La Science Ouverte

Jean-Claude Bradley

8 Novembre 2012

Nuit de la Liberté 2012Université Laval au Musée de la

Civilisation

Professeur de chimieUniversité Drexel

Aujourd’hui on prend pour acquis l'accès libre a certaines bases de

données

Ce n’est pas the le cas pour la plupart des bases de données scientifiques

Par exemple, quel est le point de fusion de l’ éthanol?

On essai avec Google…

…mais d’où vient ce chiffre?…est-ce un résultat fiable?

On essai avec NIST – une base de données gouvernementale..

…et on obtient un résultat différent.…En plus, les données ne sont pas

complètement ouvertes:

On essai avec ChemSpider – une base de données par crowdsourcing..

…et on obtient d’autres résultats différents

C'est seulement après avoir recueilli le plus grand nombre de sources possible que l'on

peut observer une convergence des données

C'est le contraire du modèle « source fiable »

• Tous les résultats sont affichés et ne sont jamais effacés

• Les valeurs aberrantes sont marqués en rouge et ne contribuent pas à la moyenne

Les collections de données ouvertes sont essentielles pour ce modèle

données ouvertesdonnées ouvertes

données ouvertes

transformation

enchaînement de provenance transparent

Collections ouvertes de données de Point de fusionActuellement 20.000 composés avec des points de fusion ouverts

La participation de tous les acteurs n'est pas nécessaire pour la science ouverte

Il suffit en effet quelques contributions

• Seulement un seul fournisseur majeur chimique (Alfa Aesar) et une seule agence gouvernementale (EPA) ont accepté de faire don de leur collection de point de fusion pour le domaine public

• Il y a maintenant suffisamment de sources ouvertes pour observer une convergence évidente pour le point de fusion de l'éthanol (et de nombreux autres composés)

Modélisation de données ouvertes de point de fusion utilisant les descripteurs de CDK (Andrew

Lang)

R2 = 0.78, TPSA and nHdon most important

La Science par Cahier de Laboratoire Ouvert

La collecte de données sur la solubilité par « crowdsourcing »

Les mesures de solubilité recueillies dans une feuille de calcul Google

Requête Web basé sur la feuille de calcul Google (Rajarshi Guha)

Provenance des données:Un article de Wikipédia

conduit...

…au cahier de laboratoire et les données brutes

Données brutes en images

Splatter?

Some liquid

YouTube pour démontrer les expériences

  Cours de Recherche d‘Information Chimique à Drexel (automnes 2009-

2012)

Optimisation du système éducatif pour contribuer de la nouvelle

science

La fiche de validation de l'information chimique

Environs 2000 mesures vérifiées et référencées

Explorateur de Point de fusion

Services Web dans une feuille de calcul Google

(Andrew Lang)

Intégration des services Web multiples à Recommander Solvants pour

réactions

(Andrew Lang)

Utilisation de point de fusion pour la prédiction de la solubilité dépendante de la

température

Livre Reaction Attempts

Reactions

Services Web

Archives

Conclusions

• La science ouverte permet et encourage la réutilisation maximale des données aux fins pratiques.

• Il bénéficie à la fois celui qui partage et la communauté scientifique.

• Il n'est pas nécessaire que tous les acteurs contribuent ouvertement dans un domaine - dans de nombreux cas il ne nécessite que quelques-uns pour atteindre une masse critique.