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Sobrevivencia en melanoma maligno Sheila Solange Sgala Facultad de Ciencias Exactas y Naturales- Universidad Nacional de La Pampa [email protected]

Sobrevivencia en melanoma maligno

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Proyecto de datos reales realizado para la materia Estadística del Profesorado en Matemática, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales- Universidad Nacional de La Pampa

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Page 1: Sobrevivencia en melanoma maligno

Sobrevivencia en melanoma maligno

Sheila Solange Sgala

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales- Universidad Nacional de La Pampa

[email protected]

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¿Qué es?

El melanoma es un tipo de cáncer de piel que aparece cuando las células llamadas melanocitos se convierten en maligna.

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Causas

qTener la piel o el pelo claro.qPresencia de nevus atípicos.

qHaber sufrido quemaduras severas por el sol.

qPresencia de nevus en una cantidad superior a 40.qPresencia de nevus congénitos.qTener antecedentes familiares de melanoma.

qHaber estado expuesto muchas horas a rayos ultravioletas. q

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Page 4: Sobrevivencia en melanoma maligno

¿Cómo determinar si un lunar es sospechoso de

ser un melanoma?

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Page 5: Sobrevivencia en melanoma maligno

Asimetría: una parte de la lesión esdiferente a la otra

Bordes irregulares

Diámetro mayor a 5-6 mm.

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Cambios de tamaño, forma, color, Aparición de picazón.

Presencia de varios colores.

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Prevención: El sol constituye el principal factor deriesgo, por lo que es necesario tomar una serie

de medidas básicas.

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Tratamientos:

qCirugía

qInmunoterapia

qRadioterapia

qQuimioterapia

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Investigaciones anteriores

En Argentina:

qAusencia de datos sobre la incidencia del melanoma hasta el año 2002.

qRegistro Argentino de Melanoma Cutáneo(RAMC)

qLiga Argentina de Lucha Contra el cáncer(LALCEC)

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Estadios de Melanoma

qEtapa 0 (melanoma cutáneo in situ)

qEtapa I

qEtapa II

qEtapa III

qEtapa IV

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Figura 1: Capas de la piel humana

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Page 12: Sobrevivencia en melanoma maligno

Objetivos

qAnalizar si los pacientes que presentan ulceración tienen una mayor probabilidad de muerte por melanoma.

qComparar si la frecuencia en que seencuentra la enfermedad en hombres y mujeres, es aproximadamente igual o existe una diferencia significativa.

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Objetivos

qDeterminar si el tiempo de supervivenciadespués de la operación está influenciado por la edad de la persona o no.

qAnalizar si existe una relación entre eltamaño del tumor y el tiempo de supervivencia.

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Hipótesis

qGran parte de las personas no detectan el melanoma a tiempo, por lo que al momento de la operación el tumor es de mayor tamaño.

qLas personas de mayor a edad tienen un menor tiempo de supervivencia luego de la operación.

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Hipótesis

qSi el tamaño del tumor es pequeño, aumenta el tiempo de supervivenciade las personas luego de la operación.

qSi el paciente presenta ulceración, tiene una mayor probabilidad de muerte por melanoma.

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Datos

Los datos fueron tomados de 205 pacientescon melanoma maligno. Cada paciente teníael tumor extirpado mediante cirugía en el Department of Plastic Surgery, University Hospital of Odense, en Dinamarca durante el período 1962-1977.

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Descripción de los datos

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Tiempo de supervivencia del paciente, en días, desde la

operación

Medidas de tendencia central:qMedia: 2152,8qMediana: 2005qClase modal: [1000; 2000)

Medidas de dispersión:

qDesviación estándar: 1122,061qAmplitud o rango: 5555qCoeficiente de variación: 0.5212099

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Figura 2: Histograma de los tiempos de supervivencia (días)de los pacientes desde el momento de la operación.

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Figura 3: Boxplot de los tiempos de supervivencia (días)de los pacientes desde el momento de la operación.

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Estado de los pacientes al final del estudio

qEl 65% de las personas que fueron operadas por un melanoma maligno estaban vivas al finalizar el estudio.

qEl 28% murieron por causa del melanoma maligno.

qEl 7% murieron por otra causa no relacionada con el melanoma.

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Figura 4: Gráfico de barras del estado de los pacientesal finalizar el estudio

Page 23: Sobrevivencia en melanoma maligno

Sexo de los pacientes

qEl 61% de los pacientes son de sexo femenino.

qEl 39% son del sexo masculino.

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Page 24: Sobrevivencia en melanoma maligno

Edad del paciente, en años, en el momento de la operación.

Medidas de tendencia central:

qMedia: 52,46341qMediana: 54qClase modal: [50; 60)

Medidas de dispersión:

qDesviación estándar: 16,67171qAmplitud o rango: 91qCoeficiente de variación: 0.3177779

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Figura 5: Histograma de las edades de los pacientes (en años) al momento de la operación.

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Figura 6: Boxplot de las edades de los pacientes (en años) al momento de la operación.

.

Page 27: Sobrevivencia en melanoma maligno

Espesor del tumor (en mm)

Medidas de tendencia central:

qMedia: 2,919854qMediana: 1,94qClase modal: [0;2)

Medidas de dispersión:

qDesviación estándar: 2,959433qAmplitud o rango: 17,32qCoeficiente de variación: 1.013555

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Figura 7: Histograma de los espesores de los tumores (en mm.) que fueron extirpados de los pacientes en la operación.

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Figura 8: Boxplot de los espesores de los tumores (en mm.) que fueron extirpados de los pacientes en la operación.

Page 30: Sobrevivencia en melanoma maligno

Presencia o ausencia de ulceración.

qEl 44% presentaban ulceración.

qEl 56% de los pacientes no presentaba ulceración.

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(a) (b)

Figura 9: Gráficos de barras del estado de los pacientes con ulceración (a) o sin ulceración (b) al finalizar el estudio.

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Poniendo a prueba las hipótesis

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Figura 2: Histograma de los tiempos de supervivencia (días)de los pacientes desde el momento de la operación.

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Pruebas de bondad de ajuste

X1= Tiempo de supervivencia del paciente, en días, desde la operación.

q X1 ~ ε (0,0005)

Valor p≈ 2,70 x 10-33

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X1= Tiempo de supervivencia del paciente, en días, desde la operación.

q X1 ~ N (2.152,8; 1.259.020,89)

Valor p≈ 5,84 x 10-7

IC (μ: 99%)= [1951; 2355]

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Figura 5: Histograma de las edades de los pacientes (en años) al momento de la operación.

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X4= Edad del paciente, en años, en el momento de la operación.

X4 ~ N (52,46; 277,89)

Valor p≈ 0,30

Page 38: Sobrevivencia en melanoma maligno

Figura 7: Histograma de los espesores de los tumores (en mm.) que fueron extirpados de los pacientes en la operación.

Page 39: Sobrevivencia en melanoma maligno

X5= Espesor del tumor (en mm.)

X5~ ε (0,34)

Valor p≈ 0,44

IC (1/λ: 99%)= [2,39; 3,45]

Page 40: Sobrevivencia en melanoma maligno

Objetivo:

Comparar si la frecuencia en que se encuentra la enfermedad en hombres y mujeres, es

aproximadamente igual o existe una diferencia significante.

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X3= Sexo del paciente. {1 si es mujer; 0 si no es mujer}

Ho: p =0,5 vs. Ha: p≠0,5

Valor p≈ 0,0013

IC (p: 99%)= [0,52; 0,70]

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Hipótesis:

Gran parte de las personas no detectan el melanoma a tiempo, por lo que al momento de

la operación el tumor es de mayor tamaño.

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Page 43: Sobrevivencia en melanoma maligno

Se considera que un tumor es de mayor tamaño cuando su espesor supera los 4

mm.

W= Presencia de un tumor de mayor tamaño al momento de la operación en un paciente.{1 si presenta un tumor de mayor tamaño; 0 si no

presenta un tumor de mayor tamaño}

Ho: p≤ 0,5 vs. Ha: p>0,5

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Valor p≈1

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Hipótesis:

Si el paciente presenta ulceración, tiene una mayor probabilidad de muerte por

melanoma

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Page 45: Sobrevivencia en melanoma maligno

Primer método:

Y= Estado de un paciente que presenta ulceración.

Z= Estado de un paciente que no presenta ulceración.{1 si muere por melanoma; 0 si no muere por melanoma}

Ho: p1≤p2 vs. Ha: p1>p2

Valor p= 1,53 x 10-7

IC (p1- p2: 99%)= [0,157; 0,476]Sheila Sgala

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Segundo método: Test de independencia

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X2= Estado de los pacientes al final del estudio.

X6= Presencia o ausencia de ulceración en el paciente.

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Segundo método: Test de independencia

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Ho: pij=pi. . p.j i {1,2}; j {1, 2, 3} ∈ ∈vs.

Ha: alguna igualdad no se cumple

Valor p= 1,19 x 10-6

Coeficiente de contingencia:C ≈0,34 → Cuya corrección arroja C* ≈0,48

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Hipótesis:

Las personas de mayor edad tienen un menor tiempo de supervivencia luego de la

operación

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Page 49: Sobrevivencia en melanoma maligno

Las edades de las personas quedan

determinadas de la siguiente manera:

*Joven: entre 0 y 19 años.

*Adulto joven: entre 20 y 39 años.

*Adulto medio: entre 40 y 59 años.

*Adulto mayor : entre 60 y 100 añosSheila Sgala

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qCoeficiente de explicación= 7%

qTest de igualdad de mediasq

Valor p= 0.00331

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Figura 10: Intervalos de Confianza usando los contrastes de Tukey para cuatro grupos de edades.

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Valores p ajustados por Bonferroni:

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Siempre que te expongas al sol, cuidá tu piel, es la única que tenés.