Schema VT16 bima15 mikrobiologi v1.5 - Lunds universitet...BIMA15 mikrobiologi VT16 (v1.5) Vecka 1. Bakteriella strukturer. FL: Grundläggande bakteriologi FL: Introduktion till examinationsuppgiften

BIMA15 mikrobiologi VT16 (v1.5)

Vecka 1. Bakteriella strukturer. FL: Grundläggande bakteriologi FL: Introduktion till examinationsuppgiften WS: Introduktion till TBL (Team Based Learning) FL: Bakteriella strukturer

Vecka 2. Bakteriell cellvägg och uppbyggnad. FL: Cellväggens uppbyggnad TBL: Gruppmöte 1 TBL: Readiness Assurance Tests (RATs)

Vecka 3. Metabolism; förberedelser inför lab FL: Bakteriell metabolism

TBL: Planering för laboration S: Kamratgranskning/Författande S: Riskanalys vid laboration

Vecka 4. Bakteriologilaboration Bakteriologilaboration

Vecka 5. Genreglering i bakterier Laboration uppföljning S: Metabolism FL: Bakteriell genreglering

Inskick delmål 1 för kamratgranskning

Vecka 6. Bakteriella genetiska element FL: Akademiskt skrivande

Inskick feedback kamratgranskning WS: Referenshantering Inskick frågor (Vad är svårt?)

TBL: Gruppmöte 2 TBL: Readiness Assurance Tests (RATs)

Vecka 7. Repetition och Kamratgranskning Tillämpning: Genreglering

EL: Vad var svårt? Inlämning av färdigt arbete för kamratgranskning

Vecka 8. Avslutning Inlämning av Feedback på kamratgranskning

Deadline för slutlig inlämning av examensuppgiften. Skickas in till Moodle.

VT 2016 [CELLBIOLOGI - MIKROBIOLOGI (BIMA15) 22.5HP]

2

Kurslitteratur Flera alternativ av kurslitteratur kan användas och diskuteras med kursledare innan start. I

mikrobiologi rekommenderas Microbiology – An Introduction (10-11th ed) av Tortora, Funke och

Case. Mycket information kommer också att utvinnas via den medicinska datorbasen PubMed.

Lärare EB Eleni Bratanis, IKVL, B14 [email protected]

FP Frida Peterson, IKVL, B14 [email protected]

JD Jonatan Dereke, IKVL, B11 [email protected]

MH Magnus Hillman, IKVL, B11 [email protected]

OS Oonagh Shannon, IKVL, B14 [email protected]

RL Rolf Lood, IKVL, B14 [email protected]

MB Matthias Bank, ITK [email protected]

Lokaler

RG – Rune Grubb

LabBio – lablokaler

C315 - HSC

C218/C217 – Datorsal HSC


3

Lokaler för Gruppmöten.

12/2 11/3 Baciller

I1208 I1208

Streptococker

I1211 I1211

Staphylococker

I1212 I1212

Bakteriofager

I1245 I1245

Bdellovibrio

I1250 I1250

Undervisningsmoment FL = Föreläsning

S = seminarium

WS = workshop

TBL = Team based learning

RATs = Readiness Assurance Tests


4

Kunskapsmål

Under kursmål 1 – redogöra för human- och bakteriecellers övergripande morfologi och strukturella

organisation samt mekanismer för transport av joner och molekyler över cellmembranet

• Att beskriva olika morfologier för bakterier • Att redogöra för uppbyggnaden av cellväggar för både Gram-positiva och Gram-negativa

bakterier • Att redogöra för strukturella skillnader mellan LPS och LTA • Att beskriva peptidoglykanlagrets uppbyggnad • Att redogöra för skillnader i en bakteries cellstruktur och en human cell • Att redogöra för andra strukturer på bakteriers yta, inkluderande pili och fimbrier

Under kursmål 3 – beskriva hur en gen ser ut och uttrycks samt förklara transkriptions- och

translationsbegreppen och redogöra för likheter och skillnader mellan eu- och prokaryota celler

• Att redogöra för generella skillnader mellan en bakteriell kromosom och humana kromosomer

• Att redogöra för extrakromosomala element i bakterier (plasmider, bakteriofager, mobila genetiska element), samt exemplifiera hur dessa kan påverka bakteriens förmåga att överleva under olika förhållanden

• Att redogöra för generell genreglering i bakterier och uppbyggnaden av operon • Att översiktligt beskriva hur mikrobiella element (plasmider, bakteriofag-DNA) kan användas

inom (molekylärbiologisk) forskning

Under kursmål 6 – redogöra för grundläggande metabola processer i cellen samt hur de samverkar

och regleras

• Att beskriva anaerob och aerob respiration • Att redogöra för bakteriell fermentering • Att beskriva bakteriell fotosyntes och hur detta tillför energi

Under kursmål 7 – redogöra för grundläggande metodik vid rening och analys av DNA, proteiner och

bakterier, samt immunkemiska visualiseringstekniker

• Att redogöra för olika sätt att växa bakterier

• Att känna till hur vi kan använda bakterier för att producera protein

Under kursmål 9 – redogöra för olika skaltyper, deskriptiv statistik, grundläggande statistiska analyser

och hypotesprövningar

• Att känna till begrepp som median, medelvärde och normalfördelning i samband med

mikrobiologiska frågeställningar


5

Färdigheter och förmåga

Under mål 1 – planera, utföra, dokumentera och skriftligt sammanfatta laborativt arbete

• Att i samråd med handledare planera, utföra, dokumentera och skriftligt sammanfatta ett

mikrobiologiskt arbete

Under mål 2 – söka vetenskaplig litteratur, samt hantera referenshanteringsprogram

• Att självständigt söka vetenskaplig litteratur till stöd för påståenden i den mikrobiologiska

rapporten, och hantera referenserna med ett referenshanteringsprogram

Under mål 3 – statistiskt analysera och presentera egna data

• Att sammanställa egna data från laborativt arbete i en rapport

• Att använda statistiska tankesätt för att beskriva hur erhållit material är fördelat


6

Vecka 1. Bakteriella strukturer

Dag Tid Lektion Grupp Lokal Lärare Mån 1/2

Tis 2/2

10.15-12.00 13.00-14.00 14.00-16.00

FL: Grundläggande bakteriologi Introduktion till examinationsarbetet WS: TBL

RG

RG RG

RL

RL

MH/RL

Ons 3/2

Tors 4/2

10.15-12.00

FL: Bakteriella strukturer

RG

RL

Fre 5/2


7

Vecka 2. Bakteriell cellvägg och uppbyggnad


Tis 9/2

10.15-12.00

FL: Cellväggens uppbyggnad

RG

RL

Ons 10/2

Tors 11/2

10.00-12.00 13.00-15.00

Referenshantering och artikelsökning – grupp 1 Referenshantering och artikelsökning – grupp 2

C217

C217

MB

MB

Fre 12/2

10.15-12.00 13.00-16.00

Gruppmöte 1 RATs och diskussion

Grupp

C315

RL

RL


8

Vecka 3. Metabolism, förberedelser inför lab


Tis 16/2

10.15-12.00 13.15-15.00

Tillämpning 1 – Mikrobiologisk laboration FL: Bakteriell metabolism

C315

RG

RL

OS

Ons 17/2

Tors 18/2

10.00-12.00 13.00-16.00

S: Kamratgranskning; Författande av texter Laborationen – planering/risker

C315

C315

MH

RL

Fre 19/2


9

Vecka 4. Bakteriologilaboration


Tis 23/2

9.00-12.00 13.00-16.00

Lab dag 1 Lab dag 1

1

2

LabBio

LabBio

EB/RL

EB/RL

Ons 24/2

Tors 25/2

9.00-16.00

Lab dag 2

1

LabBio

EB/RL

Fre 26/2

10.00-16.00

Lab dag 2

2 LabBio

EB/RL


10

Vecka 5. Genreglering i bakterier


Tis 1/3

9.00-10.00 10.15-12.00

Lab (plattor) S: Metabolism

LabBio RG

RL

OS/FP

Ons 2/3

Tors 3/3

10.00-12.00

FL: Bakteriell genreglering

RG

RL

Fre 4/3

16.00

Deadline inskick första kamrat-granskningen


11

Vecka 6. Akademiskt skrivande


☐

Tis 8/3

9.15-12.00 18.00

FL: Akademiskt skrivande; Studieverkstaden Feedback kamratgranskning

RG

Ons 9/3

Tors 10/3

10.00-12.00 13.00-15.00 16.00

Referenshantering - workshop grupp 1 Referenshantering - workshop grupp 2 Inskick frågor (Vad är svårt)

C218 C218

JD

JD

Fre 11/3

10.00-12.00 13.00-16.00

Gruppmöte 2 RATs och diskussion

Grupp

C315

RL

RL


12

Vecka 7. Repetition och Kamratgranskning


Tis 15/3

9.00-12.00

Tillämpning - Genreglering

C315

RL

Ons 16/3

Tors 17/3

10.15-12.00 16.00

EL: Vad var svårt? Deadline: Lämna arbete för kamratgranskning

RG

RL

Fre 18/3


13

Vecka 8. Kamratgranskning och Inlämning laborationsrapport


Tis 22/3

16.00

Deadline: Kamratgranskning klar

Ons 23/3

Tors 24/3

Fre 25/3

16.00 Deadline: Inlämning rapport


14

Gruppindelning under TBL och kamratgranskare TBL grupper Kamratgranskare Labgrupp

Baciller

Ariana Friberg Hanna Barresjö Johanna Johansson Nikolaos Karabelas Oskar Lundin Elin Meigård

Johanna Johansson Nikolaos Karbelas Oskar Lundin Elin Meigård Ariana Friberg Hanna Barresjö

1a 1a 1b 1b 1c 1c

Streptococker

Lovisa Johansson Alma Thelander Towe Gunnarsson Mathias Boger Louise Grövnes Philip Kanold

Towe Gunnarsson Mathias Boger Louise Grövnes Philip Kanold Lovisa Johansson Alma Thelander

1d 1d 1e 1e 1f 1f

Staphylococker

Sofia Tillgren Helene Jacobsson Sanna Nordberg Tim Benthem Emma Nyberg Kent Johansson

Sanna Nordberg Tim Benthem Emma Nyberg Kent Johansson Sofia Tillgren Helene Jacobsson

1g 1g 1h 1h 2a 2a

Bakteriofager

Zahraa Hassan Hanna Pettersson Tilde Andersson Mohanad Hayatleh Elin Arvidsson David Södergren

Tilde Andersson Mohanad Hayatleh Elin Arvidsson David Södergren Zahraa Hassan Hanna Pettersson

2b 2b 2c 2c 2d 2d

Bdellovibrio

Anni Malm Aida Yifter Lindgren Beatrice Fageräng Eric Lindblad Johanna Olsson Per Hallgren

Beatrice Fageräng Eric Lindblad Johanna Olsson Per Hallgren Anni Malm Aida Yifter Lindgren

2e 2e 2f 2f 2g 2g


15

Examination Examination av kunskapsmålen görs framförallt via det skriftliga arbetet (laborations-

rapporten), där även ytterligare frågor ska diskuteras i anknytning till laborationen. I detta

arbete är det viktigt att samtliga kunskapsmål är uppnådda och att det finns en ordentlig

motivering om varför man själv tycker att man uppnått kunskapsmålen. Det är också viktigt

att det är strukturellt välskrivet och vetenskapligt korrekt, dvs att det styrks av vetenskapliga

fakta. Bedömningsmallen ska vara till stor hjälp för att uppnå samtliga kriterier och ni har

också ansvar som kamratgranskare att hjälpa varandra att höja kvaliteten på arbetena. Om

man efter kompletteringen inte uppnår samtliga kriterier ligger ett tillfälle i slutet av augusti

för uppsamlingstentamen av de kursmål som man inte lyckats uppnå.

Vi genomför även tester med flervalsfrågor (så kallade Readiness Assurance Tests)

individuellt och i grupp. Dessa kommer att bedömas formativt och summativt.

Documents

Schema VT16 bima15 mikrobiologi v1.5 - Lunds universitet...BIMA15 mikrobiologi VT16 (v1.5) Vecka 1. Bakteriella strukturer. FL: Grundläggande bakteriologi FL: Introduktion till examinationsuppgiften