HUBUNGAN KEKERABATAN HEWAN
Oleh :
Nama
: Arida FauziyahNIM
: B1J011173Rombongan : VIIKelompok
: 2Asisten
: Luluk FuadahLAPORAN PRAKTIKUM TAKSONOMI HEWANKEMENTERIAN
PENDIDIKAN DAN KEBUDAYAAN
UNIVERSITAS JENDERAL SOEDIRMAN
FAKULTAS BIOLOGI
PURWOKERTO
2013I. PENDAHULUAN
A. Latar Belakang
Studi kekerabatan merupakan salah satu aspek yang dipelajari
dalam taksonomi hewan. Kekerabatan mencakup dua pengertian, yaitu
kekerabatan filogenetik dan kekerabatan fenetik. Kekerabatan
filogenetik adalah kekerabatan yang didasarkan pada hubungan
filogeni antara takson yang satu dengan takson yang lain, sedangkan
kekerabatan fenetik adalah kekerabatan yang didasarkan pada
persamaan dan perbedaan ciri-ciri yang tampak pada takson.
Penentukan kekerabatan filogenetik mutlak diperlukan fosil yang
representatif yang dapat memberikan gambaran hubungan antara
takson, dengan demikian kekerabatan filogenetik sulit dipelajari
tanpa tersedianya fosil yang representatif tersebut(Clifford dan
Stephenson, 1975).Filogenetik adalah salah satu sistem klasifikasi
yang didasarkan pada keeratan hubungan nenek moyang (evolusioner)
antara takson satu dengan lainnya. Oleh karena itu sistem
klasifikasi ini sangat penting untuk digunakan dalam penelusuran
kekerabatan evolusioner diantara berbagai takson yang ada. Analisis
kekerabatan Filogenetik diantara sampel (organisme) dapat dimulai
dengan pembuatan matrik yang menetapkan status karakter setiap
penanda untuk masing-masing sampel. Hasil analisis tersebut
kemudian dapat digambarkan dalam bentuk matrik similaritas maupun
disimilaritas dan diilustrasikan dengan pohon filogenetik atau
dendogram (Gotto, 1982).Menentukan kekerabatan filogenetik mutlak
diperlukan fosil yang representatif yang dapat memberikan gambaran
hubungan antara takson, dengan demikian kekerabatan filogenetik
sulit dipelajari tanpa tersedianya fosil yang representatif
tersebut (Gotto, 1982). Penentuan kekerabatan fenetik dapat
dilakukan secara kualitatif dan kuantitaif. Kekerabatan fenetik
secara kualitaif umumnya dilakukan dengan cara membandingkan
persamaan dan perbedaan ciri-ciri taksonomik yang dimiliki oleh
masing-masing takson. Menurut Mayr dan Ashlock (1993), disebutkan
bahwa ciri taksonomik meliputi ciri morfologi, antomi, fisiologi,
ekologi, dan geografi. Ciri yang dibandingkan sebanyak mungkin
paling tidak ada 50 ciri (Gotto, 1982). Makin banyak jumlah ciri
yang yang mirip antara dua takson yang di bandingkan, berarti makin
dekat hubungan kekerabatanya dan sebaliknya semakin sedikit jumlah
ciri yang mirip antara dua takson, berarti semakin jauh hubungan
kekerabatanya (Sokal dan Sneath, 1963).
B. Tujuan
Tujuan dari praktikum hubungan kekerabatan hewan adalah 1.
Menyusun karakter morfologi yang digunakan sebagai dasar menentukan
kekerabatan fenetik 2. Melakukan uji kekerabatan fenetik pada
kelompok hewan (ikan).II. MATERI DAN METODE
A. Materi
Alat-alat yang digunakan dalam praktikum ini adalah bak
preparat, pinset, buku gambar, sarung tangan, masker dan alat
tulis. Bahan-bahan yang digunakan dalam praktikum ini adalah ikan
layur (Trichiurus savala), ikan lidah (Cynoglossus lingua), ikan
kembung (Rastrellinger brachysoma), ikan lele (Clarias batrachus),
dan ikan nilem (Osteochilu hasselti).B. Metode
1. Alat dan bahan untuk praktikun hubungan kekerabatan hewan
disiapkan.
2. Dicari ciri-ciri taksonomi dari preparat yang digunakan yaitu
ikan layur (Trichiurus savala), ikan lidah (Cynoglossus lingua),
ikan kembung (Rastrellinger brachysoma), ikan lele (Clarias
batrachus), dan ikan nilem (Osteochilus hasselti).3. Ciri-ciri
taksonomi ikan tersebut dicocokkan dengan masing-masing sampel.
Angka 1 untuk hewan yang memiliki persamaan dan angka 0 untuk hewan
yang tidak memiliki persamaan.
4. Jumlah karakter baik yang ada persamaan maupun yang tidak ada
persamaan dihitung berdasarkan koefisien asosiasi.
5. Dihitung kedekatan hubungan kekerabatan antar ikan-ikan
tersebut.
III. HASIL DAN PEMBAHASAN
A. HasilTabel 1. Ciri taksonomik ikan yang diamatiNoCiri
Taksonomik (morfologi, anatomi dan ciri lainnya)Spesies Ikan
A BCDE
1Bentuk kepala pipih bilateral11100
2Bentuk kepala dorsoventral00001
3Posisi mulut inferior00010
4Posisi mulut superior00100
5Posisi mulut terminal11000
6Posisi mulut subterminal00001
7Mulut relatif lebar00101
8Mulut relatif sempit11010
9Ujung moncong meruncing10000
10Ujung moncong tumpul01111
11Mulut tidak dapat disembulkan00111
12Mulut dapat disembulkan11000
13Terdapat sungut10001
14Tidak terdapat sungut01110
15Mata terletak pada satu sisi00011
16Mata terletak pada dua sisi11100
17Mata relatif lebar11100
18Mata relatif sempit00011
19Posisi mata dorsolateral kepala00001
20Posisi mata lateral kepala11100
21Posisi mata dorsal kepala00010
22Bentuk tubuh pipih bilateral11101
23Bentuk tubuh pipih dorsoventral00010
24Punggung meninggi11000
25Punggung tidak meninggi00111
26Terdapat sisik11110
27Tidak terdapat sisik00001
28Tipe sisik ctenoid10010
29Tipe sisik sikloid01100
30Ukuran sisik relatif besar10010
31Ukuran sisik relatif kecil01100
32Jumlah sirip punggung 110111
33Jumlah sirip punggung 201000
34Jumlah jari-jari keras sirip punggung < 500000
35Jumlah jari-jari keras sirip punggung > 511100
36Sirip punggung dan sirip ekor bersambung00110
37Sirip anal dan sirip ekor bersambung00010
38Ujung-ujung sirip selain sirip ekor meruncing11000
39Ujung-ujung sirip selain sirip ekor membulat00101
40Bentuk luar sirip ekor bercagak11000
41Bentuk luar sirip ekor membulat00001
42Bentuk luar sirip ekor meruncing00110
43Posisi garis rusuk (linea lateralis) di tengah11011
44Posisi garis rusuk (linea lateralis) di bawah00100
45Bentuk garis rusuk lurus10011
46Bentuk garis rusuk melengkung01100
47Batang ekor relatif lebar00001
48Batang ekor relatif sempit11110
49Tinggi sirip-sirip selain sirip ekor relatif tinggi11101
50Sirip dada termodifikasi patil00001
Keterangan :
1 = Terdapat karakter yang diamati
0 = Tidak terdapat karakter yang diamati
A = Ikan nilemB = Ikan kembungC = Ikan layurD = Ikan lidahE =
Ikan lelekarakterA
BA
CA
DA
EB
CB
DB
EC
DC
ED
E
1 + + - - + - - - - +
2 + + - - + - - - - +
3 + + - + + - + - + -
4 + - + + - + + - - +
5 + - - - - - - + + +
6 + + + - + + - + - -
7 + - + - - + - - + -
8 + - + - - + - - + -
9 + - + + - + - - - +
10 + - + + - + + - - +
11 + - - - - - - + + +
12 + - - - - - - + + +
13 - - - + - + - + - -
14 - - - + + + - + - -
15 + + - - + - - - - +
16 + + - - + - - - - +
17 + + - - + - - - - +
18 + + - - + - - - - +
19 + + - - + + - + - +
20 + + - - + - - - - -
21 + + - + + - - - + +
22 + + - + + - - - + -
23 + + - + + - + - + -
24 + - - - - - - + + -
25 + - + - - - - + + +
26 + + + - + + - + - +
27 + + + - + + - + - -
28 - - + - + - + - + -
29 - - + - + - - - - -
30 - - + - + - + - + +
31 - - + + + - - - - -
32 - + + + - - - + + +
33 - + + + - - - + + +
34 + + - + + + + + + +
35 + + - - + - - - - +
36 + - - + - - + + - +
37 + + - + + - + - + -
38 + + - - + - - - - -
39 + + - - + + - + - +
40 + - + - - - - + + -
41 + + - - + + - + - +
42 + - + + - - + + - -
43 + - + + - + + - - -
44 + - + + - + + - - +
45 - - + + + - - - - +
46 - - + + + - - - - +
47 + + + - + + - + - +
48 + + + - + + - + - -
49 + + - + + - + - + -
50 + + + - + + - + - -
A
B
CA
B
DA
B
EB
C
DB
C
EC
D
EA
C
DA
C
EA
D
EB
D
EAB
C
DA
B
C
EA
B
D
EA
C
DEB
C
D
EA
BC
DE
+ + + + + - + + - - + + - - - +
- - - - - + - - + + - - - - - -
- - - - - - - - - - - + - - - -
- - - - - - - - - - - - + - - -
+ + + - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - + - - - - -
- - - - + + - + - - - - - - - -
+ + + + - - + - + + + - + - - +
- - - - - - - - - - - - + - - -
+ + + + + + + + + + - + + + + +
- - - + + + + + + + - - - + + +
+ + + - - - - - - - - - - - - -
- - + - - - - + + - - - - - - -
+ + - + + + + - - + + - - - + +
- - - - - + - - + + - - - - - -
+ + + + + - + + - - + + - - - +
+ + + + + - + + - - + + - - - +
- - - - - + - - + + - - - - - -
- - - - - - - - - - + - - - - -
+ + + + + - + + - - + + - - - +
- - - - - - - - - - - + - - - -
+ + + + + + + + + + + + + + + +
- - - - - - - - - - - + - - - -
+ + + - - - - - - - - - - - - -
- - + + + + + + + + - - - + + +
+ + + + + + + + + + + + + + + +
- - - - - - - - - - + - - - - -
- + - - - - + - + - - - - - - -
+ + - + + - - - - - - - - - - -
- + - - - - + - + - - - - - - -
+ - - + + - - - - - - - - - - -
+ + + + + + + + + + + + + + + +
- - - - - - - - - - - - - + - -
- - - - - - - - - - + + + + - +
+ + + + + - + + - - + + - - - +
- - - + - + + - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - + - - - -
+ + + + + - + + - - + + - - - +
- - - - - - - - - - + - - - - -
+ + + - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - + - - - - -
- - - + - + + - - - - - - - - -
+ + + + + + + + + + + + + + + +
- - - - - - - - - - - - + - - -
- + + - - + + + + + - - + - - +
+ - - + + - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - + - - - - -
+ + + + + + + + + + + + + + + +
+ + + + + + + + + + + + - + + +
- - - - - - - - - - + - - - - -
Tabel 2. Matrik Nilai Hubungan Kekerabatan Antar Species
Ikan
No.SpesiesABCDE
1A -
2B0.8 -
3C0.540.66 -
4D0.50.380.44 -
5E0.440.320.380.54 -
Tabel 3. Matrik Nilai Pengelompokan Pertama
No.SpesiesABCDE
1AB -
2C0.5 -
3D0.34 - -
4E0.28 - - -
Tabel 4. Matrik Nilai Pengelompokan Kedua
No. SpesiesABDCE
1ABD - - -
2C0.2 - -
3E0.14 - -
Tabel 5. Matrik Nilai Pengelompokan Ketiga
No.SpesiesABDCE
1ABDC - -
2E0.02 -
Diagram 1. Fenogram fenetik hubungan kekerabatan 5 spesies
ikan
0,020,10,20,30,40,50,60,70,8
Diagram 2. Fenogram filogenetik hubungan kekerabatan 5 spesies
ikan
Gambar preparat yang dipraktikumkan:
Gambar 1. Ikan Nilem
Gambar 2. Ikan Lidah
(Ostechilus hasselti)
(Cynoglossus lingua) Gambar 3. Ikan Kembung
Gambar 4. Ikan Layur
(Rastrellinger brachysoma)
(Trichiurus savala)
Gambar 5. Ikan Lele
(Clarias batrachus)B. Pembahasan
Praktikum kekerabatan hewan kali ini menggunaakan analisis
fenetik dan filogenetik. Analisis fenetik atau analisis berdasarkan
kenampkan morfologi dilakukan secara manual dengan menghitung
koefisien asosiasi dari setiap karakter dari kelima spesies hewan
uji. Setelah diketahui koefisien asosiasi dari kelima hewan uji
tersebut, dibentuklah fenogram kekerabatan. Hasilnya, ikan nilem
dan ikan kembung merupakan spesies dengan jarak kekerabatan
terdekat dibuktikan dengan matrikulasi koefisien asosiasi terbesar
yaitu 0,8. Tetuan dari ikan nilem dan kembung berkerabat dengan
tetua ikan layur. Tetua ikan layur dan tetua dari tetua ikan nilem
dan ikan kembung berkerabat dengan tetua ikan lidah. Tetua dari
tetua ikan layur, tetua dari tetua ikan nilem dan ikan kembung, dan
tetua ikan lidah, berekrabat dengan tetua ikan lele. Jadi dapat
diketahui bahwa kekerabatan terjauh terjadi pada ikan lele dan ikan
nilem (Mayr, 1982). Aalisis filogenetik dilakukan dengan
menggunakan software Molecular Evolutionary Genetic Analysis
(MEGA). Software ini menggunakan data urutan basa DNA hasil PCR
sebagai data mentah. Penggunaan urutan basa DNA ini bertujuan untuk
melacak asal-usul evolusi dari kelima spesies hewan uji. Didapat
hasil yang diperlihatkan dalam fenogram filogenetik. Ikan nilem dan
ikan kembung berasal dari tetua yang sama. Tetua dari ikan nilem
dan ikan kembung ini berkerabata dengan tetua dari ikan layur. Ikan
lidah dan ikan lele berasal dari tetua yang sama. Tetua dari ikan
lele dan ikan lidah ini berkerabat evolusi dengan tetua dari ikan
layur dan tetua dari tetua ikan nilem dan ikan kembung.Perbedaan
antara fenogram fenetik dan fiologenetik. Pada fenogram fenetik,
ikan lidah tidak pada satu garis kekerabatan dengan ikan lele. Hal
ini terjadi karena analisis fenetik didasarkan pada kenampakan
morfologi (Mayr, 1982), yang mana ikan lele tidak memiliki
kemiripan morfologi dengan ikan lidah. Berbeda dengan analisis
filogenetik yang berdasarkan karakter asal-usul evolusi (Mayr,
1982). Ikan lidah dan ikan lele berasal dari satu tetua yang sama,
hal ini dikarenakan urutan basa DNA ikan lele mirip dengan urutan
basa DNA ikan lidah. Penggunaan software MEGA, hasil analisis
filogenetik pada pembuatan fenogram menggunakan boopstrap dan
parsimoni menghasilkan data yang berbeda. Hal ini terjadi karena
pada penggunaan parsimoni (yang digunakan pada praktikum kali ini)
didasarkan pada data yang ada, yaitu urutan basa DNA dan
menghasilkan 1 buah pohon filogeni, untuk melihat jarak
kekerabatan. Sedangkan pada penggunaan boopstrap, data yang
digunakan sama, namun terdapat optional pada toolbox yaitu kisaran
50-100. Hal ini menunjukkan bahwa penggunaan boopstrap akan
menghasilkan hasil analisis jarak kekerabatan berdasarkan beberapa
pohon filogeni, jarak kekerabatan dihasilkan berdasarkan banyak
pohon filogeni yang dihasilkan antar kedua spesies uji (Simpson,
2011). Kekerabatan merupakan salah satu aspek yang dipelajari dalam
taksonomi hewan yang mencakup dua pengertian, yaitu kekerabatan
filogenetik dan kekerabatan fenetik. Kekerabatan filogenetik adalah
kekerabatan yang didasarkan pada hubungan filogeni antara takson
yang satu dengan takson yang lain, sedangkan kekerabatan fenetik
adalah kekerabatan yang didasarkan pada persamaan dan perbedaan
ciri-ciri yang tampak pada takson (Clifford dan Stephenson,
1975).
Kekerabatan dalam sistematik hewan dapat diartikan sebagai pola
hubungan atau total kesamaan antara kelompok hewan berdasarkan
sifat atau ciri tertentu dari masing-masing kelompok hewan
tersebut. Berdasarkan jenis data yang digunakan untuk menentukan
jauh dekatnya kekerabatan antara dua kelompok hewan, maka
kekerabatan dapat dibedakan atas kekerabatan fenetik dan
kekerabatan filogenetik (filetik). Kekerabatan fenetik didasarkan
pada persamaan sifat-sifat yang dimiliki masing-masing kelompok
tumbuhan tanpa memperhatikan sejarah keturunannya, sedangkan
kekerabatan filogenetik didasarkan pada asumsi-asumsi evolusi
sebagai acuan utama (Lartillot dan Philippe , 2008).
Kekerabatan fenetik, dalam prakteknya lebih sering digunakan
dari pada kekerabatan filogenetik. Hal tersebut disebabkan karena
adanya kesulitan untuk menemukan bukti-bukti evoluasi pendukung
sebagai penunjang dalam menerapkan klasifikasi secara filogenetik
dan bila cukup banyak bukti yang dipertimbangkan biasanya
kekerabatan fenetik juga akan dapat menggambarkan kekerabatan
filogenetik (Lartillot dan Philippe, 2008). Tujuan utama dari
penerapan taksonomi numerik adalah untuk meningkatkan objektifitas
dalam pengolahan data dan repitabilitas hasil klasifikasi yang
diperoleh. Hal ini penting bagi taksa yang klasifikasinya masih
menjadi perdebatan karena pebedaan dalam penempatan taksa pada
kategori tertentu.
Hubungan kekerabatan/hubungan filogenetik dapat memberikan dasar
klasifikasi mahluk hidup yang lebih tepat, sesuai dengan
kemiripannya baik secara genetik (lewat DNA dan penanda molekuler
lainnya) maupun secara morfologis. Pengklasifikasian mahluk hidup
yang disesuaikan dengan hubungan filogenetik ini, yang disebut
sebagai klasifikasi natural (versus klasifikasi artifisial yang
umumnya bersifat anthropocentric) dikenal juga dengan bidang ilmu
Kladistika atau Sistematika. Hubungan filogenetik menunjukan
hubungan kekerabatan, dan hubungan kekerabatan menunjukan pula
hubungan evolusi, maka pengklasifikasian yang berdasarkan hubungan
filogenetik ini lazim dianggap lebih benar, karena mampu
menjelaskan evolusi berbagai karakter, sifat, dan ciri-ciri suatu
mahluk hidup, serta menunjukkan kedekatan suatu mahluk hidup yang
satu dengan lainnya sesuai dengan hubungannya di alam (Lartillot
dan Philippe, 2008).
Fenogram merupakan diagram dalam bentuk dendrogram diagram yang
menunjukkan kesamaan antara kelompok organisme (populasi, tanaman
kompleks, taksa). Fenogram merupakan cabang panjang yang
melambangkan kesamaan derajat, yang merupakan ukuran koefisien
kesamaan. Fenogram merupakan grafik yang digunakan untuk
membandingan antara ciri yang mirip dengan semua ciri yang
digunakan berupa nilai rata-rata kemiripan ciri, sekaligus
menunjukan tingkat hubungan kekerabatan antara taksa yang
dibandingakan. Nilai rata-rata kemiripan ciri, selanjutnya dapat
digunakan untuk membuat fenogram (Clifford et al. ,1975).Menurut
Clifford et al. (1975), pada sistem klasifikasi modern, terdapat
dua sistem klasifikasi yang mempunyai kelebihan dan kekurangan
tersendiri. Sistem fenetik memiliki kekurangan dan kelebihan
seperti, data yang diperoleh berdasarkan persamaan dan perbedaan
karakter fenetik yang diamati, kemiripan karakter berkurang pada
kategori yang lebih tinggi, tidak memerlukan pengetahuan atau
analisis evolusi, namun sulit membedakan karakter yang terlihat
sama atau menunjukkan kemiripan, contohnya spesies sibling dan
simpatrik. Sistem filogenetik memiliki kelebihan dan kekurangan
sebagai berikut. Data berdasarkan kesamaan nenek moyang, makin
dekat moyang dua unti taksonomi maka akan berkerabat semakin dekat
dan ditempatkan pada kategori taksonomi yang lebih rendah dengan
unit taksonomi yang berbagi moyang lebih jauh, hanya dapat
diterapkan pada obyek yang benar-benar memunyai riwayat
perkembangan moyang, dan upaya rekontruksi perkembangan evolusi
yang dapat meningkatkan oemahaman kita terhadap perkembanan evolusi
dalam sistem klasifikasi. Ciri taksonomik merupakan karakter yang
dapat diukur, dihitung, atau dideskripsikan. Contoh ciri taksonomik
adalah warna tubuh dan tinggi tubuh. Merah bukan merupakan sebuah
ciri, melainkan kondisi/keadaan atau sifat suatu karakter (Mayr,
1982). Tiap ciri memiliki sifat atau status. Djuhanda (1981)
menyarankan 4 kriteria mengenai ciri taksonomik. Pertama, ciri
taksonomik harus memiliki variasi yang rendah di dalam kelompok
daripada antar kelompok. Kedua, ciri taksonomik ditentukan secara
genetik tetapi tidak memiliki keragaman genetik intrinsik yang
tinggi. Ketiga, ekspresi suatu ciri taksonomik dimodifikasi secara
tidak nyata oleh lingkungan, dan yang keempat adalah pola variasi
ciri suatu ciri taksonomik yang sedang diuji berkaitan dengan pola
variasi yang ada pada karakter lain.
Berikut ini merupakan penjelasan dari masing-masing spesies ikan
yang diamati :
1. Ikan Layur (Trichiurus savala)
Layur merupakan ikan laut yang mudah dikenal dari bentuknya yang
panjang dan ramping. Ikan ini tersebar di banyak perairan dunia.
Jenis yang ditemukan di Pasifik dan Atlantik merupakan populasi
yang berbeda. Ukuran tubuhnya dapat mencapai panjang 2 m, dengan
berat maksimum tercatat 5 kg dan usia dapat mencapai 15 tahun.
Kegemarannya pada siang hari berkeliaran di perairan dangkal dekat
pantai yang kaya plankton krustasea. Pada waktu malam ikan ini
mendekat ke dasar perairan. Layur mudah dijumpai di tempat
penjualan ikan di Indonesia. Ia juga menjadi ikan umpan (Mayr,
1982). Karakteristik yang mencolok kebanyakan dari ikan layur
(cutlassfish) adalah bentuknya lonjong ke ekor whiplike menunjuk
tanpa sirip ekor, sirip punggung tunggal yang panjang (sekitar 135
sinar) yang berasal dekat di belakang mata, sekitar dua pertiga di
midlength tinggi sebagai tubuh dalam,dubur panjang terdiri dari
lepas duri rendah yang sangat menunjuk ke belakang, dan berduri
panjang taringnya di depan mulut, empat di atas dan dua di rahang
bawah. Kedalaman dari tubuh sama dengan sekitar satu-ketiga belas
untuk satu-kelima belas dari total panjang, sekitar satu-ketujuh
seperdelapan dari yang diduduki oleh kepala. moncong ini menunjuk,
mulut gapes kembali ke bawah mata dan proyek rahang bawah luar
atas. Setiap rahang dipersenjatai dengan 7-10 yang lebih kecil di
belakang gigi taringnya. Sirip dubur direduksi menjadi serangkaian
duri mencolok pendek, sekitar 100-110 nomor, tanpa menghubungkan
membran sirip, berlari kembali dari lubang hampir ke ujung ekor.
Para dada kecil terletak sedikit di muka sudut belakang penutup
insang. Tidak ada sirip ventral dan kulitnya scaleless (Alamsyah,
1974).
Menurut Saanin (1968), klasifikasi Ikan layur adalah sebagai
berikut:Kingdom: Animalia
Phylum: ChordataOrdo
: Perciformes
Familia: Trichiuridae
Genus
: Trichiurus
Spesies: Trichiurus savala
2. Ikan Lidah (Cynoglossus lingua)
Menurut Saanin (1968), klasifikasi Ikan Lidah adalah sebagai
berikut:
Kingdom: Animalia Phylum: Chordata
Class: ActinopterygiiOrdo: Pleuronectifomes Family:
Cynoglossidae
Genus: Cynoglossus Spesies: Cynoglossus lingua
Panjang maksimum 45 cm, panjang rata-rata 25 cm. hidup di air
tawar, laut dan payau, dengan kedalaman sekitar 10-961 m. hidup di
perairan indo pasifik barat: termasuk Thailand, Vietnam, Filipina
dan Indonesia. Mata sisi coklat kemerahan, kadang-kadang dengan
tambalan coklat-hitam yang tidak teratur, dengan bercak hitam besar
pada penutup insang. Mata dengan ruang interorbital kecil. Sudut
mulut mencapai jauh melampaui vertikal melalui pinggiran belakang
mata yang lebih rendah, lebih dekat ke insang membuka daripada
ujung moncong. Sisik relatif besar, sisir pada sisi mata tubuh,
lingkaran (halus) di sisi buta. Hidup terutama di berlumpur dangkal
dan dasar berpasir landas kontinen (Menon, 1977).
Lubang mulutnya sempit dan gigi-gigi pada sebelah badan yang
tidak berwarna lebih baik. Di muara-muara sungai di Sumatra
terdapat ikan lidah dari spesies Cynoglossus monopus dalam jumlah
yang banyak. Ikan ini dapat mencapai panjang tubuh 17 cm, hidupnya
pada dasar air yang brlumpur. Jenis-jenis ikan lidah lainnya tidak
dapat lebih besar dari 17 cm. Misalnya : Cynoglossus lingua
(Djuhanda, 1981).3. Ikan lele (Clarias batrachus)Menurut Saanin
(1984), klasifikasi ikan lele adalah sebagai berikut:
Kingdom : Animalia
Sub Kingdom : Metazoa
Phylum : Vertebrata
Class
: Pisces
Sub Class : Teleostei
Ordo
: Ostariophysoidei
Sub Ordo : Siluroidea
Family : Claridae
Genus
: Clarias
Spesies: Clarias batrachusMenurut Suyanti (1991), ikan lele
(Clarias batrachus) memiliki patil tidak tajam dan giginya tumpul.
Sungut ikan lele relatif panjang dan tampak lebih kuat dari pada
lele lokal. Kulit dadanya terletak bercak-bercak kelabu seperti
jamur kullit manusia (panu). Kepala dan punggungnya gelap
kehitam-hitaman atau kecoklat-coklatan. Tidak seperti ikan lainya,
agak sulit untuk mengatakan bentuk badan lele secara tepat. Tengah
badanya mempunyai potongan membulat, dengan kepala pipih kebawah
(depressed), sedangkan bagian belakang tubuhnya berbentuk pipih
kesamping (compressed), jadi pada lele ditemukan tiga bentuk
potongan melintang (pipih kebawah, bulat dan pipih kesamping).
Kepala bagian atas dan bawah tertutup oleh pelat tulang. Pelat ini
membentuk ruangan rongga diatas insang. Disinilah terdapat alat
pernapasan tambahan yang tergabung dengan busur insang kedua dan
keempat. Mulut berada diujung moncong (terminal), dengan dihiasi 4
pasang sungut. Lubang hidung yang depan merupakan tabung pendek
berada dibelakang bibir atas, lubang hidung sebelah belakang
merupakan celah yang kurang lebih bundar berada di belakang sungut
nasal. Mata berbentuk kecil dengan tepi orbitalyang bebas. Sirip
ekor membulat, tidak bergabung dengan sirip punggung maupun sirip
anal. Sirip perut berbentuk membulat dan panjangnya mencapai sirip
anal. Sirip dada dilengkapi sepasang duri tajam/patil yang memiliki
panjang maksimum mencapai 400 mm. Patil ini beracun terutama pada
ikan ikan remaja, sedangkan padaikan yang tua sudah agak berkurang
racunya. Ikan ini memiliki kulit berlendir dan tidak bersisik
(mempunyai pigmen hitam yang berubah menjadi pucat bila terkena
cahaya matahari, dua buah lubang penciuman yang terletak dibelakang
bibir atas, sirip punggung dan dubur memanjang sampai ke pangkal
ekor namun tidak menyatu dengan sirip ekor, panjang maksimum
mencapai 400 mm. Ikan lele bersifat nokturnal, yaitu aktif bergerak
mencari makanan pada malam hari. Siang hari, ikan lele berdiam diri
dan berlindung di tempat-tempat gelap. Di alam, ikan lele memijah
pada musim penghujan. Ada sedikit perbedaan dikalangan ilmuwan
dalam menggolongkan ikan lele ini. Ada yang memasukan ikan lele ini
ke dalam ikan pemakan daging (karnivora). Dan adalagi yang
memasukannya ke dalam omnivora (Simpson, 2011).
4. Ikan Kembung (Rastrellinger brachysoma)
Ikan kembung yang tertangkap di perairan Indonesia rata-rata
terdiri atas dua spesies, yaitu kembung perempuan (Rastrelliger
negletus) dan kembung lelaki (Rastrelliger kanagurta). Kedua ikan
kembung tersebut mempunyai sifat dan ciri-ciri yang berbeda. Kedua
ikan kembung tersebut termasuk dalam famili Scombridae, yaitu jenis
ikan yang suka hidup bergerombol. Ikan kembung merupakan ikan
pelagis yang memakan plankton halus. Badan tidak begitu langsing,
tetapi pendek dan gepeng. Tubuh bagian atas berwarna kehijauan dan
putih perak pada bagian bawah, terdapat totol-totol hitam pada
bagian punggung, sirip punggung pertama kuning keabuan dengan
pinggiran gelap. Perut dan sirip dada berwarna kuning maya gelap
dan sirip lainnya berwarna kekuningan. Ikan kembung ini memiliki
finlet berjumlah 5-7, ukuran tubuhnya mencapai 15-30 cm. Ikan
kembung biasanya hidup lebih mendekati pantai dan membentuk
gerombolan besar. Menurut Saanin (1968), klasifikasi Ikan Kembung
adalah sebagai berikut:
Kingdom:Animalia
Phylum:Chordata
Subphylum:Vertebrata
Class
:Actinopterygii
Order
:Perciformes
Family
:Scombridae
Genus
:RastrelligerSpesies:Rastrelliger brachysoma
5. Ikan Nilem (Osteochilus hasselti)
Ikan Nilem (Osteochilus hasselti) termasuk ke dalam keluarga
Cyprinidae dengan bentuk tubuhnya langsing sehingga dapat bergerak
lincah walaupun di air deras. Ikan Nilem memiliki sirip punggung
yang bentuknya memanjang dan terletak di bagian permukaan, sirip
dubur bagian belakang juga memiliki jari-jari keras dengan bagian
akhir berbentuk gerigi, sirip ekor berbentuk cagak dan berukuran
simetris (Jasin, 1989).
Klasifikasi ikan Nilem (Osteochilus hasselti) menurut Jasin
(1989) adalah sebagai berikut
Phylum : Chordata
Subphylum : Vertebrata
Classis : Pisces Subclassis : Teleostei
Ordo
: Ostariophysi
Sub Ordo : Cyprinoidae
Familia : Cyprinidae
Sub familia: Cyprininae
Genus
: Ostechilus
Spesies : Osteochilus hasselti
Merekonstruksi sejarah evolusi dari sekuens molekuler
menggunakan analisis filogenetik merupakan jantung dari beberapa
bidang penelitian bilogi, seperti bidang genomic komparatif,
prediksi, deteksi transfer gen lateral atau identifikasi dari
organisme baru. Analisis filogenetik dapat ditempuh melalui
beberapa tahapan yang termasuk di dalamnya yaitu identifikasi dai
sekuen homolog, multiple alignment, dan rekonstruksi pohon
filogeni. Proses ini membutuhkan proses pemograman yang fungsional
tergantung pada panjang dan jumlah sekuen, dan tujuan dari
penelitian tersebut (Dereeper et al., 2008). Filogenetik adalah
suatu sistem yang mengklasifikasikan organisme-organisme
berdasarkan garis evolusionernya. Hubungan atau garis evolusioner
tersebut dapat yang dapat diketahui melalui matriks data molekuler
dan data morfologi. Sistem ini dianggap sebagai sistem klasifikasi
yang paling unggul. Luaran yang diperoleh dari sistem filogenetik
berupa pohon filogeni. Sistem ini juga menjadi sistem yang menjadi
acuan dari banyak taksonom seiring dengan berkembangnya sistematika
molekuler (Simpson, 2011).Analisis kekerabatan filogenetik
menggunakan software MEGA 5.05. dengan prosedur penggunaan sebagai
berikut (Simpson, 2011). Tahap pertama adalah pengolahan data.
Pertama, data spesies yang sudah dibuat, sebanyak 5 spesies dalam
Ms. Word pada filemega diganti dengan cara Ctrl-H, 0 menjadi A dan
1 menjadi T. Kedua, software MEGA 5.05 dibuka pilih Alignment,
pilih Edit/build Alignment. Ketiga, pada Select an Option: Create a
new alignment diklik, lalu OK. Keempat, pada kotak dialog Are you
building a DNA or Protein sequence alignment pilih DNA. Kelima,
pada menu Edit, Insert New Blank sequence (ctrl-N) dipilih sampai
sequence 5 (sesuai preparat). Keenam, pada sequence 1, diisi dengan
nama spesies yang sudah diketik sebelumnya pada Ms. Word. Yaitu
spesies A spesies E, kemudian pada kolom sebelahnya diisi urutan
basa yg sudah diketik pada filemega. Ketujuh, setelah selesai, pada
menu Data dipilih; lalu export Alignment diklik; MEGA Format
dipilih. Kemudian ganti nama dengan nama yg diinginkan, kemudian
save. Kedelapan, pada kotak dialog Protein-coding Nucleotide
sequence data menu YES diklik. Tahap selanjutnya adalah menentukan
fenogram hubungan kekerabatan antar spesies. Pertama, software MEGA
5.05 dibuka; Menu Analysis dipilih; lalu Phylogeny diklik; kemudian
pilih Construct/test UPGMA tree lalu klik YES, kemudian muncul
kotak dialog, Klik Compute. Kedua, hasil kemudian disimpan, klik
menu Image (ctrl-C), copy to clipboard diklik, kemudian ctrl-V
ditekan pada keyboard di MS. Word.Tahap terakhir adalah menentukan
nilai matriks hubungan kekerabatan antar spesies. Pertama, program
aplikasi MEGA 5.05 dibuka, dengan menggunakan data di atas; Menu
Distance dipilih, kemudian Compute Pairwise Distancediklik. Kedua,
file yang akan digunakan dipilh dengan cara pada menu Open dipilih;
pada kotak dialog Compute diklik. Ketiga, hasil kemudian disimpan,
menu File dipilih; Export/print Distancediklik; Pada Output Format
pilih XL Microsoft excel workbook; lalu klik Print/save matrix.
Terakhir, hasil tabel data ditampilkan pada MS. Excel, kemudian
dicopy-paste ke Ms. Word yg sudah berisi data awal tadi atau dapat
langsung diprint.IV. KESIMPULAN DAN SARAN
A. Kesimpulan
Berdasarkan hasil dan pembahasan sebelumnya dapat diambil
kesimpulan sebagai berikut :
1. Hubungan kekerabatan dibagi menjadi dua yaitu kekerabatan
filogenetik dan kekerabatan fenetik.
2. Hubungan kekerabatan yang paling dekat adalah ikan kembung
dan ikan layur sedangkan yang paling jauh adalah ikan lele.
B. Saran
Sebaiknya semua preparat terutama ikan brek tersedia untuk semua
kelompok, jadi memudahkan dalam mengamati ciri-ciri morfologi yang
terdapat pada preparat ikan-ikan tersebut.
DAFTAR REFERENSIAlamsyah., 1974. Sistematika Ikhtiologi pada
Ikan Nilem (Osteochilus hasselti). Jurnal Akuatik Fakultas
Perikanan Departemen Perikanan. Bogor. 168 halamanClifford dan
Stephenson. 1975. An Introduction To Numerical Classification. New
York, Academic Press.
Dereeper, A., V. Guignon, G. Blanc, S. Audic, S. Buffet, F.
Chevenet, J.-F. Dufayard, S. Guindon, V. Lefort, M. Lescot, J.-M.
Claverie and O. Gascuel. 2008. Phylogeny.fr: robust phylogenetic
analysis for the non-specialist. Nucleic Acids Research, Vol. 36.
W465-W469.
Djuhanda, Tatang. 1981. Dunia Ikan. Armico. Bandung.Effendie, I.
2004. Pengantar Akuakultur. Penerbit Penebar Swadaya. Bogor
Indonesia. 187 hal.
Lartillot N dan Philippe H, 2008. Improvement of molecular
phylogenetic inference and the phylogeny of Bilateria. Phil. Trans.
R. Soc. B 363, pp. 1463-1472.Mayr, Ernest. 1982. Principles Of
Systematic Zoologi. New Delhi, Tata McGraw Hill Publishing
Company.Menon, AGK .1977. A systematic monograph of the tongue
soles of the genus Cynoglossus Hamilton-Buchanan (Pisces:
Cynoglossidae).Smithson. Contrib. Zool. (238):1-129.Saanin, H.
1968. Taksonomi dan Kunci Identifikasi Ikan I. Bina Tjipta,
Bandung.
Simpson, M. G. 2011. Plant Systematics. Elsevier Academic Press.
Canada.
Sokal, R. R dan P. H. A Sneath, 1963. Principle of Numerical
Taxonomy. W. H Freeman and Company, San Fransisco and
London.Suyanto, SR. 1991. Budidaya Ikan Lele. Jakarta: Penebar
Swadaya.
