Bakteriální oxidace uhlovodíků

Bakteriální oxidace uhlovodíkůBakteriální oxidace uhlovodíků

Bakteriální oxidaceBakteriální oxidaceuhlovodíkůuhlovodíků

22 ee––

NADHNADH

CHCH44

CHCH33OHOH

HH22OO

Fe2S2FAD

HBB BB

FeFe22IIIIII ++ OO22HH

–– FeFe22IVIV == OO

PFePFeIIIIII ++ OO22HH–– PFePFeVV == OO

••PFePFeIVIV == OO

Katalytický cyklus oxidace uhlovodíkůKatalytický cyklus oxidace uhlovodíků

FeIIII

FeIIIIII

FeIIII FeIIIIII

FeIIIIII

FeIVIV

FeIIIIII

–– CO

H2O R–H

R–OH

XOHXOH

XOOHXOOH

Katalytický cyklusKatalytický cyklusoxidace uhlovodíkůoxidace uhlovodíků

FerredoxinFerredoxin

Gly Gly 1212

FeFeFeFe

Cys Cys 1111

Cys Cys 1414

Ala Ala 1313

analoga:analoga: [Fe4S4(SR)4]44

–– **[Fe4S4(SR)4]33

–– **[Fe4S4(SR)4]22

–– * *[Fe4S4(SR)4]11

–– analoga:analoga: [Fe4S4(SR)4]44

–– **[Fe4S4(SR)4]33

–– **[Fe4S4(SR)4]22

–– * *[Fe4S4(SR)4]11

––

FerredoxinFerredoxin

Změny náboje a oxidačních stavů železaZměny náboje a oxidačních stavů železa ve ferredoxinu ve ferredoxinu:Změny náboje a oxidačních stavů železaZměny náboje a oxidačních stavů železa ve ferredoxinu ve ferredoxinu:

44 Fe(IIII) 33 Fe(IIII) + Fe(IIIIII) 22 Fe(IIII) + 22 Fe(IIIIII) Fe(IIII) + 33 Fe(IIIIII) 44 Fe(IIII) 33 Fe(IIII) + Fe(IIIIII) 22 Fe(IIII) + 22 Fe(IIIIII) Fe(IIII) + 33 Fe(IIIIII)

[ 4 Fe – 4 S ]

00 [ 4 Fe – 4 S ]

11++ [ 4 Fe – 4 S ]

22++ [ 4 Fe – 4 S ]

33++ [ 4 Fe – 4 S ]

00 [ 4 Fe – 4 S ]

11++ [ 4 Fe – 4 S ]

22++ [ 4 Fe – 4 S ]

proteiny:proteiny: —— Fd Fdredred FdFdox ox // HPHPredred HP HPoxoxproteiny:proteiny: —— Fd Fdredred FdFdox ox // HPHPredred HP HPoxox

++ 00,,11 až

++ 00,,33 VV

– – 00,,33 až

– – 00,,55 VV

FdFd = ferredoxinHPHP = „high-potencial“ protein * * izolováno

FeFe –– S klastryS klastryFerredoxinFerredoxin

FeFeFeFe

SSSSRR

RRSS––

2,269 2,269 ÅÅ

2,208 2,208 ÅÅSS

2,233 2,233 ÅÅ

FeFeFeFe

FeFeSS

SSSSRR

RRSS22––

2,296 2,296 ÅÅ

2,263 2,263 ÅÅSS

2,267 2,267 ÅÅ

FeFeFeFe

SSSSRR

RRSS33––

2,286 2,286 ÅÅ

2,295 2,295 ÅÅSS

2,354 2,354 ÅÅFeFe44SS44(SR)(SR)44

––FeFe44SS44(SR)(SR)44––

FeFe44SS44(SR)(SR)442–2–FeFe44SS44(SR)(SR)44

2–2–

FeFe44SS44(SR)(SR)443–3–FeFe44SS44(SR)(SR)44

3–3–

Transport elektronu pTransport elektronu přes ferredoxinřes ferredoxin

BBBB CCCC

Tvorba radikálůTvorba radikálů

Methionin

S-adenosyl methioninS-adenosyl methioninS-adenosyl methioninS-adenosyl methionin

FeFe –– S klastry S klastry (II)

3333 4444

FeFe –– S klastry S klastry (II II)

10101010

SyntSyntézy FeS klastrůézy FeS klastrů

[[FeClFeCl44]]22––

[[FeFe(SEt)(SEt)44]]22––

4 NaSEt, MeCN

[[FeFe33SS44(SEt)(SEt)44]]33––

[[FeFe33SS44(SR)(SR)44]]33––[[FeFe44SS44(S(SEtEt))44]]

22––

[[FeFe22SS22(S(SEtEt))44]]22–– [[FeFe66SS99(SEt)(SEt)22]]

44––

[[FeFe66SS99(SR)(SR)22]]44––

1,4 S; Me2CO

4 RSH,MeCN

2 RSH,MeCN

60 ºC, MeCN

1,5 S; 85 ºC; MeCN1 S; MeCN

80 ºC,MeCN

MeCN1 FeCl 2, 1 NaSEt

ChlorofylChlorofyl

RR ’’

hydrofobní řetězec

aa: RR = CH3

bb: RR = CHO

ChlorofylChlorofyl 2 feofytiny2 feofytiny ne-hemovéne-hemové

4 hemy4 hemy 4 chlorofyly 4 chlorofyly 2 chinony 2 chinony železoželezo

Umístění atomů železa v chlorofyluUmístění atomů železa v chlorofyluUmístění atomů železa v chlorofyluUmístění atomů železa v chlorofylu

Fotosyntéza Fotosyntéza –– „Z“-schema „Z“-schema

PP680680 PP700700

Fotosyntéza Fotosyntéza –– „Z“-schema „Z“-schema

Fotosystém IIFotosystém IIFotosystém IIFotosystém II Fotosystém IFotosystém IFotosystém IFotosystém I

Tok elektronů ve fotosystémech I a IITok elektronů ve fotosystémech I a IITok elektronů ve fotosystémech I a IITok elektronů ve fotosystémech I a II

MnMnMnMn

FotosyntézaFotosyntéza

22 HH22OO OO22 ++ 44 HH ++ ++ 44 ee––22 HH22OO OO22 ++ 44 HH

++ ++ 44 ee––

SS00 SS11 SS22 SS33 SS44SS00 SS11 SS22 SS33 SS44

Klastr čtyř atomů MnKlastr čtyř atomů MnKlastr čtyř atomů MnKlastr čtyř atomů Mn

++ ++ 44 ee––

(SS00 )(SS00 )

IIIIII

– H+

(SS11 )(SS11 )

– e – H+

++ ++ 44 ee––

(SS22 )(SS22 )

++ ++ 44 ee––

(SS33 )(SS33 )

– e – 2H+

++ ++ 44 ee––

– 2 H+

(SS44 )(SS44 )

Modelové sloučeninyModelové sloučeninyklastrů manganuklastrů manganu

[[MnMn44OO22acac

77bipybipy22]]

[[MnMn44OO22acac

77bipybipy22]]

[[MnMn44OO22acac

66bipybipy22]]

[[MnMn44OO22acac

66bipybipy22]]

[[MnMn33OO33ClCl

44acac33pypy

22]][[MnMn

33OO33ClCl44acac

33pypy22]]

CorrinCorrin

N N HH CoCo

Vitamín B-12Vitamín B-12 (kobalamin) (kobalamin)

CoCo++

RR a)a) RR = CH= CH33

methylkobalamin.

b)b) RR = H= H22OO

aquokobalamin.

c)c) RR = = –– CC NN ––

kyanokobalamin (vitamin B-12B-12).

d)d) RR ==

adenosylkobalamin (koenzym B-12B-12)

a)a) RR = CH= CH33

methylkobalamin.

b)b) RR = H= H22OO

aquokobalamin.

c)c) RR = = –– CC NN ––

kyanokobalamin (vitamin B-12B-12).

d)d) RR ==

adenosylkobalamin (koenzym B-12B-12)

Koenzym B-12Koenzym B-12

Příklady reakcí Příklady reakcí katalyzovaných vitamínem katalyzovaných vitamínem B-12B-12

Záměna Záměna funkčních skupinfunkčních skupin

Přenos methyluPřenos methyluPřenos methyluPřenos methylu

Ribonukleotid reduktázaRibonukleotid reduktáza

Glutamát mutázaGlutamát mutáza

RedukceRedukceRedukceRedukce

ribonukleotid

Diol dehydratázaDiol dehydratáza

deoxyribonukleotid

Methionin syntetázaMethionin syntetáza

Obecné schema mechanismu isomerázyObecné schema mechanismu isomerázyzávislé na adenosyl-kobaltaminuzávislé na adenosyl-kobaltaminu

Methionin syntetázaMethionin syntetáza

Methyl transferázaMethyl transferáza

KKatalytický mechanismus záměny funkčních skupinatalytický mechanismus záměny funkčních skupin

Bakteriální oxidace uhlovodíků

Documents

DERIVÁTY UHLOVODÍKŮ

Halogenderiváty uhlovodíků · •Více atomů halogenu v molekule - před název halogenderivátu předponu vyjadřující počet těchto atomů halogenu v molekule 1 – mono-,

REINIGUNG UND PFLEGE SZAKSZERŰEN ... - dieda.dedieda.de/wp-content/uploads/2014/11/diedapflegev2a.pdf · PŮVOD OXIDACE • většinou je příčinou nečistá práce, nedostatečná

Modely uhlovodíků

Karboxylové kyseliny - Hajduchhajduch.eu/Chemie/Karbkys.pdf · 2012. 4. 9. · Karboxylové kyseliny Karboxylové kyseliny jsou deriváty uhlovodíků, které obsahují charakteristickou

Oxidace a redukce - Masaryk UniversityGalvanické nebo voltaické články Alessandro Volta (1745-1827) Oddělení redukce a oxidace: Zn + Cu2+ → Zn2+ + Cu Spontánní redoxní reakce

Zdroje uhlovodíků

halogenderivátyHalogenderiváty uhlovodíků prezentace VY_52_Inovace_235 Vzdělávací oblast: Člověk a příroda Vzdělávací obor: Chemie Ročník: 8, 9 Projekt EU peníze školám

Bakteriální transpozony Transpozon = sekvence DNA schopná … · 2006. 12. 27. · Bakteriální transpozony Transpozon = sekvence DNA schopná transpozice, tj. přemístění

HALOGENDERIVÁTY UHLOVODÍKŮ

Voda - web.vscht.cz Voda.pdf · klasifikace • voda endogenní oxidace hlavních živin, 300-400 g/den oxidace živiny energie + CO 2 + H 2 O 100 g bílkovin = 37 g vody

I. PŘEHLED OKRUHŮ: Obecná mikrobiologie (historie, bakterie, houby, viry) Bakteriální buňka

kyslíkaté deriváty uhlovodíků · 2011. 6. 28. · vlastnosti: methanol je bezbarvá kapalina charakteristic-kého zápachu, hořlavá a prudce jedovatá. Při požití menšího

Halogenderiváty a dusíkaté deriváty uhlovodíků PaedDr. Ivana Töpferová

Analýza vyšších uhlovodíků v zemním plynutresen.vscht.cz/kap/data/studentska_cinnost/studentska...Tabulka 2 Vybrané fyzikální vlastnost zemního plynu Skupenství (při 20

EXPERIMENTÁLNÍ SROVNÁNÍ OXIDACE MODELOVÝCH A … · Oxidace úinných látek dávkováním pevného K 2 FeO 4 snižuje CHSK, ale nemá vliv na parametr AOX!!! 43 66 54 68 57

Deriváty uhlovodíků

CHOROBY A ŠKŮDCI KVĚTIN - home.czu.cz KVĚTIN.pdf · BAKTERIÁLNÍ CHOROBY Mokré hniloby • Erwinia carotovora subsp. carotovora, • E. carotovora subsp. atroseptica, E. chrysanthemi

HYDROXYDERIVÁTY UHLOVODÍKŮ

Patofyziologie 1- jícen trávícího systému III dutiny ... · (bakteriální enterotoxiny (Vibrio cholerae, Shigella dysenteriae, E. coli, Clostridium difficile, Salmonella typhi)