Upload
alexandru-voinescu
View
28
Download
0
Embed Size (px)
DESCRIPTION
ssd
Citation preview
Cuprins
1. Introducere ....................................................................................................2
2. Structura ARN-ului ......................................................................................3
3. Sinteza ARN-ului ..........................................................................................4
4. Funcţiile celulare ale ARN-ului ...................................................................4
5. Tipuri de ARN ..............................................................................................6
6. Sinteza proteinelor ........................................................................................9
7. Bibliografie ...................................................................................................11
2
1. Introducere
Acizii nucleici sunt compuşi macromoleculari cu structură complexă şi mase
moleculare cuprinse între câteva zeci de mii şi milioane. Sunt, împreună cu proteinele,
componentele nucleoproteidelor, compuşi de importanţă biologică, existenţi în celulele
vii. După provenienţa lor, respectiv după materialele din care au fost extrase, acizii
nucleici erau consideraţi de două tipuri: acizi timonucleici (acizi nucleici din timus sau
acizi nucleici animali) şi acizi zimonucleici (acizi nucleici din drojdie sau acizi nucleici
vegetali). Întrucât s-a constatat că deosebirea dintre ei constă în natura componentului
glucidic (acizii timonucleici conţin în molecula lor dezoxi-D-riboza, iar acizii
zimonucleici conţin D-riboza), denumirile lor au fost înlocuite cu denumirile de acizi
dezoxiribonucleici (ADN), şi acizi ribonucleici (ARN). Cercetări ulterioare au dovedit,
însă, că aceste două tipuri de acizi nucleici sunt prezente în toate organismele vii, având
rol important în desfăşurarea proceselor vitale normale şi patologice; acizii
dezoxiribonucleici sunt substanţele de bază în aparatul genetic, care asigură ereditatea şi
variabilitatea, pe când acizii ribonucleici au mai mult rol funcţional legat de sinteza
proteinelor.
Acidul ribonucleic (ARN) este, ca și ADN-ul, un polinucleotid format prin
copolimerizarea ribonucleotidelor. Un ribonucleotid este format dintr-o bază
azotată (adenină A, guanină G, uracil U și citozină C), o pentoză (D-2-dezoxiriboză) și
un fosfat. În molecula de ARN uracilul înlocuiește timina.
3
2. Structura ARN-ului
Fig. 2.1 - Structura unui ribonucleotid. Baza azotată prezentată aici este uracilul
Molecula de ARN este monocatenară (este alcătuită dintr-un singur lanț
polinucleotidic). Este un complex macromolecular similar, structural și funcțional, în
multe privințe ADN-ului. ARN-ul rezultă din copolimerizarea ribonucleotidelor, care
determină formarea unor lanțuri lungi, monocatenare.
Un ribonucleotid este format dintr-o bază azotată ( adenină A, guanină G, uracil U si
citozină C ), o pentoză ( D-2-dezoxiriboză) şi un fosfat. În molecula de ARN uracilul
înlocuieşte timina. Polimerizarea ribonucleotdelor se realizează prin legaturi
fosfodiesterice în pozitiile 3’- 5’.
Fig. 2.2 - Pliere și aparierea unei regiuni din molecula unui ARN ce conține o secvență repetată inversată
cu formarea unei regiuni dublu catenare terminată cu o buclă.
4
Compoziția nucleotidică (sau secvența, ordinea nucleotidelor în moleculă)
definește structura primară a moleculei de ARN. Datorită complementarității bazelor în
unele regiuni mai mari sau mai mici ale moleculei de ARN, în soluție și în funcție de
temperatură, prin pliere și aparierea regiunilor complementare, molecula poate capăta,
formând o buclă, o structură parțial bicatenară. Această structură secundară este deosebit
de importantă în funcția unor tipuri de ARN, ca, de exemplu, ARN-ul de
transfer. Molecula de ARN poate adopta o structură tridimensională numită structură
terțiară ce rezultă din aparieri între bazele azotatediferite de aparierile clasice A-T și C-G.
3. Sinteza ARN-ului
ARN-ul este sintetizat prin procesul numit transcripție. În acest proces, ADN-ul
are rol de matriță. Molecula dublu catenară de ADN este desfăcută, pe intervalul care
urmează a fi transcris, de anumite complexe proteice prin ruperea punților de hidrogen
între bazele azotate complementare. Un complex proteic cu funcție enzimatică
numit ARN polimerază copiază una din catenele de ADN pentru a produce un ARN
complementar. Catena de ADN care funcționează ca matriță pentru sinteza ARN-ului se
numește catenă sens.
Sinteza ARN-ului (transcripția) se realizează pe baza complementarității bazelor
azotate ca și în cazul replicării moleculei de ADN cu o singură excepție: în
dreptul adeninei de pe catena matriță a ADN-ului se va atașa uracilul în catena nou
sintetizată de ARN. Polimerizarea ribonucleotidelor în transcripție se desfășoară în
același sens ca reacția de polimerizare a dezoxiribonucleotidelor din cadrul
replicării ADN-ului și anume de la 5' spre 3'.
4. Funcţiile celulare ale ADN-ului
Suport temporar al informației genetice
Acest rol este realizat de ARN-ul mesager ce transportă informația genetică
necesară sintezei de proteine de la ADN-ul localizat nuclear la ribozomii localizați
încitoplasmă.
5
Catalizator enzimatic
Unele molecule de ARN au capacitatea de a cataliza reacții chimice modificând
atât aminoacizi sau proteine cât și acizi nucleici.
Ghid pentru enzime
Unele molecule de ARN sunt componente ale unor complexe ribonucleoproteice ce
participă la ghidarea lor spre secvențele specifice. În această categorie pot fi încadrate
moleculele mici de ARN nucleolar (snoARN – small nucleolar ARN în engleză) ce
participă la clivarea ARN-ului ribozomal sau ARN telomeric ce reprezintă matrița
folosită de complexul ribonucleoproteic numit telomerază pentru sinteza extremităților
moleculelor de ADN (numite telomere).
Regularea expresiei genelor
Unele molecule de ARN (ARN antisens, spre exemplu) sunt implicate în represia uneia
sau mai multor gene.
Rol în translație
ARN-ul de transfer transportă aminoacizii și îi poziționează în cursul sintezei proteice.
6
Suport al informației genetice
Genomul unor virusuri este constituit din ARN. În această categorie intră virusul gripei,
virusul hepatitei C sau virusul SIDA. Replicarea acestor virusuri se face cu o fidelitate
mult mai redusă, deoarece în cazul ARN-ului nu există un proces de corijare a erorilor,
frecvența mare a erorilor ducând la o mare variabilitate genetică.
5. Tipuri de ARN
În celule se găsesc diferite tipuri de ARN. Proporția lor este diferită: o mare
cantitate este reprezentată de ARNr (80-90% din ARN-ul celular), ARNt în proporție de
10-15% și doar o cantitate mică de ARNm (mai puțin de 5%).
ARN mesager - ARNm
ARN-ul mesager este ARN-ul ce va servi ca tipar pentru sinteza proteinelor. Complexul
enzimatic ARN polimerază sintetizează inițial un ARN mesager precursor ce conține
secvențele corespunzătoare exonilor și intronilor genei. Prin procesul ulterior de maturare
ARN-ul premesager este modificat pentru a duce la formarea ARN-ului mesager matur:
la capătul 5’ se adaugă un „cap” (o moleculă de 7-metil-guanozină);
la capătul 3’ se adaugă o serie de 100-200 de ribonucleotide conținând
adenină ce formează coada poli-A;
sunt eliminate secvențele corespunzătoare intronilor prin procesul
numit matisare (splicing în engleză) fiind păstrate doar secvențele
corespunzătoare exonilor, secvențe ce conțin informația necesară sintezei de
proteine prin procesul numit translație.
Fig. 5.1 - Matisarea exonilor și formarea ARN-ului mesager matur
7
Fig. 5.2 - Structura ARN-ului mesager matur: "capul" situat la extremitatea 5' (în roșu), regiunea 5'UTR (în
galben), regiunea codantă (în verde), regiunea 3'UTR (în violet) și coada poli-A (în negru).
ARN de transport - ARNt
ARN-ul de transport (notat ARNt) este un ARN scurt, de 75-100 nucleotide, cu o
structură terțiară „în treflă” (cu patru regiuni scurte dublu catenare și trei bucle) ce
fixează un anumit aminoacid la capătul 3’ și care are o regiune specifică de trei
nucleotide numită anticodon în bucla opusă capătului 3’. Acest ARN fixează un
aminoacid pe care îl transportă și în poziționează în dreptul unui codon (prin
complementaritatea codon (de pe molecula de ARNm) – anticodon (de pe molecula de
ARNt) în cursul procesului de translație.
Fig. 5.3 - Vedere spațială a unui ARNt. Situl de fixare a aminoacidului este în portocaliu, bucla ce conțineanticodonul în albastru și anticodonul în negru.
8
ARN ribozomal - ARNr
ARN-ul ribozomal este un constituient principal al ribozomilor, structuri celulare la
nivelul cărora se realizează sinteza proteinelor. ARN-ul ribozomal este sintetizat prin
transcripția genelor corespunzătoare situate în anumite regiuni ale cromozomilor numite
organizatori nucleolari (sau NOR în engleză). Prin transcripție sunt sintetizați precursori
de talie mare ce vor fi ulterior scindați în patru tipuri de ARNr: ARNr 28S, ARNr 5.8S,
ARNr 5S (ce intră în compoziția subunității mari, 60S, a ribozomului) și ARNr 18S (ce
intră în compoziția subunității mici, 40S, a ribozomului).
ARN regulatori
Unele molecule de ARN au ca rol regularea expresiei genelor:
ARN antisens, ARN ce conține regiuni complementare ARN-ului mesager și
care, prin apariere, poate determina formarea de regiuni dublu catenare ARN-
ARN, regiuni ce pot fie modifica capacitatea ARNm de a fi translat , fie pot
duce la degradarea moleculei de ARNm. Acest proces de degradare este
numit interferență ARN și a fost descoperit de Andrew Z. Fire și Craig C.
Mello (premiul Nobel de Fiziologie și Medicină în 2006).
ARN regulator de talie mare ce determină modificări
epigenetice (condensare a cromatinei și oprirea expresiei genelor localizate în
regiunea respectivă). Un exemplu îl reprezintă ARN-ul Xist la mamifere ce
intervine în procesul de inactivare a unui cromozomul X la organismele de sex
feminin.
ARN catalitic (ribozime)
Unele molecule de ARN (numite și ribozime, prin contracția cuvintelor ribonucleotid
și enzime) au capacitatea de a cataliza reacții chimice de clivare sau de transesterificare în
absența proteinelor enzimatice. Un exemplu îl reprezintă siturile
9
active (peptidil și aminoacil) ale ribozomilor care sunt formate exclusiv din segmente
de ARN ribozomal. Ribozimele pot cataliza și reacții de modificare ale acizilor nucleici,
spre exemplu spliceozomii, complexe ribonucleoproteice implicate în procesul de
matisare al ARN-ului premesager. Pentru identificarea ribozimelor Thomas Cech și
Sidney Altman au primit premiul Nobel pentru Chimie în 1989.
Fig. 5.4 – Pricipalele tipuri de ARN celular
6. Sinteza proteinelor
Într-o celulă pot exista circa 10000 proteine care au rol esenţial în funcţionarea şi
reproducerea celulei şi organismului. Biosinteza proteinelor se desfăşoară în următoarele
momente. În primul moment are loc transcripţia, care constă în sinteza mARN de către
una dintre catenele de ADN dintr-o genă. Acest mARN are o structură complementară
catenei de ADN matrice, reprezentând o “imagine în oglindă” a acestuia, o transcriere
mecanică a codonilor catenei de ADN, respectiv a mesajului genetic, cu simboluri
complementare. În al doilea moment are loc translaţia care constă în migrarea mARN în
10
citoplasmă şi asocierea mARN cu ribozomii activi în sinteza proteică. Catena de mARN
se fixează simultan prin absorbţie pe mai mulţi ribozomi la distanţa între ei de 300-350A,
formând poliribozomi. În al treilea moment are loc activarea aminoacizilor, care constă
în reacţia unui aminoacid cu adenozin-trifosfat (ATP) catalizată de aminoacil-ARN
sinteza, şi formarea de aminoacil-adenilat (aminoacil AMP), care se ataşează de o
moleculă de tARN, determinând apariţia unui complex aminoacil-tARN. Acest complex
este transportat în locul lui propriu în lanţul proteic, determinat de mARN din polizomi.
Pe catena mARN din polizom, se vor amplasa, la nivelul fiecărui ribozom, numai acele
complexe aminoacil-tARN care, pe bucla centrală, reprezentând anticodonul, posedă o
secvenţă de trei ribonucleotizi complementară codonilor mARN din complexul
polizomului. În acest fel aminoacizii sunt legaţi enzimatic într-o ordine impusă de ADN
care a matriţat mARN şi care joacă un rol direct în biosinteza proteinelor. În al patrulea
moment are loc translaţia, polimerizarea sau asamblarea aminoacizilor. Legătura se
realizează între gruparea COOH a primului aminoacil care reprezintă punctul activ al
biosintezei progresive, cu gruparea NH2, a celui de al doilea aminoacil, în prezenţa
enzimei peptid-polimeraza, care catalizează formarea legăturilor peptidice între
aminoacizi; încorporarea aminoacizilor este ireversibilă; iau astfel naştere lanţuri
polipeptidice care se eliberează de polizom, prin translocarea ultimului complex
aminoacil-tARN de ultimul ribozom din polizom, când acesta a ajuns în urma rotirii la
extremitatea matricei mARN de care se detaşează. Un lanţ polipeptidic se sintetizează
într-un minut.
Fig. 6.1 – Sinteza proteinelor
11
7. Bibliografie
1. www.wikipedia.org
2. Covic, M., Ștefănescu D., Sandovici I. (2004), Genetică Medicală, Ed. Polirom,
București
3. http://www.biotech.icmb.utexas.edu/pages/science/nucacid_db_intro.html4. http://anatomie.romedic.ro/arn5. http://www.nature.com/scitable/definition/ribonucleic-acid-rna-456. http://www.medterms.com/script/main/art.asp?articlekey=5366