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Summer research Summer research 研研研研研研研研Yeast One Hybrid system Yeast One Hybrid system 研研研研研研研研研研研 研研研研研研研研研研研 研研研研研 研研研研研 研研 04 研 881714 研研研

Summer research 研究主題: Yeast One Hybrid system 中央研究院生農所籌備處 楊文欽教授 生科 04 級 881714 何國維

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Summer researchSummer research

研究主題:研究主題: Yeast One Hybrid systemYeast One Hybrid system

中央研究院生農所籌備處 楊文中央研究院生農所籌備處 楊文欽教授欽教授

生科 04 級 881714 何國維

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Institute introductionInstitute introduction

作物改良組作物改良組

中草藥研究組中草藥研究組

環保及工業用酵素環保及工業用酵素

動物疫苗技術動物疫苗技術

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IntroductionIntroduction

Lymphocyte stem cell

( Bone marrow )

B cell ( Bone marrow )

T cell ( Thymus )

Tc

( Cytotxic T cell )

Th

( Helper T cell )

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IntroductionIntroduction

Th1 cells activate macrophages. Th1 cells activate macrophages.

Enabling them to destroy intracellular Enabling them to destroy intracellular

microorganisms more efficiently.microorganisms more efficiently.

Th2 cells drive B cells to differentiate Th2 cells drive B cells to differentiate

and produce immunoglobulins of all and produce immunoglobulins of all

other type. other type.

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IntroductionIntroduction

TT 細胞由未受刺激的細胞由未受刺激的 Th0Th0 細胞發展到 細胞發展到 Th1Th1 細胞的細胞的

分化過程中,其分化過程中,其 Interferon gamma promoter (pIFInterferon gamma promoter (pIF

N-γ) N-γ) 會被活化而導致會被活化而導致 IFN-γIFN-γ 的產生。 的產生。

T-bet T-bet 可以促進 可以促進 TT 細胞從 細胞從 Th0 Th0 細胞分化到 細胞分化到 Th1 Th1

細胞,也可以控制 細胞,也可以控制 IFN-γ IFN-γ 的表現。 的表現。

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IntroductionIntroduction

Th0 Th1 IFN-γT-bet

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MaterialMaterialYeastYeast

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Main difference between yeast and E.coli culMain difference between yeast and E.coli cultureture

YeastYeast E.ColiE.Coli

4~6 days4~6 days 16 hours16 hours

YeastYeast E.ColiE.Coli

3030℃℃ 3737℃℃

YeastYeast E.ColiE.Coli

YPDYPD LBLB

Incubation timeIncubation time

Incubation temperatureIncubation temperature

Culture mediumCulture medium

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MethodMethodYeast One Hybrid systemYeast One Hybrid system

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One-Hybrid System provides an in vivo genetic assay One-Hybrid System provides an in vivo genetic assay

used for isolating novel genes encoding proteins that used for isolating novel genes encoding proteins that

bind to a target, cis-acting regulatory elementbind to a target, cis-acting regulatory element

Protein-DNA interactionProtein-DNA interaction

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由於 由於 T-bet T-bet 可和 可和 IFN-IFN-γγ 啟動子結合並且調控之,啟動子結合並且調控之,

因此想利用 因此想利用 T-bet T-bet 和 和 IFN-γIFN-γ 啟動子的作用來探討 啟動子的作用來探討

Yeast one hybrid Yeast one hybrid 系統是否可以偵測到兩者的作系統是否可以偵測到兩者的作

用。若可行,我們將利用此系統進一步來篩選其用。若可行,我們將利用此系統進一步來篩選其

他能和 他能和 IFN-IFN-γγ 啟動子作用的基因,與研究這些基啟動子作用的基因,與研究這些基

因的產物是否可以促進 因的產物是否可以促進 T cell T cell 從 從 Th0 Th0 細胞分化細胞分化

到 到 Th1 Th1 細胞。細胞。

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AD

AD

BD

AD

BD

報導基因BD

AD BDAD BD

ADAD

AD

BDAD

BD

Reporter geneBD

c. Activation

b. Fusion protein binding

a. Fusion protein expression

AD BDAD BDAD BDAD BD

Yeast chromosome

Constructed plasmid

T-bet

IFN-r promoter

GAL4AD

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XbaI

IFN-r promoter

EcoRI

pHISi6786 bp

HIS3

URA3

AmpR

Bam HI (1447)

Eco RI (2)

Nco I (2935)

Sma I (9)

Xba I (43)

Xho I (1009)

Xma I (7)

Bst XI (542)

Eco RV (2918)

Kpn I (775)

Sac I (17)

Hin dIII (457)

Hin dIII (644)

Hin dIII (3635)

Pst I (836)

Pst I (2712)

Pst I (3627)

ligation

Reporter gene

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T-bet binding domain

EcoRI PstIpGAD4246659 bp

LEU2

AmpR

GAL4AD

Bam HI (844)

Eco RI (834)

Pst I (860)

Sma I (841)

Xma I (839)

Eco RV (1891)

Kpn I (484)

Hin dIII (410)

Hin dIII (1105)

Bst XI (767)

Bst XI (1130)

Bst XI (1930)

Activation domain

ligation

Report gene

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Yeast strain : YM4271 ( MATa )、 Y187 ( MATα )

Can’t synthesis histidine 、 leucine 、 uracil by itself 。

Yeast

Incubate

Yeast selection medium

-His or -Leu or -Ura

Yeast can’t growth on selection medium

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pHISi-IFN-γ

Yeast ( YM4271 )

Yeast selection medium

-His

pGAD424-T-bet

Yeast ( Y187 )

Yeast selection medium

-Leu

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Yeast selection medium

-His

Appropriate 3-AT

3-AT : a inhibitor of the HIS3 gene product

Yeast ( YM4271 )

pHISi-IFN-γ

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Yeast selection medium

-His/-Leu

Yeast ( Y187 )

pGAD424-T-bet

Yeast can’t growth

Yeast ( YM4271 )

pHISi-IFN-γ

Yeast can’t growth

Yeast selection medium

-His/-Leu

Incubate

Incubate

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pHISi-IFN-γ

pGAD424

Appropriate 3-AT

Yeast selection medium

-His/-Leu

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Yeast mating

YM4271 Y187

Yeast selection medium

-His/-Leu

pHISi-IFN-γ

pGAD424-T-bet

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Y187

YM4271

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Future work

Screen library to find new transcription Screen library to find new transcription factor.factor.

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THE ENDThank you