Beberapa enzim hanya terdiri dari polipeptida dan tidak mengandung gugus kimiawi selain residu asam amino; contohnya adalah ribonuklease pancreas. Akan tetapi, enzim lain, memerlukan tambahan komponen kimia bagi aktivitasnya; komponen ini disebut kofaktor. Kofaktor mungkin suatu molekul anorganik seperti ion Fe2+,. Mn2+, atau Zn2+, atau mungkin juga suatu molekul organic kompleks yang diebut koenzim. Beberapa enzim membutuhkan baik koenzim maupun satu atau lebih ion logam bagi aktivitasnya. Pada beberapa enzim, koenzim atau ion logam hanya terikat secara lemah atau dalam waktu sementara pada protein, tetapi, pada enzim lain, senyawa ini terikat kuat, atau terikat secara permanen dalam hal ini disebut gugus prostetik. Enzim yang strukturnya sempurna dan aktif mengkatalisis, bersama-sama dengan koenzim atau gugus logamnya disebut haloenzim. Koenzim dan ion logam bersifat stabil sewaktu pemanasan, sedangkan bagian protein enzim, yang disebut apoenzim, terdenaturasi oleh pemanasan.Beberapa enzim mengandung atau memerlukan unsure anorganik esensial sebagai kofaktorFe2+ atau Fe3+

Cu2+Zn2+

Mg2+

Mn2+K+

Ni2+MoSeOksidase sitokromKatalasePeroksidaseOksidase sitokromPolymerase DNAAnhidrase karbonikDehidrogenase alcoholHeksokinase6-fosfatase glukosaArginaseKinase piruvat(juga memerlukan Mg2+)UreaseReduktase nitratPeroksidase glutation

Enzim digolongkan berdasarkan reaksi yang dikatalisisKebanyakan enzim mengkatalisis pemindahan elektron, atom, atau gugus fungsional. Oleh karena itu. Enzim diklasifikasikan, diberikan nomor kode/sandi dan ditentukan namanya menurut jenis reaksi pemindahan gugus pemberi, dan gugus penerima. Terdapat enam kelas utama.noKelasJenis reaksi yang dikatalisa

1.OksidoreduktaseTransferaseHidrolaseLiaseIsomeraseligasePemindahan elektronReaksi pemindahan gugus fungsionilReaksi hidrolisis (pemindahan gugus fungsional ke air)Penambahan gugus ke ikatan ganda atau sebaliknyaPemindahan gugus di dalam molekul, menghasilkan bentuk isomerPembentukan ikatan C-C, C-S, C-O dan C-N oleh reaksi kondensasi yang berkaitan dengan penguraian ATP