Филогенетични връзки и генетично разнообразие на...

Preview:

DESCRIPTION

Филогенетични връзки и генетично разнообразие на някои местни (отечествени) породи кучета

Citation preview

  • () ( )

    . , , , . , , . ( , ) , , , . , , . ; , - , , . , . , .

    . , , .

    :1. ;2. ()

    1

  • ;3. ;4 , , , , .

    . , ( , , ) , . . , . , , .

    . , , , .

    . : (, 2007.) (, 2006.) (, 2007.) 40 - .. (, 2006.)6 (, 2007.)10 50 (, 2006.)3 (, 2002.)

    . 8 .

    2

  • . 117 : , , , , , ( 44 169 ) . 16 13 ( ), 3 4 (). . , , . : ; ; ; , ; . (Vila et al., 1997, Savolainen et al., 2002, van Ash et al., 2005), . , GenBank, , .( 1.) - , GenBank; , (Savolainen et al., 2002).

    3

  • . . PCR , . PCR ABI-Prism 3100-Avant (Applied Biosystems, USA). , , .(GenBank accession number NC_002008) , , GenBank, BLAST( NCBI, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST )

    , , , (AMOVA)

    4

  • rlequin v.3.0 (Excoffier et al., 2005). () TCS v.1.21 (Clement et al., 2002). , - A, B, C, D, E (Savolainen et al., 2002), , - ( ) . (neighbor-joining) Mega v.2.1 (Kumar et al., 2001,) UPGMA Phylip 3.65 (Felsenstein, 2004). FST (Fixation index), ( -) 6.0 (StatSoft, 2001). 321 , 15459-15779 (GenBank accession number NC_002008). GenBank : DQ403817, DQ403818, DQ403819, DQ403820, DQ403821, DQ403822, DQ403823, DQ403824, DQ403825, FJ392757, FJ392758, FJ392759, FJ392760, FJ392761.

    1. (S = 48) .RH . , , ( ) , (Savolainen et

    5

  • al.,2002), . 321 28 .( 1.) 14 , , . 7 , D, 2 , C . , (la5) , , . la5 GenBank, , , Canis, .

    ( ), , ( ) . (Posada & Crandal, 2001).

    , (Savolainen et al.,2002). 2.

    (Savolainen et al., 2002). .

    , , , . , , .

    D RH 24, . , D, , RH 26.

    6

  • 2 , . , (Savolainen et al. 2002). , . RH . , , - , , (Savolainen et al., 2002) , . , , , 2. , ( ) E/W, . , D, , .

    2 - , , .

    7

  • 1. ;2. , (van Ash et al., 2005). 321 .3. , (Savolainen et al., 2002). 321 . D .

    RH 24 (.2), , , D. 27 11=12=13=14=54, ( /, ). D 5, D, RH 24 .

    RH 26, , D RH 24 .

    , ( ) D , .

    D 6, , D 5. , , D1, D2, D3, D4, . D 5,

    8

  • , , D 6 . D 6, (van Asch et al., 2005) , , .. . , D 5, D 6 D, .

    , , D.

    (. 2.), D . RH 24, , , . D .

    D .

    ( ) , , W . (RH 2, RH 14), . . 1, . 1 . , , , 29, (Savolainen et al., 2004) (Savolainen et al., 2002) (, , ), . , , , , W .

    FST (Fixation index) - FST ( 3.) FST = 0.00 : . FST = 0.08 , ,

    9

  • . , , , , , , .

    3. FST . , p>0.05.

    .1. .2. , (van Asch et al., 2005). 321 .3. , (Savolainen et al., 2002). 321 .

    .

    / , , (-

    10

  • ). , , . , , (UPGMA) . (.3.)

    , , , , , , .

    . /: , : , . : , . , ( ), , .

    3. , , UPGMA , . , , . , . , , . , ,

    11

  • , , . , , , , : (.4) FST (. 5)

    4. . , .

    (): 1. , 2. , 3. , 4. -, 5. , 6. , 7. (, ), 8. , 9. , 10. , 11. , 12.

    FST, () , 70 % , 21 %. , , / , , , , . ( ( . 3 4), FST (. 5).

    12

  • 5. , FST.(): 1. , 2. , 3. , 4. -, 5. , 6. , 7. (, ), 8. , 9. , 10. , 11. , 12.

    , , , .

    (AMOVA), , ( ) . , , , . (1. , , 2. , 3. , 4. ) , . , . ( ) ,

    13

  • . . , 75 85 % .

    , , , , . , , , , . ( .3 .3, ( D 6 ) ), (Pereire et al., 2006), , , . , , , . , , , ( ) , - .

    . /, ( 4): (S) ; (/L) ; () ; (H).

    14

  • 4 ..1. ;2. , (van Ash et al., 2005). 321 ;3. , (Savolainen et al., 2002). 321 4 , , , , . , , , . () . , /. , ,

    15

  • , . , , () , , , . , , - . , , , , ( - ).

    .

    1. , (, ) .

    2. , , , .

    3. ( ) , .

    4. , , .

    5. .

    6. , D . D, .

    16

Recommended