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Guion de la clase de taxonomía bacteriana del pre-grado de medicina veterinaria
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TAXONOMIABACTERIANA
CONCEPTO
Ciencia de la clasificación biológica
Taxo: Estructuración u orden
Nomos: Ley
PARTESClasificación: Ubicación de los organismos en grupos (taxones) en función de semejanzas y/o parentesco evolutivo
Nomenclatura: Asigna los nombre de acuerdo a normas
Identificación: Determina a que taxones pertenece un microorganismo aislado
IMPORTANCIAOrdena los conocimientos
Permite hacer predicciones y formular hipótesis
Establecer un lenguaje común y universal
Caracterizar e identificar aislados
Realizar estudios evolutivos
NO CONFUNDIR
Taxonomía
Identificación
•Estudio exhaustivo•Aplica teorías y métodos de clasificación•Grupos taxonómicos•Nomenclatura
•Caracteriza por pruebas limitadas•Compara spp conocidas•Asigna una sp•No identificado: Estudio taxonómico
CONCEPTOS, CLASIFICACION Y
RANGOS
RANGOS TAXONOMICOSDominio
Phylum
Clase
Orden
Familia
Genero
EspecieImportante en clínica y ecología
CLASIFICACIONA nivel de especie (sp) o subespecie (spp):
Serovariedad o serotipo: Ag distintos
Fagovariedad: tipificación por fagos
Biovariedad: diferencias bioquímicas o fisiológicas
Patovariedad: Patogenicidad
Morfovariedad: Apariencia morfológica
Genovariedad: Grupos ADN similares
NOMENCLATURA
Sistema binomial (Linneo):
Staphylococcus intermedius
Staphylococcus aureus
S. intermedius
S. aureus
Streptococcus sp
ESPECIEUnidad taxonómica básica
Grupo de cepas con alto grado de similitud y que difieren de otro grupo de cepas
Cepa: Población de organismos que desciende de un único organismo o de una sola célula
ESPECIE BACTERIANAHomología mayor al 70% (Bergey’s Manual, 1984)
Hoy, criterio Polifásico: Fenotipo y genotipo (incluye filogenético)
Posible criterio futuro: Definición genomica
Cepa Tipo: Primera cepa estudiada, siendo la mas caracterizada.
No necesariamente es la representativa del grupo
Existen bancos de cepas a nivel mundial
Se tratan de mantener con el menor numero de pases (subcultivos)
Centro de Colecciones Microbiologicas (Facultad de Ciencias, UCV)Vzla.
American Type Culture Collection (ATTC), USA
CIP (Coleccion Instituto Pasteur) Francia
DSMZ, Alemania
Genero:
Grupo definido de especies con muchas similitudes que estan claramente separados de otros
Actualmente muchas especies estan en estudio a raiz de nuevas evaluaciones
ESTUDIOS TAXONOMICOS
TAXONOMIA POLIFASICA Es la tendencia moderna
Integra los caracteres:
Fenotipicos
Genotipicos
Filogenéticos
Características fenotipicas
También conocida como clasificación Fenética
Porcentaje de G+C
Ponderación de caracteres con Claves Dicotómicas
TAXONOMIA CLASICA
CARACTERES FENOTIPICOS
Morfológicas Fisiológicas
CONTENIDO G+CPermite distinguir 2 organismos si difieren mas del 10%. Si tienen igual porcentaje, no funciona
TAXONOMIA NUMERICASe utiliza para evaluar datos fenotipicos
Utiliza gran numero de caracteres (>60)
Cada dato tiene el mismo valor
Los caracteres comunes indican similitud entre especies
TAXONOMIA NUMERICA
TAXONOMIA NUMERICA
Matrices de asociación
Grupos de similitudes
Dendogramas
TAXONOMIA MOLECULAR
Basada en análisis moleculares
Técnicas utilizadas:
Hibridación ADN-ADN
Huella molecular (Molecullar Fingerprinting)
HIBRIDACIONDependen de la secuencia
Util en organismos muy cercanos
Criterio actual para definir especie
Se basa en:
Porcentaje de hibridación ADN-ADN
Temperatura de desnaturalización del híbrido
PROCEDIMIETO
HUELLA MOLECULAR
Secuencias especificas de ADN
Las mismas son sometidas a digestión con enzimas de restricción
Su resolución se ubica a nivel de sub-especies
Fingerprinting
CARACTERIZACION FILOGENÉTICA
Evalúa la evolución
Se basa en la conservación de secuencias dentro de los genomas y su comparación con las variaciones que aparecen
CARACTERIZACION FILOGENÉTICA
Plantea hipótesis de evolución, es decir, determina relaciones de parentesco entre especies
Compara las secuencias de moléculas (cronómetros evolutivos) y establece la relación entre ellas
Las secuencias de las moléculas son el registro histórico de la evolución
MOLECULAS UTILIZADAS
ARNr: 5S, 16S, 23S
Subunidad beta de ATPasa
RecA
Factor de elongacion Tu
Genes funcionales
RIBOSOMA
RIBOSOMA
Esquema del ARNr 16S
ARBOL FILOGENÉTICO