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giuliano-ricci
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Quanto l’ITAS è stato importante per me…e non solo
Matematica ed informatica all’UniversitàForma mentisEconomia come fonte di organizzazioneMarchetti Nicola (Diploma Indirizzo
Programmatori ’97, Laurea in Ingegneria Elettronica, Ricercatore)
Pinotti Mirko (Diploma Indirizzo Biologico, Laurea in Biologia, Ricercatore presso l’Università di Ferrara)
Importanza della Bioinformatica
Dati genomici, funzionali, databases pubblici e privati
Dati clinici
Dati relativi a diverse forme di cancro e malattie rare
Gli studi Bioinformatici stanno emergendo come importanti strumenti per identificare associazioni
fra diversi tipi e fonti di dati
ncRNA profiling, l’uso di dispositivi quali i microarrays di espressione, risorse pubbliche quali il
Mappaggio genico, espressione, databases funzionali, E algoritmi di predizione hanno permesso l’identificazione
Di specifiche signatures associate condiagnosi, prognosi e risposta al trattamento dei tumori
umani.
Microarrays
C1 C2 T1 T2
gene1 34 89 55 89
gene2 22 888 44 77
gene3 345 78 34 896
gene4 212 66 333 234
gene5 23 7 567 564
….. …. ….. …. ….
Misurare la qualità di DNA microarrays
Pseudo-images Normalized unscaled standard errors (NUSE).
Relative log expression (RLE).Percentage of PM > MM.
Mascellani et al, 2007. UniFE, Lab Prof. Stefano Volinia
TOM
Rossi et al, 2005. UniFE, Lab Prof. Stefano Volinia
GebbaLab
Progetto Regionale Emilia Romagna: UniFE, IOR, NSI
Lab Prof. George Calin
MicroRNAs• I microRNAs sono piccole molecole di
RNA a singolo filamento di 20-22 nucleotidi che svolgono diverse funzioni
• Ciascun miRNA si lega al complesso proteico RISC e lo guida verso l'mRNA target.
• Negli animali, si è visto che il complesso costituito da RISC e miRNA si associa per complementarietà imperfetta alla 3'UTR dell'mRNA target, causando in questo modo il blocco della traduzione di quell'mRNA.Si è visto che un mRNA può essere riconosciuto e legato da diversi complessi miRNA-RISC, inoltre ciascun tipo di complesso miRNA-RISC può legarsi ad mRNA target diversi.Studi attuali stanno dimostrando che in alcuni tipi di cancro i livelli di alcuni miRNAs sono bassi o alti dando origine a miRNA oncosoppressori o tumorali.
Tiziano Terzani
…”cercate una vita che vi assomigli”
Da: La fine è il mio inizio
Domande??????????...sì dai!!!!!!