Upload
eugene
View
42
Download
2
Embed Size (px)
DESCRIPTION
- PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
Każda cząsteczka mRNA ( messenger RNA, informacyjny RNA ) organizmów eukariotycznych i większości wirusów posiada na swoim końcu 5’nietypową strukturę zwaną kapem. Składa się ona z 7-metyloguanozyny połączonej wiązaniem 5’, 5’ – trifosforanowym z kolejnym nukleozydem, co jest zapisywane skrótowo jako MMG-kap (monometyloguanozyno kap ). Główną funkcją pełnioną przez kap jest jego udział w procesie inicjacji translacji. Cząsteczka mRNA zostaje wprowadzona do maszynerii translacyjnej poprzez oddziaływanie jej struktury kapu z białkowym faktorem inicjującym eIF4E. Oddziaływanie to jest etapem limitującym szybkość całego procesu biosyntezy białka.
NPE - 2-(4-nitrophenyl)ethanolDBU - 1,8-
diazabicyclo[5.4.0]undec-7-eneDIAD - diisopropyl azodicarboxylate
O
N
N
NH
N
NH2
AcO
OAc
OAc
O
O
AcO
AcO
OAc
N
N
NH
N
ONPENH2
O
OHOH
OH
N
N
N
N
N
CH3
H3CONPE
O
OHOH
OH
N
N
NH
N
ON
CH3
H3C 1. NaNO2, HBF4
O
OHOH
OH
N
N
NH
N
NH2 O
DBU
Ac2O, pirydyna, DMF PPh3, NPE, DIAD
toluen
2. (CH3)2NH
Cel pracy magisterskiej :
opracowanie i zoptymalizowanie drogi syntetycznej prowadzącej do otrzymania N2,N2 dimetyloguanozyny optymalizacja warunków reakcji fosforylacji metodą Yoshikawy otrzymanie pięciu mononukleotydowych analogów TMG kapu zawierających w pozycji N7 dimetyloguanozyny różne podstawniki alkilowe (etylowy, n-propylowy, izopropylowy, n-butylowy oraz izobutylowy)
Mechanizm wiązania MMG kapu z faktorem eIF4E został rozszyfrowany dzięki wieloletnim badaniom, w których wykorzystano całą gamę chemicznie zmodyfikowanych analogów kapu. U nicieni znaczna część cząsteczek mRNA posiada na swoim końcu 5’ zamiast MMG kapu jego formę hipermetylowaną tzw. TMG kap (trimetyloguanozyno kap), zawierającą 7-metyloguanozynę z dwiema dodatkowymi grupami metylowymi w pozycji N2. W organizmach tych wykryto, obok białka oddziałującego z MMG kapem, izoformy faktora eIF4E, które wiążą zarówno MMG jak i TMG kap. Do tej pory nie udało się niestety ustalić jak wygląda molekularny mechanizm oddziaływania tych białek z TMG kapem. Niewątpliwie, tak jak w przypadku badań nad oddziaływaniem eIF4E z MMG kapem, pomocne byłyby badania z wykorzystaniem różnie zmodyfikowanych analogów TMG kapu. Substratem wyjściowym do syntezy takich związków jest N2,N2-dimetyloguanozyna (m2
2,2Guo), której otrzymywanie stwarza od lat problemy chemikom.
Synteza N2,N2 dimetyloguanozyny
Synteza N7 alkilopochodnych monofosforanu N2,N2 dimetyloguanozyny
Uzyskane przeze mnie analogi mają w przyszłości posłużyć jako narzędzie do badań prowadzących do uzyskania odpowiedzi, czy i w jaki sposób, wielkość oraz rozgałęzienie podstawnika alkilowego w pozycji N7 dimetyloguanozyny wpływa na specyficzność oddziaływań struktury końca 5’ mRNA z białkami rozpoznającymi kap.
jodek alkilu ( RI )
czas reakcji / temp.
wydajność
jodek etylu 20h / RT 57%
1-jodopropan 26h / RT 45%
2-jodopropan 24h / 60oC 40%
1-jodobutan 48h / 60oC 30%
2-jodobutan 48h / 60oC 18%
O
OHOH
OH
N
N
NH
N
ONCH3
CH3
(CH3O)3PO , POCl3
O
OP
O
O-OH
OH
N
N
NH
N
N
CH3
CH3
O
O-
Synteza 5’monofosforanu N2, N2-dimetyloguanozyny
O
OP
O
O-
OH
OH
N
N
NH
N
N
CH3
CH3O
O-
O
OP
O
O-
OH
OH
N
N+
NH
N
N
CH3
CH3O
O-
R
DMSO , RI
Syntezę N2,N2 dimetyloguanozyny przeprowadziłam wprowadzając grupę aminodimetylową w pozycję N2 układu purynowego drogą substytucji nukleofilowej. Do zabezpieczenia pozycji O6 guanozyny wykorzystałam reakcję Mitsunobu. Wielką zaletą tej reakcji jest jej uniwersalność i możliwość stosowania łagodnych warunków. Niestety, podobnie jak inni, napotykałam problemy z wyodrębnieniem produktu finalnego z mieszniny reakcyjnej.
W celu wprowadzenia grupy fosforanowej w pozycję 5’ m22,2Guo zastosowałam metodę
fosforylacji przy użyciu trichlorku tlenku fosforu w fosforanie trimetylu. Manipulując czynnikiem temperaturowym oraz czasem prowadzenia reakcji udało mi się doprowadzić do osiągnięcia prawie 100% wydajności tej reakcji.