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TruSight Oneシーケンスパネル
イルミナ株式会社マーケティング部
2
これまで
– 次世代シーケンサー(NGS)は優れたツール
– 遺伝子だけを対象としたエクソーム解析は効率的
だけど、、、
– それでもまだデータ量は多い
– エクソーム解析(両親と罹患児のトリオ解析)を行おうとすると、高出力のシーケンサーが必要
問題提起
こうした懸念に答えるのが TruSight One とデスクトップ型NGS– TruSight One: 臨床的に疾患と関与すると報告されている4813遺伝子に
フォーカス
– データ解析が全エクソームより容易
– デスクトップ型NGSとの最適な組み合わせ
MiSeq 3サンプル/ラン
NextSeq 36サンプル/ラン
3
TruSight One疾患にフォーカスしたエクソーム解析に最適なキット
4
手頃な設定 4,813 臨床的に
意義をもつ遺伝子
95%のターゲットが最低20xの平均カバレッジ
50ng DNAスタート
4日でDNAから答えま
で
TruSight One 疾患にフォーカスしたエクソーム解析を可能に
2 431
低コスト コンテンツ カバレッジ ワークフロー
5
次世代シーケンサーによる解析で考慮すべき点コスト、カバレッジ、対象領域、検体処理数
低コスト効率化
高カバレッジ高検体処理
低カバレッジ低検体処理
TruSightOne
全エクソーム
全ゲノム
カスタムパネル
対象領域およびコスト高コスト網羅性
カバレッジおよび検体処理数
6
TruSight One フォーカスした対象領域で解析しやすい処理数を可能に
ターゲット遺伝子数: 4,813
ターゲット領域:12 Mb
ターゲットエクソン数:~62,000
MiSeq: 3 サンプル
NextSeq:12 サンプル(中出力)36 サンプル(高出力)
HiSeq: 36 サンプル
フォーカスした対象領域
解析しやすい処理数
7
TruSight One ワークフローステップ 1: 断片化およびアダブターとインデックスのライゲーションを実施
8
TruSight One ワークフローステップ2: プローブとのハイブリダイゼーションとターゲットDNAのキャプチャー
9
TruSight Oneシーケンスパネル製品情報: 2種類のキット構成
MiSeq Kit
TruSight One Sequencing Panel (9 Samples)
キャプチャー用オリゴ濃縮キット 3反応 - 3 プレックス/反応
6 種類のインデックスMiSeq Reagent Kits v3 3キット
FC-141-1006
HiSeq/NextSeq Kit
TruSight One Sequencing Panel (36 Samples)
キャプチャー用オリゴ濃縮キット 3反応 - 12 プレックス/反応
48 種類のインデックスシーケンス試薬は含まず
FC-141-1007
10
TruSight OneシーケンスパネルSample to Answer