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日本語で PubMed 検索 PubMed.JP 操作マニュアル Ver1.0.7 世界最大級の医学生物学文献データベース PubMed(パブメド)を日本語で 検索できる Windows アプリケーション。 「日本語で PubMed 検索 PubMed.JP」がついに登場! トラストメディカル株式会社

日本語で PubMed 検索“作マニュアル_1.07.pdf日本語でPubMed 検索(PubMed.JP)操作マニュアル 6 3. 使い方 3.1. 先ず検索してみましょう 探したい文献のキーワードを【検索語】エリアに入力して「Enter」キーを押すか【文献総数

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日本語で PubMed 検索

PubMed.JP 操作マニュアル Ver1.0.7

世界最大級の医学生物学文献データベース PubMed(パブメド)を日本語で

検索できる Windows アプリケーション。 「日本語で PubMed 検索 PubMed.JP」がついに登場!

トラストメディカル株式会社

日本語で PubMed 検索(PubMed.JP)操作マニュアル

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目次

1. はじめに............................................................................................................................. 3 1.1. 概要 ............................................................................................................................ 3 1.2. 主な機能 ..................................................................................................................... 3 1.3. 動作環境 ..................................................................................................................... 3

2. 準備 .................................................................................................................................... 4 2.1. インストール .............................................................................................................. 4 2.2. 起動 ............................................................................................................................ 4 2.3. シリアル番号の入力 ................................................................................................... 5 2.4. 終了 ............................................................................................................................ 5 2.5. アンインストール....................................................................................................... 5

3. 使い方 ................................................................................................................................ 6 3.1. 先ず検索してみましょう............................................................................................ 6 3.2. 検索結果を PubMed で確認する................................................................................ 6 3.3. 辞書展開語毎のヒット件数を確認する ...................................................................... 9 3.4. 辞書展開語を複数指定した検索 ................................................................................. 9 3.5. その他検索オプションの指定................................................................................... 10

3.5.1. 検索方法............................................................................................................ 10 3.5.2. 発行年 ............................................................................................................... 11 3.5.3. 日本語文献 ........................................................................................................ 12 3.5.4. フリーフルテキスト ......................................................................................... 12

3.6. 検索語の履歴 ............................................................................................................ 12 3.7. 検索の履歴表示 ........................................................................................................ 14 3.8. 標題一覧ウインドウの表示 ...................................................................................... 15 3.9. 標題一覧ウインドウの更新 ...................................................................................... 16 3.10. 該当文献の表示 .................................................................................................... 16 3.11. 表題一覧の活用 .................................................................................................... 17

日本語で PubMed 検索に関するお問い合わせは下記までお願いします。

ホームページ:http://pubmed.web.fc2.com/index.html

メール:[email protected]

日本語で PubMed 検索(PubMed.JP)操作マニュアル

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1. はじめに

1.1. 概要

日本語で PubMed 検索 PubMed.JP は、PubMed(アメリカ国立医学図書館の国立生物工学

情報センター:NCBI が運営する無料の文献検索サービス)を日本語キーワードで検索する文献

検索プログラムです。PubMed に掲載されている文献情報(書誌情報や抄録)は全て英語で書

かれており、文献を検索する為には英語のキーワードを指定する必要があります。しかし専門性

が高く日々変化する医薬用語を的確に翻訳する事は非常に困難な作業で、世界最大級の文献デー

タベースが十分生かされていないのが日本の現状と言えます。このような問題を解決するために

生まれたのが、日本語で PubMed 検索(PubMed.JP)です。

PubMed.JP には医薬用同義語辞書が搭載されており、入力した用語を自動的に翻訳して

PubMed を検索してくれます。PubMed.JP により、今まで他のツールで翻訳していた煩わしい

作業が不要になり、誰でも簡単に文献検索ができるようになります。更に、PubMed.JP の同義

語展開機能により、一度の検索で複数の同義語による検索が可能となり、より網羅性が高く漏れ

の少ない検索結果が得られます。また、発行年指定、日本語文献指定、フリーフルテキストの有

無等、PubMed でよく使われる検索オプションを PubMed.JP の画面から指定することで、検索

結果を絞り込むことができます。

1.2. 主な機能

入力した用語を日本語から英語へ翻訳、更に同義語展開して PubMed を検索します。

すべての展開語を OR 演算したヒット件数と、展開語毎のヒット件数を表示します。

検索結果のタイトル一覧を PubMed.JP のウインドウに表示します。

検索結果を PubMed の Web 画面で見ることができます。

複数のキーワードを指定すると同義語展開結果に対する AND 検索を行います。

フリーワード検索、フレーズ検索、タイトル内検索を選択できます。

文献の発行年を指定して絞り込むことができます。

日本語文献、フリーフルテキスト付文献に絞り込むことができます。

文献標題一覧を Excel へコピーやファイルへエクスポートすることができます。

1.3. 動作環境

動作 OS:WindowsXP SP3、WindowsVista SP2(32/64bit)、Windows7(32/64bit)

インターネット接続環境を有すること

.NET Framework2.0 以上がインストールされていること

(.NET Framework の入手先)

http://www.microsoft.com/downloads/details.aspx?familyid=0856eacb-4362-4b0d-8edd-aab15c5e04f5&displaylang=ja

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2. 準備

2.1. インストール

圧縮ファイルを解凍すると「PubMed.JP」と言うフォルダができますので、任意の場所にコ

ピーしてください。

2.2. 起動

PubMedJP.exe をダブルクリックして起動します。

操作の詳細はウインドウ上部の【情報表示】ボタンをクリックしてオンラインマニュアルを参

照してください。

情報表示ボタン

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2.3. シリアル番号の入力

PURIN を起動して初めて文献を検索するとシリアル番号入力画面が表示されます。

① 既にシリアル番号をお持ちの方は10桁のシリアル番号を入力して「次へ」ボタンを押

してください。

② まだシリアル番号をお持ちでない場合「後で入力する」ボタンを押して下さい。

注:シリアル番号と有効期限、及びシリアル番号の入手方法に関しては、ウインドウ上部の【情

報表示】ボタンを押すと確認できます。

2.4. 終了

ウインドウ上部右にある×印の部分をクリックしてください。

2.5. アンインストール

インストール時作成した「PubMed.JP」と言うフォルダを削除してください。

シリアル番号

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3. 使い方

3.1. 先ず検索してみましょう

探したい文献のキーワードを【検索語】エリアに入力して「Enter」キーを押すか【文献総数

検索】ボタンを押すと、キーワードを翻訳し更に同義語展開し PubMed を検索します。検索し

た結果は【PubMed 検索結果】に辞書展開結果とヒットした文献数が表示されます。なおキー

ワードをスペースで区切り複数指定すると AND 検索になります。

注:入力したキーワードが翻訳できない場合ウインドウ下部に【英語に翻訳できませんでした】

と表示されます。その場合には他の用語を入力するか、英単語を入力し再検索して下さい。

3.2. 検索結果を PubMed で確認する

検索した結果を PubMed で確認する為には、【PubMed 検索結果】に表示された検索結果を

ダブルクリックしてください。Web ブラウザが起動され PubMed の検索結果一覧画面が表示さ

れます。なお起動されるブラウザは Windows 規定の Web ブラウザとなります。

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注:PURIN に表示されているヒット件数と PubMed でのヒット件数が異なる場合があります。 ヒント:PubMed.JP から Web ブラウザ経由で PubMed を表示すると、PubMed に検索履歴が

残ります。更に高度な検索が必要な場合 PubMed の画面で引き続き検索することができます。

【Limits】絞込み検索ができます。

【Advanced search】検索履歴表示と履歴同士の演算ができます。

ヒント:検索結果を日本語に翻訳したい場合、Web ブラウザの機能を使い検索結果一覧等

を翻訳することができます。なお、機械翻訳ですので正しく翻訳されない場合があります。

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注:ブラウザの設定によっては「Live Search で翻訳」と表示される場合があります。

注:あらかじめ FoxLingo アドオンをインストールしておいてください。

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3.3. 辞書展開語毎のヒット件数を確認する

辞書展開語毎のヒット件数を確認する場合、キーワードが入力された状態で【キーワード別一

覧】ボタンを押してください。【PubMed 検索結果】に辞書展開した用語毎のヒット件数が表

示されます。表示された用語をダブルクリックすると、Web ブラウザが起動され PubMed の検

索結果一覧画面が表示されます。

3.4. 辞書展開語を複数指定した検索

【PubMed 検索結果】のチェックボックスにチェックを入れ【PubMed へ】ボタンを押すと、

選択した用語の OR 演算をした検索結果が Web ブラウザに表示されます。【全て選択】【選択

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【選択解除】ボタンを押すと全てのチェックボックスを ON/OFF することができます。なお、

総数のチェックボックスが ON の場合総数の結果一覧が表示されます。

注:検索結果チェックボックスが全て OFF の場合、ウインドウ下に「文献検索した用語をチェ

ックしてください(複数可)」とメッセージが表示され検索結果が Web ブラウザに表示され

ません。

3.5. その他検索オプションの指定

3.5.1. 検索方法 次の3つの検索方法を設定することができます。

通常:普通に PubMed 検索をする場合と同じフリーワード検索です。

フレーズ:熟語や文章を検索する場合、単語の順番通りに完全一致するものだけを検索しま

す。

タイトル内検索:文献の表題に含まれている用語のみを検索します。

ヒント:通常検索では PubMed の辞書(MeSH)による用語補完が働き(automatic term

mapping)、ヒット件数が多くなる場合があります。そのようなときにフレーズ検索を使うと、

PubMed 側での用語補完が OFF になり、ヒット件数を抑えることが出来ます。

注:フレーズ検索では複数の用語をスペース区切りで指定する AND 検索はサポートされていま

せん。複数用語の AND 検索をするときは、各用語毎に検索をし PubMed の Advanced search機能を使い、検索履歴の演算をしてください。

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3.5.2. 発行年 【発行年】フィールドを指定することで、文献の発行年を指定できます。

注:PubMed の絞込み検索画面(Limits)で Dates が指定されている場合、PubMed 側の設定

が優先されます。

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3.5.3. 日本語文献 【日本語】チェックボックスを ON にすると、日本語で書かれた文献に絞り込めます。

注:PubMed の絞込み検索画面(Limits)で Languages が指定されている場合、PubMed 側の

設定が優先されます。

3.5.4. フリーフルテキスト 【フリーフルテキスト】チェックボックスを ON にすると、フリーフルテキストが入手可能

な文献に絞り込めます。

注:PubMed の絞込み検索画面(Limits)で TextOption が指定されている場合、PubMed 側の

設定が優先されます。 ヒント:【日本語】と【フリーフルテキスト】チェックボックスを同時に ON にすると、日本

語且つフリーフルテキストが入手可能な文献に絞り込めます。

3.6. 検索語の履歴

【検索語】エリア右側をクリックすると過去に検索した用語の履歴が表示されます。プルダウ

ンリストから用語を選択すると、選択した用語が【検索語】エリアにコピーされます。

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注:検索語の履歴は PubMed.JP を終了するとクリアされます。

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3.7. 検索の履歴表示

文献検索を行うとウインドウ下部にある【検索の履歴】エリアに検索条件とヒット件数が履歴

として残ります。検索の履歴をマウスで選択すると、「検索条件」に入力された用語と選択した

オプション及び「PubMed 検索結果」が再現されます。

注:検索の履歴は PubMed.JP を終了するとクリアされます。

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3.8. 標題一覧ウインドウの表示

PubMed.JP は PubMed の検索結果一覧を表示する標題一覧ウインドウを表示することがで

きます。【TITLE VIEW】アイコンをクリックすると非表示になっていた標題一覧がウインド

ウ右側に表示されます。また【標題一覧】を押すと、選択した用語の OR 演算をした結果一覧が

表示されます。なお、総数のチェックボックスが ON の場合総数の結果一覧が表示されます。

注:検索結果チェックボックスが全て OFF の場合、ウインドウ下に「文献検索した用語をチェ

ックしてください(複数可)」とメッセージが表示され標題一覧ウインドウの表示は変化しま

せん。

ここをクリック

検索条件を選択してから表

題一覧を押してください

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3.9. 標題一覧ウインドウの更新

標題一覧ウインドウ上部にあるボタンを押すと、表示内容が更新されます。

【>】を押すと次のリストが表示されます・

【<】を押すと前のリストが表示されます。

【≫】を押すと最後のリストが表示されます。

【≪】を押すと先頭のリストが表示されます。

【表示数】を選択すると一度に表示される件数が変更されます。

3.10. 該当文献の表示

標題一覧ウインドウで見たい文献をダブルクリックすると Web ブラウザが起動され PubMed

の Abstract 画面が表示されます。

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3.11. 表題一覧の活用

表題一覧ウインドウで文献を選択してマウス右ボタンをクリックすると以下のメニューが表

示されます。

【ブラウザで表示】Web ブラウザが起動され PubMed の Abstract 画面が表示されます。

【コピー】選択された文献の書誌情報がクリップボードにコピーされます。

【すべてコピー】標題一覧に表示されている全ての文献書誌情報がクリップボードにコピーさ

れます。

【名前を付けて保存】標題一覧に表示されている全ての文献書誌情報がテキストファイルに保

存されます。

ヒント:クリップボードにコピーされた文献書誌情報を Excel にペーストすると、標題一覧に

表示されている項目が Excel のセルに分割されて貼り付けられます。また、保存したテキス

トファイルを Excel にドラッグ&ドロップしても同様です。