ЦЕЛЬ: РАЗРАБОТАТЬ ТЕХНОЛОГИЮ СОЗДАНИЯ АНАЛИТИЧЕСКИХ ТЕСТ-СИСТЕМ ДЛЯ КЛИНИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ

БИОЛОГИЧЕСКИХ ПРОБ НА ГЕНОМНОМ, ТРАНСКРИПТО-ПРОТЕОМНОМ И МЕТАБОЛОМНОМ УРОВНЕ

ООО «ПОСТГЕНТЕХ»

СХЕМА РАЗРАБОТКИ ТЕХНОЛОГИИ

МЕТА-АНАЛИЗ ДАННЫХ

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЙ СКРИНИНГ

ОТБОР ПАТТЕРНОВ (ПЛЕЯДЫ) БИОМАРКЕРОВ

ВАЛИДАЦИОННЫЕ ИСПЫТАНИЯ

ИНФОРМАЦИОННО-АНАЛИТИЧЕСКАЯ

ЭКСПЕРТНАЯ СИСТЕМА

ПРОБЛЕМА С ПАНЕЛЯМИ БИОМАРКЕРОВ: все, что можно было открыть легким способом -

уже открыто !!!Простатический специфический антигенРаковый эмбриональный антигенАльфа-фетопротеин …

ПАТТЕРНЫ ПРОТИВ БИОМАРКЕРОВ

• Здравый смысл Биомаркеры должны лучше отделять опухоли

от нормы, потому что они СПЕЦИФИЧНЫ для опухоли. Паттерны содержат много шума

• Однако высокий уровень шума и определяет злокачественный потенциал опухоли, ее плеоморфизм

ДВА ПРОГНОСТИЧЕСКИХ НАБОРА БИОМАРКЕРОВ ДЛЯ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

Wang et al. Lancet 2005,List = 76 лучших генов

Van’t Veer. et al. Nature 2002,List = 70 лучших генов

276 70

ОПРЕДЕЛЕНИЕ НОРМЫ

ЧТО ТАКОЕ НОРМАЛЬНАЯ

ПЕЧЕНЬ ?

НОРМАЛЬНЫХ ПЕЧЕНЕЙ НЕ БЫВАЕТ, КАК И СТАНДАРТНЫХ ПЕЧЕНЕЙ

НАСКОЛЬКО ПЛОХА МОЯ ОПУХОЛЬ?

ОТВЕТ: дистанция от идеальной нормы

Ваша опухоль

Пространство ,занимаемое ОПУХОЛЕВЫМИ образцами

DCancer

Центр пространства НОРМАЛЬНЫХ тканей

DNormal

Центр пространства ОПУХОЛЕВОЙ

клетки

Пространство,занимаемое НОРМАЛЬНЫМИ образцами

ИЗМЕРЕНИЕ РАССТОЯНИЙ В ПРОСТРАНСТВЕ МНОГОПАРАМЕТРИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ

ПРИМЕР №1: Панели биомаркеров

Каждая точка это отдельный образец нормы и опухоли на микрочипе

АДЕНОКАРЦИНОМА ЛЕГКИХ

СОСЕДНЯЯ НОРМАЛЬНАЯ ТКАНЬ

Dcspec – расстояние от центра пространства, занимаемого ОПУХОЛЕВЫМИ образцами

Dnspec – расстояние от центра пространства, занимаемого НОРМАЛЬНЫМИ образцами

ПРИМЕР №2: мишени для лекарств

Онкогены – драйверы опухолевых процессов

Гены-мишени, повреждение которых убивает опухоль

ВЗГЛЯД В БУДУЩЕЕ

ЦЕНТРАЛИЗОВАННАЯЛАБОРАТОРИЯ Профили 100 нормальных образцов простаты

Определение НОРМАЛЬНОГО ПРОСТРАНСТВАдля каждого вида оборудования

Для каждого опухолевого образца, будет измерено расстояние до нормальной ткани

ДРУГИЕ ПРИМЕНЕНИЯ (кроме онкологии)

• СТАРЕНИЕ: как далеки мои ткани от идеала?

• Хронические заболевания – сердечнососудистые, резистентность к инсулину

• Пре-злокачественные воспалительные состояния – могут регистрировать скрытую анеуплоидизацию … канцерогенез…