Subtipificación Molecular para la Vigilancia de Shigella Shigella spp.spp.

en ArgentinaAvances y Metas 2006-2008

23 al 25 de octubre 200723 al 25 de octubre 2007 Mariana PichelAngela SalveMaría Rosa Viñas

Departamento BacteriologíaInstituto Nacional de Enfermedades Infecciosas – ANLIS “Carlos G. Malbrán”

Actividades Desarrolladas Implementación del protocolo estandarizado de PFGE de la Red PulseNet -CDC para Shigella sonnei (Certificación, 2006 y Prueba de Competencia, 2007). Protocolo aplicable también a aislamientos de S.boydii .

Criterios de selección :-S. sonnei: se seleccionaron aislamientos, considerando la inclusión de cepas de diferentes lugares y tiempos de aislamiento y todos aquellos relacionados a sospecha de brote.- S. boydii: estudio de dos brotes y de aislamientos esporádicos

Creación de la Base de Datos Nacional

ShigellaShigella spp. spp.

Base de Datos Nacional (2002 - 2007Base de Datos Nacional (2002 - 2007))

Especies Especies

dede

ShigellaShigella

Nº de aislamientosNº de aislamientos

Periodo 2002 -2007Periodo 2002 -2007

Nº de patrones Nº de patrones de de XbaXbaI-PFGE/I-PFGE/

Nº Nº aislamientosaislamientos

Nº de patrones Nº de patrones de de BlnBlnI-PFGE/I-PFGE/

Nº Nº aislamientosaislamientos

S.sonneiS.sonnei

S.boydiiS.boydii

223223

2525

124 /223124 /223

13 /25 13 /25 (10 patrones de 15 (10 patrones de 15

aislamientos aislamientos esporádicos)esporádicos)

12 /40 *12 /40 *

3 /10 **3 /10 **

* S.sonnei: 40 aislamientos correspondientes a 6 brotes

** S.boydii: 10 aislamientos correspondientes a 2 brotes, que mostraron 3 patrones de XbaI-PFGE y BlnI-PFGE

Brotes y clusters 2006 – 2007 analizados por XbaI-PFGE y BlnI-PFGE

FechaFecha EspecieEspecie ProvinciaProvincia Tipo de broteTipo de brote Nºaisl.Nºaisl. Nº patronesNº patrones

con con XbaXbaI-PFGEI-PFGE

Abril 2006Abril 2006 S. sonneiS. sonnei Entre RíosEntre Ríos Comunitario sin Comunitario sin confirmaciónconfirmación

1414 2 perfiles relacionados2 perfiles relacionados

Enero 2007Enero 2007 S. sonneiS. sonnei La PampaLa Pampa Comunitario sin Comunitario sin confirmaciónconfirmación

2020 4 perfiles relacionados 4 perfiles relacionados (17aisl.)y 3 no (17aisl.)y 3 no relacionados.relacionados.

Brotes confirmados por el laboratorio y epidemiología

FechaFecha Especie y Especie y serotiposerotipo

ProvinciaProvincia Tipo de broteTipo de brote NºaislNºaisl Nº patronesNº patrones

con con XbaXbaI-PFGEI-PFGE

Abril 2006Abril 2006 S. boydii 4S. boydii 4 MendozaMendoza ComunitarioComunitario

(Comedor universitario) (Comedor universitario)

33 11

Marzo 2007Marzo 2007 S. sonneiS. sonnei San LuisSan Luis FamiliarFamiliar 22 11

Enero 2007Enero 2007 S. boydii 2S. boydii 2 NeuquénNeuquén ComunitarioComunitario

(Viaje de egresados)(Viaje de egresados)

77 22

Detección de “clusters” identificado por el laboratorio y sin confirmación epidemiológica

Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE-XbaI

100

90

80

PFGE-XbaI

SB108/07

SB421/06

SB104/07

SB105/07

SB106/07

SB107/07

SB143/07

SB144/07

SB721/06

SB1401/06

SB504/05

SB1679/05

SB719/06

SB1310/06

SB959/05

SB916/06

SB986/06

SB987/06

SB988/06

SB357/06

SB414/06

SB680/05

SB2249/05

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Neuquén

Buenos Aires

Neuquen

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Río Negro

Mendoza

Mendoza

Mendoza

Salta

Mendoza

Buenos Aires

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Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Nª de cepa/ Lugar de Serotipo

año aislamiento

1er Brote

2do Brote

Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE-XbaI

100

90

80

PFGE-XbaI

SB108/07

SB421/06

SB104/07

SB105/07

SB106/07

SB107/07

SB143/07

SB144/07

SB721/06

SB1401/06

SB504/05

SB1679/05

SB719/06

SB1310/06

SB959/05

SB916/06

SB986/06

SB987/06

SB988/06

SB357/06

SB414/06

SB680/05

SB2249/05

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Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

Nª de cepa/ Lugar de Serotipo

año aislamiento

Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE-XbaI

100

90

80

PFGE-XbaI

SB108/07

SB421/06

SB104/07

SB105/07

SB106/07

SB107/07

SB143/07

SB144/07

SB721/06

SB1401/06

SB504/05

SB1679/05

SB719/06

SB1310/06

SB959/05

SB916/06

SB986/06

SB987/06

SB988/06

SB357/06

SB414/06

SB680/05

SB2249/05

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Shigella boydii 4

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Shigella boydii 4

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Shigella boydii 4

Shigella boydii 4

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Nª de cepa/ Lugar de Serotipo

año aislamiento

1er Brote

2do Brote

Dendrograma de relación genética de Shigella boydii XbaI-PFGE

Mar del Plata

2

5

3

4

6

7

NeuquénMar del Plata

2

5

3

4

6

7

Neuquén

Dice (Opt:1.50%) (Tol 2.5%-2.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE-BlnI

100

959085

PFGE-BlnI

SB986/06

SB987/06

SB988/06

SB104/07

SB105/07

SB106/07

SB107/07

SB108/07

SB143/07

SB144/07

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Shigella boydii 2

Shigella boydii 2

Shigella boydii 2

Nª de cepa/ Lugar de Serotipo

año aislamiento

1er Brote

2do Brote

Dice (Opt:1.50%) (Tol 2.5%-2.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE-BlnI

100

959085

PFGE-BlnI

SB986/06

SB987/06

SB988/06

SB104/07

SB105/07

SB106/07

SB107/07

SB108/07

SB143/07

SB144/07

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Neuquen

Neuquen

Neuquen

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Shigella boydii 2

Nª de cepa/ Lugar de Serotipo

año aislamientoDice (Opt:1.50%) (Tol 2.5%-2.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]

PFGE-BlnI

100

959085

PFGE-BlnI

SB986/06

SB987/06

SB988/06

SB104/07

SB105/07

SB106/07

SB107/07

SB108/07

SB143/07

SB144/07

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Shigella boydii 2

Shigella boydii 2

Shigella boydii 2

Nª de cepa/ Lugar de Serotipo

año aislamiento

1er Brote

2do Brote

Dendrograma de relación genética de Shigella boydii por BlnI-PFGE.

METAS 2008METAS 2008

Incorporar la aplicación de PFGE en forma activa en la vigilancia de Shigella spp . en Argentina.

Asignación de patrones en la Base de Datos Nacional e ingreso de patrones y datos de aislamientos humanos a la Base de Datos Regional en tiempo real (aislamientos 2006-2007).

Participar del control de calidad anual para Shigella sonnei mediante la prueba de competencia para la realización de geles y análisis remitida por el CDC, USA