en E. coli entérohémorrhagiques typiques (VTEC avec les deux facteurs de virulence supplémentaires) ou E. coli entérohémorrhagiques atypiques (VTEC négatifs pour un ou les deux facteurs de virulence supplémentaires).

• Agglutination pour les principaux sérogroupes O. • Recherche de VTEC dans les selles des patients SHU (Syndrome Hémolytique

Urémique). • Détermination des anticorps dans le sérum des patients SHU.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Enregistrement des infections à VTEC, en particulier du sérotype O157:H7 et de son

variant immobile O157:H-. • Enregistrement des cas SHU. • Détection d’épidémies et si possible, recherche des sources d’infection.

Buts en terme de Recherche et Développement : • Epidémiologie des infections à O157. • Epidémiologie des infections non O157 et recherche de leur signification au niveau

des facteurs de virulence.

FRANCISELLA TULARENSIS

Responsable : Nom : Dr FRETIN D. Hôpital / Laboratoire : CODA-CERVA Adresse : Groeselenberg 99 – 1180 Bruxelles Tél. : 02/379.04.40 Fax : 02/375.06.70 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum ou tout échantillon ou souche suspecte pour

confirmation bactériologique milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : standard pour les sérums, emballage étanche

répondant aux normes de biosécurité pour les cultures délai d’envoi maximum : /

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic sérologie/bactériologie

typage sous-espèce étude de résistance Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 3 jours pour un résultat de

sérologie / 7 jours pour un résultat de bactériologie délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 7 jours

Description des activités du Laboratoire de Référence : Services envers les Laboratoires : • Sous-traitance pour les tests de bactériolgie et de sérologie. • Typage des souches isolées jusqu’à la sous-espèce. Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Prévalence de Francisella dans la faune sauvage. • Incidence de la tularémie humaine. Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Développement et validation d’un test sérologique ELISA. • Epidémiologie moléculaire.

HAEMOPHILUS INFLUENZAE : version 2002

Responsable : Nom : Dr CROKAERT F. Hôpital / Laboratoire : Instituut Bordet - Microbiologie Adresse : Rue Héger Bordet, 1 - 1000 Bruxelles Tél. : 02/541.37.06 Fax : 02/541.32.95 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : localisations profondes (LCR, hémoculture, liquides

normalement stériles) + pus d’oreille milieu de transport à utiliser : milieu chocolat milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : envoi postal - culture de 24h

délai d’envoi maximum : 24 à 48 heures

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n o typage n o étude de résistance (diffusion) o n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

o o

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 2 semaines délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : suivant les demandes

Description des activités du Laboratoire de Référence : Services envers les Laboratoires : /

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Suivi de la fréquence des infections à Haemophilus influenzae de type B dans les

infections profondes et impact de la vaccination sur les populations pédiatriques.


HANTAVIRUS

Responsable : Nom : Dr VANDENVELDE C. Hôpital / Laboratoire : Hôpital Central de la Base - Reine Astrid Adresse : Rue Bruyn - 1120 Bruxelles Tél. : 02/264.40.44 – 02/264.46.80 Fax : 02/264.46.08 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum / plasma (EDTA) milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : de préférence sur glace (sèche) + emballage “Isomo”

délai d’envoi maximum : 2 (à 3) jours

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage q n étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

n q



• Dosage des IgG par ELISA pour au minimum 4 sérotypes différents d’Hantavirus : Hantaan (HTN), Puumala (PUU), Seoul (SEO), Dobrava (DOB).

• Si IgG+, confirmation d’une infection récente avec ELISA IgM, HTN, PUU, SEO ou DOB.

• Pour des situations cliniques particulières (choc et/ou œdème pulmonaire et/ou problèmes au niveau de plusieurs organes, ...) : confirmation par Western Blot et/ou tests spécifiques de neutralisation.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance nationale des infections à Hantavirus en Belgique chez l’homme et chez

les rongeurs. • Mise sur carte des cas séropositifs grâce aux codes postaux. • Réalisation d’un “registre clinique” grâce aux données cliniques et à la collaboration

de quelques laboratoires importants.

• Suivi (tests spéciaux de confirmation) des cas cliniques particuliers. • Collaboration avec l’I.S.P. pour la réalisation d’enquêtes cas-témoins, par ex. pour les

épidémies de 1993 et de 1996.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Publication de cas cliniques particuliers. • Organisation de captures de rongeurs dans les environs du lieu de travail ou habitat

des cas sérologiquement confirmés --> screening IgG ELISA des séra des rongeurs --> “antigen capturing ELISA” sur les poumons des rongeurs séropositifs extraits aseptiquement.

• Récemment : séquençage des génomes hantaviraux d’origine humaine (serum) et animale (poumons).

HEPATITES VIRALES A, B, C, D, E

Responsable : Nom : MICALESSI Isabel

THOMAS Isabelle Hôpital / Laboratoire : ISP - Section Virologie Adresse : Rue Juliette Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.50.73 - 02/642.50.74 Fax : 02/642.56.92 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum, plasma milieu de transport à utiliser : néant milieu disponible sur demande : sans objet

conditionnement à utiliser : triple emballage + étiquette UN3373 sur emballage externe délai d’envoi maximum : /

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande diagnostic confirmation du diagnostic

n n n n

Typage n n étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : max. 3 semaines


• Sérologie et GAT (Genome Amplification Techniques, dont PCR + real time PCR) sur les virus hépatiques.

• Génotypage (HBV + HCV).

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Diagnostic, confirmation de diagnostic et contrôle sur demande des médecins,

hôpitaux, laboratoires, centres de transfusion, etc. • Surveillance et études épidémiologiques sur des groupes représentatifs de la

population totale ainsi que sur des groupes à risque pour les hépatites virales. • Contrôle de qualité des réactifs.


INFLUENZA

Responsable : Nom : Dr THOMAS I.

Hôpital / Laboratoire : ISP - Section Virologie Adresse : Rue Juliette Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.50.74 Fax : 02/642.56.92 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : écouvillon ou lavage naso-pharyngé, lavage

ou aspiration broncho-alvéolaire (BAL) milieu de transport à utiliser : milieu de transport viral

milieu disponible sur demande : oui conditionnement à utiliser : triple emballage + étiquette UN3373 délai d’envoi maximum : dans les 4 jours qui suivent l’apparition des symptômes

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande diagnostic n n confirmation du diagnostic q n typage n n étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q



• Typage (Influenza A, B) par PCR • Sous-typage Influenza A : H1, H3, H5, N1, N2 par PCR

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance virologique des épidémies saisonnières et de pandémie


LEGIONELLA PNEUMOPHILA

Responsable : Nom : Prof. Dr LAUWERS S. Hôpital / Laboratoire : UZ Brussel - Microbiologie Adresse : Avenue du Laarbeek, 101 - 1090 Bruxelles Tél. : 02/477.50.00 Fax : 02/477.50.15 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toutes les souches probables de Legionella milieu de transport à utiliser : culture pure, fraîche sur le milieu d’isolement utilisé milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : enveloppe ouatée, en double emballage selon les

instructions de l’ISP (http://www.iph.fgov.be/ClinBiol/bckb33/what_is_new/envoi_echantillon/envoi_fr.htm)


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation de l’identification n q typage q n étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Autre recherche : recherche de Legionella dans des échantillons cliniques via culture et PCR, cfr CMD website : http://cmd-www.uia.ac.be/cmd/

n q


q q

Autre recherche : recherche d‘antigènes type 1 de Legionella pneumophila dans l’urine, cfr guide des laboratoires AZ-VUB : http://webhost.ua.ac.be/cmd/index.htm

n q


q* q

* provisoirement pas, mais la direction de l’UZ Brussel étudie le dossier. Autre recherche : détection quantitative de Legionella dans l’eau : seulement après un contact avec le

q n

laboratoire


q n

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 10 jours (recherche d´antigènes type 1 de Legionella pneumophila dans l’urine : 1 jour; prendre contact avec le labo pour les cas urgents). délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : prendre contact avec le

laboratoire de référence


• Diagnostic moléculaire. • Confirmation de l’identification des souches envoyées avec des techniques

biochimiques, de chromatographie gazeuse et d’immunofluorescence. • Détermination du sérotype de L. pneumophila.



LEGIONELLA PNEUMOPHILA

Responsable : Nom : Prof. STRUELENS M. Hôpital / Laboratoire : Hôpital Erasme ULB - Microbiologie Adresse : Route de Lennik, 808 - 1070 Bruxelles Tél. : 02/555.45.18 Fax : 02/555.31.10 E-mail : [email protected]

Envoi :

adresse : c/o N. Maes / S. Rottiers / S. Crevecoeur type d’échantillons à envoyer : culture de Legionella sp. milieu de transport à utiliser : gélose Buffered Charcoal Yeast Extract (BCYE) en

double emballage + formulaire milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : double emballage hermétique et renforcé

délai d’envoi maximum : < 24 heures

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage épidémiologique q n étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Autre analyse : - Recherche de legionella dans les

échantillons cliniques respiratoires par PCR (cfr web site CDM : http://webhost.uia.ac.be/cmd)

- Recherche d’antigène sérogroupe 1 de Legionella pneumophila dans l’urine (test Binax NowTM)

- Détection quantitative de Legionella dans l’eau : seulement après contact avec le laboratoire (enquête épidémique)

q n

n q q n

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 1 semaine délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : selon l’urgence


• Confirmation du diagnostic (identification, sérotypage). • Détection d’antigènes urinaires. • Typage par anticorps monoclonaux, par Amplified Fragment Length Polymorphism

(AFLP) et par Sequence Based Typing (SBT). • Aide à l’investigation épidémiologique et enquête microbiologique de l’environnement

en cas d’épidémie. • Conseils sur les mesures de prévention.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance de l’incidence de la légionellose et distribution en fréquence des espè-

ces/sérotypes. • Aide à la détection, à l’investigation et au contrôle des épidémies locales en Belgique

(hôpitaux, maisons de repos et de soins, ...). • Participation au réseau européen de surveillance et de prévention des légionelloses

du voyageur (European Working Group on Legionella Infections - EWGLI).

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Mise au point de méthodes moléculaires d’identification et de typage épidémiologique

des Legionella (et évaluation de performance). • Standardisation internationale du typage moléculaire. • Méthodes de monitoring environnemental des Legionella dans les réseaux d’eau

chaude et valeur prédictive des risques de transmission (participation au contrôle externe de la qualité du PHLS, London).

• Organisation de l’évaluation externe de la qualité des Centres de Diagnostic Moléculaire (PCR pour détection de Legionella, typage moléculaire).

LEISHMANIA


Envoi : type d’échantillons à envoyer : biopsie, moelle osseuse milieu de transport à utiliser : pour les biopsies : 1 ml d’eau physiologique stérile milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : adapté à l’échantillon (normes légales)

délai d’envoi maximum : 24h à température ambiante ou 3 jours

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic typage étude de résistance

Autre : détection d’anticorps par agglutination directe en cas de suspicion de leishmaniose viscérale Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande



• Confirmation du diagnostic.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Confirmation du diagnostic.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Leishmaniose mucocutanée dans les soins de santé primaires. • Epidémiologie et génétique moléculaire des leishmanioses.

LEPTOSPIRA


Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : adapté à l’échantillon (normes légales)


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic typage étude de résistance

autre : détection d’anticorps : agglutination directe avec des leptospires vivants Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande



• Confirmation du diagnostic.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Confirmation du diagnostic. • Epidémiologie en Belgique.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Evaluation des kits et des tests commerciaux.

LISTERIA MONOCYTOGENES

Responsable : Nom : Dr Sc. YDE M. Hôpital / Laboratoire : ISP - Section Bactériologie Adresse : Rue Juliette Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.51.54 Fax : 02/642.52.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : cultures milieu de transport à utiliser : ordinaire milieu disponible sur demande : oui, au 02/642.51.54 conditionnement à utiliser : double emballage (port payé par le destinataire)


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage n q étude de résistance n q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q



• Confirmation biochimique • Sérotypage • Typage par des profils de résistance aux métaux et PFGE • Détermination de la sensibilité aux antibiotiques

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Le laboratoire des Listeria agit aussi en tant que laboratoire de référence pour les

souches de Listeria monocytogenes isolées de denrées alimentaires. En cas de poussée épidémique, la relation entre les souches humaines et les souches alimentaires sont analysées.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Mise au point d’une technique PCR reproductible pour l’identification et le sérotypage

de souches de Listeria.

MORBILLIVIRUS

Responsable : Nom : Madame HUTSE V. Hôpital/Laboratoire : ISP - Section Virologie Adresse : Rue Juliette Wytsman 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.56.90 Fax : 02/642.56.92 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum, salive, écouvillon naso-pharyngé (culture virale)

milieu de transport à utiliser : écouvillon oracol pour salive, milieu de transport viral pour écouvillon naso-pharyngé

milieu, formulaire de demande et kit de prélèvement disponible sur demande : oui au 02/642.56.90

conditionnement à utiliser : triple emballage du prélèvement + étiquette UN3373 sur l’emballage externe.

délai d’envoi maximum : le plus rapidement possible et max. 1 semaine pour la salive

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n n typage q q étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q



• Sérologie (IgM sérum et salive; IgG sérum) et PCR (salive et écouvillon naso-pharyngé).

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Contrôle et confirmation à la demande des médecins, hôpitaux, etc. • Surveillance et études épidémiologiques dans les groupes représentatifs pour la

population entière et dans les groupes à risque. • Contrôle de qualité.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Génotypage à partir de fin 2007

MYCOBACTERIES

Responsable : Nom : Dr FAUVILLE – DUFAUX M. Hôpital / Laboratoire : ISP - Dpt Institut Pasteur - Laboratoire des Mycobactéries Adresse : Rue Engeland, 642 - 1180 Bruxelles Tél. : 02/373.32.08 ou 02/373.32.10 Fax : 02/373.32.81 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : Cultures de mycobactéries milieu de transport à utiliser : Lowenstein Jensen, Ogawa, Bactec MGIT ou 7H12,

MB/BacT ou tout autre milieu solide ou liquide milieu disponible sur demande : éventuellement Löwenstein-Jensen conditionnement à utiliser : triple emballage conforme aux normes OMS pour envoi

de microorganismes de niveau de risque 3 (WHO/EMC/97.3) et au règlement universel de la Poste chap.II, art.20-MB du 29/12/90


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q identification de mycobactéries n q étude de résistance n q autres : génotypage M. tuberculosis

cpx

q n


q q


• Identification : 2 à 12 jours • Résistance : 10 jours à 6 semaines, selon méthode utilisée et espèce mycobactérie

délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : • Génotypage (spoligotyping ou MIRU-VNTR) : 1 à 3 semaines • Génotypage RFLP : 2 à 3 mois


• Identification des mycobactéries du complexe M. tuberculosis et des mycobactéries atypiques (biologie moléculaire).

• Antibiogramme des souches du complexe M. tuberculosis (Bactec MGIT). • Antibiogramme étendu (antibiotiques de 2de ligne) et confirmation d’antibiogramme

par les méthodes de Canetti et/ou Bactec radiométrique en cas de souche résistante. • Antibiogramme des mycobactéries atypiques si elles sont cause d’une pathologie.

• Recherche de mutations associées à la résistance aux antibiotiques (confirmation de

la résistance de M. tuberculosis aux antituberculeux de 1ère ligne). • Génotypage de toutes les souches du complexe M. tuberculosis résistantes à

l’isoniazide et/ou à la rifampicine et des autres souches du complexe sur demande (épidémie, transmission de TB, suspicion de contamination croisée de laboratoire).

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Contrôle et surveillance de la tuberculose et plus particulièrement de la tuberculose

multirésistante. • Détection des cas de mycobactériose.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Epidémiologie moléculaire en vue de tracer les voies de transmission de la

tuberculose. • Mise au point de techniques de biologie moléculaire en vue d’un diagnostic plus rapide

de tuberculose et de mycobactériose.

MYCOBACTERIES

Responsable : Nom : Prof. Dr PORTAELS F. Hôpital / Laboratoire : I.M.T. - Mycobactériologie Adresse : Nationalestraat 155 – 2000 Antwerpen Tél. : 03/247.63.24 Fax : 03/247.63.33 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : Mycobacterium spp. milieu de transport à utiliser : culture originale (en cas de milieu dur, d’abord enlever

le liquide) ou bactéries sèches dans un tube microcentrifuge stérile

milieu disponible sur demande : conditionnement à utiliser : 3 couches (emballage primaire avec matériel

absorbant, emballage secondaire contre les chocs et emballage extérieur avec informations nécessaires)

délai d’envoi maximum : 1 semaine

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande 1. confirmation de l’identification par PCR (gène 16S rRNA) et détermination de séquence

n q

2. détermination de la résistance aux moyens de première ligne (système MGIT-SIRE)

n q

3. détermination de la résistance aux moyens de seconde ligne (méthode de proportion)

q n

4. détermination de la résistance pour rifampicine par détection de mutations dans le gène rpoß (PCR et séquençage)

q n

5. typage ADN d’isolements du complexe M. tuberculosis (spoligotypage et/ou typage MIRU-VNTR)

q n


n n


1. au maximum 2 semaines 2. 2-4 semaines (dépend de la croissance sur le milieu envoyé)

délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 3. 6 semaines (dépend de la croissance sur le milieu envoyé) 4. au maximum 1 semaine 5. 2-4 semaines


• (Confirmation de l’) identification des mycobactéries • Culture + identification des mycobactéries difficiles à cultiver • (Contrôle de qualité des) détermination de la résistance • (Contrôle de qualité des) recherches microscopiques • Mettre à disposition des cultures pour le contrôle de qualité externe pour déterminer

la sensibilité et/ou l’identification Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique :

• Enregistrement d’infections à M. tuberculosis en Flandre (Belgique) • Enregistrement de M. tuberculosis résistantes • Enregistrement d’infections mycobactériennes atypiques

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Contribuer à la surveillance mondiale et enregistrement de TB résistants • Contribuer à la simplification, la standardisation et l’évaluation sur le terrain de

techniques pour la détermination (rapide) de la sensibilité, avec l’attention ciblée sur les tests peu onéreux

• Contribuer à l’évaluation de traitements MDRTB standardisés • Exécuter une surveillance sur le développement de la résistance dans différents

schémas de traitements • Participer à une étude multicentrique sur un schéma de traitements de première ligne

contenant de la gatifloxacine • Stimuler le renforcement de la capacité des laboratoires locaux dans les pays à petits

et moyens revenus • Déterminer le réservoir de Mycobacterium ulcerans, causant le Buruli ulcer, mettant

l’accent sur le rôle des différentes espèces animales (rongeurs, insectes, amphibies et reptiles)

• Développement de tests moléculaires pour le typage de M. ulcerans • Epidémiologie des TB humains et bovins • Epidémiologie de maladies causées par des mycobactéries atypiques.

NEISSERIA GONORRHOEAE

Responsable : Nom : Ph. CRUCITTI T. / Mr VAN DYCK E. Hôpital / Laboratoire : I.M.T. - Microbiologie Adresse : Kronenburgstraat 43/3 - 2000 Antwerpen Tél. : 03/247.63.29 Fax : 03/247.63.33 E-mail : [email protected] / [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : isolement NG après une croissance d’au maximum 24

heures milieu de transport à utiliser : agar sanguin milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : conforme à la circulaire de l’ISP – Biologie Clinique

délai d’envoi maximum : 24 heures – envois les lundi, mardi, mercredi

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage (annuel) q q étude de résistance (annuel) q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : max. 4 jours


• Confirmation de l’identification endéans les 4 jours. • Information sur la résistance et le typage, tous les ans.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Recommandations sur les traitements aux antibiotiques de Gonocoques. • Evolution et distribution des génotypes des Gonocoques en Belgique.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Evaluation et validation des techniques diagnostiques. • Evolution des mécanismes de résistance (chromosomal, plasmides).

NEISSERIA MENINGITIDIS

Responsable : Nom : Mme CARION F. Hôpital / Laboratoire : ISP – Section de Bactériologie Adresse : Rue Juliette Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.50.89 Fax : 02/642.52.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toutes les souches probables de N. meningitidis ainsi

que les échantillons de LCR ou de sang en cas d’échec de la culture dans les cas d’infections invasives (méningite, septicémie)

milieu de transport à utiliser : milieu à l’œuf de Vandekerkhove milieu disponible sur demande : oui, au 02/642.50.89 conditionnement à utiliser : double emballage formulaire de demande d'analyse : le formulaire de demande d’analyse est disponible à

l’adresse : http://www.iph.fgov.be/bacteri o frais d'envoi : port payé par le destinataire


Analyse : Type d’analyses en routine sur demande confirmation du diagnostic n q Typage n q étude de résistance n q

Résultats : Délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine :

au minimum 2 jours ouvrables pour l’ensemble des résultats


• Confirmation de l’identification biochimique de la souche. • Détermination du sérogroupe et rapportage. • Détermination du sérotype et sous-type. • Diagnostic et détermination du sérogroupe (A, B, C, Y, W135) par PCR à partir du

LCR ou du sang en cas d’échec de la culture. • Détermination de la sensibilité aux antibiotiques (pénicilline, ampicilline,

chloramphénicol, cefotaxime, ciprofloxacine et rifampicine). • Rapport annuel disponible à l’adresse : http://www.iph.fgov.be/bacterio • Collection de souches.


• La détermination du sérogroupe est importante dans le cadre de la prévention (possibilité de vacciner contre les sérogroupes A, C, Y et W135).

• L’analyse des marqueurs étudiés (sérogroupe, sérotype, sous-type, sensibilité aux antibiotiques) ainsi que des données concernant les patients (âge, sexe, localisation, nature de l’infection, ...) permet de suivre l’évolution de la méningite à méningocoque en Belgique et de déceler l’apparition de souches résistantes ou d’éventuels signes précurseurs d’épidémie : recrudescence d’un sérogroupe, introduction d’un sérotype contre lequel la population ne serait pas immunisée.

• Par l’envoi de données au HPA, Communicable Disease Surveillance Centre, London, le laboratoire participe au projet européen de surveillance des méningites bactériennes « DG SANCO » (EU-IBIS).

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Développement et application des techniques de typage moléculaire pour l’étude des

souches.

PASTEURELLA SP.

Responsable : Nom : Dr VANROBAEYS M. Hôpital / Laboratoire : DGZ. Vlaanderen, Verbond West-Vlaanderen Adresse : Industrielaan, 29, 8820 Torhout Tél. : 050/230.534 Fax : 050/230.569 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : culture greffée, incubée 1jour à 37°C milieu de transport : tube fermé, contenant un milieu (riche) qui

permet la croissance de Pasteurella sp. milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : /

délai d’envoi maximum : 1- (2) jours

Analyse : Type d’analyse Urgent Non Urgent Typage biochimique de Pasteurella (Actinobacillus) sp.

q n

Oui Non Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q n

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse : 3-4 jours après le début de la recherche (en cas d’urgence, le typage est mis en route le jour où la culture est reçue).


• Typage biochimique de Pasteurella – (Actinobacillus) sp.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Typage biochimique de Pasteurella – (Actinobacillus) sp.

PLASMODIUM

Responsable : Nom : Dr JACOBS J. Hôpital / Laboratoire : I.T.G. - Klinische Biologie Adresse : Nationalestraat, 155 - 2000 Antwerpen Tél. : 03/247.64.45 Fax : 03/247.64.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : goutte épaisse non colorée et frottis fait sur sang frais +

0,5 ml de sang EDTA milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : adapté à l’échantillon (normes légales)


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage n q étude de résistance q q autre : recherche parasitologique

PCR détection d’antigènes (P. falciparum versus non falciparum) détection d’anticorps avec IFAT


q q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 1 jour


• Confirmation, identification et éventuellement typage des parasites • Sérologie (pas pour diagnostic aigu)

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Confirmation du diagnostic. • Identification des espèces. • Epidémiologie des malarias importées.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Médecine du voyage : traitement et prophylaxie • Evaluation de la PCR • Evaluation des tests antigènes • Recherche des différents types de rongeurs (laboratoire de protozoologie).

RAGE

Responsable : Nom : Dr Vét. VAN GUCHT S. et Dr Vét. LE ROUX I. Hôpital / Laboratoire : ISP – Dpt Institut Pasteur - Rage Adresse : Rue Engeland, 642 - 1180 Bruxelles Tél. : 02/373.31.50 Fax : 02/373.32.86 E-mail : [email protected]

Envoi :

Titrage des anticorps anti-rabiques : type d’échantillons à envoyer : 5 ml de sang ou de sérum milieu de transport à utiliser : tube sec milieu disponible sur demande : non

conditionnement à utiliser : envoi par la poste avec les précautions d’usage (triple emballage)

délai d’envoi maximum : 2 à 3 jours après prise de sang si conservé à 4°C

Diagnostic post mortem : type d’échantillons à envoyer, milieu de transport à utiliser, conditionnement à

utiliser, délai d’envoi maximum : prendre contact avec le service milieu disponible sur demande : non (pas nécessaire)

Diagnostic ante mortem : type d’échantillons à envoyer, milieu de transport à utiliser, conditionnement à

utiliser, délai d’envoi maximum : prendre contact avec le service, un document explicatif est disponible

milieu disponible sur demande : oui.

Analyse : Types d’analyses en routine sur demande diagnostic ante mortem q n diagnostic post mortem n q détection des anticorps n q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q n

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’un titrage d’anticorps : 10 jours délai pour recevoir le résultat d’un diagnostic : entre 24 heures pour les premiers résultats et 72 heures pour les derniers.


• Recherche d’anticorps antirabiques.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Diagnostic de la rage humaine et animale.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Epidémiosurveillance de la rage des chauves souris (virus EBL1 et EBL2).

RUBIVIRUS

Responsable : Nom : Madame HUTSE V. Hôpital/Laboratoire : ISP – Section Virologie Adresse : Rue Juliette Wytsman 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.56.90 Fax : 02/642.56.92 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum, salive, écouvillon naso-pharyngé (culture virale) milieu de transport, formulaire de demande et kit de prélèvement disponible sur demande : oui au 02/642.56.90

conditionnement à utiliser : triple emballage du prélèvement + étiquette UN3373 sur l’emballage externe.

délai d’envoi maximum : le plus rapidement possible

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n n typage q q étude de résistance q q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q



• Sérologie (IgM et IgG). • Nested-RT-PCR sur frottis naso-pharyngé ou culture virale.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Contrôle et confirmation à la demande des médecins, hôpitaux, etc. • Surveillance et études épidémiologiques dans les groupes représentatifs pour la

population entière et dans les groupes à risque. • Contrôle de qualité.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Validation du test pour la détection des anticorps dans la salive (fin 2007).

SALMONELLA sp.

Responsables : CNRSS : Dr Sc. COLLARD J.M. Typage moléculaire : Dr Sc. BERTRAND S. Hôpital / Laboratoire : I.S.P. - Section de Bactériologie – Centre National de Référence

des Salmonella et Shigella (CNRSS) Adresse : Rue Juliette Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.50.82 – 02/642.52.81 Fax : 02/642.52.40 E-mail : [email protected] / [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : souches d’origine humaine, alimentaire ou de

l’environnement milieu de transport à utiliser : gélose agar nutritive milieu disponible sur demande : oui, au 02/642.50.82 ou au 02/642.50.81 conditionnement à utiliser : double emballage formulaire de demande d'analyse : le formulaire de demande d’analyse est disponible à

l’adresse : http://www.iph.fgov.be/bacterio frais d'envoi : port payé par le destinataire délai d’envoi maximum : aussi rapide que possible

Analyse : Type d’analyses en routine sur demande confirmation du diagnostic n q sérotypage n q étude de résistance (ABR) q n typage moléculaire (PFGE, ABR) q n autres : identification d’une Entérobactérie q n autre que Salmonella Pour les souches d’origine non humaine, facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

Résultats : Délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 2 jours ouvrables si l’analyse

ne demande pas de tests biochimiques complémentaires ou de purification de la souche.


• Détermination du sérotype et rapportage. • Envoi des sérotypes rares et nouveaux pour confirmation à l’Institut Pasteur de Paris. • Rapport annuel disponible à l’adresse : http://www.iph.fgov.be/bacterio • Collection de souches.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • La détermination du sérotypage des souches de Salmonella isolées chez l’homme

mais aussi dans les produits alimentaires permet de suivre l’épidémiologie des Salmonelloses en Belgique.

• Les objectifs de la surveillance épidémiologique sont de: - documenter les fluctuations des principaux sérotypes, - détecter les épidémies, - orienter les mesures de prévention et en évaluer l’impact, - suivre l’antibiorésistance.

• Au niveau de la Communauté Européenne, un réseau de Surveillance des Salmo-nelloses humaines “ENTER-NET”, regroupant les centres de référence de tous les pays, a été mise en place. Il a entre autres pour objectifs,: - la mise en place d’un système de lysotypage commun, - la mise en commun des données épidémiologiques concernant les souches

humaines répertoriées par les centres de référence, - la détection d’épidémies touchant plusieurs pays.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Détermination en collaboration avec l’Institut Pasteur (Bruxelles) du lysotypage pour

les souches isolées d’aliments et de malades lors d’intoxications alimentaires, principalement S. Typhimurium et S. Enteritidis.

• Développement et application des techniques d’analyse moléculaire.

SHIGELLA sp.

Responsables : CNRSS : Dr Sc. COLLARD J.M. Typage moléculaire : Dr Sc. BERTRAND S. Hôpital / Laboratoire : I.S.P. - Section de Bactériologie – Centre National de Référence des Salmonella et Shigella (CNRSS) Adresse : Rue Juliette Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.50.82 – 02/642 52 81 Fax : 02/642.52.40 E-mail : [email protected] / [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : tous les échantillons milieu de transport à utiliser : gélose agar nutritive milieu disponible sur demande : oui, au 02/642.50.82 ou au 642.50.81 conditionnement à utiliser : double emballage formulaire de demande d'analyse : le formulaire de demande d’analyse est disponible à

l’adresse : http://www.iph.fgov.be/bacterio frais d'envoi : port payé par le destinataire délai d’envoi maximum : aussi rapide que possible

Analyse : Type d’analyses en routine sur demande confirmation du diagnostic n q sérotypage n q étude de résistance (ABR) q n typage moléculaire q n autres : identification d’une Entérobactérie autre q n que Shigella Facturation des tests moléculaires

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 2 jours ouvrables


• Détermination du sérotypage. • Rapport annuel. • Collection de souches.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • La détermination du sérotypage des souches de Shigella, ainsi que leur résistance

aux antimicrobiens, permet de suivre l’épidémiologie des Shigelloses en Belgique.

STAPHYLOCOCCUS AUREUS

Responsable : Nom : Prof. Dr STRUELENS M. Hôpital / Laboratoire : Hôpital Erasme - Microbiologie Adresse : Route de Lennik, 808 - 1070 Bruxelles Tél. : 02/555.45.18 Fax : 02/555.31.10 E-mail : [email protected] / [email protected]

Envoi :

adresse : c/o A. Deplano / R. De Ryck type d’échantillons à envoyer : Staphylocoques milieu de transport à utiliser : gélose profonde milieu disponible sur demande : oui, au 02/555.69.71 ou [email protected] conditionnement à utiliser : double emballage (plastique+enveloppe rembourrée) + formulaires d’envoi (téléchargeable de www.mrsa.be) délai d’envoi maximum : < 1 semaine

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande

• Confirmation de l’identification n q • Confirmation de la résistance à l’oxacilline n q • Recherche d’exotoxines (PVL, TSST-1,

exfoliatines) n q

• Typage moléculaire q n • Détermination de la résistance à d’autres

antibiotiques par méthodes phénotypiques (concentration minimale inhibitrice) et génotypiques (détection des gènes de résistance par PCR)

q n


q q

Résultats : préciser si urgent + n° tél., e-mail ou fax délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 10 - 15 jours (sauf urgence) délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : selon l’urgence


• Identification moléculaire et conventionnelle des Staphylocoques. • Diagnostic moléculaire des gènes de résistance (mupirocine, macrolides-licosamides-

streptogramines, aminoglycosides, tétracyclines, quinolones, …). • Typage moléculaire par électrophorèse en champs pulsé (PFGE), séquençage du

gène spa, typage de la cassette SCCmec, Multilocus Sequence Typing (MLST). • Diffusion de recommandations techniques.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance de la prévalence et de la diffusion géographique locale, régionale et

internationale des souches épidémiques de MRSA dans les hôpitaux belges et européens.

• Aide à l’investigation et au contrôle des épidémies hospitalières à MRSA. • Surveillance des MRSA dans les maisons de repos et de soins et la communauté. • Contribution au programme d’évaluation externe de la qualité des laboratoires de

biologie clinique (envoi de souches test + rédaction des commentaires).

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Evolution des phénotypes et génotypes de résistance et activités des antibiotiques, y

compris les nouveaux antibiotiques, sur les MRSA en Belgique; analyse moléculaire des mécanismes de résistance (dissémination horizontale et clonale).

• Mise au point et évaluation des performances de méthodes phénotypiques et moléculaires d’identification, détection de résistance et typage génomique des staphylocoques.

• Standardisation internationale des méthodes de typage moléculaire des MRSA. • Exploration des corrélations entre surveillance épidémiologique multicentrique

(incidence, prévalence), analyse moléculaire (diffusion clonale et virulence), études de consommation d’antibiotiques (statistiques sur l’emploi, la pression et la sélection) et intensité des mesures de prévention (isolement, traitement, ...).

• Evaluation externe de la qualité des Centres de Diagnostic Moléculaire (PCR mecA, typage moléculaire).

STAPHYLOCOCCUS AUREUS (LYSOTYPIE)

Responsable : Nom : Mme WILDEMAUWE C. Hôpital / Laboratoire : ISP – Dpt Institut Pasteur - Lysotypie Adresse : Rue Engeland, 642 - 1180 Bruxelles Tél. : 02/373.32.69/70 Fax : 02/373.31.74 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : Staphylococcus aureus coagulase+ milieu de transport à utiliser : milieu nutritif solide de préférence milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : précautions pour pathogènes; attention à éviter la casse


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic q q typage n q étude de résistance (PCR du gène mecA) q n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 72 h en urgence 30 jours en moyenne délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 2 à 3 semaines


• Surveillance des infections, en particulier par MRSA. • Typage par une gamme de bactériophages. • Des typages complémentaires sont envisageables selon la nécessité. • Le lysotype peut confirmer l’identification de l’espèce et l’attribution de certains

syndromes.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance des infections à S. aureus, en particulier MRSA, dans les hôpitaux ainsi

que dans les maisons de repos et de soins. • Reconnaissance du potentiel épidémique de certaines souches. • Détection de sources de contamination. • Participation aux enquêtes nationales (p.ex. sur MRSA). • Suivi de l’évolution de S. aureus en Belgique comme au niveau international. • Représentation de la Belgique au sein du sous-comité international de lysotypie des

staphylocoques de l’IUMS (International Union of Microbiological Societies).

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Participation à des travaux sur les mécanismes de résistance aux antibiotiques en

fonction du lysotype. • Participation à des travaux de caractérisation de souches à potentiel épidémique ou

pathogène en lien avec le contexte, chez l’homme ou chez l’animal. • Participation à des études de l’évolution des souches au niveau moléculaire.

STREPTOCOCCUS AGALACTIAE

Responsable : Nom : Dr MELIN P. Hôpital / Laboratoire : CHU - Microbiologie Médicale Adresse : Bât. B23 Sart Tilman - 4000 Liège Tél. : 04/366.24.38 Fax : 04/366.24.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : souche isolée d’une infection néonatale souche isolée d’un site profond ou respiratoire, quel

que soit l’âge milieu de transport à utiliser : gélose au sang, tube d’agar, écouvillon avec milieu de

transport (Amies, Stuart) milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : double emballage en postpack ou enveloppe ouatée


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n o Typage n o Etude de résistance o n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

o o



• Confirmation des identifications et détermination des sérotypes. • Détermination des sérotypes des souches envoyées. • Avis consultatif sur : - la qualité des tests rapides disponibles et sur l’opportunité de leur utilisation; - les techniques de cultures à utiliser pour le dépistage prénatnal; • Conseils sur les mesures de prévention des infections néonatales précoces.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance des sérotypes. • Surveillance de l’évolution de la résistance aux antibiotiques. • Détermination et surveillance de l’incidence des infections néonatales, des facteurs

de risque et de la prévalence de la colonisation vaginale chez les parturientes. • Editer des recommandations de prévention des infections néonatales précoces.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Evaluation et développement de tests de diagnostic rapides. • Identification de facteurs, de marqueurs de virulence. • Mise au point de méthodes moléculaires pour la détection de la résistance aux

antibiotiques.

STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE

Responsable : Nom : Prof. Dr VERHAEGEN J. Hôpital / Laboratoire : U.Z. Gasthuisberg - Laboratoriumgeneeskunde (Microbiologie) Adresse : Herestraat, 49 - 3000 Leuven Tél. : 016/34.70.73 Fax : 016/34.79.31 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : pneumocoques isolés de liquides corporels

normalement stériles (à l’exception du pus d’oreille) milieu de transport à utiliser : agar au sang non incubé milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : standard pour l’envoi de boîtes de pétri



q q



• Suivi des différents types de capsules pneumococciques qui sont à la source des infections invasives profondes en Belgique. C’est grâce à la collaboration de plus de 100 laboratoires, pendant des années, que le laboratoire de référence dispose de données fiables quant à la répartition des différents types de capsules, ainsi que d’information sur la sensibilité à la pénicilline, aux céphalosporines de troisième génération, aux macrolides, à la tétracycline et aux fluoroquinolones. Depuis un an nous utilisons aussi le matériel reçu pour des recherches sur le plan de la génétique moléculaire.



STREPTOCOCCUS PYOGENES (GROUPE A)

Responsable : Nom : Prof. Dr GOOSSENS H. Hôpital / Laboratoire : UZ Antwerpen - Labo Microbiologie Adresse : Wilrijkstraat, 10 - 2650 EDEGEM Tél. : 03/821.37.89 Fax : 03/825.42.81 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : souches invasives de S. pyogenes milieu de transport à utiliser : agar milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : postpack


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic q n typage q n étude de résistance q n autres : après concertation : typage M/souches non invasives Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 14 jours


• Rapport individuel par souche après délibération orale avec le laboratoire de référence.

• Rapport annuel.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Répartition clonale des souches virulentes. • Evolution de la résistance antimicrobienne.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Mise au point de méthode d’identification et de techniques de recherche de résistance. • Epidémiologie et résistance en Belgique.

Tick-borne encephalitis virus (TBEV)

Responsable : Nom : Dr VANDENVELDE C. Hôpital / Laboratoire : Hôpital Militaire - Reine Astrid Adresse : Rue Bruyn, 2 - 1120 Bruxelles Tél. : 02/264.40.44 – 02/264.46.80 Fax : 02/264.46.08 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum/sang EDTA et LCR Idéalement deux échantillons à trois semaines

d’intervalle. milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : 4°C (Sérum, sang et LCR)

délai d’envoi maximum : 2 (à 3) jours

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic typage (via RT-PCR) étude de résistance Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande



• Dosage des IgM et des IgG par ELISA • Détection d’acide nucléique spécifique dans le sérum et le LCR par RT-PCR (cette

analyse n’est utile que dans la phase virémique, c.-à-d. de 1 à 4 jours après le début des symptômes)

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Mise sur carte, avec la collaboration de l’ISP, des cas séropositifs sur base des codes

postaux. • Réalisation d’un “registre clinique” sur base des données cliniques avec la

collaboration de quelques laboratoires importants. • Suivi des cas cliniques particuliers. • Surveillance dans le cadre du projet ‘Emerging threats’.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Publication de cas cliniques particuliers. • Organisation de captures de tiques pour analyse par RT-PCR. • Séquençage des souches trouvées.

TOXOPLASMA

Responsable : Nom : Dr NAESSENS A. Hôpital / Laboratoire : UZ Brussel - Microbiologie Adresse : Laarbeeklaan, 101 - 1090 Bruxelles Tél. : 02/477.50.00 Fax : 02/477.50.15 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : liquide amniotique, LCR, liquide oculaire milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : tubes, double emballage délai d’envoi maximum : 1 jour

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation de l’identification typage par PFGE typage des facteurs de virulence (toxine pertussis, pertactine, facteur de colonisation trachéal)

étude de résistance autre recherche : PCR sur des échantillons cliniques, cfr site web CDM : http://cmd-www.uia.ac.be/cmd/


Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : max. 1 semaine délai pour recevoir le résultat d’une analyse PCR sur demande : prendre contact si demandes urgentes


• Diagnostic de toxoplasmose congénitale, oculaire, ou cérébrale.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Suivi de la fréquence des complications de toxoplasmose.


TOXOPLASMA

Responsable : Nom : Ir DE CRAEYE S. Hôpital / Laboratoire : ISP – Dpt Institut Pasteur - Toxoplasmose Adresse : 642 Rue Engeland – 1180 Bruxelles Tél. : 02/373.32.03 Fax : 02/373.32.78 E-mail : [email protected]

Type d’analyse :

Sérologie (Sabin-Feldman, fixation du complément, Capture IgM EIA et Capture IgA EIA) : sérum/plasma

Inoculation chez les souris : placenta, sang ombilical total/nouveau-né, LCR, biopsies des ganglions ou autre, liquide amniotique, sang fœtal (et autre à la demande)

PCR : placenta, sang ombilical total/nouveau-né, LCR, biopsies des ganglions ou autre, liquide amniotique, sang fœtal (et autre à la demande)

Conservation et envoi : - envoyer les échantillons endéans les 24 heures après la prise de l’échantillon - ne pas utiliser de conservateurs ni de fixateurs - ne pas congeler les échantillons - conserver temporairement à 4°C - envoyer par courrier express ou par service express

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande sérologie n q inoculation de souris n q PCR n q Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

n q

Résultats : délai - sérologie : 1 semaine - test d’inoculation : 6 à 8 semaines - PCR : 1 semaine


Services envers les Laboratoires : • Diagnostic sérologique en cas de doute ou de soupçon d’une infection aiguë ou en

cas de risque d’une affection congénitale. • Isolement du parasite par inoculation de souris pour adapter le traitement. • Détection directe du parasite dans des échantillons cliniques par PCR; toujours

pratiquée en parallèle avec l’inoculation, sur le même échantillon.

VIBRIO CHOLERAE : version 2002

Responsable : Nom : Pr. DE MOL P. Hôpital / Laboratoire : C.H.U. de Liège B23 - Microbiologie Médicale Adresse : Domaine du Sart-Tilman - 4000 Liège 1 Tél. : 04/366.24.39 Fax : 04/366.24.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toute suspicion de V. cholerae milieu de transport à utiliser : gélose ordinaire milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : /


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n o typage n o étude de résistance n o Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

o o



• Confirmation, typage et étude de la résistance de V. cholerae.



VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS : version 2002

Responsable : Nom : Pr. DE MOL P. Hôpital / Laboratoire : C.H.U. de Liège B23 - Microbiologie Médicale Adresse : Domaine du Sart-Tilman - 4000 Liège 1 Tél. : 04/366.24.39 Fax : 04/366.24.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toute suspicion de V. parahaemolyticus milieu de transport à utiliser : gélose ordinaire milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : /


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n o typage o o étude de résistance n o Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

o o



• Confirmation et étude de la sensibilité de V. parahaemolyticus.



WEST NILE VIRUS

Responsable : Nom : Dr M. VAN ESBROECK

Hôpital / Laboratoire : I.T.G. - Klinische Biologie Adresse : Kronenburgstraat 43/3 - 2000 Antwerpen Tél. : 03/247.64.07 (08)

Fax : 03/247.64.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum (Idéalement deux échantillons à trois semaines d’intervalle et le premier échantillon au cours de la semaine qui suit le début des symptômes) milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : /



Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : max. 10 jours ouvrables


• Poser un diagnostic par détection des IgM et des IgG (ELISA)

Objectifs en termes de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance des infections humaines à virus West Nile. • Surveillance des infections humaines à West Nile Virus attrapées en Belgique (projets

‘Emerging threats’ et European Network for Diagnostics of ‘Imported’ Viral diseases - ENIVD).


WEST NILE VIRUS

Responsable : Noms : Ir. GERARD C./Dr Vét. THOMAS I.

Hôpital / Laboratoire : ISP - Section Virologie Adresse : Rue Juliette Wytsman, 14 - 1050 Bruxelles Tél. : 02/642.55.48 ou 50.74

Fax : 02/642.56.92 E-mail : [email protected]/[email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : sérum, LCR (idéalement 1 ml, minimum 500 μl), plasma,sang EDTA (Idéalement deux échantillons à trois semaines d’intervalle et le premier échantillon au cours de la semaine qui suit le début des symptômes et max. 7 jours après) milieu de transport à utiliser : / milieu disponible sur demande : / conditionnement à utiliser : Envoi à 4°C

délai d’envoi maximum : Endéans les 7 jours qui suivent l’apparition des symptômes

Analyse : Type d’analyse en routine sur demande diagnostic confirmation du diagnostic

Typage étude de résistance Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse de routine : 48 heures


• Détection des IgM dans le sang ou le LCR par ELISA • Confirmation du diagnostic par détection de l’acide nucléique dans le sang ou le LCR

par PCR.

Objectifs en termes de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Surveillance des infections humaines à virus West Nile. • Surveillance des infections humaines à West Nile Virus non importées en Belgique

(projet ‘Emerging threats’). • Contrôle de la sécurité du sang et dérivés.


YERSINIA ENTEROCOLITICA

Responsable : Nom : Prof. WAUTERS G. Hôpital / Laboratoire : U.C.L. 5490 - Microbiologie Adresse : Avenue Hippocrate, 54 - 1200 Bruxelles Tél. : 02/764.54.90 Fax : 02/764.94.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toutes les souches isolées milieu de transport à utiliser : gélose milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : tube


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage n q étude de résistance q n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q



• Confirmation biochimique de l’identification. • Détermination du biotype, du sérotype. • Recherche de marqueurs de virulence.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Incidence des infections à Y. enterocolitica en Belgique. • Formes cliniques de l’infection (entérites, septicémies, ...). • Evolution de la distribution des bio-sérotypes.

Buts précis en terme de Recherche et Développement : • Relation entre les infections humaines et les réservoirs possibles (animaux, aliments,

...).

YERSINIA ENTEROCOLITICA

Responsable : Nom : Prof. Dr VERHAEGEN J. Hôpital / Laboratoire : U.Z. Gasthuisberg-Laboratoriumgeneeskunde Adresse : Herestraat, 49 - 3000 Leuven Tél. : 016/34.70.73 Fax : 016/34.79.31 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : chaque souche de Yersinia, quelle qu’en soit l’origine milieu de transport à utiliser : milieu agar milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : standard



q q



• En collaboration avec les autres laboratoires de référence, typage des souches de Yersinia envoyées.

P.S. : Il n’est pas nécessaire de rédiger un formulaire spécifique pour Yersinia pseudotuberculosis.



YERSINIA PESTIS

Responsable : Nom : Dr WATTIAU P. Hôpital / Laboratoire : CODA-CERVA - Bactériologie Adresse : Groeselenberg 99 – 1180 Bruxelles Tél. : 02/379.04.41 Fax : 02/379.06.70 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : souche pure vivante ou lyophilisée, échantillons

suspects, tissus biologiques infectés milieu de transport à utiliser : solide ou semi-solide milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : biocontainer pour microorg. de classe de risque 3 ou triple emballage cfr. instructions IATA 602 température ambiante (min 0°C max 40°C)

délai d’envoi maximum : max 2 semaines


Résultats : délai pour recevoir le résultat d’une analyse sur demande : 48 heures


• Confirmation du diagnostic par méthode biochimique et PCR.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Identification de cas de peste humaine. • Surveillance des vecteurs de transmission + réservoirs animaux. • Détection des agents du Bioterrorisme (colis suspects, poudres, ...).


YERSINIA PSEUDOTUBERCULOSIS

Responsable : Nom : Prof. WAUTERS G. Hôpital / Laboratoire : U.C.L. 5490 - Microbiologie Adresse : Avenue Hippocrate, 54 - 1200 Bruxelles Tél. : 02/764.54.90 Fax : 02/764.94.40 E-mail : [email protected]

Envoi : type d’échantillons à envoyer : toutes les souches isolées milieu de transport à utiliser : gélose milieu disponible sur demande : non conditionnement à utiliser : tube


Analyse : Type d’analyse en routine sur demande confirmation du diagnostic n q typage n q étude de résistance q n Facturation des tests au laboratoire qui fait la demande

q q



• Confirmation biochimique de l’identification. • Détermination du sérotype.

Objectifs en terme de Surveillance Epidémiologique et de Santé Publique : • Incidence des infections à Y. pseudotuberculosis en Belgique. • Formes cliniques de l’infection. • Evolution de la distribution des sérotypes.


Documents

Laboratoires de Reference - Sciensano · 2013-07-02 · Avant-propos Ce document, à caractère informatif, présente par germe, dans l’ordre alpha- bétique, une fiche d’identification