Microbiota normal de la boca y vas respiratorias superioresLas mucosas de la boca suelen ser estriles en el momento del nacimiento, aunque pueden contaminarse en el paso por el conducto vaginal.

La flora bacteriana de la boca se caracteriza por su gran variabilidad.De 4 a 12 horas despus del nacimiento, se establecen los estreptococos viridans, como miembros ms prominentes de la flora residente, permaneciendo toda la vida. Se van aadiendo estafilococos aerobios y anaerobios, diplococos (Neissuia), difteroides y ocasionalmente lactobacilos.Cuando comienza la denticin se establecen espiroqueta, bacteroides, fusobacterias y algunos vibriones y lactobacilos.Las levaduras (Candida) se encuentran tambin en la boca y otros tipos de hongos.Estos microorganismos u distribuyen buscando las condiciones ms apropiadas para su desarrollo. As los estreptococos facultativos y las veillonellas se constituyen la mayoria en la saliva, que representa prcticamente el dorso de la lengua.En la placa y el dorso gingival, las proporciones de diheroides y bacilos anaerobios gramnegativos aumentan. Las neisserias estn presentes de forma regular. Los lacto-bacilos, estafilococos d y formas filamentosas estn en igual proporcin, y las espiroquetas y bacteroides aparecen, sobre todo, en el surco gingival.Aparato respiratorio nariz:flora formada por estafilococos y difteroidesfaringe:se encuentran basicamente estrepococos y diplococos.tambien aparecen especies patogenas como haemophilus influenzae y streptococcus pneumoniae traquea ,bronquios : se consideran esteriles

Microbiota normal del intestino.

Estomago : se considera esteril

intestino: sus rimeras porciones se consideran esteriles pero en el intestino grueso hay presencia de microorganismos . Abundan enterococos ,estafilococos ,lactobacilos ,bacilo coli . Entre los hongos aparece candida , aspergillus , penicillium .