32
WCS/REBIOMA Tsiky Rabetrano Biodiversity data manager [email protected] Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité, 07 Octobre 2015

Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

  • Upload
    others

  • View
    1

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

WCS/REBIOMA

Tsiky Rabetrano Biodiversity data manager [email protected]

Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA

De la science à la prise de décision

Symposium sur la Biodiversité, 07 Octobre 2015

Page 2: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Mission

Améliorer la planification intégrée de la

conservation et du suivi de la biodiversité à

Madagascar.

Page 3: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Comment?

Capitalisation des données sur la

biodiversité (“Données”)

Utilisation de différents outils pour

la gestion et la gouvernance

(“Services”)

Page 4: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

REBIOMA - Données: Portail de données

http://data.rebioma.net

Page 5: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Objectif

A propos et pour Madagascar

Fournir des données d’occurrences de la biodiversité mises a jour, validées pour la communauté de la conservation a Madagascar

Page 6: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Validation automatique

des données

Taxonomie

Distribution

Validation par les experts

Modélisation de la

distribution des espèces

Taxonomie, coordonnées

géographiques, date

Oui

Non

Oui

Non

Données

Données validées

Données évaluées

Professionnels Sciences

Planification

de la

conservation

Utilisateurs

Applications

Qualité de données

Données

Specimens Recherche Publications

Modèles de distribution

Visualisation, Requêtes,

Téléchargement

Données invalides

No

tifi

cati

on

Structure et fonctionnalité du portail

Page 7: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Quelles Données ?

Qui ? Collectionneur, chercheur

Quoi ? Espèce, Taxonomie, Caractéristiques

Où ? Localité, Coordonnées

géographiques

Quand? date d’observation

Données d’occurrence d’espèces

Page 8: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Chargement des données

(1) Format de données à charger

Format DarwinCore Norme de métadonnées développées pour la description et la

découverte de la diversité biologique

Champs minimum requis:

YearCollected: Année de collecte

Genus: genre

SpecificEpithet: espèce

DecimalLatitude

DecimalLongitude

GeodeticDatum

CoordinateUncertaintyInMeters,

NomenclaturalCode. (cf. http://rs.tdwg.org/dwc/terms/index.htm

Page 9: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Taxonomie

Référence Taxonomique :

Validité taxonomique

Géographie

Bio-Geomancer:

Validité géographique

(1) Validation automatisée

Processus de validation de données

Page 10: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Validation automatique

des données

Taxonomie

Distribution

Validation par les experts

Modélisation de la

distribution des espèces

Taxonomie, coordonnées

géographiques

Oui

Non

Oui

Non

Données

Données validées

Données évaluées

Professionnels Sciences

Planification

de la

conservation

Utilisateurs

Applications

Qualité de données

Données

Specimens Recherche Publications

Modèles de distribution

Visualisation, Requêtes,

Téléchargement

Données invalides

No

tifi

cati

on

Page 11: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

- Les Experts sont notifiés sur les nouvelles

données

- Les Experts marquent les données :

« fiable » ou « questionnable »

(2) Validation par les Experts (Comité de

validation Taxonomique) ou Taxonomic Review

Board

Processus de validation de données

Page 12: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Validation automatique

des données

Taxonomie

Distribution

Validation par les experts

Modélisation de la

distribution des espèces

Taxonomie, coordonnées

géographiques

Oui

Non

Oui

Non

Données

Données validées

Données évaluées

Professionn

els Sciences

Planificatio

n de la

conservatio

n

Utilisateurs

Applications

Qualité de données

Données

Specimens Recherche Publications

Modèles de distribution

Visualisation,

Requêtes,

Téléchargement

Données invalides

No

tifi

cati

on

Page 13: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Portail de données en ligne http://data.rebioma.net

Page 14: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

- Modélisation automatique à partir de données publiques et privées certifiées

par les experts

- Par le logiciel de modélisation MAXENT

(http://www.cs.princeton.edu/~schapire/maxent/) est utilisé pour produire

continuellement ces modèles de distribution

inputs: données d'occurrence évaluées fiables + données environnementales

pour plusieurs époques.

Modèles de Distribution des espèces

Page 15: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Occurrences

data

Boophis madagascariensis

+

Environmental data

PFC 2000 9 variables

climatiques

+

Page 16: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

suitable habitat

Page 17: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Données (terrestres et marines)

Données Privées Publiques Total

Occurrences 67 046 146 066 213 112

32% 68%

Certifiées 51 880 112 940 164 820

77%

Privée Publique Total

Espèces 2 082 4 848 6 930

Marine 1 289 1 293 2 582 37%

Septembre 2015

Page 18: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Communauté d’experts (TRB)

Statistiques sur les TRB

Terrestre:

Flore: 16 experts

Faune: 17 experts

Marine:

06 experts

Page 19: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Portail en live

Page 20: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,
Page 21: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Comment créer un compte?

Page 22: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,
Page 23: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,
Page 24: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,
Page 25: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Species explorer

Page 26: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Data dashboard

Page 27: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Mise en ligne des données

(1)

(2)

Page 28: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,
Page 29: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,
Page 30: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,
Page 31: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

GBIF et REBIOMA

- En cours de discussion avec les « data owners »

pour le partage des données Publics dans le portail

GBIF

- Renforcement de capacité en IPT

- Adresse IPT de rebioma : ipt.rebioma.net

Page 32: Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA€¦ · Réseau de la Biodiversité de Madagascar: REBIOMA De la science à la prise de décision Symposium sur la Biodiversité,

Misaotra!