Modelo para codificação de narrativas clínicas para uma

ontologia de domínio utilizando SNOMED CT

Priscilla KoppeEdson José Pacheco Percy Nohama

Stefan Schulz

Pontifícia Universidade Católica do Paraná

Universidade de Freiburg, Alemanha

INTRODUÇÃO

Crescente expansão de informações não estruturada em prontuários eletrônicos

Necessidade de implementação de sistemas que lidam com terminologias clínicas

Importância da codificação na comunicação eletrônica

Criação de regras para codificação

OBJETIVO

O objetivo da pesquisa é propor uma metodologia para o mapeamento de texto livre, especificamente de narrativas clínicas, para SNOMED CT, através de regras de codificação.

Finalidade é a criação de um padrão-ouro para permitir a avaliação de um sistema PLN

SNOMED CT

SNOMED CT é um vocabulário médico padronizado que define o significado dos termos médicos, visando melhorar a interoperabilidade entre sistemas.

Inclui: sinais sintomas doenças procedimentos medicamentos

SNOMED CT Os elementos básicos que compõem

SNOMED CT são: Conceito: unidade básica de SNOMED

CT. Cada conceito é identificado por um código numérico único, tem um nome único (Fully Specified Name) e um conjunto de termos sinônimos (descriptions).

Hierarquias: são 19 as principais (ex: Disorder, Procedure, Substance, Clinical findings, etc.);

Relações: associações entre conceitos, usadas para formalmente definir e descrever um conceito

SNOMED CT

METODOLOGIA

120 sumários de alta oriundos da área de cardiologia do Hospital de Clínicas de Porto Alegre (HCPA) foram selecionados para a efetuação da codificação do conteúdo

Utilização do Virginia Tech Browser

Desenvolvimento de uma estrutura tabular para relacionar elementos do texto com conceitos SNOMED

METODOLOGIAChunk Context Structure Polarity Code Observation

Paciente          

com história de          

HAS e HIS LIS   38341003Hipertensão Arterial

Sistêmica

DM tipo 2 HIS LIS   44054006 Diabetes Mellitus

Submetido a          

cat       41976001 cateterismo

que evidenciou          

lesão suboclusiva       2929001  

na coronária DA.       59438005 Descendente Anterior

Realizado          

angioplastia.       41339005  

Recomendação na alta:          

em caso de intercorrência, UNC      

vir à UNC      

emergência. UNC   185265000  

METODOLOGIA

O processo de codificação foi realizado por dois profissionais da área da saúde.

A composição de um guideline foi necessária para dar suporte à criação de um padrão ouro de codificação objetivando a avaliação de um processo computadorizado de mapeamento usando tecnologias de processamento de linguagem natural.

GUIDELINE As principais regras implantadas foram: Somente use a hierarquia “Morphologies”

se não houver código correspondente nas hierarquias preferidas: “Clinical Findings” ou “Procedure”;

Para codificar resultados de laboratório, utilize a categoria “Observable concepts”;

Para codificar um medicamento, utilize o código SNOMED CT referente a Substance ao invés de Product. Ex: digoxin (substance) preferencialmente a digoxin (product)

GUIDELINE Para conceitos anatômicos, a SNOMED

CT apresenta sempre dois conceitos: “Entire X” e “ X structure ”. Nesses casos, codifique o último, termo mais geral. Ex.: “Right coronary artery structure” ao invés de “Entire right coronary artery”;

Utilize conceitos SNOMED CT da categoria “Qualifier value” apenas quando esta referir-se a características importantes de outros conceitos. Ex.: “laterality, episodicity, severity”;

Se um termo estiver presente na hierarquia SNOMED CT “Anatomical concepts” e o mesmo conceito estiver nas hierarquias “Clinical Findings” ou “ Procedure”, codifique o termo obtido na “ Clinical Findings”;

RESULTADOS

Efetividade do Guideline através da avaliação da concordância do trabalho de codificação realizado pelos profissionais

12 sumários de alta foram aleatoriamente selecionados e submetidos ao processo de codificação pelos dois especialistas envolvidos nesta atividade

89% de concordância (Cohen’s Kappa)

DISCUSSÕES

Avaliação das discordâncias existentes:

Termo: “TABAGISTA”

DISCUSSÕES

Termo: “ELETROCARDIOGRAMA”

DISCUSSÕES

Termo: “SATURAÇÃO DE OXIGÊNIO”

DISCUSSÕES

Termo: “PARADA RESPIRATÓRIA”

DISCUSSÕES

Termo: “HEMATÚRIA”

DISCUSSÕES Avaliação das concordâncias existentes:

Medicamentos (Hierarquia Substance): Aspirina, Sinvastatina, Metoprolol, Captopril, Furosemida, etc.

Doenças (Hierarquia Disorder): Hipertensão arterial sistêmica, Diabetes mellitus, Cardiopatia isquêmica, etc.

Procedimentos (Hierarquia Procedure): Angioplastia transluminal percutânea, Cateterismo, Rx de tórax, Ecocardiograma, etc.

Estruturas anatômicas (Hierarquia Body Structure): Ventrículo direito, Septo cardíaco, Artéria coronária direita, etc.

CONCLUSÃO

O Guideline desenvolvido abordou tópicos importantes para a obtenção de um resultado satisfatório de codificação manual.

Com base no resultado alcançado com o mapeamento manual, uma rotina automatizada de mapeamento está sendo desenvolvida, com base em ferramentas de processamento de linguagem natural (PLN).