THL Bakteeri-infektiot-yksikkö Helsinki

Bakteeri-infektiot-yksikkö

Helsinki

Toiminnan kohteet

Avoimet ovet 2015

Vakavia yleisinfektioita aiheuttavat hengitystiebakteerit Pneumokokki

Meningokokki

Hemofilus

Legionella

Suolistoinfektioita, ruokamyrkytyksiä ja zoonooseja

aiheuttavat bakteerit EHEC (+ muut enteropatogeeniset E. colit)

Salmonella

Shigella

Listeria

Vibrio cholerae

Kampylobakteerit, Yersinia, C. difficile, C. perfringens

2 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Toiminnan painopisteet

Erikoistason bakteriologiset

laboratoriotutkimukset

Epidemioiden havaitseminen ja

selvittäminen

Kantatyyppien trendiseuranta

Kansallisen rokotusohjelman vaikuttavuuden

seuranta

Yhteistyö ja verkostot kansallisella ja

kansainvälisellä tasolla

Tutkimus- ja kehittämistyö

Avoimet ovet 2015 3 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna

Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna 4

Erikoistason bakteriologiset

laboratoriotutkimukset

29.1.2015


Perinteiset fenotyypitysmenetelmät

2.2.2015 5 29.1.2015


DNA-pohjaiset tyypitysmenetelmät

Menetelmiä n. 80 kpl

Määrityksiä n. 17 000/vuosi

29.1.2015


Kokogenomin sekvensointi

2.2.2015 7

Vaiheittainen käyttöönotto 2015-2017

Pystytys, validointi, harmonisointi, akkreditointi

Tavoitteena korvata suuri osa perinteisistä

menetelmistä

Ensi vaiheessa: EHEC, Listeria, Meningokokki,

epidemiat

29.1.2015


Potilas- ja löydöstiedot lähetelomakkeesta Tehtyjen määritysten tulokset

Noin 19 000 DNA-profiilia

LABORATORIOTIETOJÄRJESTELMÄ

KANTOJEN DNA-PROFIILIKIRJASTO

Tietojärjestelmät

NÄYTEHALLINTAJÄRJESTELMÄ

Tiedetään mitä kantoja säilötty -70ºC ja missä

ne sijaitsevat

TTR

TESSy /

ECDC

29.1.2015

Muutoksia tyypityksissä 2014, 2015

Avoimet ovet 2015

Tyypitykset osin otospohjaisesti

Vain kotimaiset tartunnat: Salmonella, Shigella

Ikäperusteisesti: Pneumokokki

Vain epidemia-/erityistilanteissa

Yersinia, C. difficile

9 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna


Epidemioiden havaitseminen ja

selvittäminen

29.1.2015

• 2012 epätavallisen suuri lkm. huhti-toukokuussa

– valtaosin kotimaisia

• normaalisti 0-10 /vuosi

– yl. ulkomaan matkailijoilla

• tyypitys

– Antibiooteille herkkiä

– DNA-profiilit identtiset

0

5

10

15

20

19

88

19

90

19

92

19

94

19

96

19

98

20

00

20

02

20

04

20

06

20

08

20

10

20

12

epidemiaselvitys - syvähaastattelut (epidemiologit)

- vertailu elintarvikekantoihin (Evira)

- ECDCn kautta kansainvälinen kysely

Seurantatieto tärkeä epidemian havaitsemiseksi Salmonella Isangi



o 5 Salmonella-epidemiaa

o 1 EHEC-epidemia, 10 perheryvästä

o 3 Listeria-ryvästä

o 1 Yersinia pseudotuberculosis

o 1 C. difficile osastoepidemiaepäily

Kotimaiset epidemiat/epidemiaepäilyt

2014

29.1.2015


EPIS-kyselyt

2014, 45 kpl

Suomesta yksi EHEC-kysely

Epidemic Intelligence Information System, ECDC

29.1.2015

14

The European Surveillance System

Vuodesta 2007, tapauskohtainen datan keruu

Molecular Surveillance Pilot, vuodesta 2012

Fenotyyppidata

Mikrobilääkeherkkyys

Genotyyppidata

Mahdollistaa Euroopan laajuisen tautiseurannan

Suolistobakteerit: mahdollisuus yhdistää eri maiden

yksittäiset tapaukset kansainväliseksi epidemiaksi

TESSy-tietokanta

MTCI 15 kpl 2014

4 Listeria monocytogenes

11 Salmonella

Avoimet ovet 2015 29.1.2015 Työvälineitä tartuntatautien torjuntaan Saara Salmenlinna


Kantatyyppien trendiseuranta

29.1.2015

Seroryhmä B-kannat, 2010

4

2

111

1

1

1

11

B:P1.7-2,4:F1-5

B:P1.22,14-6:F1-5

B:P1.12-1,9:F1-5

B:P1.17,16-3:F5-5

B:P1.18-1,34:F4-1

B:P1.18,25-11:F1-23

B:P1.19,13-1:F5-1

B:P1.5-1,10-4:F1-5

B:P1.7-12,14:F1-7

B:P1.7-2,10-7:F1-23

Seroryhmä B-kannat, 2011

10

2

2

1

1

1

11

B:P1.7-2,4:F1-5

B:P1.19,15:F5-9

B:P1.7-12,14:F1-7

B:P1.18,25-11:F1-23

B:P1.22,14:F5-5

B:P1.5,10-1:F4-1

B:P1.7-2,10-7:F1-23

B:P1.7,16:F3-3

Meningokokki ryhmä B Serotyypitys porA – fetA genotyypityksellä

Seurantatieto tärkeää trendimuutosten havaitsemiseksi



Kansallisen rokotusohjelman vaikuttavuuden

seuranta

29.1.2015


Pneumokkikonjugaatti-rokotusohjelman vaikutus lasten vakavaan pneumokokkitautiin

29.1.2015


Yhteistyö ja verkostot kansallisella ja

kansainvälisellä tasolla

29.1.2015

Kuntien mikrobiologiset laboratoriot

Zoonoosikeskus

INBA, Hki

WHO: Global Foodborne Infections Network

Muut THL:n

yksiköt

Yliopistot FiRe

Aluehallinto

virastot

STM



Tutkimus- ja kehittämistyö

29.1.2015


Tutkitaan pneumokokkikonjugaattirokotteen

vaikutusta lasten pneumokokkikantajuuteen

rokotetuilla lapsilla

rokottamattomilla sisaruksilla

Rokotuksen suorat ja epäsuorat

(laumaimmuniteetti) vaikutukset

Jatkoa aiemmalle kantajuustutkimukselle 2011

Bakteriologiset työt INBA:ssa

Ensimmäiset tulokset loppuvuodesta 2015

Pneumokokki: FinIP-kantajuustutkimus

n = 3900

29.1.2015


Meningokokki

• Meninkokkien tautitaakka varusmiehillä 2002–2013

• Yhteistyötutkimus Puolustusvoimien kanssa

• Varusmiehillä suurentunut riski sairastua B-ryhmän

meningokokin aiheuttamaan vakavaan yleisinfektioon muuhun

väestöön verrattuna (Suomen Lääkärilehti 3-4/2015)

• Meningokokki B rokotteiden kantakattavuus

• Kuinka hyvin uudet B-ryhmän meningokokin aiheuttamaa

tautia vastaan suunnatut proteiinirokotteet antavat suojaa

Suomessa kiertäviä invasiivisia kantoja vastaan?

29.1.2015

Health & Medicine

THL Bakteeri-infektiot-yksikkö Helsinki