Contexte scientifique
CO2
Capture du Carbone Organique Particulaire dans les abysses
Réseau trophique
planctonique
De la vision à la modélisation, genèse d’une innovation
Observation in situ
Capture
MAIS,- Temps bateau important- Faible couverture spatiale- Analyse longue -zooplancton et flux de matière mal représentés dans les modèles
Automatiser l’acquisition et le
traitement des données en mer et en laboratoire
grâce à l’imagerie.
VISION in-situ : Profileur de VisionEtude haute fréquence de la biodiversité et des flux de matière.
FUTURE INTEGRATION EOL, CETO
Plateformes multicapteurs
PVM6, <0.5 kg
Réseaux ARGO et BioARGO
VISION laboratoire : ZOOSCANAnalyse d’‘échantillons de plancton
35 instituts équipés dans le monde
de 1997 à 2010
FORMATION-20 Masters-7 thèses-3 post docs
PUBLICATION-30 de rang A
VALORISATION-Un BREVET-Un contrat de valorisation-Deux LICENCES-Un concours scientifique-Deux Stages internationaux de formation
Des développements instrumentaux cohérents, importance de la vision
PVM4 1997, 300 kg PVM5 2008, 30 kg
Application: Suivi en temps réel du zooplancton à Villefranche depuis 1966
http://www.obs-vlfr.fr/Rade/RadeZoo/
Application: Application: Biogéographie mondiale des Biogéographie mondiale des océans profonds océans profonds
200 profiles UVP9 régions océaniques
21 taxa
Stemmann et al., 2008a and b
Perspectives: réseau mondial de surveillance
Réseau d’observation - Flotteurs équipés de système d’imagerie.- Stations fixes
Centres de réception et d’analyse- Serveur d’images pour la validation en réseau
Carbone Organique Particulaire
ZooplanctonAssimilation dans des modèles - biogéochimique- halieutique
UVP principles
Camera
Light
Volumetric image
PVMThe UVP 4 is based on :1. Camera2. Specially design lighting system3. Computer4. Software
A CTD is associated on the frame
New 2007 version :o 30 Kgo Red light systemo Increased autonomyo Real time processingo Optional telemetryo 6000 m rangeo Rosette-AUV-adaptable
The UVP 4 was a real innovative system but it is heavy and limited to 1000 m.
Size spectra / depth Organisms identification CTD
MATLAB routines
UVP in-situ Image
Measurements
Threshold
Large objects
Large Aggregates - Zooplankton
Large Particulate MaterSize Calibration
ESD ( > 60µm)
All objects
UVP Image process
1987
2001 2001
2003
2005
From silhouette to Zooscan
Silhouette photography (Ortner et al., 1979)
The Zooscan system was constructed to allow the construction of a homogenous, permanent and secure digital image data bank allowing global comparison of zooplankton series. => Zooplankton Data standardization through networks or collaborations (50 Zooscans)
1979
IMAGE ANALYSIS
Basic stats and graphs
Object Separation
Visualisation
Manual measurements
Calibration
Vignettes (thumbnail images)
Basic stats and graphs
Object Separation
Visualisation
Manual measurements
Calibration
Vignette extraction for :
- Training sets for recognition
- Manual identification
- Semi automatic identification