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Estructura de membrana, superficie celular y transporte de moléculas
Membranas celulares:
Funciones de la membrana plasmática: -‐ Define la Identidad Celular -‐ Rodea y define los límites de la célula -‐ Mantiene la composición del citosol, que es diferente a la del medio extracelular, regulando el transporte de iones y moléculas. -‐ A través de sus proteínas de transmembrana comunica el ambiente externo con el interno y esto repercute en las funciones y destino celulares: proliferación, diferenciación, apoptosis, migración, etc. Funciones de las membranas internas: -‐ Definen a los diferentes organelos subcelulares: núcleo, retículo endoplásmico, Aparato de Golgi, lisosomas, sistema endosomal, peroxisomas, mitocondrias, vesículas de tráfico intracelular. Bicapa Lipídica: -‐ Modelo de Bicapa fue propuesto en 1925 por Gortnery Grendel y en 1935 Davson y Danielli, mediante estrategias bioquímicas sugieren la existencia de proteínas a ambos lados de la bicapa. Posterior a la Microscopía electrónica se dilucida su estructura. -‐Bicapa de 5 nm de espesor. -‐ Está compuesta por proteínas y lípidos. Las proteínas de membrana constituyen el 30% de las proteínas totales de una célula animal. La masa de la membrana está constituida de un 50 % de lípidos -‐ Los principales lípidos que componen la membrana son los fosfolípidos, que incluyen a los fosfoglicéridos y a la esfingomielina, el colesterol y los glicolípidos. -‐ Modelo de Mosaico fluido: Modelo propuesto por Singery Nicholson(1972). Considera que la membrana es como un mosaico en el que la bicapa lipídica es la red, con proteínas embebidas en ella. Tanto las proteína scomo los lípidos pueden interaccionar y desplazarse lateralmente dotando a la bicapa de fluidez e impermeabilidad a moléculas muy polares. Grosor de la membrana es de 5 nm
-‐ Bicapa compuesta por proteínas y lípidos -‐ No hay triglicéridos en la membrana plasmática -‐ Glicolípidos: importantes para la membrana de las neuronas mielínicas -‐ Esfingomielina: Lípido que interacciona muy bien con el colesterol -‐ RE: ocurre la síntesis del colesterol, aunque él tiene poco colesterol en sí, ya que una vez que se forma, se libera de inmediato -‐ Membrana plasmática es la que más colesterol tiene.
Fosfolípidos: -‐ Tienen 2 cadenas de ácidos grasos: uno saturado y otro insaturado (tiene un doble enlace en conformación cis), el cual le da mayor flexibilidad a la cadena -‐ Hay un enlace fosfodiéster -‐ 5 tipos de fosfolípidos: Fosfatidil etanolamida Fosfatidil serina: Está generalmente hacia adentro de la célula, rol importante cuando funciona como mensajero. Cuando la célula hará apoptosis, la fosfatilserina se expone hacia afuera para informarle de su estado a las células vecinas. Fosfatidil colina: Fosfolípido más abundante de la membrana plasmática Esfingomielina Esfingosina: Tiene un alcohol y un grupo amino. Es la base de la esfingomielina
-‐ Flippasas: Con un gasto energético, translocan el Fosfolípido hacia la cara interna. Son proteínas de membrana (insertas o periféricas)
-‐ Proteínas glicosiladas y lípidos unidos a azúcares, están expuestos hacia el exterior de la célula. -‐ La estructura de la bicapa tiende a cerrarse sobre sí misma, formando un compartimiento
-‐ Los lípidos espontáneamente forman micelas o bipacas, dependiendo de su forma -‐ Los lípidos presentan movilidad en la bicapa: rotación, flexión, y flip flop
Características de la bicapa lipídica: 1. La Fluidez de la Bicapa depende de su composición y de la temperatura: La temperatura de Transición de Fase (paso de estado gel a fluído) depende del largo de las cadenas hidrocarbonadas y de la presencia de dobles enlaces. -‐ A mayor número de dobles enlaces, menos compacta es la bicapa y así, se mantiene el estado fluído a bajas T°. -‐ La fluidez de la bicapa depende de su composición, cuando el dominio está muy ordenado o compacto hay menor fluidez, si se agregan dobles enlaces en las cadenas de fosfolípidos, se hará más desordenado y con mayor fluidez.
Colesterol: -‐ El colesterol es un esterol, constituido por un anillo rígido y un grupo polar (hidroxilo) y una corta cadena no polar. -‐ contenido de colesterol de la Membrana Plasmática es el más alto, y puede constituir el 20-‐25 % de los lípidos totales.
El colesterol modula las propiedades de las bicapas lipídicas: -‐Aumenta el empaquetamiento de los de lípidos en la bicapa, pero no disminuye la fluidez de la membrana. -‐ Aumenta las propiedades de barrera de de permeabilidad de la membrana: su grupo OH interacciona con las cabezas polares de los fosfolípidos y su anillo rígido y plano interacciona e inmoviliza parcialmente las regiones de cadenas hidrocarbonadas más cercanas a las cabezas polares. Esto lleva a que la membrana sea menos deformable y menos permeable a moléculas pequeñas solubles en agua. -‐A las altas concentraciones, en que se encuentra en la membrana plasmática, el colesterol
también impide la cristalización de la de la membrana, al impedir que las cadenas hidrocarbonadas se acerquen demasiado.
Efectos del colesterol en la organización lipídica de la membrana plasmática: -‐ Aunque de alguna forma “ordena” la membrana y controla la permeabilidad (al llenar espacios), al mismo tiempo la membrana se mantiene en estado de líquido y fluido. -‐ Colesterol interactúa con glicoesfingolípidos y ciertas proteínas en la hemicapa externa de la membrana plasmática. Estos “micro dominios” se pueden aislar bioquímicamente por sus propiedades de “insolubilidad en detergentes no iónicos a 4 °C, denominados “balsas lipídicas”, que corresponderían a dominios de membrana, ricos en colesterol y esfingomielina, donde se concentra la maquinaria de señalización celular. Balsas lipídicas: -‐ Las Balsas lipídicas (Lipid rafts) están constituidas principalmente por colesterol y glicoesfingolípidos.
-‐Estas zonas de membrana tienen mayor espesor que el resto de la membrana. -‐Dominios de membrana: zonas de la membrana con características especiales, en función de las proteínas que se ubican en ellos. -‐ Ciertas proteínas se enriquecen en estos dominios al tener más afinidad por los lípidos y tener tendencia a agregarse y/o formar complejos: Proteínas que se asocian a estos dominios: -‐Ancladas a la membrana por un tallo lipídico, de fosfatidil inositol. -‐Proteínas de transmembrana, con mayor afinidad por los lípidos de las balsas. Funciones: Concentrar maquinaria de señalización celular; Participan en la generación de asimetría de la membrana plasmática en células con fenotipo polarizado. Rutas de internalización al intracelular, algunas utilizadas por Virus (HIV, SV40) y Toxinas (Cólera, Shiga) para entrar a la célula. -‐ Aislamiento de balsas lipídicas desde gradientes de sacarosa: Western Blot, técnica para ver qué células se asocian a cada dominio, la muestra se transfiere por un gel de poliacrilamida. Se usa un anticuerpo para detectar la proteína o receptor, se obtendrá un bandeo. -‐ Las Balsas se definen bioquímicamente como Membranas resistentes a detergente sno-‐iónicos a 4 °C y que “flotan” en una gradiente de densidad (por ejemplo de sacarosa). En estos dominios se concentran, por ejemplo, proteínas con funciones de señalización. (Ejemplo Receptor de ApoE y su Ligando Reelina en neuronas)
-‐ Colesterol se inserta entre los fosfolípidos, interactuando su OH con las cabezas polares del fosfolípido, hace que la membrana sea más impermeable a moléculas polares, impide que se forme un gel -‐ También interactúa con los glicoesfingolípidos que se exponen hacia afuera.
La membrana plasmática es asimétrica _ La propiedad de asimetría es importante funcionalmente -‐ Hemicapa interna: Se encuentran Fosfatidil serina FS (carga neta negativa, marca células apoptóticas) , Fosfatidil etanolamina (FE), Fosfatidil inositol (señalización) -‐ Hemicapa externa: Fosfatidil colina y esfingomielina. Glicolípidos(en azul). -‐ La asimetría se produce en la Membrana Plasmática por acción de enzimas con actividad de Flipasas, y con gasto de ATP, mueven FS y FE desde la cara extracelular hacia el interior, generando la asimetría de composición y carga de la membrana plasmática. -‐ Señal de célula en Apoptosis: Se expone FS al extracelular y esto hace que la célula sea eliminada por macrófagos mediante fagocitosis -‐ Fosfatidil inositol: Hay enzimas fosfatidil inositol quinasas, que le agregan fosfatos a los lípidos en diferentes posiciones, generando distintos tipos de fosfaditil inositol. El tipo 4,5 fosfatidil inositol se encuentra en la membrana y es importante en la señalización de todos los sistemas. Glicolípidos: -‐ se encuentran en la hemicapa externa de la Membrana Plasmática. -‐ En células animales se derivan de la esfingosina, como la esfingomielina. -‐ Se asocian entre si y además están enriquecidas en las Balsas Lipídicas. -‐ La adición de moléculas de azúcar, ocurre durante su biosíntesis en el lúmen del Aparato de Golgi. -‐ Constituyen alrededor del 5% de lípidos de la monocapa externa. Funciones: (de la membrana plasmática al poseer glicolípidos) 1. Protección celular de condiciones extremas del medio externo (pH, sales biliares, enzimas degradativas) 2. En Sistema Nervioso, los gangliósidos son abundantes y modifican las propiedades eléctricas de la membrana 3. Son señales de reconocimiento celular 4. Algunos glicolípidos pueden ser receptores de toxinas (ejemplo la toxina del cólera) *Glicolípidos y glicoproteínas se exponen hacia el medio extracelular
Proteínas de membrana -‐ Son anfipáticas, con regiones hidrofóbicas e hidrofílicas
-‐ Las proteínas periféricas se pueden disociar si existe un cambio drástico de pH, las integrales no -‐ Reacción de palmitoilación: es un tipo de asociación covalente con lípidos que permite que la proteína se una de manera más fuerte con la membrana -‐ Otras proteínas se anclan a la membrana por medio de un tallo de glicofosfatidil inositol (proteína es cortada por una peptidasa y se le agrega el glicofosfatidil inositol que la ancla a la membrana exponiéndose hacia afuera) -‐En la mayor parte de las proteínas de transmembrana, la cadena que cruza la bicapa lo hace en una conformación de Alfa-‐helicoidal, en la cual los enlaces peptídicos forman puentes de hidrogeno entre sí, de manera de estabilizarse en un ambiente hidrofóbico. -‐La cadena de transmembrana puede ser única, o existir varias cadenas (4, 7, 12 por ejemplo) que crucen la membrana. -‐Los aminoácidos característicos de una alfa-‐hélice contienen grupos funcionales no polares. -‐El largo necesario y suficiente de la alfa-‐hélice que cruza la membrana es de 20 a 30 aminoácidos.
-‐ Acuaporina: canal de agua constituido por 4 subunidades, cada una con una alfa-‐hélice -‐ Algunas proteínas de membrana (mitocondrial, cloroplastos o presentes en bacterias) forman estructuras de Barril, con hojas Beta. Forman las llamadas “Porinas”. -‐La mayor parte de las proteínas de membrana en células eucariones son glicosiladas. -‐ Las Glicoproteínas, forman junto con los glicolípidos y los proteoglicanes, el llamado “glicocalix”, en la superficie celular, que cumple funciones de protección ante daño mecánico o químico. Características de las proteínas de membrana: Solubilización -‐Las proteínas de de membrana pueden ser solubilizadas y purificadas con detergentes suaves, y mantener su actividad -‐ A bajas concentraciones de detergente están como monómeros, a mayores cantidades forman micelas -‐ CMC: concentración micelar crítica (se debe buscar en condiciones fisiológicas de T°, pH, etc.)
Características de las proteínas de membrana: Difusión Experimentos que probaron que las proteínas de la membrana pueden difundir o moverse alrededor de ella: 1. Se fusionaron 2 células (una de un ratón y otra de un humano),se forma un heterocarión, se agregaron anticuerpos y se observó al microscopio y se vio que las proteínas marcadas con los anticuerpos habían cambiado de lugar. 2. Marcación con fluorescencia de las proteínas de membrana También existe una difusión limitada de las proteínas de membrana:
1. Mantención del fenotipo polarizado à en la cara basolateral hay proteínas de homeostasis y de interacción célula-‐célula / en la cara apical hay proteínas de transporte
2. Difusión limitada también se asocia a la presencia de un citoesqueleto cortical que genera movimientos restringidos de las proteínas de la membrana plasmática.
Transporte de moléculas pequeñas a través de la membrana
-‐ La bicapa lipídica tiene una permeabilidad relativa a diferentes solutos -‐ Gradiente electroquímico: Combinación del potencial de membrana y la diferencia de concentración de solutos
-‐ Las cargas negativas dentro de las células son mayores.
Canales y transportadores: Componentes proteicos que ayudan al transporte de solutos y iones a través de la membrana plasmática -‐ Los canales transportan más rápidamente (menor afinidad por el soluto) y siempre participan en difusión facilitada o transporte pasivo (a favor de la gradiente electroquímica) -‐ Los transportadores mediante cambios conformacionales transportan solutos a favor o en contra del gradiente electroquímico. Tipos de transporte:
Modelo simple de transporte pasivo, mediado por transportador:
Diferencias cinéticas entre transporte pasivo facilitado y difusión simple:
Fuentes de energía en el transporte activo
-‐ El transportador se mueve espontánea y reversiblemente entre el estado A y B. -‐ El sentido del transporte dependerá de la disponibilidad del soluto por el cual presenta afinidad.
-‐ Simple: No saturable, la velocidad del transporte es directamente proporcional a la concentración del soluto. -‐ Facilitada: Es saturable (número finito de sitios de unión) y refleja la Vmáx de transporte, la cual depende de la rapidez del cambio conformacional. Km refleja la afinidad del transportador por el soluto.
1. Utilizar la energía libre liberada por transporte de un soluto, a favor de gradiente, para cotransportar otro soluto, en contra de su gradiente electroquímica. Si el transporte es en el mismo sentido se habla de Co transportador (ejemplo Transportador de Na+/Fosfato). Si es sentido contrario: Intercambiador (ejemplo, Intercambiador de Na +/H+, NHE+/NHE). 2. Para mover uno o más solutos en contra de su gradiente, se puede utilizar la energía de la hidrólisis de ATP (Bombas). Ejemplos, Protón ATPasa, Na +/K+ ATPasa. 3. Bombas activadas por luz (presentes en ciertas
Ejemplo: Transporte de glucosa facilitado por la gradiente de Na+
La unión de ambos sustratos es cooperativa . La unión del Na+ en el extracelular estimula la unión, de la glucosa al transportador , con mayor afinidad. Esto permite transportar glucosa en contra de la gradiente de concentración. También se utiliza este sistema en el transporte de aminoácidos. Estos mecanismos de transporte, mediados por la gradiente de Na+ operan en la membrana plasmática. La diferencia de concentración del Na+ depende de la actividad de la Na+/K+ ATPasa(Bomba). Los transportadores en la Membrana plasmática regulan el pH citosólico
Uso de la gradiente de Na+ para bombear H+ (generados intracelularmente o que entran desde afuera): 1.-‐Intercambiador de Na+/H+ (NHE)varias formas (NHE1-‐8). 2.-‐Intercambiador de Cl-‐/HCO3-‐, acoplado a la entrada de Na+ y salida de H+ (NaHCO3entra-‐HCL sale). Intercambiador de Cl-‐/HCO3-‐independiente de Na+: La actividad se regula por el pH intracelular. –Al alcalinizarse el citosol, y sale HCO3 a favor de su gradiente de concentración. Ejemplo: Banda 3, en la membrana del glóbulo rojo (facilita salida de CO2, como HCO3-‐ al pasar la sangre por los capilares pulmonares). También regulan pH pero no son transportadores: Bombas de H+: Funcionan gastando ATP para transportar H+ en contra de su gradiente. Se localizan preferentemente en organelos intracelulares (acidifican el contenido luminal).
-‐ El transporte transcelular de solutos está determinado por la existencia de epitelios polarizados, con asimetría en la distribución de transportadores y canales.
Transporte activo mediado por bombas acopladas a la hidrólisis de ATP
Tipo P: Se autofosforilanen el proceso de transporte. Mantienen gradientes iónicos en la membrana celular (especialmente de Na+, H+, K+ y Ca2+) Tipo F: Compuestas de varias subunidades. Sintetizan ATP utilizando la gradiente de H+ que se genera en la membrana plasmática en bacterias, membrana interna de mitocondrias, y cloroplastos. También se llaman “ATP sintetasas” (Relacionadas estructuralmente las ATPasa stipo V, que bombean H+ y gastan ATP) Transportadores ABC: Tienen 12 segmentos de transmembrana. Bombean distintas moléculas, pequeñas. Funcionan como canales y transportadores, por cada transportador ABC se hidrolizan 2 ATP. -‐ Bombas transportan en contra de la gradiente de concentración -‐ Iones siempre están hidratados
Ejemplos de bombas tipo P, que utilizan ATP y se fosforilan Bomba de Calcio del Retículo Sarcoplásmico à Función: mantener la concentración de Calcio citosólico 10-‐7M, bombea Ca+2 al lumen del Retículo Sarcoplasmático posterior a la contracción muscular. Constituye el 90% de las proteínas de membrana del Retículo.
Bomba Na+/K+ con actividad ATPasa -‐ Mantiene las diferencias de concentración de K+ (10 a 30 veces más en el intracelular) y Na+ (10 veces más en el extracelular) con un gasto de energía que constituye 1/3 del total celular -‐ Normalmente en la célula hay más sodio afuera y más potasio dentro, esta bomba hace que salgan 3 Na+ y entren 2 K+ (generando una diferencia de potencial negativo dentro de la célula) -‐ Es electrogénica, aportando el 10% del potencial de membrana (saca 3 Na+ y entran 2 K+) -‐ Contribuye a mantener la osmolaridad celular , al mantener alta concentración de Na+ y Cl-‐ afuera de la célula e impedir una mayor entrada de agua por los canales (acuaporinas) *Ouabaína à es un inhibidor de la bomba
Transportadores ABC: (ATP binding casette) -‐ Transportadores formados por 2 dominios hidrofóbicos cada uno con: 6 segmentos de transmembrana, 1 dominio de unión a ATP por el lado citosólico, hidrolizan 1ATP en el proceso de transporte de moléculas. * Papel del Transportador ABCA1 en la generación de lipoproteínas de alta densidad HDL à Mutaciones en el gen abca1, causan la Enfermedad de Tangier , (autosómica recesiva) caracterizada por: -‐ Deficiencia de HDL -‐ Acumulación de colesterol en macrófagos tisulares -‐ Arteriosclerosis CFTR: Proteína ABC con función de canal iónico, es un regulador de transmembrana de la fibrosis quística, cuando muta se produce la enfermedad -‐ Glicoproteína de 1480 aa y 12 segmentos de transmembrana La fosforilación regulada del dominio “R”, que no está en otras proteínas ABC, determina la apertura del canal de Cl-‐.
-‐Fibrosis quística: Enfermedad hereditaria autosómica recesiva, en donde se afecta el gen CFTR, se deben tener ambas copias del gen mutado -‐ La mayoría de las mutaciones produce proteínas truncas no funcionales o que no llegan a la membrana.
Canales y Propiedades Eléctricas
Las proteínas de canal, a diferencia de los transportadores, forman poros abiertos que permiten el paso de moléculas pequeñas y de carga apropiada a través de la membrana lipídica. Las porinas son canales mucho mas grandes que, a diferencia de la estructura en α-‐hélice que adoptan los canales, se conformará en un barril β-‐plegada que será menos permeable y regulado que los canales.
Canales iónicos: son aquellos que intervienen en el tránsito de iones a través de las membranas de todas las células. Algunas propiedades muy importantes para su función es que 1) el transporte a través de estos canales es extremadamente rápido, 2) son altamente selectivos debido a su estrecho poro y 3) la mayoría de estos canales no se encuentran permanentemente abiertos. No necesariamente se encuentran abiertos durante todo el tiempo que exista un estímulo.
Tipos de activación de canales iónicos
Activación por ligando
Corresponde a una señal química que puede provenir del medio intracelular o extracelular, y que produce un cambio de conformación al canal, accediendo a su apertura.
El receptor nicotínico de la acetilcolina es el canal activado por ligando más conocido y estudiado. Está compuesto por 5 subunidades y puede responder con la nicotina y la acetilcolina.
La diferencia con la nicotina es, que ésta puede ser administrada a voluntad por el sistema nervioso. En cambio, la nicotina es difícil de excretar y, por lo tanto, permanece mucho tiempo en la sangre, mantiene abierto el canal por más tiempo del normal. Debido a esto, se ve alterado el “circuito normal del placer” que posteriormente generará adicción
Activación mecánica
Estos tipos de canales necesitan de una señal mecánica para activarse, que generalmente es estrés.
El ejemplo más claro es un canal iónico que se encuentra en el sistema auditivo. Las esterocilias, corresponden a prolongaciones en la cóclea que en ausencia de sonido está en reposo. Ante el estímulo del sonido, las membranas se comienzan a mover y se abren los canales para el flujo de iones, que desencadenarán una respuesta.
Activación Dependiente del voltaje
Este tipo consiste en la apertura de canales en respuesta a variaciones en el potencial eléctrico a través de la membrana plasmática.
Hacia ambos lados de la membrana existen cargas, siendo el medio extracelular más positivo y el intracelular más negativo. Cuando esta diferencia de carga cambia, la proteína actúa como un sensor de voltaje, pues posee aminoácidos cargados de cierta forma que detectan el voltaje de la membrana según las leyes de atracción y repulsión por afinidad de cargas.
Estructuralmente, puede corresponder a una sola cadena polipeptídica que se enrolla sobre si misma y que forma varios dominios transmembrana o estar compuestos por un tetrámero de varios polipéptidos.
Los canales compuestos por una sola cadena polipeltídica, generalmente poseen 6 subunidades en transmembrana,
siendo la cuarta la que cumplirá una función sensor de voltaje.
Lo que determinará la selectividad del canal será
1) el tamaño del poro, que va disminuyendo a medida que entramos en el canal
2) las cargas en la boca y pared del canal que repelerá a todo ion inadecuado que quisiera ingresar al canal. Por ejemplo, el canal de K+ posee grupos carbonilo en su pared que impedirá que el potasio se vea repelido. Y por último
3) su capa de hidratación.
La capa de hidratación es una propiedad que depende de la relación caga/masa y, por lo tanto, para un mismo grupo de la tabla periódica, mientras más pequeña sea la masa, el ion poseerá más capas de hidratación. Perder esta capa es energéticamente desfavorable, por lo que para cada canal específico existen iones que perderán estas capas de forma energéticamente favorable, quedando desnudos y listos para insertarse en el sitio de unión del canal.
La gradiente electroquímica del ion provocará que sea imposible para él mantenerse por un largo tiempo en el canal, pues se verá presionado por las demás partículas que constantemente están entrando al canal. Al momento de salir del canal, vuelve a adquirir las capas de hidratación.
Para estudiar el potencial de membrana se utiliza la electrofisiología, que permite calcular la diferencia de voltaje dentro y fuera de una célula de interés mediante la inserción de microelectrodos.
La Técnica del Patch – Clamp se utiliza para estudiar canales iónicos, y consiste en aplicar presión positiva a un cilindro de vidrio (microelectrodo) a medida que nos acercamos a la membrana de una célula. Al posicionarnos sobre la membra, se elimina la presión ejercida y se cambia por una negativa, de manera de producir un sello. Posteriormente, se retira este electrodo con el segmento de membrana celular que contendrá los canales iónicos que se estudiarán.
Éstos canales podrán ser manipulados y sometidos a condiciones deseadas para descubrir, por ejemplo, la cantidad de corriente que pasa a través del tiempo y ser llevados a gráficos que muestren el paso de esta corriente para saber cuando se encuentra abierto o cerrado.
Estado inactivo del canal
Depende del dominio de inactivación del canal (partícula de inactivación), que reconoce cuando el canal ha estado abierto por mucho tiempo. Consiste en un bloqueo físico denominado “modelo de bola y cadena”, donde la partícula se inserta en la boca del canal para impedir que continúe el flujo de iones.
Gradiente electroquímica: gradiente eléctrica + gradiente química
Todas las células son capaces de generar gradientes electroquímicas por bombas electrogénicas (de transporte activo, como la bomba Na+ -‐ K+ ATPasa) y difusión pasiva de
iones a través de la membrana. Cuando están en sentido opuesto, como en el canal de K+, actúan como fuerzas opuestas que compiten entre sí. Estas fuerzas llegarán a un punto donde el movimiento de potasio será nulo y se alcanzará un estado de equilibrio que se conoce como potencial de membrana en reposo.
El canal de K+ se caracteriza por abrirse con facilidad, pero cerrarse de manera muy lenta (estos canales se conocen como canal de fuga), por lo que siempre hay un flujo de potasio a través de la membrana, a diferencia de los canales de Ca2+, Na+ y Cl-‐. La permeabilidad mucho mayor al K+ hace que éste sea el principal componente en la medición del potencial de membrana en reposo (diferencial de carga del ion potasio entre intracelular y extracelular). Es por esto que al medir el potencial de membrana para este ion se obtiene alrededor de -‐75mV, muy cercano a lo vivo.
Ecuación de Nernst
Establece cuantitativamente la relación entre la concentración iónica y el potencial de membrana. Afirma que el potencial en equilibrio de cualquier ion está dado por la concentración en el extracelular, respecto al intracelular.
También puede expresarse en:
Ecuación de Goldman
Es una modificación de la ecuación de Nernst para dar cuenta de la contribución más importante en el establecimiento del potencial de membrana.
El valor P corresponde a la permeabilidad de los iones. Como la permeablidad del potasio es muy alta en comparación a la del sodio y cloruro (1:0,04:0,45 respectivamente), el potasio contribuye mucho más al valor del potencial de membrana en reposo.
La célula tiene la capacidad de cambiar su potencial de membrana gracias a la apertura y cierre de canales. Un estímulo provoca cambios en el potencial de la membrana: si se hace más negativa, se dice que la membrana sufrió una hiperpolarización. En cambio, si el estímulo hace que el potencial de membrana se haga mas positivo, se habla de depolarización. También, se diferencias los potenciales graduados si dependen de la intensidad del estímulo para generar cambios de potencial o los potenciales independientes de la intensidad del estímulo, que cuando alcanzan el umbral, se desencadenará la misma respuesta así y solo así. Se dice que en este tipo de potenciales, la membrana responde a la ley del “todo o nada”. Dentro de éste último, se encuentra el potencial de acción, que corresponden a señales eléctricas conducidas por axones.
Etapa de reposo canales de Na+ cerrados y algunos de K+ abiertos, lo que genera una gradiente electroquímica en una célula biológica.
Depolarización, permite la apertura de algunos canales de Na+ en un segmento de la membrana. Si el estímulo es suficiente para alcanzar el umbral, se pasa a una fase de depolarización donde se abren todos los canales de Na, ingresando a la célula y cambiando el potencial de membrana +30/+40mV.
Comienzan a abrirse los canales de K+ voltaje dependientes, mientras los de sodio se inactivan. Fase de repolarización que vuelve a los niveles de potencial inicial.
Producto de los canales de fuga de K. se produce una hiperpolarización a causa de la salida masiva de K+ , hasta que se cierran.
La bomba sodio – potasio ATPasa, siempre activa, restableece el potencial de reposo.
El trozo de membrana depolarizada provoca que el resto de la membrana recorra el mismo proceso descrito anteriormente.
Hodgkin y Huxley realizaron experimentos en axones de calamar que los llevó a ganar el permio Nobel en 1963. Utilizaron este tipo de axón en particular debido a su gran grosor (1mm) que permite observarlo, instertarle electrodos y medir su variación del potencial de membrana durante la transmisión de un impulso nervioso. Demostraron que los cambios del potencial de membrana se deben a la apertura y cierre de diferentes canales iónicos.
Propagación del potencial de acción
Existen dos tipos de fibras de neuronas: mielinizadas y no mielinizadas. Las mielinizadas se encuentran fundamentalmente en neuronas motoras. La disposición en vainas de mielina permite una propagación saltatoria, ya que, gracias a ella la fibra consta de zonas aisladas por las vainas y zonas con canales iónicos concentrados que permite la conducción saltatoria, exclusivamente entre los nodos de Ranvier (zonas entre vainas de mielina que poseen canales iónicos). Esta propiedad otorga a las fibras a que la señal eléctrica que se mueve se mantenga constante y protegida gracias a las vainas de mielina. Diferente es en el caso de axones desnudos, como en el del calamar, que gradualmente va disminuyendo la intensidad del impulso eléctrico.
La llegada de los potenciales de acción a los terminales de la mayoría de las neuronas señala la liberación de neurotransmisores, que son exocitados en vesículas desde la neurona presináptica y se unen a receptores en la membrana de las neuronas postsinápticas, donde inducen la apertura de los canales iónicos regulados por voltaje. Esta señal puede ser excitatoria (como el flujo de sodio) o inhibitoria (como es el flujo de ion cloruro hacia el intracelular, o potasio hacia el extracelular). Una neurona recibe millones de sinapsis al día.
Terminación de la señal química
Existen transportadores que toman el neurotransmisor y lo vuelven a la neurona presináptica, para su reutilización.
El uso de dorgas afecta la comunicación, pues actúan sobre transportadores que afectan la fisiología del circuito del placer, del circuito dopaminérgico y serotoninérgico)
Ejemplos:
• Cocaína y anfetaminas bloquean el transportador de dopamina (asociado al placer) • Éxtasis bloquea el transportador de serotonina (asociado a la conducta)
si
Transducción de señales 1
-‐ Vías de comunicación son esenciales para regular la función celular a nivel sistémico -‐ En el organismo hay 104 células que deben comunicarse entre sí para coordinar funciones. -‐ Diferenciación à por medio de señales las células pueden cambiar su fenotipo -‐ Como respuesta a una señal, cada célula dependiendo de su diferenciación, tiene efecto distinto. -‐ Un receptor tendrá gran afinidad por su ligando mientras sea capaz de captarlo a bajas concentraciones y emitir una respuesta ante esa señal. -‐ La mayor parte de la comunicación celular se debe a moléculas extracelulares que están en muy bajas concentraciones <10 -‐8como: proteínas, péptidos pequeños, aminoácidos, esteroides, retinoides, derivados de ácidos grasos, gases en solución.
Existen 2 tipos de receptores: 1. Receptores de superficie celular: Son, generalmente, proteínas de transmembrana, y unen ligandos hidrofílicos 2. Receptores intracelulares: pueden ser citoplasmáticos o nucleares. Los ligando son moléculas hidrofóbicas o lipofílicos, como hormonas esteroidales, algunas proteínas, sales biliares, vitamina D, etc)
-‐ Proteínas intracelulares serán las mediadores entre el estímulo extracelular (ligando) y las proteínas efectoras que finalmente generarán una respuesta a nivel celular. -‐ Los sistemas de comunicación entre células tienen como objetivo: emitir y recibir señales, diferenciación celular, control de proliferación, comportamiento colaborativo y coordinado. -‐ Dependiendo de la proteína efectora final se producirán diferentes respuestas (a nivel metabólico, expresión genética, etc.) -‐ Las respuestas están compartimentarizadas dentro de la célula.
Señalización de corto y largo alcance: -‐ La distancia entre célula señalizadora y respondedora, determinan la velocidad de respuesta.
1. Contacto dependiente o interacción célula-‐célula: Común en el sistema inmune, ocurre entre linfocito T y una célula presentadora de antígenos por medio de su MHC. Una célula expone un ligando a una célula blanco que responderá. 2. Paracrina: La célula secreta una molécula y ésta tendrá efecto sobre sus células vecinas. Cuando la secreción es de tipo autocrina, la molécula secretada autoregulará a la misma célula que la generó. 3. Sinapsis: Potencial de acción viaja por el axón de una neurona, se abren canales de Ca+2 y se liberan vesículas con el neurotransmisor. Son respuestas rápidas, precisas y controladas por enzimas que degradan neurotransmisores para cesar la respuesta. Los receptores son de menor afinidad. La remoción de la señal se hace por hidrólisis o transportadores. La concentración en el espacio sináptico es muy alta. 10-‐4
4. Vía hormonal o endocrina: Respuestas más bien lentas, desde que se secreta la hormona hasta que llega a la célula blanco. En este caso los receptores son específicos y de alta afinidad. Concentración de señales 10-‐8 (pocos). Un ejemplo son las hormonas que se producen en la hipófisis y tienen un efecto a nivel periférico. Una célula puede responderá más de una hormona y lo hará de acuerdo al repertorio de proteínas intracelulares que posea.
Relación entre velocidad, tipo de respuesta y la naturaleza de la respuesta celular
-‐ Señales Rápidas (seg, min): No involucran cambios en expresión génica. Pueden ser cambios en la concentración de calcio, fosforilación de proteínas. No hay cambios en genes. Efectos: Cambios metabólicos, cambios en la forma celular, secreción, migración celular. -‐ Señales Lentas: Efectos en proliferación, diferenciación. Cambios en Expresión Génica. Se sintetiza un nuevo repertorio de proteínas que la hace diferenciarse y expresar otro fenotipo. También puede hacer apoptosis.
f
Diferentes efectos de la acetilcolina, dependiendo del tipo celular en el que actúa: 1. En corazón: Tiene un receptor metabotrópico (muscarínico en este caso), se abren canales de K+
y éste sale de la célula, produciendo una hiperpolarización, lo que genera la relajación de la célula cardíaca y disminuye la frecuencia cardíaca. 2. En músculo esquelético: Se une a receptor ionotrópico o nicotpinico en este caso (es un canal) el cual se abre y permite la entrada de Na+ , de despolariza la membrana y se contrae el músculo esquelético. 3. En glándulas salivales: Se une a receptor muscarínico en la glándula salival, que abre canales de Na+ se despolariza la membrana y produce secreción de gránulos que generan amilasa. Sub-‐tipos de receptores de superficie 1. Ionotrópicos: Es un canal, poro físico. Ej: receptor de IP3 (se abren canales de Ca en RE), Ach 2. Metabotrópicos: Acoplados a proteína G 3. Catalíticos: Tienen actividad quinasa propia o están acoplados a una actividad catalítica (JAK)
Morfógenos -‐ La identidad final de algunas células, durante el desarrollo, depende de su posición en gradientes de morfógenos. -‐ Algunos morfógenos: Shh, wnts, BMPs, FGFs -‐ Hay ligandos que dependiendo de su concentración, generan respuestas distintas. Si el ligando está cerca de su fuente de producción, la concentración es alta. Esto es lo que se conoce como variación por posición en una gradiente de concentración de la señal. -‐ La concentración relativa de un ligando, define su respuesta. -‐ Actúan de manera importante durante el desarrollo embrionario, pero en adultos también están presentes en nichos troncales, como en cerebro e hígado. -‐ Están involucrados en respuestas de diferenciación y proliferación, por lo que, cuando morfógenos mutan, se asocian a ciertos tipos de cáncer. -‐ La notocorda activa la placa del piso, genera Shh, el cual va cambiando sus concentraciones y generando distitnos tipos celulares (glía, motoneuronas, etc)
-‐ Un mismo tipo de célula puede recibir distintas señales, y las distintas combinaciones provocan cambios distintos en ella (supervivencia, proliferación, desarrollo, apoptosis). Esto es muy común en células epiteliales. -‐ Una misma señal puede producir diferentes respuestas en las distintas células, esto depende del repertorio de proteínas intracelulares que ella posea y del receptor. Esto ocurre en el caso de la acetilcolina (Ach como ligando).
Señalización por gas: Ligandos solubles -‐ Óxido nítrico (NO) à NO se produce por desaminación de la arginina por la Oxido Nítrico Sintasa (NOS) siendo la enzima eNOS la endotelial, nNOS la muscular y neuronal (constitutiva) y la iNOS inducible (presente en macrófagos). -‐ NO activa en algunas células a la guanilato ciclasa, que induce síntesis de GMPc y relajación del músculo liso, que en los vasos sanguíneos implica Vasodilatación. -‐ NO es de corto alcance, vida media muy corta 5-‐10 sec. -‐ GMPc se degrada rápidamente por la GMP Fosfodiasterasa (blanco del Viagra y sus derivados).
Ligandos liposolubles que activan receptores nucleares: -‐ Algunos de estos ligandos son: Vitamina D, ácido retinoico, testosterona, progesterona, estradiol, tiroxina (T3-‐T4), cortisol. -‐ Los receptores de estos ligando, tiene en común un dominio o zona de unión al DNA, cuando los receptores se unen a su ligando, exponen este dominio de unión y regulan la transcripción. Esquema de activación de estos receptores: 1. Cuando está inactivo, está unido a proteínas inhibitorias (co-‐ represores) 2. Cuando llega el ligando, el receptor cambia su conformación y suelta al co-‐represor y se une a un co-‐ activador (aumenta eficiencia de la transcripción). A veces la unión de un ligando genera una señal de translocación nuclear (pasa de citoplasma a núcleo). Si el sistema funciona como represor de transcripción, el ligando determina unión de co-‐ represores.
Tipos de receptores para ligando extracelulares: Están en la superficie celular (membrana) 1. Canales iónicos: Funcionan a favor de la gradiente de concentración
2. Receptores acoplados a poteína G: Hay más de 800 tipos. Son heptahelicoidales (con 7 dominios de transmembrana, receptor atraviesa la membrana 7 veces). Cuando llega el ligando, se activa el receptor y la proteína G cercana a él. Se desencadena la respuesta. * Proteína G actúa sobre un efector como la Adenilato ciclasa, que formara AMPc a partir de ATP (lo cicla), y éste AMPc actuará como segundo mensajero para desatar una serie de respuestas a nivel celular, una de ellas es activar a la PKA. Proteína G unida a GDP (inactiva) y a GTP (activa)
3. Receptores acoplados a enzima: Algunos tienen actividad quinasa propia y otros están acoplados a la actividad quinasa de otra proteína. Dimerizan, se autofosforilan y eventualmente fosforilan a otras proteínas.
Proteínas de andamio: Proteínas capaces de interactuar con varias proteínas que actúan para una señalización. Permiten compartimentarizar la respuesta y que ocurra la cascada de señalización, en donde se amplifica la señal, se producen segundos mensajeros, etc.
Fosfatidilinositol en la señalización Receptor GPCR: Receptor ubicado en la membrana celular, es heptahelicoidal y está asociado a una proteína Gq trimérica (tiene 3 subunidades, alfa, beta y gamma). Cuando llega el ligando al receptor GPCR, se activa la proteína Gq y la subunidad alfa (antes unida a GDP, se activa ya que el receptor GPCR intercambia el GDP por GTP), la subunidad alfa activa a la fosfolipasa C -‐ En este caso el mismo receptor GPCR actúa como GEF (intercambia GDP por GTP y activa a la proteína Gq) -‐ El complejo beta-‐gamma también puede interactuar con distintos efectores y activarlos. -‐ La fosfolipasa C activa, rompe el 4,5 fosfoinositol bifosfato en diacilglicerol (DAG) e IP3. -‐ IP3 actúa sobre el RE haciendo que salga Ca+2, este calcio se une al DAG activando a la PKC la cual comienza a fosforilar -‐ DAG e IP3 actúan como segundos mensajeros
-‐ La proteína quinasa IP3 quinasa, agrega grupos fosfato en posición 3 a los inositoles, siento el 4,5 fosfoinositolbifosfato (está en la membrana) el blanco de la fosfolipasa C.
¿Cómo hacer que no se acumule el calcio en el citoplasma? 1. Hacer entrar el calcio por medio de bombas de vuelta al retículo (Transporte activo) 2. Hidrolizar el IP3 a IP2 o pasarlo a IP4 3. El calcio se puede unir a proteínas para disminuir su concentración libre en el citoplasma
Proteínas G Proteína Gs à Adenilado ciclasa à AMPc à activa a PKA Proteína Gq à Fosfolipasa C à DAG e IP3 à activa a PKC -‐ Pueden ser monoméricas o trímericas (subunidades alfa, beta y gamma) -‐ Unidas a GDP están inactivas, y a GTP están activas -‐ Hay señales que se activan por fosforilación y otras que se activan por hidrólisis de nucleótidos, este último es el caso de activación de las proteínas G (acá no hay fosforilaciones)
Receptor GPCR y Adenilato ciclasa: -‐ GPCR es un receptor acoplado a proteína G, en el caso anterior era Gq, pero también puede estar acoplado a proteína Gs, en este caso se activará a la adenilato ciclasa, la cual ciclará el ATP para formar AMPc, el cual actuará como segundo mensajero y activará a la PKA. -‐ La adenilato ciclasa es una proteína de membrana con su lado catalítico hacia el citoplasma -‐ Toxina del Cólera: mantiene a Gs activa todo el tiempo y a la célula con elevados niveles de AMPc. Se inactiva la fosfodiesterasa (que degradaba los segundos mensajeros). -‐ El AMPc es de corta vida porque es hidrolizado por la AMPc Fosfodiasterasa. Funciones del AMPc: -‐Activación de Proteína Quinasa A (PKA) -‐Activación de canales iónicos de membrana -‐Activación del GEF de Rap1, que activa integrinas y adhesión celular. -‐ Un ejemplo de ligando que desencadena la respuesta de la adenilato ciclasa y producción de AMPc es la serotonina (neurotransmisor).
GEF: Intercambia GDP por GTP, activando a la proteína G GAP: Se asocia a la proteína G monomérica y actúa como cofactor para que la proteína G cumpla su rol de GTP asa, rompe GTP en GDP, se inactiva la proteína G
¿Cómo funciona la regulación por AMPc?
Efector de Calcio: CaMK -‐ Calcio activa la calmodulina que une Ca2+ que luego activa a una kinasa. -‐ Ca2+actúa como 2do mensajero. -‐ La calmodulina sólo se activa cuando se le une el calcio.
¿Cómo termina la señalización? -‐ Por medio de mecanismos de desensibilización de GPCR, estos mecanismos requieren de la fosforilación de GPCR por PKA, PKC o GRKs 1. Inactivación: El receptor al estar fosforilado, ya no interactúa con la proteína G 2. Secuestro del receptor: Receptor al no poder interactuar con la proteína G, se une a otras proteínas llamadas arrestinas, generan la internalización temporal del receptor (se desfosforila y recicla). 3. Regulación negativa: Internalización del receptor, se ubiquitina, y degrada en el lisosoma.
Concentración de AMPc Sin estímulo: 5 x 10-‐8M Post-‐estímulo: 10-‐6
PKA: serina/ treonina quinasa -‐ AMPc se une a las subunidades regulatorias de la PKA PKA: Fosforila CREB (factor de transcripción) importantes en procesos de memoria y aprendizaje. Hay neuronas olfatorias que funcionan con AMPc: -‐ Activan GPCRs con Golf que activa a Adenilato ciclasa. AMPc activa a canal de Na+ que permite entrada de Na+ y despolarización de la membrana neuronal. -‐ Hay aprox. 350 GPCR para detectar grupos de odorantes. Cada neurona produce un solo tipo de receptor.
Señalización por mecanismos de proteólisis
-‐ Involucra proteasas extra e intracelulares Vía Notch: -‐ Es una vía irreversible -‐ Hay una célula central que se especializa en neurona, dentro de un conjunto de células epiteliales precursores. La célula central expresa un Ligando de membrana (Delta) que le informa a las células adyacentes (que expresan Notch, el receptor) que no se pueden diferenciar a neuronas. -‐ En mamíferos, Notch funciona en muchos sistemas especificando el destino celular, tanto durante el desarrollo embrionario como en etapa adulta (en células troncales): Diferenciación Sobrevida/apoptosis Ciclo celular y en relación con nichos de células troncales -‐ Si la vía Notch llega a mutar, se produce crecimiento descontrolado de células troncales y eso lleva a cáncer.
1. Durante su biosíntesis en el Golgi: receptor queda con 2 subunidades y de esa forma se expone en la membrana 2. Cuando receptor se encuentra con el ligando Delta actúa una alfa-‐secretasa, haciendo que se exponga el fragmento carboxilo-‐terminal del receptor Notch 3. Este fragmento C-‐terminal es el sustrato para la gamma-‐secretasa, la cual vuelve a cortar el receptor, se separa el ectodominio del dominio intramembrana, este último (la parte soluble) viaja hacia el interior de la célula hacia el núcleo y regula la expresión de genes. -‐ La etapa que puede regularizarse es la interacción con Delta y el 2do corte proteolítico -‐ Gamma secretasa: Clave en producción del péptido que genera enfermedad de Alzheimer. Se intentó sacar el gen de esta enzima en ratones Knockout pero el resultado fue letal en el organismo ya que se bloqueaba la vía Notch. -‐ La vía Notch participa en la organogénesis, desarrollo del sistema vascular, sistema hematopoyético e inmune, sistema muscular esquelético, mucosa intestinal, entre muchos otros.
-‐ Existe una célula central que expresa el ligando Delta (se diferenciará a neurona) y muchas células alrededor que expresan el receptor Notch. -‐ Mientras el ligando Delta no se una al receptor Notch la vía está apagada. -‐ Cuando el ligando Delta es reconocido por el receptor Notch, se produce la proteólisis del receptor Notch, el cual se encuentra sólo una vez en la membrana y subre 3 proteólisis durante toda su vida:
Vía Wnt canónica: Se regula proteólisis de la β-‐catenina -‐ Receptores: Frizzled y LRP (co-‐receptor) Ausencia de ligando wnt à Complejo de destrucción está activo, GSK-‐3 (forma parte del complejo), fosforila a β-‐catenina, se ubiquitina y degrada en el proteosoma Presencia de ligando wnt à Ligando se une al co-‐receptor, el cual se fosforila haciendo que se inactive el complejo de destrucción (se desensambla) y se orienta hacia la membrama
-‐ Esta vía sirve para la diferenciación, organogénesis y proliferación. -‐ Cuando hay recambio celular con células troncales, está presente esta vía. En general, mutaciones en esta vía se asocian a cáncer. -‐ Tipos de ligandos Wnt: Familia formada por colesterol y lípidos, es un tipo de morfógeno que puede viajar en vesículas. -‐ Mutación en la proteína de andamio APC que regula el complejo de destrucción de beta Catenina, está mutado en el 80% de los tumores de colon. -‐ Wnt controla la proliferación de las células troncales. -‐ La perdida de la exposición al ligando promueve que salgan del nicho y dejen de proliferar. -‐ En todos los nichos troncales se concentran y funcionan todo el tiempo los ligandos Wnt.
Vía Hh (hedgehog) -‐ Hay un receptor Patched que une el ligando Hh y otro receptor intracelular que está inactivado por Patched llamado Smoothened Ausencia de Ligando Hh: Proteía Gli se fosforila, se ubiquitina y degrada. Sus fragmentos actúan como supresores de genes Presencia de Ligando Hh: Receptor Patched deja de inhibir a Smoothened, pues se internaliza y degrada en lisosomas. Smoothened se fosforila y activa y ahora impide que se fosforile Gli. Ésta entra al núcleo y transcribe.
-‐ Vía Hh no ocurre en cualquier parte de la célula, sino que en una estructura llamada Cilio Primario, sitio único que concentra la maquinaria de señalización.
-‐ Tanto Shh como Wnt tienen en común: en ausencia de ligando, hay un factor de transcripción que se degrada y la vía está inactiva. Mutaciones en estas vías generan cáncer:
-‐ Hh: carcinoma células basales, fibrosarcoma. -‐ Wnt: cáncer colorectal, hepatoblastoma.
Célula Troncal: - Las células hijas pueden ser pluripotenciales o comprometerse a un fenotipo diferenciado -‐ Características: 1. No está ni diferenciada ni comprometida. 2. Se puede dividir sin límite, condicionada por las condiciones del nicho 3. Cuando se divide, cada hija puede permanecer como célula Troncal o comprometerse a un linaje. -‐ Se encuentran en la médula ósea, hipocampo (cerebro), pelo, piel
I. Receptores con actividad serina/treonina quinasa
TGFβr (receptor) 1. Al unirse el ligando TGFβ el receptor forma un dímero. *En realidad, el receptor es un tetrámero, formado por 2 subunidades tipo I y 2 subunidades tipo II, pero para simplificar se habla de dímero. El dominio ser/tre quinasa de la subunidad tipo II del receptor fosforila a la cola citoplasmática de la subunidad tipo I. 2. El dominio quinasa de la subunidad tipo I fosforila a R-‐Smad (Smad 2 o 3), la cual abre su estructura, lo que le permite formar un dìmero con Smad 4 (le permite entrar al núcleo) 3. El complejo R-‐Smad/Smad4 ahora es capaz de entrar al núcleo, donde interactúa con el ADN y regula la transcripción génica. Tanto R-‐smad como Smad 4 poseen dominios hp (hairpin) que le permiten interactuar con el ADN.
-‐ Hay muchos variantes de receptores tipo I y II, los que al dimerizar forman distintas combinaciones, para interactuar con diferentes tipos de R-‐Smad. -‐ La Smad4 o co-‐Smad siempre es la misma. -‐ La subunidad tipo I del receptor posee especificidad para la R-‐Smad que va a fosforilar. -‐ La subunidad tipo II del receptor posee especificidad por el ligando. -‐ Generalmente el complejo R-‐Smad/Smad4 es un trímero, compuesto por 2(R-‐Smad) y 1 (Smad4).
R-‐Smad y Smad 4 poseen 2 dominios globulares MH1 y MH2. -‐ En MH1 está el dominio hp, el cual permite la unión con el ADN. -‐ “Basic Pocket”: Permite interacción con otras Smad o consigo misma y replegarse. -‐ En la cadena de unión de ambos dominios existen sitios quinasa que pueden ser fosforilados. -‐ Hydrophobic corridor: Presente en R-‐smad. Permite asociación con co-‐factores y proteínas en el núcleo para regular la transcripción génica.
La señalización Smad puede ser inhibida dentro y fuera de la célula Extracelular: Se secretan proteínas específicas que capturan al morfógeno (ligando) e impiden que este interactúe con su receptor, lo que va a impedir la cadena de señalización por vía Smad. Intracelular: I-‐Smad participa en la inhibición de la cadena Smad, lo que puede ocurrir en diferentes niveles en la cadena de señalización Smad. 1er nivel: I-‐Smad compite con R-‐Smad para unirse a la cola citoplasmática de la subunidad tipo I del receptor. 2do nivel: I-‐Smad se asocia a “Smurfs” (ubiquitin-‐ligasas) que se unen al receptor y lo ubiquitinan para que sea degradado. Ubiquitinan al receptor 1, pero como está unido al 2, todo el complejo se degrada. 3er nivel: I-‐Smad compite con R-‐Smad y se une a co-‐Smad (Smad4). Se forma complejo I-‐Smad/co-‐Smad, que puede entrar al núcleo e inhibir la unión de otro complejo R-‐Smad/co-‐Smad por competencia. *Un R-‐Smad fosforilado no unido a co-‐Smad no puede entrar al núcleo. 4to nivel: I-‐Smad/co-‐Smad entra al núcleo e impide unión del ADN con complejo R-‐Smad/co-‐Smad. *La expresión de algunos I-‐Smad es regulada por los propios R-‐Smad. (sistema se autoregula) *En todos los niveles de regulación existen fosfatasas que desfosforilan e inactivan el sistema. * I-‐smad no se puede unir al DNA pues no posee el dominio hp
II. Receptores asociados a una Tirosina Quinasa (JAK) -‐ Estos receptores son homodímeros, formados por 2 subunidades idénticas que interactúan al unirse el ligando. La unión del ligando puede ser de 2 formas: a) El ligando posee 2 dominios iguales que interactúan con ambas subunidades del receptor. b) El ligando posee 2 dominios de interacción distintos, y cada uno interactúa con una parte diferente de las subunidades del receptor (esto puede “cruzarse”, porque recordemos que las subunidades del dímero son iguales). -‐ JAK quinasa: Actividad tirosina quinasa, está asociada íntimamente a cada subunidad del receptor
Ruta de señalización 1. Cuando llega el ligando (citocina como la GH), receptor dimeriza, las JAK se autofosforilan de forma cruzada (JAK de una subunidad fosforila a la de la otra subunidad). 2. JAK fosforilada fosforila ahora las colas citoplasmáticas de las subunidades del receptor y deja tirosinas fosforiladas en las cosas que sirven como sitios anclaje para las STATs, las cuales reconocen la stirosinas fosforiladas gracias a su dominio SH2. 3. STAT fosforiladas se sueltan de la cola e interactúa con otras STATs y como dímeros entran al núcleo y regulan la transcripción (regulan metabolismo, crecimiento, diferenciación y proliferación). *La señalización puede ser a través de otras moléculas pero lo más común es la vía STAT * La familia de las STAT participa principalmente en el sistema inmune
III. Receptores con actividad Tirosina quinasa -‐ Estos receptores poseen dominios (1 o 2) en su cola citoplasmática con actividad Tirosina quinasa. -‐ Estos dominios son sitios de anclaje para proteínas señalizadoras con dominios SH2. -‐ Este sistema debe estar regulado porque una sobreexpresión gatilla tumores. Se encuentran como monómeros al estar inactivos, y al unirse su ligando dimerizan y se activan. -‐ Al acercarse ambos monómeros del receptor se fosforilan. Al ser uno de los monómeros del receptor un “dominante negativo” debido a alguna mutación o falla en la subunidad, las colas citoplasmáticas del receptor con los dominios quinasa no se fosforilan y no cumplen su función, inhibiéndose la señalización -‐ Los dominios tirosina quinasa de la cola citoplasmática al estar fosforilados sirven de unión para proteínas con dominio SH2 (que identifican a la tirosina fosforilada), los que son específicos pues también reconocen al contexto de aminoácidos cercano a la tirosina fosforilada. -‐ El dominio SH3 de estas proteínas actúa como sitio de unión para otras proteínas. -‐ El El dominio SH2 es como un “enchufe”. Es pequeño y compacto, puede estar presente en muchas proteínas. Posee un bolsillo que identifica a la fosfo-‐tirosina y otro bolsillo que reconoce el contexto aminoacídico de la fosfo-‐tirosina.
Regulación de la actividad de RAS
RAS: Proteína G monomérica que participa en la señalización de receptores Tirosina quinasa. GEF: Es un intercambiador GDP/GTP. Saca el GDP de RAS, y al haber una mayor concentración de GTP en la célula, éste llega al sitio donde estaba antes el GDP. GAP: Activa función GTPasa de RAS, lo que ocasiona la hidrólisis del GTP y la inactivación de la RAS.
*RAS: Activan rutas de las MAP quinasas. *Rho: Activan cambios en el citoesqueleto.
Activación de RAS por un receptor Tirosina quinasa activado
Colapso del cono de crecimiento mediado por GTPasas de la familia Rho: Cuando un axón está en crecimiento, debe existir una señal para que el crecimiento se detenga cuando llegue a la célula blanco para la sinapsis. 1. La célula con la que va a hacer sinapsis posee el ligando ephrin A1, el cual interactúa con su receptor EphA4 ubicado en la porción terminal del axón, el cual dimeriza y se activa fosforilándose en una Tirosina. 2. Una enzima Tirosina-‐quinasa con dominio SH2 se une al dominio fosforilado del receptor, al cual también se une Rho-‐GEF (pero no por dominio SH2, por otra interacción). La enzima Tirosina-‐quinasa fosforila a Rho-‐GEF, el cual se activa. 3. Rho-‐GEF saca un GDP de RhoA inactiva, a la cual se une ahora un GTP y activa a RhoA, lo que genera una contracción en filamentos de miosina y actina, lo que detiene el crecimiento del axón.
El receptor al unir a su ligando, se fosforila y se activa, uniéndose a él una proteína adaptadora (Drk o Grb2), la cual se asocia a un RAS-‐GEF (Sos), el cual saca el GDP de una RAS para que se le una un GTP y se active.
Ruta MAP quinasa (serina/treonina quinasas) activada por RAS: 1. Una RAS (ojo: RAS no es quinasa) al estar activa (unida a GTP) activa a MAPKKK (Raf) 2. MAPKKK activada fosforila a MAPKK (Mek) , activándola. 3. MAPKK activada fosforila a MAPK (Erk) , activándola. 4. MAPK activada fosforila diversas proteínas que funcionan como factores de transcripción, por ejemplo a c-‐fos, el cual interactúa con cjun, que unidos se unen a una zona del ADN llamado AP1.
Las especificaciones temporales en la activación de ERK permiten que las mismas señales lleven a proliferación o diferenciación. Dos receptores que gatillan a través de una misma ruta una señalización pueden dar origen a resultados distintos.
Ruta de señalización de PI3-‐k
-‐La IP3-‐K agrega un grupo fosfato al Carbono n°3 del anillo del fosfatidilinositol. Se obtienen diferentes tipos de inositoles dependiendo de las fosforilaciones previas que poseían. -‐ PI3 (3,4,5 fosfoinositoltrifosfato) está en la membrana y al estar fosforilado se activa como sitio de anclaje para distintas proteínas con dominios PH (como la PDK1 o Akt). -‐ Mutaciones en esta vía puede producir cáncer
Receptores ErbB: Poseen un dominio Tirosina-‐quinasa en su cola citoplasmática. Se fosforilan y activan en presencia de ligando. -‐ Generalmente cuando ErbB ya se unió a su ligando, para apagar la señalización, se endocitan, ubiquitinan y degradan en el proteosoma. Dependiendo de las concentraciones del ligando éste se puede reciclar y ser devuelto a la membrana. O pueden ser cortados por proteasas, con lo cual sus colas citoplasmáticas entran al núcleo actuando como factores de transcripción. -‐ Si la señalización vía ErbB nunca se apaga, ras siempre estará activa, activando a MAP-‐K y al final habrá mucha proliferación (cáncer). ErbB1: EGFR ErbB2: No posee ligando conocido, se cree que está asociado a un tipo de cáncer. ErbB3: Su dominio Tirosina-‐k es incapaz de fosforilar ErbB4 -‐ Todos estos tipos de ErbB forman dímeros al unirse al ligando que pueden ser hetero u homodímeros. -‐ La gran mayoría de los ligandos de ErbB son sintetizados como ligandos unidos a la membrana.
Transactivación de EGFR: El receptor es activado indirectamente, para lo cual se necesitan proteínas de tipo ADAM, las cuales cortan una proteína unida a membrana y la dejan en forma soluble. Las ADAM pueden cortar ligandos unidos a la membrana o receptores. -‐ Proteína G activada activa a las ADAM, las cuales cortan al pro-‐ligando unido a la membrana el cual se suelta y actúa como ligando de otro receptor, activándolo. -‐ Al cortarse un receptor, su ectodominio puede unirse al ligando inhibiéndolo, pues el ligando no podrá unirse a un receptor transmembrana capaz de iniciar una señal.
ADAM
EGFR y cáncer
-‐ Las rutas de señalización pueden activar las vías MAP-‐K e IP3-‐K, las cuales promueven 5 de las 6 características que tiene las células tumorales (sobre todo proliferación) -‐ Terapias: Inhibir por medio de un anticuerpo al receptor, y así el ligando no se puede unir Inhibir la actividad tirosina quinasa de estos receptores, inhibiendo la respuesta final.
Las vías se cruzan
Ruta exocítica I: RE y Golgi
Ruta exocíticaà Procesamiento de proteínas en RE y Golgi y exportación por vesículas al exterior Ruta endocítica à Captar proteínas extracelulares en la membrana, endosoma
-‐ RE à síntesis proteica -‐ Golgi à Procesamiento de proteínas *Dirección anterograda en rojo y retrograda en azul
Retículo Endoplasmático -‐ Es una red que se encuentra en prácticamente toda la célula -‐ Es un organelo membranoso y se observan poliribosomas en la membrana del RE -‐ Tiene contacto con la membrana nuclear y responde ante las proteínas mal plegadas -‐ Hay células en donde hay más RER o REL. Por ejemplo, en las células plasmáticas, como linfocitos B que participa en la producción de anticuerpos, células pancreáticas que producen muchas enzimas proteolíticas). -‐ Los ribosomas que se encuentran libres en el citoplasma son iguales a aquellos que se asocian al RE formando el RER. Su mensajero determina si estará libre o en el RER (asociado a su membrana) -‐ REL à participa en la detoxificación de drogas, muy presente en el hígado -‐ Albúmina se secreta en el hígado Técnicas de fraccionamiento subcelular: Sirve para aislar organelos y caracterizarlos. RE puede aislarse por medio de centrifugación, se generan diferentes gradientes. Las vesículas se someten a centrifugación al equilibrio, donde se separan las lisas de las rugosas por densidad. No se deben usar jabones que rompen la membrana.
Funciones del RE: -‐ Síntesis de lípidos: fosfolípidos y colestetol (Sintetiza colesterol pero no se observa en el RE, pues se libera rápidamente) -‐ Síntesis de hormonas esteroidales y sales biliares. Reacciones de detoxificación de compuestos liposolubles (citocromo P450) (funciones célula-‐dependiente) -‐ Secreción y recaptura de calcio -‐ Síntesis de proteínas de secreción y de membrana. Glicosilación de proteínas -‐ Activación de la respuesta a “proteínas mal plegadas” -‐ Exporte de proteínas en la ruta secretoria, en transportadores vesiculares. à Proteínas que son sintetizadas salen por vesículas de secreción (zonas específicas o dominios en el RE) hacia el Golgi para sufrir sus modificaciones. Síntesis de proteínas:
1. Reconoce el péptido señal, y se une a la subunidad mayor del ribosoma 2. Une GTP (P54: Subunidad del SRP que une GTP, tiene residuos de metionina) 3. Detiene momentáneamente la traduccional unirse al polipéptido naciente vía P54, hasta que lleva el péptido junto al ribosoma y su RNAm hasta la membrana del RE, donde estará el receptor SRP, el cual tiene GTP, por lo tanto hay un gasto energético para que ocurran los cambios conformacionales. Polipéptido es reconocido, SRP se suelta y el péptido queda asociado al poro. Cuando SRP se suelta puede funcionar en otra ronda.
Péptido señal: secuencia hidrofóbica del péptido que cuando es reconocida por el receptor del SRP en el RE, se abre el poro y entra la cadena polipeptídica. -‐ Luego el péptido señal es cortado por una peptidasa señal. -‐ En el RE hay un receptor para el SRP -‐ El translocón o poro es un complejo formado por varias proteínas. -‐ Cuando entra el péptido al RE, comienza a sufrir modificaciones post-‐traduccionales, como glicosilaciones.
-‐ Sub-‐unidad mayor y menor (reconoce el RNAm) -‐ Actividad catalítica (actúa como ribozima) -‐ Pool común de ribosomas, hay asociados a la membrana del RE y otros libres en el citoplasma SRP: Partícula robonucleoproteíca (tiene un RNA de 300 nucleótidos y 6 proteínas) que reconoce la secuencia “péptido señal” en la cadena polipeptídica del péptido que se está traduciendo hay hidrólisis de GTP, se abre un poro en el RE (translocón) y de esa forma la cadena polipeptídica se va insertando en el lumen del RE.
-‐ El péptido señal junto al SRP llevan al ribosoma a la membrana del RER -‐ SRP unido a GDP está inactivo, cuando se une a GTP se activa y es capaz de interactuar con su receptor. -‐ Existe un requerimiento energético para la entrada del péptido en el translocón. -‐ Hidrólisis de GTP también permite la salida de SRP y la entrada del péptido al poro del RE. El mismo SRP tiene la actividad GTPasa (hidrólisis de GTP). El receptor de SRP también tiene esta actividad GTPasa. -‐ Continúa la síntesis del polipéptido cuando ya entró por el poro, ocurre el corte del péptido señal por una peptidasa señal, y también ocurren modificaciones como glicosilaciones. El orden de estos procesos es relativo, pero la glicosilación es una modificación temprana. -‐ Péptido maduro no posee péptido señal -‐ Cuando el péptido señal es cortado, éste tiene una vida media muy corta y se degrada rápidamente.
Poro o translocón: Está compuesto por varias subunidades de proteínas sec61. Normalmente está cerrado (tapón), que impide la salida de iones y del péptido cuando se corta el péptido señal. La apertura del poro depende de la entrada del péptido y de la hidrólisis de GTP. -‐ El complejo de sec61 forma la unidad básica del translocón que está cerrado o abierto dependiendo de la síntesis de polipéptido.
-‐ A medida que se sigue traduciendo, el péptido va entrando al poro, es co-‐traduccional -‐ Membrana de RE protege al péptido de la acción de protesas que podrían cortarlos. -‐ Las membranas del retículo tienen actividad peptidasa (por esta razón se obtienen péptidos más pequeños. Al incubar esto se deben acoplar todas las partes simultáneamente). Dos características importantes del RE: 1. Ambiente dentro del RE es muy oxidante (aa que se pueden oxidar, como la cisteína, que formará puentes disulfuro al oxidarse) 2. También hay mucho calcio adentro del RE, sirve para el plegamiento de la proteína.
Proteína de membrana Tipo 1: -‐ Tienen su grupo N-‐terminal hacia el lumen de RE y el C-‐terminal hacia el citosol -‐ Cuando la proteína sale del RE y se posiciona en su destino final (en la membrana citoplasmática) se revierten los grupos, es decir, el N-‐terminal mira hacia el espacio extracelular y el C-‐terminal hacia el citosol. -‐ Tienen un solo dominio de transmembrana -‐ Tienen una secuencia Stop Tranfer, es una señal para que la proteína se libere del poro, pero sigue asociada a la membrana. -‐ Péptido señal (en rojo) es una secuencia hidrofóbica
-‐ Existe una variación de proteína Tipo 1, en donde no hay secuencia péptido señal,porque éste es interno y no se asocia al amino-‐terminal. En este caso la secuencia hidrofóbica tiene cargas.
Proteína tipo 2: En este caso el N-‐terminal esta mirando hacia el citosol y el C-‐terminal hacia el lumen del RE, cuando la proteína madura y se va hacia la membrana citoplasmática, el N-‐terminal mira el citosol y el C-‐terminal el espacio extracelular. También tienen solo un dominio de transmembrana.
-‐ A veces, la entrada al RE es post-‐traduccional, implica un gasto de energía Resumen: 1. En ribosomas unidos a la membrana del RE se sintetizan proteínas de secreción, enzimas y proteínas del RE, aparato de Golgi y lisosomas. La síntesis comienza con los ribosomas libres. 2. El péptido señal está compuesto por aminoácidos de carácter hidrofóbico, reconocido por la partícula de reconocimiento del péptido señal (SRP), la que a su vez es reconocida por un receptor en la membrana del RER. 3. Generalmente el péptido señal se localiza hacia el extremo amino-‐terminal de la proteína y se reconoce por sec61. Una vez insertado en la membrana es cortado por la peptidasa señal y degradado. También existen PS internos. 4. El SRP dirige tanto la unión del ribosoma a la membrana y permite la inserción de la proteína naciente al canal de transmembrana. La hidrólisis de GTP por la subunidad P54 del SRP y la subunidades del SRP-‐R son requeridas para el proceso de salida del SRP de la membrana, solo cuando el polipeptido está siendo translocado. 5. Las proteínas cruzan la membrana del RER en un estado desplegado a través del canal proteico, el translocón, un complejo multiproteico compuesto por el complejo sec61. 6. En células de mamífero las proteínas de membrana mínimas requeridas para la translocación son el receptor de SRP y el complejo sec61.
Modificaciones Post-‐traduccionales y Control de calidad en RER -‐ Las Proteínas neosintetizadas de membrana y luminales del RER experimentan una serie de modificaciones antes de alcanzar su destinación final: 1. Formación de Puentes disúlfuro 2. Plegamiento correcto 3. Incorporación y procesamiento de azúcares (carbohidratos). 4. Cortes proteolíticos específicos. 5. Ensamblaje de complejos multiméricos. 6. Degradación de proteínas mal plegadas (UPR)
Glicosilaciones : Modificaciones que sufren las proteínas y que son importantes en su plegamiento y en su función. Chaperonas: Proteínas que tienen 2 cisteínas, y una de ellas está hidrolizada. Por medio de ataques nucleofílicos ayuda a que las proteínas se plieguen hasta alcanzar su grado más estable. Esto ocurre simultáneamente mientras se van agregando los azúcares. Modificación post-‐traduccional: N-‐glicosilaciones -‐ Función de las glicosilaciones en el RE: plegamiento de proteínas y sistema de control de calidad -‐ Hay una secuencia (presencia de asparragina -‐ x-‐ serina/treonina). Ese tripéptido es señal de que la proteína sea glicosilada. -‐ X puede ser cualquier aminoácido excepto prolina -‐ El grupo amino de la asparragina se glicosila -‐ Cumple un rol importante en el plegamiento de la proteína -‐ Todas las proteínas que salen del RE pasan por un control de calidad, donde las proteínas mal plegadas no lo pasan. -‐ El dolicol es un lípido de la monocapa interna de la membrana del retículo endoplasmático. Su función es transportar oligosacáridos N-‐ligados hasta una proteína que haya sido sintetizada en el retículo endoplasmático. -‐ Este precursor, llamado Dolicol, unido a 2 fosfatos, es capaz de transferir el core de azúcares ( 9 manosas, 3 glucosas y 2 acetil )a la cadena polipeptídica. Este proceso catalizado por la oligosacariltransferasa. -‐ En este proceso ayudan chaperonas, las cuales son leptinas (reconocen azúcares) y además unen calcio, ayudando al plegamiento. -‐ Hay 2 chaperonas: Calnexina y calreticulina. Participan en el plegamiento de las proteínas, mediante el reconocimiento de los azúcares. Hay glicosidasas que quitan 2 glucosas a la proteína, la glucosa que queda es reconocida por estas chaperonas leptinas. -‐ Glicosidasa quita 2 residuos de glucosa -‐ Manosidasa quita 1 residuo de manosa
-‐ La glucosa residual en el centro es mantenida hasta que se alcance el plegamiento adecuado -‐ Al salir del RE, el centro de azúcares ha perdido las 3 glucosas, y una manosa, es decir, cuando la proteína sale del RE mediante vesículas hacia el Golgi, lo hace con 2 N-‐acetilglucosamina y 8 residuos de manosa. Esto constituye una proteína bien plegada que pasaría el control de calidad. -‐ Si la proteína no se pliega correctamente es una señal de estrés, que si no se repara lleva a apoptosis.
Modificación post-‐traduccional: Anclaje de proteínas a un tallo de GPI -‐ Una proteína puede ser sintetizada como una proteína de membrana. Existe una enzima que corta a la proteína y lo que queda en el lumen del RE se une al glicofosfatidilinositol. -‐ En este caso la misma enzima que cortó la proteína, será la que la une al GPI -‐ El tallo, es una parte del GPI que es reconocida por la enzima para que corte y que sirve de puente de anclaje del GPI con la proteína.
Vía retrógrada de Cis Golgi a RE: Recuperación de proteínas residentes de RE -‐ A veces las chaperonas salen junto con sus proteínas hacia el Golgi, para que regresen al RE,ellas tienen una secuencia en su C-‐terminal de 4 aminoácidos que es reconocida por un receptor KDEL ubicado en la membrana de la cisterna cis del Aparato de Golgi, cuando el receptor reconoce esta secuencia, las chaperonas regresan al RE. Resumen:
-‐ El ambiente oxidante del RER favorece la oxidación de los grupos SH de las cisteínas a enlaces S-‐S, mientras que esta reacción no está favorecida en el citosol. De esto se desprende que los puentes S-‐S son comunes en proteínas secretorias y en los ectodominios de proteínas de membrana, y están ausentes en proteínas citosólicas.
-‐ La enzima PDI, localizada en el lumen del RE cataliza el reordenamiento de los S-‐S, acelerando el plegamiento de proteínas de secreción y de membrana en el RER.
-‐ El Plegamiento de proteínas en el RER está facilitada por otras proteínas chaperonas como BIP y lectinas como calnexina y calrreticulina.
-‐ La glicosilación de proteínas comienza en el RE, por el reconocimiento de la secuencia Asn-‐X-‐Ser/Thr. El centro se transloca en el lumen del RE. -‐ En el RE la glicosilación cumple un papel clave en el plegamiento proteico. -‐ Solo las proteínas plegadas correctamente y con el centro de azúcares procesado, serán transportadas fuera del RE hacia el Aparato de Golgi.
-‐ El ensamblaje de subunidades para formar proteínas multiméricas ocurre en el RER.
-‐ Algunas proteínas del RE se retienen por la presencia de una secuencia KDEL en el carboxilo terminal que es reconocido por el receptor de KDEL, que cicla entre las zona cis del aparato de Golgi y el RE.
UPR: Respuesta a proteínas mal plegadas -‐ Permite eliminar proteínas mla plegadas y así evitar que la célula muera. IRE1 : Proteína de membrana en el RE que censa lo que ocurre en el lumen, tiene actividad quinasa intrínseca, se autofosforila, dimeriza y posee actividad endonucleasa, que cortará en lugares específicos sobre el RNAm inmaduro, ocurre splicing y el RNA al madurar genera un factor de transcripción (XBP1, gen o proteína regulatoria)que entrará al núcleo y activará genes que generen chaperonas. De esta forma, ellas ayudarán a plegar las proteínas mal plegadas, y las que ya no sean capaces de plegar, son ubiquitinizadas y degradadas en el proteosoma. -‐ Hipoxia, baja en glucosa, drogas, etc. Pueden generan condiciones que llevan a producir proteínas mal plegadas.
PERK: Quinasa que se fosforila y forma un dímero o más. Detiene la traducción de proteínas, se da cuenta que están saliendo mal plegadas y detiene el proceso, mientras intenta solucionarlo. AFT6: Aumenta la expresión de genes que se traducen en chaperonas, las cuales ayudarán al plegamiento de las proteínas.
Inductores químicos de la UPR Tunicamicina: Inhibe la formación del núcleo central de glicosilación de las proteínas en el RE y por lo tanto afecta el plegamiento de las proteínas Tapsigargina: Induce la liberación de Ca2+ desde el lúmen del RE al citoplasma afectando la función de chaperonas, como Calnexina y Calreticulina y RAP que requieren de Calcio para unir a los polipéptidos. Ditiotreitol (DTT): agente reductor que impide la formación de puentes S-‐S y por lo tanto afecta el plegamiento de proteínas y el ambiente redox luminal. Inicio de la UPR -‐ La proteína chaperona BIP/Grp78 se asocia a receptores de UPR en la membrana del RE y los mantiene inactivos (a PERK; IRE y ATF6). -‐ Si se induce la UPR por algún estímulo y se acumulan proteínas mal plegadas. Chaperonas como Bip/grp78 se suelta de los receptores para asistir el plegamiento y esto gatilla la activación de estos y el comienzo de la UPR.
Funciones de la UPR -‐ Las fases iniciales de la activación de la UPR tiene dos papeles claves: 1. Atenuación de la traducción y detención del ciclo celular por el receptor PERK que se autofosforila, oligomeriza y activa. Esto ocurre dentro de minutos a horas del inicio de UPR y evita sobrecarga de Proteínas en el lumen del RE. 2. Aumento de la producción de proteínas que participan en el plegamiento, como chaperonas (Bip/Grp78). En esta etapa participan: -‐ IRE 1: con actividad quinasa, que se autofosforila y homodimeriza. El dominio activado funciona como endonuclasa y activa XBP1, que como factor de transcripción activa promotores de genes de respuesta a UPR (Ejemplo de chaperonas). -‐ ATF6, factor de transcripción que al disociarse de Bip, se transloca al aparato de Golgi, donde se proteolisa y activa, translocándose al núcleo y activando expresión génica. OBJETIVO: Respuesta Adaptativa para remover proteínas mal plegadas y acumuladas, previniendo un estrés adicional al que causó la respuesta inicial y restablecer lo antes posible la función de RE. Si esto no se logra, se induce Apoptosis (Muerte celular programada).
-‐ Proteínas mal plegadas o subunidades no ensambladas se retienen selectivamente en el RER ya sea como agregados o porque están unidos a chaperonas. -‐ Las proteínas mal ensambladas son a menudo devueltas al citosol y son luego degradadas por el proteosoma previa ubiquitinación. -‐ La acumulación de proteínas mal plegadas en el lumen del RE induce la UPR. UPR tiene función de sobrevida celular, pero si se prolonga lleva a la Apoptosis. Aparato de Golgi -‐ Proteínas salen del RE y se van al Golgi vía vesículas secretorias -‐ Golgi cumple un rol central en la célula -‐ Tiene varias cisternas, las cuales se dividen por sus funciones en: Cisterna Cis: En contacto directo con las vesículas desde el RE, es la que recibe la carga. Cisterna Medial Cisterna Trans
-‐ Aquellas proteínas lisosomales, cuyo destino final es ir a los lisosomas, sufren una modificación en donde un residuo de manosa es fosforilado y esto es una marca que indica que su destino final es el lisosoma. -‐ Las vesículas se fusionan con la cisterna Cis y las proteínas comienzan a sufrir modificaciones. Hay procesamiento de azúcares (remoción de manosas) -‐ Recordar que en RE las proteínas perdieron 1 manosa y 3 glucosas. En la cisterna Cis pierden 3 manosas más y se incorpora 1 N-‐acetilglucosamina. -‐ Para saber en qué cisterna se encuentran las proteínas, se usa Endoglicosidasa H (endo H), que rompe enlace entre dos N-‐acetilglucosamina. Solo cuando la Glicoproteína tiene la estructura alta en manosa (5) y por lo tanto deja a la proteína sin N-‐glicosilación. -‐ Cuando la proteína aún es suceptible a endo H (aún puede ser cortada por ella), significa que aún no pasa a la cisterna medial. -‐ También se sintetizan proteoglicanos -‐ Luego cuando pasa a la cisterna medial, pierde 2 manosas más y a nivel más trans se agregan azúcares más complejos como Galactosa y ác.Siálico (Ác. N.acetilneuraminico) . Estos azúcares están conjugados con nucleóticos (como UDP). En la zona trans hay transportadores especiales que permiten la entrada de estos azúcares con nucleótidos. -‐ La compartamentalización del procesamientode los oligosacáridos, está dada por la presencia de los transportadores de nucleótidos-‐azúcar de las glucosiltransferasas en las distintas cisternas del Golgi. -‐ En la cisterna trans también ocurren sulfataciones -‐ A nivel más Trans ocurre la segregación de proteínas, donde se van a vesículas para irse a los distintos destinos en la célula. Vesículas transportan las proteínas modificadas a las diferentes partes.
Funciones del Aparato de Golgi: 1. O-‐glicosilación
2. Síntesis de proteoglicanes 3. Procesamiento proteolítico: Existen endoproteasas (enzimas proteolíticas) dentro del Golgi, como las furinas, que cortan 2 aminoácidos positivos. Son distintas modificaciones y procesamiento de proteínas. 4. Modificación de enzimas lisosomales y segregación en su transporte: Proteínas lisosomales, sufren una modificación en donde un residuo de manosa es fosforilado (manosa 6 fosfato) y esto es una marca que indica que su destino final es el lisosoma. 5. Segregación de proteínas de acuerdo a su destino final: Proceso que ocurre en el Trans Golgi. En donde las proteínas se separan para dirijirse a su destino final, dependiendo si son enzimas lisosomales, secretorias, regulatorias, etc.
Segregación proteica
Proteasa del Golgi
Las N-‐glicosilaciones ocurren en el RE y las O-‐glicosilaciones en el Golgi -‐ Se diferencia en que la O-‐glicosilación es la N-‐acetilgalactosamina la que se une a la Treonina por enlace covalente.
Ruta exocítica II: Rutas de transporte en vías secretorias
-‐ Normalmente los flujos son bidireccionales, continuos, regulados y se mantiene la integridad del organelo. Proteínas (residentes) vuelven a su organelo de origen. Esto permite recuperar las proteínas residentes y en el fondo evita la desaparición del organelo. -‐ Ruta exocítica à Vesícula se fusiona con la membrana plasmática y se libera su contenido -‐ Ruta endocítica à Partículas desde el espacio extracelular entran a la célula y se forma una vesícula con el contenido desde el extracelular. -‐ Esto no ocurre en forma espontánea, es decir, no está favorecido termodinámicamente, se necesitan muchas proteínas que ayudan a formar la yema.
-‐ Vesículas que recorren una mayor distancia, requieren de proteínas motoras asociadas al citoesqueleto. Esto ocurre en el caso de la neurona, en donde la vesícula debe recorren un largo trayecto desde el Golgi hasta la punta del axón, donde es liberado. -‐ Las vesículas se forman y se fusionan con el organelo blanco. También existe un flujo retrogrado, donde las proteínas residentes regresan a su organelo de origen. Proteínas de cubierta: Proteínas que cubren a la vesícula que se va a transportar, son capaces de deformar la membrana para que se forme la vesícula y participan en la concentración de cargas. -‐ COP I: Cubierta de las vesículas que se originan en el Golgi durante el flujo retrogrado y también anterogrado entre las cisternas. -‐ COP II: Cubierta de las vesículas que se originan en el RE hacia el Golgi
Clatrina: -‐ Es una proteína formada por tres cadenas pesadas y tres cadenas ligeras que forman una estructura llamada triskelio. -‐ Las cadenas pesadas interactúan con las proteínas adaptadoras y con las cadenas livianas. -‐ Forma una red fibrosa constituida por 12 pentágonos y 8 hexágonos. 36 triskelios -‐ Su función principal es recubrir las vesículas en el proceso de transporte entre membranas -‐ Los triskelios unidos a la membrana conforman una caja poliédrica que provoca la invaginación de la membrana -‐ La clatrina se encuentra alrededor de las vesículas que transportan proteínas TM, ligadas a la glicosilfosfatidilinositol(GPI) y secretadas des del golgi hasta la membrana plasmática. -‐ Es importante en la formación de vesículas y en el flujo retrogrado de los gránulos de secreción inmaduros de vuelta al Golgi. También es importante en la endocitosis. -‐ Funciona como un entramado proteico que no se relaciona directamente con las membranas, sino que hay proteínas adaptadoras que la asocian a ellas. Clatrina y Transporte entre membranas -‐ Los trisqueliones unidos a la membrana provocan la invaginación de esta membrana dando lugar a vesículas. Cuando se produce la gemación de una vesícula, la clatrina se desprende de su unión a la membrana. Una vez la vesícula está libre de clatrina, ésta se acopla a los late endosomas, los precursores inmediatos de los lisosomas, fusionándose las membranas de ambos. Relación entre la clatrina y la endocitosis -‐ La endocitosis es un mecanismo de la célula que permite introducir material extracelular dentro de la célula. Mediante este proceso, las vesículas recubiertas de clatrina actúan para incorporar diferentes moléculas como por ejemplo LDL. A partir de la invaginación de una porción de la membrana plasmática son transportadas hasta las destinaciones intracelulares.
COP I y II: Tienen capacidad de proteínas adaptadoras, que reconocen las cargas para la segregación. -‐ Una vez que se forma la vesícula se pierde la cubierta -‐ Recordar que por la difererencias de pH, el receptor de KDEL reconoce a la chaperona en el Golgi y no antes. -‐ A medida que se avanza en sentido anterogrado, se van acidificando los organelos.
-‐ En el dominio citoplasmático de KDEL de la chaperona, hay señales para que se unan a COPII y así viajen juntas al Golgi (la chaperona, junto a la vesícula y la proteína en su interior). Compartimiento intermedio tubular o VTCs: Zona de transición ubicada entre el RE y Golgi, esta zona se fusiona con la cara Cis del Golgi. Este compartimiento recibe las vesículas que estaban cubiertas con COPII. -‐ Alimentado por vesículas anterógradas desde RE y lugar de salida de vesículas retrógradas con Cop I -‐ Ruta anterograda es dependiente de microtúbulos. Cuando se usan drogas como el nocodazol , cambia la dinámica de los microtúbulos, con lo cual se afecta la vía anterograda desde el RE al Golgi. -‐ Cuando las proteínas llegan a la cara cis-‐medial del Golgi, la manosidasa saca manosas. Comienzan las modificaciones a medida que avancen por el Golgi. Modelos propuestos de transporte a través del Golgi a) Modelo de transporte vesicular: Hay flujo anterogrado y retrogrado de vesículas b) Modelo de maduración de cisternas: Hay proteínas muy grandes que no entran en vesículas, por lo que se dice que se transportan por medio de túbulos y se cree que las cisternas se van convirtiendo de cis a medial a trans. La cisterna misma va cambiando su composición. Es una vía más bien retrograda. La formación de túbulos requiere de proteínas ubicadas en la cara trans.
Rutas de transporte Golgi-‐endosomas y membrana plasmática
-‐ La segregación de proteínas ocurre en la cara trans del Golgi, capacidad de generar vesículas con distintos destinos (lisosomas, secreción constitutiva o secreción regulada) -‐ Existen proteínas que forman lisosomas y otras que forman gránulos de secreción, estas últimas actúan ante una señal externa, se asocian a un aumento del Ca+2 y liberan sus gránulos de secreción. Receptor de manosa 6 fosfato: Proteína de membrana que tiene en su dominio luminal un bolsillo que reconoce a la manosa 6 fosfato. Su dominio C-‐terminal mira al citoplasma y se asocia a proteínas adaptadoras que a su vez se asocian a la clatrina. -‐ Los gránulos se producen desde el Golgi y por medio de un ligando u hormona extracelular, se produce una cascada de señalización, aumenta el calcio y esto hace que la proteína libere sus gránulos. -‐ La maduración de los gránulos es un proceso intrínseco. La señal extracelulares induce que este gránulo ya maduro se fusione con la membrana y se liberen.
Páncreas exocrino: Se producen vesículas secretorias con enzimas digestivas.
Formación de vesículas de secreción: Exocitosis regulada
Gránulos con insulina: Las células Beta del páncreas presentan gránulos con insulina. Estos gránulos inmaduros están cubiertos por clatrina, cuando ya está maduro se observa un gránulo más concentrado y sin la cubierta de clatrina -‐ La ventaja de que los gránulos estén concentrados es que, en presencia de ligando, se liberará una gran cantidad de proteínas. Es un sistema eficiente. -‐ Insulina se sintetiza como un precursor, que luego formará insulina madura. Para madurar sufre de modificaciones como proteólisis que ocurren en el Golgi (TGN, Trans Golgi network) -‐ Este proceso es estimulado por glucosa, la cual hace glicólisis y aumenta el ATP en la celula (cambia la razón ADP/ATP). Se bloquea la salida de potasio, despolarizándose la membrana, lo cual estimula la entrada de calcio. Esta entrada de calcio permite que las vesículas cargadas de insulina se fusionen con la membrana y excreten su contenido. -‐ Para que se concentre el contenido una de las cosas que se puede hacer es aumentar la acidez. -‐ Hay un canal de cloruro que esta inhibido con ADP, con la entrada de ATP se activa, y ocurre la entrada de cloruro a la célula, aumentando la acidez. -‐ Esta señal de glucosa, en el fondo, sirve para la maduración y la secreción de los gránulos. Secreción regulada de insulina Secreción de histamina: Aparte de secretar proteínas en estos gránulos, también se pueden secretar aminas, como la histamina, la cual se asocia a proteoglicanos para concentrarse. Es otro tipo de secreción regulada.
-‐A veces las mismas proteínas tienen la capacidad de autoagregarse y se van concentrando -‐ Por otro lado, el gránulo va perdiendo membrana en el flujo retrogrado (desde el gránulo al Golgi) -‐También el lumen se va acidificando, esto favorece la agregación.
Biogénesis de Lisosomas y Sistema endosomal I Zona Cis à Maquinaria que reconoce enzimas que serán lisosomales -‐ Enzima N-‐acetilglucosamina fosfotransferasa (le da especificidad al proceso) y reconoce un parche proteico en la proteína que será lisosomal. Agrega un grupo fosfato con un grupo N-‐acetilglucosamina en la posición 6 de la manosa. -‐ Luego la enzima N-‐acetilglicosidasa quita el grupo N-‐acetilglucosamina -‐ Cuando esta proteína lisosomal llega a la zona trans, es reconocida por el receptor de manosa 6 fosfato (proteína de membrana tipo 1). Se libera la cubierta y la vesícula se fusiona con el endosoma (donde el pH es más ácido), esto ayuda a disociar la enzima lisosomal del receptor. -‐ A la proteína lisosomal se le elimina el grupo fosfato una vez que llegó al endosoma, y de esa forma ésta no puede volver. -‐ Hay vesículas que transportan el receptor de manosa 6 fosfato de regreso al Golgi desde el endosoma. Estás vesículas tienen una cubierta llamada retrómero.
-‐ Este endosoma va a originar al lisosoma, ya que parte de su membrana se va concentrando y además va concentrando su contenido, originando el lisosoma (los organelos van madurando) -‐ Endosoma temprano, madura a endosoma tardío y éste genera un lisosoma en donde hay un pH muy bajo y es capaz de degradar moléculas (Endosoma no es capaz de hacerlo).
Lisosomas: Concentra funciones de degradación de la célula (sistema digestivo celular). Pueden degradar diferentes compuestos que vengas desde el extracelular, pero también elementos propios (endofagia), en donde envuelve a los organelos defectuosos en una membrana y los degrada.
-‐ Degrada macromoléculas de todos los tipos: Proteínas, Acidos Nucleicos, Carbohidratos, Lípidos, varios ésteres. -‐ Organelos digestivos: recambio -‐ 50 enzimas hidrolíticas • Para todas las clases de macromoléculas • Productos de bajo PM pasan al citosol • Todas funcionan con un pH óptimo ácido(4.6) Hidrolasas acidas: Activas a pH 5 (dentro del lisosoma,); Inactivas si se liberan al citosol (pH 7.2) -‐ Bomba de H+ para generar pH contra concentración -‐ Membranas contienen proteínas especializadas: Altamente acídicas y Altamente glicosiladas (ambas características protege a las enzimas lisosomales de la hidrólisis)
Sorting Defectuoso Causa Enfermedad
1. Enfermedad de Células I: Defecto genético -‐ No se adiciona M6P a hidrolasas lisosomales en fibroblastos -‐ Las enzimas se secretan desde la célula, lisosomas no funcionales. -‐ Acumulación de inclusiones (I-‐cell)
2. Enfermedad de Tay Sach -‐ Enfermedad de acumulación lisosomal, debido a una mutación en la enzima B-‐N-‐hexosaminidase-‐A* -‐ Acumulación de glicolípidos sin degradar dentro del lisosoma -‐ Encontrado en neuronas del SNC
-‐ Cuando la N-‐acetilglucosamina fosfotransferasa está mutada y las enzimas lisosomales no sufren su modificación, éstas no irán hacia el lisosoma, aunque sí pueden ser secretadas. Cuando esto falla, se crearán menos lisosomas y ocurrirá una acumulación de elementos a ser degradados, generando diferentes enfermedades. -‐ Cuando fallan lipasas, proteasa, etc se producen algunas enfermedades específicas.
Fosfatidilinositol: Es importante para darle la identidad a las diferentes membranas, para el trasnporte y su función. -‐ Recluta la maquinaria de transporte y señalización -‐ Cada inositol tiene la capacidad de reclutar diferentes proteínas. -‐ Quinasas y fosfatasas agregan y quitan grupos fosfatos, generando distintos inositoles -‐ El 4,5 es el que está normalmente en la membrana citoplasmática -‐ El IP3 es el que está normalmente en las membranas de los endosomas, en donde es capaz de reclutar varias proteínas, entre ellas el retrómero. -‐ Existen proteínas adaptadoras que se unen específicamente a los distintos inositoles.
Ruta exocítica III: Maquinaria de transporte vesicular
Etapas en el transporte vesicular de proteínas: 1. Formación de la cubierta: Reclutamiento de proteínas citosólicas, selección de carga, deformación de membrana, yemación, fisión (liberación de la vesícula). 2. Liberación de cubierta: hidrólisis de GTP y/o ATP 3. Reconocimiento de membrana blanco y anclaje 4. Fusión de membranas
-‐ Durante la formación de la vesícula ninguno de los procesos es espontáneo GTPasas: *Recordar que al inicio de la traducción (cuando el RNAm unido a su ribosoma entra al RE), el SRP y su receptor SRP tenían actividad GTPasa. -‐ También existen GTPasas que tienen relación con la formación de la cubierta y que regulan el proceso de transporte en diferentes etapas. -‐ Son proteínas que tienen una conformación diferentes si están unidas a GTP o GDP, esto hace que puedan interactuar con efectores distintos. -‐ Cuando están unidas a GTP son capaces de reclutar las proteínas de la cubierta para formar la vesícula que será posteriormente transportada -‐ Primero se forma una yema, se rompe el cuello por una proteína específica llamada dinamina, y así se formará la vesícula. -‐ Una vez que se forma la vesícula, esto activa la propiedad GTPasa, entonces habrá hidrólisis de GTP en GDP, soltándose la cubierta (la cual se unía gracias al GTP). La vesícula se libera rápidamente al hidrolizarse el GTP. A veces, experimentalmente, se asocian análogos de GTP no hidrolizables para que la cubierta dure más tiempo rodeando la vesícula. -‐ Clatrina à no es un adaptador, pues no es capaz de interactuar directamente con la membrana, sino que requiere adicionalmente de proteínas adaptadoras para hacerlo. No así COP I y II. -‐ GTPasas pequeñas: reclutan cubierta, modifican indirectamente composición lipídica.
Favoreciendo la fisión, favorecen el proceso de segregación de la carga
Proteínas participantes en las distintas etapas:
1. Proteínasde Cubierta: Clatrina, Adaptadores (complejosAP1, AP2, AP3, AP4), GGAs (en Golgi), Retrómero, Coatómeros (COP-‐I, COP-‐II) 2. Receptores para la carga y la cubierta 3. Proteínas de anclaje: Etapa de reconocimiento 4. SNARES: fusión de membrana 5. Rabs: Regulación del proceso a varios niveles Transporte anterógrado entre RE y Golgi: vesículas con COPII y sar1p Transporte retrógrado entre Golgi y RE: vesículas con COPI y ARF Transporte entre cisternas de Golgi : vesículas con COPI y ARF Transporte entre Golgi y sistema endosoma/lisosoma: vesículas con clatrina, ARF/AP1 o GGAs Transporte entre endosoma y aparato de Golgi: Cubierta “retrómero” Transporte entre Golgi y membrana plasmática: Menos caracterizado COP I à Transporte de proteínas entre Golgi y RE (Retrógrado) y entre las cisternas del Golgi (anterogrado) COP II à Transporte de proteínas de membrana y secreción entre RE al Golgi * Las vesículas con clatrina son aquellas que salen desde el Golgi hacia los endosomas y aquellas destinadas a la membrana plasmática que son de secreción regulada * Las partículas con coatómero (COP I y II) son aquellas que están entre RE y Golgi y además se cree que COP I forma la cubierta de aquellas vesículas que salen desde el Golgi hacia la membrana plasmática, pero con secreción constitutiva. Vesículas con COP II desde el RE al VTC: -‐ Primero la proteína sar1 (GTP asa) debe activarse, para ella se usa la proteína GEF llamada Sec12 que se encuentra en la membrana del RE (es una GEF que sólo se encuentra en el RE, es por esto que la Sar1 sólo se activará en el RE). -‐ Cuando Sar1 está con GTP será capaz de reclutar a las primeras proteínas que formarán la cubierta -‐ Primero se recluta a Sec23/Sec24, son las primeras en asociarse para formar complejo COP II, éstas son las encargadas de comenzar a concentrar la carga. -‐ Sec 24 tiene un bolsillo que es capaz de interactuar con la carga (proteína a ser transportada) -‐ Luego se recluta Ser13/Ser31 que son las que formarán la vesícula en sí. Deforman la membrana y además están asociadas a la actividad GTPasa que se produce una vez formada la vesícula, gracias a esto se suelta la cubierta. -‐ Luego Sec16 también se asocian al complejo -‐ Las Snare se incorporan en las vesículas en formación.
-‐ El reclutamiento de las diferentes proteínas es secuencial -‐ Se cree que el fenómeno de salida es activo, es decir, hay señales en las proteínas que serán transportadas que son reconocidas por el receptor. Carga es seleccionada al expresar alguna señal e interactúa con la maquinaria de formación de la vesícula. -‐ Túbulos derivados del RE son intermediarios en el proceso de transporte
Algunas Patologías asociadas a la ruta secretoria dependiente de la maquinaria de COP II 1. Enfermedad de retención de quilomicrones(CRD) y Enfermedad de Anderson: Poco frecuentes, autosómica recesiva, caracterizada por Diarrea crónica, fallas en el desarrollo, hipocolesterolemia. Mutaciones en gen sar1b, que codifica para la GTPasa Sar1b (subtipo de Sar1). Pacientes retienen partículas lipoproteicas intestinales, deficiencia de vitaminas liposolubles (ejemplos, vitaminas E y A). Al estar mutado Sar 1, no se reclutarán las proteínas de la cubierta y por ende no se formará la vesícula. 2. Defectos se asocian a mutaciones o ausencias de componentes de COPII (Sec 23, 24, 13 y 31), con acumulación de colágeno II en retículo, defectos en la secreción de elementos de la matriz extracelular de fibroblastos y condrocitos. En el desarrollo de pez cebra, se ven defectos en la condrogénesis craneofacial.
Vía retrógrada Golgi – RE e intracisternas del Golgi, vesículas con COP I: -‐ A diferencia de las vesículas COP II, en este caso la cubierta se recluta a la membrana en bloque una vez activada la GTPasa pequeña llamada Arf1… -‐ Las cubiertas de estás vesículas están formadas por Arf 1(GTPasa), coatómero (complejo de 7 proteínas) y proteínas de membrana que reclutan el coatómero. -‐ Arf1 es una proteína que tiene una modificación lipídica (ác.graso), está miristpilada (por ácido mirístico), esta modificación le permite interactuar con la membrana del Golgi, pero de manera débil. -‐ Hay una proteína GEF (intercambiador GDP/GTP), que activa a la Arf1 y hace que esta pueda interactuar de manera más fuerte con la membrana y así recluta a las proteínas de cubierta para formar COP I.
Brefeldin A (BFA): Hongo que bloquea a las GEF y por ende no se forma la vesícula, pues siempre la GTPasa (Arf1) estará unida a GDP, es decir, inactiva y no podrá reclutar a las proteínas de la cubierta.
Etapas en la formación de vesículas con COP I: 1. Formación de la cubierta: Reclutamiento de proteínas citosólicas, selecciónde carga, deformaciónde membrana, yemación. 2. Fisión (liberación de la vesícula). 3. Liberación de cubierta: hidrólisis de GTP Transporte retrógrado desde cis Golgi al retículo: Reciclaje y recuperación de proteínas de retículo -‐ Receptor de KDEL en el Golgi reconoce proteína chaperona con su señal KDEL (señal de 4 aa: lys, Ac. Asp, Ac.glu, leucina, ubicados en el C-‐terminal de proteínas residentes) soluble en el lumen del Golgi, se une a su receptor y esta unión es reconocida por la cubierta COP I y de esa forma se devuelve la chaperona regresa. Sirve para proteínas residentes luminares del RE como BIP,
RAP y otras -‐ Proteínas de membrana residentes de RE que reciclan tienen secuencia en su dominio citoplásmico del tipo KKXX reconocido por la cubierta COP I
Etapas finales en el transporte vesicular: Anclaje y fusión
-‐ Las proteínas de anclaje dan la especificidad. -‐ La fusión de membranas no es un proceso espontáneo y es asistido por proteínas Snares Snares: Proteínas de fusión. Hay una V-‐snare (vesicular) y una T-‐snare (target) que está en la membrana del organelo aceptor. Estos snares se unen fuertemente, forman alfa-‐hélices muy resistentes y estables y cuando se acercan liberan energía que es utilizada para unir y fusionar las membranas. -‐ Para soltar la interacción tan fuerte entre T-‐snare y V-‐snare se requiere de ATP (hidrólisis de ATP) y se reciclan (para unirlos no requiere ATP pues el complejo por si sólo libera energía)
Proteínas Rab: Proteínas que modulan el acercamiento de las snares, al interactuar con proteínas de anclaje. -‐ Rab es una GTPasa que normalmente está inactiva unida a GDP, ya que se asocia a una proteínas GPI (Inhibidor del intercambio de GDP por GTP), que la mantiene inactiva. -‐ Entonces, para que se active la Rab aparte de que se active una GEF que agregue el GTP, se disociar la GPI del complejo. -‐ Rab modula la eficiencia del proceso en diferentes etapas. -‐ Si Rab siempre estuviera unida a GTP se alteraría todo el tráfico (se formarían organelos más grandes)
Funciones reguladoras de las Rabs, pueden ser directas o indirectas tales como: 1) Facilitar el proceso de yemación de vesículas. 2) Asociación de vesículas al citoesqueleto (transporte de vesículas). 3) Reclutar complejos de anclaje y facilitar el anclaje de la vesícula a la membrana blanco (hace más específico el evento posterior de fusión). 4) Facilitar el apareamiento de SNAREs.
Fusión homotípica en la formación de organelos: Fusión de vesículas iguales, con v-‐y t-‐snares, que generan organelos como VTC (entre RE y Golgi), endosomas tempranos.
Rutas de transporte Golgi -‐ endosomas y Membrana Plasmática
Secreción Constitutiva: Las moléculas se secretan en forma automática, la producción de proteínas es continua y el producto se descarga apenas es elaborado. Ej en la secreción de colageno por el fibroblasto. Secreción Regulada: La síntesis en más o menos continua, el producto secretorio es almacenado en el citoplasma en gránulos especiales cuyas membranas poseen características particulares provistas por el golgi que hacen que nunca sean exocitados en ausencia de un estimulo especifico. Proteínas lisosomales: Destinadas a los lisosomas, se forma un Endosoma temprano y luego tardío y este último forma el lisosoma. Vesículas cubiertas con clatrina, Arf1* y AP1
-‐ Ruta Golgi-‐Endosoma tardío/lisosoma: vesículas cubiertas con clatrina -‐ Ruta Endosomas -‐Golgi: Cubierta “retrómero”
Complejos adaptadores: Son 4 complejos proteícos -‐ AP 1: Se asocia a vesículas cubiertas con clatrina desde el Golgi -‐ AP 2: Participa en endocitosis, también son vesículas cubiertas con clatrina -‐AP 3 y 4: Tienen funciones menos conocidas
-‐ AP 1 y 2 tienen subunidades pesadas y livianas. Las pesadas son las que interactúan con la clatrina, con las proteínas que serán transportadas, con los lípidos de la membrana y con otras proteínas -‐ Son proteínas de andamiaje, que modulan la interacción con otras proteínas y moléculas.
Adaptadores monoméricos GGAs: -‐ Entre Golgi y Endosomas -‐ Tienen un dominio de interacción con la cadena pesada de la clatrina, interactúa con la Arf1 GTPasa que estaba ubicada en el Golgi y reconocen secuencias de aminoácidos ácidos de las proteínas que van a transportar (como receptores, un ejemplo de receptor sería el M-‐6-‐P)
Formación de vesículas cubiertas con clatrina:
Dinamina: Proteína que rompe el cuello para que se produzca la fisión y se suelte la vesícula de la membrana de origen (no se requiere en COP II) -‐ Corresponde a otra proteína GTPasa, al estar unida a GTP rompe el cuello y se produce la fisión o rotura -‐ Es importante en aquellas proteínas que tienen mucho colesterol, ya que en estos casos es más difícil que se produzca la fisión. -‐ Mutantes de dinamina (análogos de GTP no hidrolizable) bloquean la fisión, entonces no se produce la rotura y se acumulan muchos cuellos
Hay una señal peptídica (secuencia de aminoácidos) en el dominio citoplasmático del receptor (podría ser el receptor de M-‐6-‐P) el cual está unido a su ligando por dentro o hacia el lumen del organelo. Esta señal permite que el receptor interactúe con proteínas adaptadoras y éstas a su vez interactúan con la clatrina, formándose la cubierta.
Complejo adaptador “Retrómero” que media transporte vesicular entre endosoma-‐TGN
-‐ Si se altera la dinámica de los microtúbulos se afecta el transporte de vesículas, tanto del RE al Golgi, como del Golgi a la Membrana plasmática (vía anterograda) -‐ Microtúbulos son importantes durante todo el procesos de transporte vesicular.
El retrómero posee varias proteínas que reconocen el IP3, el cual es muy abundante en la membrana del Endosoma temprano. -‐ Lípidos junto con proteínas modulan y regulan la identidad de los organelos.
Endocitosis: Funciones: 1. Incorporación de Nutrientes 2. Limpieza 3. Regulación de respuestas activadas por ligandos/señalización 4. Inmunidad 5. Infección viral
¿Cómo la célula internaliza las moléculas y otras células? Existen 3 grandes tipos de endocitosis, se diferencian en la maquinaria que utilizan para la internalización. 1. Pinocitosis: Beber celular, es constitutivo. Se internalizan líquidos y partículas pequeñas como neurotransmisores. Es la más inespecífica, endocita fluidos y depende de las moléculas que existan en el LEC en ese minuto, es poco selectivo. Se deforma la membrana y se producen filopodios, ocurre la protrusión de la membrana (proceso de extensión de la membrana) 2. Fagocitosis: Es el comer celular. Se endocitan bacterias, las cuales tienen moléculas que son reconocidas por los receptores. La membrana se deforma, cambia el citoesqueleto de actina para generar proyecciones y cambian los PI (se genera PI3 por la PI3 kinasa, el cual favorece la fagocitosis). Se produce un fagosoma, el cual se fusiona posteriormente con el lisosoma -‐ Actúan macrófagos y neutrófilos -‐ Es un proceso gatillado por la interacción de la partícula a fagocitar y receptores en la célula. 3. Endocitosis mediada por receptores: Cuando llega el ligando, su receptor se endocita unido a él. Es la forma más específica de endocitosis. Se generan vesículas cubiertas por clatrina, dinamina corta el cuello y posteriormente la vesícula se fusiona con el Endosoma temprano, para que ocurra la fusión debe haberse desprendido la cubierta de clatrina.
Etapas en el proceso de fagocitosis:
Activación de RHO GTPasas llevan a cambios locales en PIPs y polimerización de actina.
Distintas vías de Entrada a la Célula por eventos de internalización de membrana
Endocitosis mediada por cavéolas: Las cavéolas son dominios de la membrana ricos en glicoesfingolípidos y colesterol (Balsas lipídicas). Además tienen una proteína llamada caveolina, la cual es una proteína integral de membrana, no es una cubierta. Este tipo de endocitosis siempre requiere de dinamina. -‐ Las vesículas de caveolina son más pequeñas y después de fusionarse con el Endosoma temprano, se recicla. Las vesículas de caveolina no requieren de cubierta, pues las cavéolas al tener mucho colesterol les otorgan rigidez.
-‐ Caveosomas: Agregados de vesículas con caveolina, se fusionan con el Endosoma sin perder la caveolina. -‐ Hay endocitosis clatrina y caveolina independientes y pueden usar o no dinamina -‐ Determinados tipos de virus (SV40 y respiratorio sincicial) se endocitan mediante caveolas. El virus interactúa con la membrana plasmática, hay un cambio en el citoesqueleto de actina y se forma la vesícula con caveolina. A veces estas vesículas se fusionan directamente con el RE generando muchas proteínas virales. -‐ Dominantes negativos de caveolina, donde la vesícula no se podrá formar (no habrá fisión)
-‐ Receptores tienen la capacidad de moverse a través de la membrana, esto les permite moverse a zonas de la membrana ricas en caveolina y así se produce la endocitosis mediada por cavéolas. -‐ Patching: acumulación de receptores en una zona determinada de la membrana plasmática. -‐ Unión ligando-‐receptor se da frente a condiciones específicas, como pH -‐ A medida que se endocita una partícula, los compartimientos por los q pasa se van acidificando. -‐ LDL y su receptor de LDL tienen más afinidad a pH fisiológico (7) à se endocita vía clatrina -‐ En el lisosoma la interacción ligando receptor casi no existe (pH es muy ácido)
3 Vías endocíticas mediadas por receptores: caveolina, clatrina y caveolina-‐clatrina independientes. Todas se fusionan en el Endosoma temprano, este se va al Endosoma tardío y luego se degrada en el lisosoma.
Curva A: Unión especifica e inespecífica de ligando marcado. Experimental . Curva C:Ligando marcado pero en presencia de 100 veces de exceso de ligando sin marca saturando los receptores (finitos). El ligando marcado se une a los sitios inespecíficos. Experimental. Curva B: Resulta de la resta de las curvas A de C. Todo el ensayo se hace a 4 grados.
En la generación del gradiente, participan: -‐Bomba de H+ (V-‐ATPasa) -‐NHE3 -‐Transportador de Cl-‐
Clases de endocitosis
Clase Ligandos Generalidades I LDL, insulina, M6P, fibronectina, interferon, Receptores reciclan, pero no
unidos a su ligando II Transferrina Receptor recicla unido a su
ligando III EGF, NGF, Glucagón, Insulina, GH, GC, TSH,
Interleuquinas. Receptor se degrada y no recicla
IV IgA, IgG, insulina, EGF, fibronectina Receptor hace transcitosis
Clase I: -‐ Receptor de LDL -‐ LDL (ligando) tiene componentes tanto proteicos como lipídicos -‐ Cuando receptor se une a LDL se forma vesícula con clatrina y ésta se va a un Endosoma temprano donde el ligando se desprende de su receptor. -‐ Recepotor vuelve a la membrana plasmática (reciclaje). Señales en la C-‐terminal del receptor hacen que se reconozca por otras maquinarias que hacen que se recicle. -‐ Ligando sigue su ruta degradativa hacia el lisosoma -‐ Cuando hay deficiencias en receptores de LDL ocurren hipercolesterolemias. Mutación en el receptor, es una patología hereditaria en donde habrá mucho nivel plasmático de LDL. Síntomas: Santomas (acúmulos de grasa), arteriosclerosis (lleva a infarto). Habrá problemas en la liberación del LDL de la sangre.
* Si se muta la región para el reciclaje, el receptor de LDL no volverá a la membrana, por lo que habrá menos receptores en ella y el LDL se endocitará menos y se acumulará.
A. Receptor de LDL se une a su ligandos LDL, se recubre de clatrina y se endocita. B. Receptor mutado no es capaz de reclutar clatrina, no se forma la vesícula, LDL no se endocita y se acumula. * Receptor de LDL tiene su C-‐terminal hacia el citoplasma y su N-‐terminal hacia el LEC. Tiene una región que une el ligando y otra región de reciclaje.
Orden en que ocurren las cosas: ¿Cómo se crea una vesícula? 1. Unión de ligando: reclutamiento de receptores 2. Yemación 3. Fisión 4. Cubierta
Clase II: -‐ Receptor de Transferrina -‐ Receptor en la membrana une ferro-‐transferrina (Transferrina unida a Fe), se forma la cubierta de clatrina (mediada de adaptadores AP2) y se endocita. Cuando la vesícula llega al Endosoma temprano, el receptor no se desprende del ligando, el cual ahora es apotransferrina (liberó el Fe), entonces ligando-‐receptor se reciclan juntos. Por medio del Endosoma de reciclaje (fragmentos del Endosoma temprano) -‐ La apotransferrina (sin unir Fe) a pH 7 no es capaz de endocitarse por su receptor como lo hace la ferro-‐transferrina.
Clase III: -‐ Es la vía clásica o más común, en donde actúan receptores con actividad quinasa -‐ Ligando unido a su receptor internaliza, desatan cascadas de señalización intracelular. -‐ Se degradará tanto el receptor como el ligando (no se reciclan)
Clase IV: -‐ Receptores hacen transcitosis -‐ Para que ocurra la transcitosis debe haber una célula que tenga una polaridad, es decir, dominios de membrana con componentes diferentes a otro. -‐ Ej: Célula epitelial tiene dominios que exponen diferentes receptores dependiendo si se trata de la cara apical (rosada) o basolateral (verde) -‐ Esta polaridad se mantiene por interacciones célula-‐célula como tight junctions
-‐ Transcitosisà Si un receptor en la cara apical une ligando, se endocita, y la vesícula llegará a Endosoma temprano y se libera el ligando en la cara basolateral de la célula. El receptor se puede degradar o reciclar nuevamente hacia la cara apical de donde vino. -‐ La transcitosis ocurre en células de membrana plasmática asimétrica y depende de la endocitosis -‐ A pH bajos no debiera degradarse el receptor -‐ Puede ocurrir de cara apical a basolateral o al revés -‐ Receptor de Ig à Madre entrega inmunidad pasiva o innata a su hijo, esta inmunidad se traspasa por medio de transcitosis. Madre entrega sus Inmunoglobulinas desde la sangre a su hijo y éstos por transcitosis pasan al embrión. -‐ También ocurre transcitosis en el lumen intestinal Adaptadores: Los adaptadores reconocen la carga y ayudan al acoplamiento de la cubierta de clatrina AP1: Adaptador ubicado en Golgi para crear vesículas con clatrina hacia el Endosoma AP2: Adaptador ubicado en la membrana plasmática para endocitar vesículas cubiertas de clatrina. Señales de internalización: -‐ Todos los receptores en su porción citoplasmática o intracelular tienen una señal de internalización o de endocitosis en su cola C-‐terminal, la cual tiene residuos de aminoácidos aromáticos (tirosina y fenilalanina). Otros tienen motivos de leucina o bileucina y otros tienen señales por mono o multiubiquitinación. -‐ Estas señales reclutan adpatadores (AP2) y así se formará la cubierta de clatrina y se internaliza formándose la vesícula con ayuda de la dinamina. -‐ Por mutaciones de los aminoácidos de estas secuencias de internalización, se sabe si estas son o no importante para la endocitosis, -‐Debe haber coincidencias de receptores, PI, clatrina y AP2 para que ocurre la endocitosis. -‐ Receptor se une a AP2 y ésta se unirá a la clatrina -‐ Dab2 y ARH son moléculas monoméricas (sin subunidades) que también pueden reclutar la clatrina -‐ Fisión de vesículas cubiertas con clatrina es dependiente de dinamina y de la hidrólisis de GTP
-‐ Para que la vesícula se fusione posteriormente con el Endosoma, se debe desprender la cubierta de clatrina, este proceso requiere de una proteína ATPasa llamada Hsc70, la cual al hidrolizar ATP logra que se desprenda la cubierta y así se fusione con el Endosoma. -‐ Sinaptojanina: es una proteína que ayuda a que cambien los fastidilinositoles -‐ Endosoma temprano es alimentado por la fusión de vesículas endocíticas sin cubierta
Cuerpos multivesiculares: -‐ Endosoma tardío tiene muchas funciones, es más que un paso previo a la degradación. -‐ A veces el Endosoma tardío tiene cuerpos multivesiculares (hexosomas)y se ha visto que estas vesículas tienen otros destinos más que la degradación. -‐ Cuando una célula fagocita a una bacteria, en el Endosoma tardío habrán vesículas con fragmentos de las bacterias, estás vesículas saldrán del Endosoma y se fusionarán con otras células (Amplificación del sistema inmune). Esto explica que hayan células que, sin haberse expuesto directamente a una bacteria, expresen sus fragmentos. -‐ Lo mismo ocurre en el caso de los tumores. -‐ Hay hexosomas que se liberan por la cara apical o basolateral de la célula. -‐ En el Endosoma temprano se ubiquitinizan los receptores, esta señal quedará adentro de la vesícula y es una señal que indica que se formen cuerpos multivesiculares. Cuando estos cuerpos mutivesiculares se fusionen con otra célula quedarán en su membrana.
-‐ ESCRT: Maquinaria para llevar una carga determinada a cuerpos multivesiculares. Son los responsables de su formación. Participan desde el reconocimiento del receptor ubiquitinizado hasta que la vesícula se libere y se fusione con otra célula.
Escrt 0: Reconoce Escrt I y II: comienzan la invaginación Escrt III: forma anillo en la membrana para cerrar la vesícula
Participación de Fosfatidilinositoles en rutas de tráfico: PI 4,5 à Membrana plasmática PI3 à Endosoma temprano Cuerpo mutivesicular tiene PI 3,5 y las vesículas en su interior tienen PI 3 PI4 à Golgi
Endosoma de señalización: -‐ Hay otro tipo de Endosoma, llamado Endosoma de señalización, los cuales están antes del Endosoma temprano. -‐ En estos Endosomas, los receptores aunque estén dentro de la célula pueden seguir señalizando intracelularmente (como EGF receptor). Hay otros receptores que requieren endocitarse para poder señalizar. Luego de señalizar, pasarán a un Endosoma temprano y tardío. -‐ Hay receptores que se encuentran en las dendritas de las neuronas y que para señalizar requieren endocitarse desde las dendritas y viajar por mcirotúbulos hacia el axón en donde van a señalizar. Endosomas se mueven por medio de proteínas motoras como la dineína.