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2013-02-22 バイオインフォマティクス・ハンズオンセミナーでの講演
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Linked Open DataとはLODI 加藤文彦
バイオインフォマティクス・ハンズオンセミナー 2013-02-22
1
2
ティム・バーナーズ＝リーが示す次のウェブ
http://www.ted.com/talks/tim_berners_lee_on_the_next_web.html
オープンデータとマッシュアップで変わる世界
http://www.ted.com/talks/tim_berners_lee_the_year_open_data_went_worldwide.html
Raw Data Now!
3
4
5
作品
作品
書誌
6
友人
在住
人物
7
舞台
観光地
観光地名前の由来
観光
8
舞台
観光地
観光地名前の由来
作品
作品
友人
在住
書誌人物
観光
9
Open Data+
Linked Data
10
Reuse
11
Open Data
12
“A piece of data or content is open if anyone is free to use, reuse, and redistribute it — subject only, at most, to the requirement to attribute and/or share-alike.”
The Open Definition - http://opendefinition.org/
13
Open (Data) License
14
Public Domain
15
Attribution
16
Share-Alike
17
18
http://data.gov.uk
19
20
http://www.city.sabae.fukui.jp/pageview.html?id=11552
21
http://datameti.go.jp
22
23
https://opendataday.crowdmap.com/main
25
http://odhd13.okfn.jp/
26
http://spending.jp
27
Linked Data
28
29
Web技術でデータを公開・共有するための方法論
30
データのWeb
31
Webの原則1. IRIをHTML文書の識別子として使う
2. IRIにはhttpスキームを使う
3. IRIを見るとHTML文書が返ってくる
4. HTML文書には他のIRIへのリンクがある
32
Linked Dataの原則1. IRIをモノ(Thing)の識別子として使う
2. IRIにはhttpスキームを使う
3. IRIを見るとモノの構造化データが返ってくる
4. データには他のIRIへの型付リンクがある
子供
執筆
発行日
誕生日出版社
所在地
"Things, not Strings" by Google
33
Reuse
Discovery Integration
ID
34
Reuse構造化データ
35
IRIID
36
DiscoveryHTTP + 型付リンク
37
IntegrationIRI + 型付リンク
38
RDF
Discovery Integration
Reuse
全てを含んだグラフデータモデル
ID
39
子供
執筆
発行日
誕生日出版社
所在地
40
子供
執筆
発行日
誕生日出版社
所在地
41
シリアライズ形式• Turtle (N3)• JSON-LD• RDFa• Microdata• RDF/XML• TriX• TriG• ......
42
1.オープンライセンス
2.構造化データ
3.オープンな形式
4. IRIによる識別 / W3C標準
5.他データへのリンク
Linked Open Data
43
Linked Data(データのWeb)
Open Data(オープンライセンス)
RDF(グラフデータモデル)
44
As of September 2011
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(zitgist)
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Zaragoza
yovisto
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KEGG Pathway
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KEGG Drug
KEGG Com-pound
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Publications
Government
Cross-domain
Life sciences
User-generated content
Linking Open Data cloud diagram, by Richard Cyganiak and Anja Jentzsch. http://lod-cloud.net/
45
http://wiki.dbpedia.org/Internationalization/Chapters
47
http://ja.dbpedia.org
48
http://ja.dbpedia.org/resource/沖縄科学技術大学院大学
49
http://ja.dbpedia.org/resource/東京都
http://ja.dbpedia.org/page/東京都
http://ja.dbpedia.org/data/東京都
"東京都"のIRI
HTML表現
データ表現
DBpediaのIRI設計
cf. http://www.w3.org/TR/cooluris/
"東京都"についてのウェブページIRI
"東京都"についてのデータIRI
50
http://ja.dbpedia.org/resource/東京都
http://ja.dbpedia.org/page/東京都
http://ja.dbpedia.org/data/東京都
"東京都"のIRI
HTML表現
データ表現
% curl -IH 'Accept: text/html' http://ja.dbpedia.org/resource/東京都TTP/1.1 303 See OtherServer: Virtuoso/06.01.3127 (Linux) x86_64-unknown-linux-gnu Connection: closeContent-Type: text/html; charset=UTF-8Date: Fri, 25 Jan 2013 03:43:38 GMTAccept-Ranges: bytesLink: <http://mementoarchive.lanl.gov/dbpedia/timegate/http://ja.dbpedia.org/resource/東京都>; rel="timegate"
Location: http://ja.dbpedia.org/page/東京都Content-Length: 0
"東京都"についてのウェブページIRI
"東京都"についてのデータIRI
51
http://ja.dbpedia.org/resource/東京都
http://ja.dbpedia.org/page/東京都
http://ja.dbpedia.org/data/東京都
"東京都"のIRI
HTML表現
データ表現
% curl -IH 'Accept: text/n3' http://ja.dbpedia.org/resource/東京都
HTTP/1.1 303 See OtherServer: Virtuoso/06.01.3127 (Linux) x86_64-unknown-linux-gnu Connection: closeDate: Fri, 25 Jan 2013 03:44:13 GMTAccept-Ranges: bytesTCN: choiceVary: negotiate,acceptContent-Location: /data/東京都.n3
Content-Type: text/n3; qs=0.8Link: <http://mementoarchive.lanl.gov/dbpedia/timegate/http://ja.dbpedia.org/resource/東京都>; rel="timegate"
Location: http://ja.dbpedia.org/data/東京都.n3
Content-Length: 0
"東京都"についてのデータIRI
"東京都"についてのウェブページIRI
52
クエリ言語
• データの検索や操作を行うための言語
• データモデルやDBシステムに合わせて設計
• 例: SQL
–データモデル: 関係モデル
–DBシステム: RDBMS
• LODのデータモデル: グラフモデル53
グラフのクエリ• グラフの最小単位: 3つ組 (トリプル)
• グラフパターン1. 完全一致
• dbp:東京都 dbp-owl:country dbp:日本 .
2. 変数によるパターンマッチ
• dbp:東京都 dbp-owl:country ?country .
3. 1と2の組み合わせ
dbp:東京都 dbp:⽇日本dbpedia-‐owl:country
54
:Amy :Bob :Cathy
:Dan
:Jim
:Ed
:Kate
:Gil
:Flo
:Hal
:Ian
:Lee:May
:like :like
:like
:like :like
:like
:like
:dislike
:dislike
:dislike :dislike
:dislike
:dislike :dislike
:dislike
好き嫌いグラフ
55
:Amy :Bob :Cathy
:Dan
:Jim
:Ed
:Kate
:Gil
:Flo
:Hal
:Ian
:Lee:May
:like :like
:like
:like :like
:like
:like
:dislike
:dislike
:dislike :dislike
:dislike
:dislike :dislike
:dislike
Amyが好きな人グラフパターン:Amy :like ?person .
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:Amy :Bob :Cathy
:Dan
:Jim
:Ed
:Kate
:Gil
:Flo
:Hal
:Ian
:Lee:May
:like :like
:like
:like :like
:like
:like
:dislike
:dislike
:dislike :dislike
:dislike
:dislike :dislike
:dislike
“Amyが好きな人”が好きな人グラフパターン:Amy :like ?person1 .?person1 :like ?person2 .
57
SPARQL• LOD用クエリ言語
– データモデル: RDF (ラベル付き有向グラフ)
– プロトコル: HTTP
• W3C仕様
– 1.0: Recommendations
– 1.1: Working Drafts
58
SPARQLエンドポイント• SPARQLクエリを受け付ける場所– SPARQLエンドポイントURI
• プログラムからSPARQLを使うときに指定
– 入力フォームがある場合もあり
59
DBpedia Japanese SPARQLエンドポイント
60
dbp-owl:AdministrativeRegiondbp:サイボーグ009 dbp-owl:
ComicsCreatordbp:宮城県
dbp:石ノ森章太郎
rdfs:label
rdf:type
rdfs:label
dbp-prop:生年
dbp-owl:notableWork
dbp-owl:award
dbp-owl:birthPlace
rdf:type
サイボーグ009
宮城県 foaf:Person
1938石ノ森章太郎
rdf:type
rdfs:labeldbp:村井嘉浩
dbp-owl:leaderName
DBpedia Japaneseのグラフ例
dbp:手塚治虫文化賞
dbp-owl:Comics
rdf:type
61
dbp-owl:AdministrativeRegiondbp:サイボーグ009 dbp-owl:
ComicsCreatordbp:宮城県
dbp:石ノ森章太郎
rdfs:label
rdf:type
rdfs:label
dbp-prop:生年
dbp-owl:notableWork
dbp-owl:award
dbp-owl:birthPlace
rdf:type
サイボーグ009
宮城県 foaf:Person
1938
rdf:type
rdfs:labeldbp:村井嘉浩
dbp-owl:leaderName
dbp:手塚治虫文化賞
dbp-owl:Comics
rdf:type
クエリ: 手塚治虫文化賞を受賞した漫画家の代表的な漫画PREFIX dbp: <hPp://ja.dbpedia.org/resource/>PREFIX dbp-‐owl: <hPp://dbpedia.org/ontology/>
SELECT ?creatorName ?comicNameWHERE { ?creator a dbp-‐owl:ComicsCreator ; dbp-‐owl:award dbp:手塚治虫文化賞 ;
dbp-‐owl:notableWork ?comic ; rdfs:label ?creatorName . ?comic a dbp-‐owl:Comics ; rdfs:label ?comicName .}
石ノ森章太郎
62
63
http://lod.ac/apps/yas
64
65
66
© 2013 Scholex co.,ltd. and ATR Creative Inc. © 2013 ATR Creative Inc., Linked Open Data Initiative
67
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データの作成・共有・再利用をして新しい世界をつくりましょう
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