Upload
lamar
View
53
Download
0
Embed Size (px)
DESCRIPTION
Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności spotkanie sprawozdawcze Warszawa 15.XII.2007 CENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓW „ColIBB” INSTYTUT BIOCHEMII I BIOFIZYKI PAN Pawińskiego 5A, 02-106 Warszawa. mgr inż. Karolina Makieła dr hab. Piotr Jonczyk. 2000 r - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
mgr inż. Karolina Makiełamgr inż. Karolina Makieła
dr hab. Piotr Jonczykdr hab. Piotr Jonczyk
Krajowa Sieć Informacji o Krajowa Sieć Informacji o Bioróżnorodności Bioróżnorodności
spotkanie sprawozdawczespotkanie sprawozdawczeWarszawa 15.XII.2007Warszawa 15.XII.2007
CENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓWCENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓW „ColIBB” „ColIBB”
INSTYTUT BIOCHEMII I BIOFIZYKI PAN INSTYTUT BIOCHEMII I BIOFIZYKI PAN
Pawińskiego 5A, 02-106 WarszawaPawińskiego 5A, 02-106 Warszawa
http://kolekcja.ibb.waw.pl/
•2000 r
•Zbiór unikalnych szczepów skonstruowanych przez pracowników i studentów IBB
•Źródło informacji
KSIB - ColIBB
Zakup materiałów niezbędnych do deponowania i przechowywania szczepów bakteryjnych i drożdżowych: raków, pudełek i fiolek kriogenicznych, także sprzętu komputerowego, zasilacza UPS
Informatyk, opiekun kolekcji
6200
6400
6600
6800
7000
7200
7400
7600
7800
2005 2006 2007
liczbarekordów
CENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓWIBB PAN „ColIBB”
KOLEKCJA SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH2605 REKORDY (311 w przygotowaniu)
KOLEKCJA SZCZEPÓW DROŻDŻOWYCH 3422 REKORDY(178 w przygotowaniu)
KOLEKCJA PLAZMIDÓW1624 REKORDY(495 w przygotowaniu)
KOLEKCJA BAKTERIOFAGÓW
IZOLATY ŚRODOWISKOWE(300 rekordów w przygotowaniu)
CENTRALNA KOLEKCJA SZCZEPÓWIBB PAN „ColIBB”
Euroscarf
KOLEKCJA SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH
ZBIÓR MUTANTÓW W GENACH ZAANGAŻOWANYCH W SZEREG PROCESÓW KOMÓRKOWYCH
replikacja DNA metabolizm komórkowy np. metabolizm siarkowy segregacja chromosomów w bakteriach G+ G-
segregacja plazmidów
ZBIÓR SZCZEPÓW WYKORZYSTYWANYCH DO KONSTRUKCJI SZEREGU MUTANTÓW I MAPOWANIA MUTACJI
kolekcja szczepów niosących transpozony w różnych miejscach na chromosomie
KOLEKCJA SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH
SZCZEPY STOSOWANE W PRODUKCJI PREPARATÓW SZCZEPY STOSOWANE W PRODUKCJI PREPARATÓW FARMACEUTYCZNYCHFARMACEUTYCZNYCH Lactobacillus rhamnosusLactobacillus rhamnosus , , Streptococcus equisimilisStreptococcus equisimilis
ZBIÓR SZCZEPÓW BAKTERII MLEKOWYCHZBIÓR SZCZEPÓW BAKTERII MLEKOWYCH
LABORATORYJNE SZCZEPY BAKTERII PATOGENNYCH LABORATORYJNE SZCZEPY BAKTERII PATOGENNYCH Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus
ZBIÓR SZCZEPÓW – LIZOGENÓW BAKTERIOFAGÓW P1, P7, ZBIÓR SZCZEPÓW – LIZOGENÓW BAKTERIOFAGÓW P1, P7, LambdaLambda
Bacillus subtilis ok.100
Bifidobacterium longum Enterococcus faecalis
Escherichia coli ok.1000
Lactobacillus sp.Lactobacillus casei Lactobacillus paracaseiLactobacillus plantarumLactobacillus rhamnosus
Lactococcus cremoris Lactococcus garvieae Lactococcus hordniae Lactococcus lactis ok.1000 Lactococcus raffinolactis Salmonella typhimurium
Staphylococcus aureus
Streptococcus agalactiae Streptococcus bovisStreptococcus equisimilisStreptococcus thermophilus
KOLEKCJA SZCZEPÓW DROŻDŻOWYCH
ZBIÓR MUTANTÓW W GENACH ZAANGAŻOWANYCH W SZEREG PROCESÓW KOMÓRKOWYCH replikacja DNA naprawa DNA segregacja chromosomów w komórkach drożdżowych transport wewnątrzkomórkowy regulacja transkrypcji cytoplazmatycznej (POL III RNA) translacja mitochondrialna inne
KOLEKCJA PLAZMIDÓW
PLAZMIDY NIOSĄCE SKLONOWANE GENY, SŁUŻĄCE DO BADANIA RÓŻNYCH PROCESÓW KOMÓRKOWYCH replikacja DNA naprawa DNA segregacja plazmidów transport wewnątrzkomórkowy segregacja chromosomów (Pseudomonas aeruginosa)
PLAZMIDY NIOSĄCE FRAGMENTY GENOMÓW BAKTERIOFAGÓW P1 I P7
PLAZMIDY NIOSĄCE FRAGMENTY PLAZMIDÓW KLINICZNYCHO SZEROKIM SPECTRUM OPORNOŚCI
WEKTORY LINIOWE WEKTORY EKSPRESYJNE
KOLEKCJA IZOLATÓW
ŚRODOWISKOWYCH
Izolaty z terenów skażonych z okolic kopalni: Złoty StokZłoty Stok, Szklary, Olkusz
Grupa bakterii opornych na wysokie stężenia Arsenu – izolowane z terenów kopalni (woda, skały, osady) – tworzą maty i biofilmy
Grzyby – izolowane z nieczynnej kopalni Złoty Stok
Konieczność dokumentacji fotograficznej
KOLEKCJA BAKTERIOFAGÓW
Unikalna kolekcja bakteriofagów bakterii mlekowych, enterobakterii i gronkowców
Badania nad genomiką i biologią fagów umożliwią wykorzystanie ich potencjału bakteriotoksycznego i przemysłowego
Wymagająca nowych rozwiązań deponowania i przechowywania
W PLANACH Przebudowa bazy danych usprawniająca
wprowadzanie i wyszukiwanie danych Współtworzenie sieci informacji o
referencyjnych szczepach bakteriofagowych oraz bakteriofagach
Rozbudowa bazy danych dotyczących Bakteriofagów (współpraca z Siecią Biologii i Biotechnologii Bakteriofagów) oraz Izolatów Środowiskowych
Zakup niezbędnych materiałów do deponowania bakteriofagów oraz liofilizacji i dokumentacji fotograficznej izolatów środowiskowych
Dostosowanie formatu bazy danych ColIBB do standardów międzynarodowych
Dziękuję za uwagę