8/19/2019 Tugas Bioinformatika Syahputra Wibowo 135090101111008

http://slidepdf.com/reader/full/tugas-bioinformatika-syahputra-wibowo-135090101111008 1/1

Gene : Gallus Gallus Ovalbumin Gene

Exon : 2996..3163

( catggg ctccatcggt gcagcaagca tggaattttg ttttgatgta ttcaaggagc tcaaagtcca

ccatgccaat gagaacatct tctactgccc cattgccatc atgtcagctc tagccatggtatacctgggt gcaaaagaca gcaccaggac acaaataaat aa )

Primer :

Primer forward :

30bp sebelum exon (agc att cca tcc tta cat ttt cac tgt tct gct gtt tgc tct aga caa ctc aga gtt cac)

:

( TCG TAA GGT AGG AAT GTA AAA GTG ACA AGA CGA CAA ACG AGA TCT GTT

GAG TCT CAA GTG )

Primer reverse :

18 bp setelah exon (ggt gag cct aca gtt aaa gat taa aac ctt tgc cct) :

( AGG GCA AAG GTT TTA ATC TTT AAC TGT AGG CTC ACC )

Melting Temperature :

Tm = ((G+C) X 4) + ((A+T) X 2)

= ((25+15) X 4) + ((32+25) X 2)

= 160 + 114

= 274

Temperature annealing : 274-5 = 269

TUGAS BIOINFORMATIKA

SYAHPUTRA WIBOWO

135090101111008