Snomed CT - vardgivarwebb.regionostergotland.se CT... · • Den är ganska lik de diagram jag visat hittills i presentationen . 2015-12-02 23 233604007 pneumoni 95436008 konsoliderad

Snomed CT Mikael Nyström Hälsoinformatik, Institutionen för medicinsk teknik Linköpings universitet

Disposition

• Några problem som Snomed CT löser och hur

• Engagera sig

• Snomed CT:s innehåll

2015-12-02 2 Mikael Nyström, Hälsoinformatik, Institutionen för medicinsk teknik

Några problem som Snomed CT löser och hur


Hur välja vilken synonym term som ska användas för att benämna en viss sak? • Fokusera på det abstrakta innehållet hos den språkliga termen

– Begreppet ”bakom” termen

• Ge varje begrepp ett id som inte bär någon betydelse

• Associera de användbara termer som kan beskriva begreppet till begreppets id


233604007

pneumoni 233604007

lunginflammation

233604007

pneumonia

233604007

neumonía


Hur hålla ordning på alla begrepp?

• Ordna dem i en hierarki

– ”Träd med förälder”

• Lättare att bläddra sig fram till rätt begrepp

• Möjliggör aggregering



233604007

pneumoni

95436008

konsoliderad lunga

19829001

lungsjukdom

24385003

främmande kropp i lunga 7159003

nekros i lunga

64662007

lunginfarkt 77920006

pulmonellt gangrän

Hur placera in alla begrepp på rätt ställe?

• Ordna dem i en polyhierarki

– ”Träd med en eller flera föräldrar”

• Möjliggör att alla begrepp kan placeras på rätt ställe

• Försvårar statistiska aggregeringar litegrann



Σ = 1*n

Σ = 2*n

233604007

pneumoni

95436008

konsoliderad lunga

19829001

lungsjukdom

205237003

pneumonit

Hur lägga till dator- och människoläsbara definitioner?


• Lägga till relationer från ett begrepp till andra begrepp som får definiera begreppet

– Relationerna från begreppet till dess föräldrar är den ena delen

– Relationer som pekar ut andra begrepp som attribut är den andra delen

• Attributrelationerna pekar (oftast) ut begrepp i andra hierarkier


orsakad av

patologisk process

422588002

aspirationspneumoni 278692007

aspirering till de nedre luftvägarna

441862004

infektionsprocess

413585005

aspirering till luftvägar

312342009

infektiös pneumoni

233604007

pneumoni

Hur göra med begrepp som inte går att definiera med relationer?


• Ange om ett begrepps definition är fullständig eller inte

– Fullt definierat begrepp

• Begreppets betydelse är fullständigt definierat av dess utgående relationer

– Primitivt begrepp

• Begreppets betydelse är inte fullständigt definierad av dess utgående relationer

–Alla relationer är dock sanna

– Fler relationer behövs för att fullt definiera begreppet

– Primitiva begrepp definieras av en term av typen specificerad term


233604007

pneumoni

95436008

konsoliderad lunga 205237003

pneumonit

fyndplats 39607008

lunga, struktur

707496003

inflammation och konsolidering associerad morfologi


23583003

inflammation

409774005

inflammationsmorfologi

Specificerad term:

Inflammation (morphologic abnormality)

Hur placeras alla begrepp in på rätt ställe i hierarkin?


• Begreppen och deras definitioner körs genom en klassificerare som kan göra vissa justeringar

– ”Klassificerare” har i det här fallet inte något med klassifikationer, som ICD-10 eller ICF, att göra

• En klassificerare kan inte ändra ett begrepps innebörd

– Kan därför inte rätta riktiga modelleringsfel


102556003

smärta i arm

90834002

smärta i extremitet

74323005

smärta i armbåge

fyndplats

127949000

armbågsregion, struktur

53120007

arm, struktur fyndplats

Hur håller man ordning på alla begrepp och attribut?


• En begreppsmodell definierar vilka attribut som är tillåtna att använda

– I varje delhierarki är bara vissa attributtyper tillåtna

– Varje attributtyp kan bara ha begrepp från vissa hierarkier som attributvärden

• Begreppsmodellen kan ses som en översiktskarta över Snomed CT:s innehåll

Hiearkin kliniskt fynds begreppsmodell (del av)


• fyndplats – anatomisk eller förvärvad kroppsstruktur

• associerad morfologi – morfologiskt avvikande struktur

• patologisk process – autoimmun – infektionsprocess – överkänslighetsprocess

• orsakad av – kliniskt fynd – händelse

Hur uppdateras Snomed CT?


• Nya versioner kommer, för närvarande, två gånger per år

– Internationella versionen i januari och juli

– Svenska versionen i maj och november

• Komponenterna (begreppen m fl) kan aldrig tas bort, utan enbart inaktiveras eller genomgå vissa förändringar

– Alla ändringar är spårbara

• Inaktiva begrepp har dator- och människoläsbara förslag på ett eller flera möjliga aktiva begrepp som kan ersätta det inaktiva begreppet


421976005

överkänslighet

473010000

överkänslighetstillstånd

Tvetydigt begrepp

Möjligen ekvivalent med

64572001

sjukdom och annat avvikande tillstånd 421961002

överkänslighetsreaktion

orsakad av

472963003

överkänslighetsprocess

patologisk process


421961002

överkänslighetsreaktion patologisk process

473010000

överkänslighetstillstånd 281647001

biverkning

472963003

överkänslighetsprocess 421961002

överkänslighetsreaktion

Finns ett standardiserat sätt att visa begrepp grafiskt?


• Ja och den heter SNOMED CT Diagramming Guideline

• Den är ganska lik de diagram jag visat hittills i presentationen

2015-12-02 23

233604007

pneumoni

95436008

konsoliderad lunga 205237003

pneumonit

fyndplats 39607008

lunga, struktur

707496003

inflammation och konsolidering associerad

morfologi

Engagera sig


International Health Terminology Standards Development Organisation (IHTSDO)

• Organisationen äger Snomed CT och förvaltar internationella versionen

• Är en icke vinstdrivande organisation

• Ägs och styrs av 27 medlemsländer

– Sverige var med och grundade organisationen 2007

– 15 europeiska medlemsländer

– Danmark, Estland, Island, Litauen och Sverige i Norden och Baltikum

• http://www.ihtsdo.org/

• Relativt liten personalstyrka som är spridd över världen

• Delar av arbetet sker i medlemmarnas nationella releasecenter

http://www.ihtsdo.org/



Socialstyrelsen


• Driver det svenska nationella relasecentret

• http://www.socialstyrelsen.se/nationellehalsa/snomed-ct

• Ansvarar för Snomed CT:s svenska utökning

– Svensk översättning

– Begrepp enbart relevanta för svenska förhållanden

• Ansvarar för den primära Snomed CT-supporten i Sverige

• Arrangerar möten för Snomed CT-användare

• Tar emot licensansökningar från svenska organisationer och personer

http://www.socialstyrelsen.se/nationellehalsa/snomed-ct





Förändringsförslag till Snomed CT:s innehåll


• Socialstyrelsen är ansvarig för alla förändringsförslag från Sverige

– Hanterar och genomför förslag om den svenska utökningen själva

– Skickar förslag om den internationella versionen vidare till IHTSDO

• Några riktlinjer för förändringar

– Behovet ska vara beskrivet och gärna förankrat inom området

– Nya begrepp ska vara relevanta för många och inte vara lokala

– Nya termer ska följa språkliga riktlinjer och medicinskt fackspråk

• http://www.socialstyrelsen.se/nationellehalsa/snomed-ct/lamnaforslag

http://www.socialstyrelsen.se/nationellehalsa/snomed-ct/lamnaforslag





Egen utökning


• Alla med licens kan skaffa en egen namnrymd och skapa egna utökningar

• Utökar den internationella (och troligen den svenska) versionen

– Kan lägga till alla typer av komponenter, som nya begrepp och termer

– Kan inte förändra innehåll någon annan ansvarar för

– Kan t ex rekommendera lokala termer för internationella begrepp

• Utökningar paketeras normalt på samma sätt som internationella versionen, så att de kan användas tillsammans i informationssystem

• Ansvarig organisation för en viss utökning kan spåras

• Ansvarig organisation står för kvaliteten på innehållet i utökningen

IHTSDO:s styrning


• General Assembly är högsta beslutande organ

– En representant per medlemsland

– Sveriges representant är Henrik Moberg, Socialdepartementet

• Management Board motsvarar en bolagsstyrelse

– Består av sju personer

– I dagsläget ingen representant från Sverige

IHTSDO:s rådgivande organ


• Member Forum är ett rådgivande organ som koordinerar medlemmarnas arbete och samarbete

– Två representanter per land

– Sveriges representanter är Erika Ericsson & Lotti Barlow, Socialstyrelsen

• Vendor Liaison Forum är ett rådgivande organ för företag som använder Snomed CT i sina produkter

– Öppen för de leverantörer som vill

IHTSDO:s rådgivande organ


• Sju Advisory Groups ger råd inom sitt specialområde

– Består av valda medlemmar, men är oftast öppna för observatörer

– Content Managers, Modeling, Software Development, Tooling Users, E-Learning, SNOMED CT Editorial, Terminology Release

• Flera Special Interest Groups ger råd inom sitt specialområde

– Består av volontärer och valda ordföranden

– Alla som är intresserade att bidra är välkomna

– Nursing, Family Practice/General Practice, Dentistry, Anesthesia, Pathology and Laboratory Medicine, Pharmacy

IHTSDO:s konferenser


• SNOMED CT Expo

– Presentationer om Snomed CT-implementationer och –utbildning

– Väldigt bra tillfälle att nätverka

– 27-28 oktober 2016 i Wellington, Nya Zeland

– 2017 i (troligen) Europa

• IHTSDO Business Meetings

– Det mindre hålls i april i London

– Det större hålls innan och på samma plats som SNOMED CT Expo

IHTSDO:s kurser om Snomed CT


• Alla kurser är engelskspråkiga och webbaserade

• SNOMED CT Foundation Course

– Introduktionskurs som tar upp många aspekter av Snomed CT

– Läses i egen takt och tar cirka 30-35 timmar under max 4 månader

– Godkänt resultat krävs för att bli antagen till alla andra kurser

– Anmälan kan göras löpande och kursen startar normalt inom 8 veckor

– Socialstyrelsen erbjuder en frivillig svenskspråkig utökning

IHTSDO:s kurser om Snomed CT


• SNOMED CT Implementation Course

– Fortsättningskurs om implementation i ett brett perspektiv från beslut till införande, med viss dragning mot teknik

– Läses under sex månader och tar 12-15 timmar/månad

• SNOMED CT Content Development Theory Course

– Fortsättningskurs om innehållsutveckling till egna utökningar

• Fler kurser kan tillkomma under 2016

• http://www.ihtsdo.org/snomed-ct/learn-more/elearning-overview

http://www.ihtsdo.org/snomed-ct/learn-more/elearning-overview







IHTSDO:s dokument om Snomed CT


• Dokumentsamlingen finns på adressen http://www.snomed.org/doc

• Starter Guide introducerar Snomed CT för nybörjaren

– Finns även i en svensk översättning på Socialstyrelsens webbplats

• Technical Implementation Guide innehåller tekniska specifikationer och riktlinjer för implementering

• Editorial Guide innehåller beskrivningar av Snomed CT:s innehåll, inklusive begreppsmodellen, och hur nytt innehåll utvecklas

• Vendor Introduction to SNOMED CT introducerar hur leverantörer kan implementera Snomed CT

http://www.snomed.org/doc


Snomed CT:s innehåll


Snomed CT-bläddrare


• IHTSDO har en bläddrare där man kan titta på Snomed CT:s innehåll

• Innehåller både internationella versionen och nationella utökningar

– Inkluderar den svenska utökningen

• http://browser.ihtsdotools.org/

http://browser.ihtsdotools.org/


kliniskt fynd 33%

åtgärd 17% organism

10%

kroppsstruktur 10%

substans 8%

farmaceutisk eller biologisk produkt

5%

fysiskt objekt 5%

bestämningsvärde 3%

observerbar företeelse 3%

social grupp eller socialt sammanhang

1%

omständighet som rör visst sammanhang

1%

händelse 1%

område eller geografisk plats 1%

provmaterial 1%

SNOMED CT Model Component 0%

stadieindelning eller skala 0%

inaktivt begrepp eller metabegrepp

0%

journalhandling 0%

fysisk faktor 0%

Andel aktiva begrepp i respektive hierarki, internationella versionen juli 2015

kliniskt fynd

åtgärd

organism

kroppsstruktur

substans

farmaceutisk eller biologisk produkt

fysiskt objekt

bestämningsvärde

observerbar företeelse

social grupp eller socialt sammanhang

omständighet som rör visst sammanhang

händelse

område eller geografisk plats

provmaterial

SNOMED CT Model Component

stadieindelning eller skala

inaktivt begrepp eller metabegrepp

journalhandling

fysisk faktor

Mikael Nyström, Hälsoinformatik, Institutionen för medicinsk teknik

Kliniskt fynd, 33 % Clinical finding

• Representerar resultatet av kliniska observationer, bedömningar och beslut

• Inkluderar både normala och onormala kliniska tillstånd

– Alla onormala tillstånd finns med i underhierarkin sjukdom och annat avvikande tillstånd

– Polyhierarkin möjliggör att ett onormalt tillstånd kan vara ättling till både onormala och obestämda tillstånd






Åtgärd, 17 % Procedure

• Representerar aktiviteter som utförs inom hälso- och sjukvården och socialtjänsten

– Invasiva åtgärder

– Läkemedelshantering

– Bilddiagnostiska åtgärder

– Utbildningsåtgärder

– Administrativa åtgärder







Kroppsstruktur, 10 % Body structure

• Representerar både normala som onormala anatomiska strukturer

• Normala anatomiska strukturer kan användas för att ange kroppsstrukturen i samband med ett kliniskt fynd eller åtgärd

• Några av underhierarkierna är

– Anatomisk struktur

– Förvärvad kroppsstruktur

– Morfologiskt förändrad struktur





Organism, 10 % Organism

• Representerar organismer som har betydelse inom human- och veterinärmedicin

• Används också i modelleringen av definitionerna av orsakerna till begreppen i hierarkin kliniskt fynd

• Har inte några attributrelationer

• Några av underhierarkierna är

– Djurriket

– Växtriket

– Mikroorganism






Länkar


Länkar


• IHTSDO, http://www.ihtsdo.org/

• Socialstyrelsens svenska nationella releasecenter, http://www.socialstyrelsen.se/nationellehalsa/snomed-ct

• Föreslå förändringar i Snomed CT:s innehåll, http://www.socialstyrelsen.se/nationellehalsa/snomed-ct/lamnaforslag

• IHTSDO:s kurser om Snomed CT, http://www.ihtsdo.org/snomed-ct/learn-more/elearning-overview

• IHTSDO:s dokument om Snomed CT, http://www.snomed.org/doc

• IHTSDO:s Snomed CT-bläddrare, http://browser.ihtsdotools.org/





























www.liu.se

Mikael Nyström Hälsoinformatik, Institutionen för medicinsk teknik

Documents

Snomed CT - vardgivarwebb.regionostergotland.se CT... · • Den är ganska lik de diagram jag visat hittills i presentationen . 2015-12-02 23 233604007 pneumoni 95436008 konsoliderad