Upload
mariusz
View
218
Download
5
Embed Size (px)
Citation preview
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS376
Zastosowanie technologii mikromacierzy w onkologii dziecięcej
Microarray technology in pediatric oncology
Joanna Szczepanek1,2, Jan Styczyński1, Andrzej Tretyn2, Mariusz Wysocki1
STRESZCZENIENowotwory występujące u dzieci kształtują ważny i trudny dział medycyny. Wykazują ogromne zróżnicowanie, a ich diagnoza jest często utrudniona ze względu na brak specyficznych objawów. Profilowanie ekspresji dzięki technice mikromacierzy jest często stosowane w badaniach pediatrycznych nowotworów hematologicznych i guzów litych. W wielu badaniach uzyskano profile ekspresji umożliwiające ich precyzyjną klasyfikację, monitorowanie przebiegu klinicznego, ocenę reakcji na leczenie i w konsekwencji rokowania. Za pomocą profilu genetycznego możliwa jest identyfikacja nowych podklas w obrębie danego nowotworu dziecięcego, poszukiwanie nowych markerów genetycz-nych o znaczeniu prognostycznym oraz opracowywanie terapii dostosowanej do pacjenta. W pracy zaprezentowano przegląd najnowszych analiz z zakresu wykorzystania technik monitorowania genomu i transkryptomu komórek no-wotworowych w onkologii wieku dziecięcego. Słowa kluczowe: profil ekspresji genów, mikromacierze, nowotwory, onkologia dziecięca, genomika, transkryptomika
SUMMARYCancers occurring in children create an important and difficult section of medicine. There is a large diversity of cases, and their diagnosis is often difficult because of the lack of specific symptoms. Expression profiling with microarray technology is nowadays used in studies of pediatric hematological malignancies and solid tumors. In many studies, expression profiles were obtained to enable their accurate classification, monitoring the clinical course, evaluation response to treatment and prognosis. Using genetic profile it is possible to identify new subclasses of children tumors, to search for new genetic markers with prognostic significance, and to develop therapies tailored for the patient. This paper presents an overview of recent studies of the use of genome and transcriptome monitoring techniques for cancer cells in childhood oncology.Key words: genes expression profile, microarrays, cancer, pediatric oncology, genomics, transcriptomics
Pediatr Pol 2011; 86 (4): 376–384
© 2011 by Polskie Towarzystwo Pediatryczne
Otrzymano/Received: 21.06.2011
Zaakceptowano do druku/Accepted:
9.07.2011
1Katedra i Klinika Pediatrii, Hematologii i Onkologii,
Collegium Medicum, Uniwersytet Mikołaja Kopernika, Bydgoszcz
Kierownik: prof. dr hab. Mariusz Wysocki
2Zakład Biotechnologii, Katedra Fizjologii Roślin
i Biotechnologii, Uniwer-sytet Mikołaja Kopernika,
Toruń Kierownik: prof. dr hab.
Andrzej Tretyn
Konflikt interesu/ Conflicts of interest:
Autor pracy nie zgłasza konfliktu interesów
Adres do korespondencji/ Address for
correspondence: Prof. dr hab. n. med.
Jan Styczyński Katedra i Klinika Pediatrii,
Hematologii i Onkologii Collegium Medicum
Uniwersytet im. Mikołaja Kopernika
ul. Curie-Skłodowskiej 9 85-094 Bydgoszcz tel: (52) 585 4860
fax: (52) 585 4867 e-mail:
Wprowadzenie
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS 377
Ryc. 1. Przebieg eksperymentu mikromacierzowego Fig. 1. Phases of microarray experiment
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS378
κ
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS 379
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS380
α α
α
α
Podsumowanie
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS 381
P i ś m i e n n i c t w o
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS382
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS 383
P e d i a t r i a P o l s k a t o m 8 6 , n r 4 , l i p i e c – s i e r p i e ń 2 0 1 1
PRACE POGLĄDOWE / REVIEWS384