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Lordine degli esoni è lo stesso nel genoma e negli mRNA Gli introni dei geni nucleari hanno codoni di terminazione in tutti gli schemi di lettura

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•L’ordine degli esoni è lo stesso nel genoma e negli mRNA

•Gli introni dei geni nucleari hanno codoni di terminazione in tutti gli schemi di lettura

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•Gli introni possono essere presenti in tutti i tipi di geni (pre-mRNA, tRNA, rRNA)

•Negli mRNA gli esoni terminali contengono regioni non tradotte (5’ e 3’ UTR)

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•Lievito: lunghezza dei geni simile alla lunghezza dei messaggeri

•Mammiferi: lunghezza dei geni circa 5 volte quella degli mRNA

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Introni

•Assenti nei procarioti (qualche eccezione)

•Pochi negli archeobatteri e nei lieviti

•Molti negli eucarioti complessi

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Origine degli introni

•Antica: gli introni sono stati eliminati in alcuni genomi

•Moderna: gli introni si sono inseriti in alcuni genomi

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La teoria esonica dei geni

I brevi geni dei primi genomi probabilmente codificavano proteine a singolo dominio che, per produrre un enzima attivo, dovevano associarsi formando proteine a molte subunità. Più tardi la sintesi di questo enzima può essere stata resa più efficiente dall’unione dei brevi geni, a formare un gene discontinuo codificante una singola subunità proteica con molti domini.

Piccoli geni

Genomaprimordiale

Singola subunità proteicacon molti domini

Singolo gene discontinuo

Proteina con molte subunità

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Ruolo degli introni nell’evoluzione

(teoria del “mescolamento degli esoni”)

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Moduli a “dito”

FN (Fibronectina)

Struttura ‘Kringle’

UK (Plasminogeno)

TPA(Attivatore del plasminogeno)

EGF (Fattore di crescita epidermico)

Domini da fattore di crescita

La struttura modulare della proteina “attivatore tissutale del plasminogeno”

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precursore del fattoredi crescita epidermico

recettore dellalipoproteina a bassa densità

FN

C9

EGFP

LDLR

fibronectina

componente 9del complemento

TPAattivatore delplasminogeno

UKurokinasi

FXfattore X dellacoagulazione del sangue

Struttura modulare delle proteine

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Capacità codificante dei geni eucariotici

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DNA

Ghiandole salivari

proteina

pre-mRNA

mRNA

Fegato mRNA

proteina

pre-mRNA

Il gene per la -amilasi

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Pre-mRNAtrascritto primario

Muscolo striato

Muscolo liscio

TMBr-1 di cervello

TMBr-2 di cervello

TMBr-3 di cervello

TMBr-2 di fibroblasti

TMBr-3 di fibroblasti

TMBr-5a di fibroblasti

TMBr-5b di fibroblasti

Il gene per la -tropomiosina

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Le diverse isoforme di mRNA possono variare:

•nella parte codificante•nella parte non tradotta