89
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ ΙΩΑΝΝΗΣ Σ. ΠΑΠΑΔΑΚΗΣ ΕΙΔΙΚΕΥΟΜΕΝΟΣ ΒΙΟΠΑΘΟΛΟΓΙΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΠΑΓΝΗ 02-11-2011

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Embed Size (px)

DESCRIPTION

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥΙΩΑΝΝΗΣ Σ. ΠΑΠΑΔΑΚΗΣΕΙΔΙΚΕΥΟΜΕΝΟΣ ΒΙΟΠΑΘΟΛΟΓΙΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΠΑΓΝΗ02-11-2011ΑΝΑΤΟΜΙΚΑ ΣΤΟΙΧΕΙΑ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ ΣΥΣΤΗΜΑΤΟΣΚΥΡΙΟΤΕΡΕΣ ΑΣΘΕΝΕΙΕΣ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥΑνώτερο αναπνευστικό Κοινό κρυολόγημαΡινίτιδαΦαρυγγίτιδαΔιφθερίτιδαΑεραγωγοίCroup (οξεία λαρυγγίτιδα, λαρυγγοτραχειοβρογχίτιδα, επιγλωττίτιδα)ΓρίπηΚοκκύτηςΟξεία βρογχίτιδαΒρογχιολίτιδαΚατώτερο αναπνευστικόΠνευμονία Λοιμωξεισ κατωτερου αναπνευστικουπνευμονιεσΠΝΕΥΜΟΝΙΑΛοίμωξη πνευμονικών κυψελίδων + παρεγχύματοςΔιάγνωση πνευμονίας σχετικά απλήδεδομένου ότι τόσοι πολλοί μικροοργανισμοί μπορούν να προκαλέσουν πνευμονία, ο προσδιορισμός της αιτίας μιας πνευμονίας μπορεί να είναι πολύ δύσκολος ΠΑΘΟΓΟΝΑ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣπολυάριθμοι μικροοργανισμοί μπορούν να προκαλέσουν πνευμονία συνήθως προκαλείται από βακτήριασυνήθη παθογόνα πνευμονίας σχετίζονται με →κατάσταση ανοσοποιητικού συστήματος ασθενούς, περιβάλλον ασθενούς, ηλικία ασθενούς,τύπο πνευμονίας ασθενούς (π.χ., τυπική έναντι διάμεσης πνευμονίας)ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΟΙ ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΑΝΑΛΟΓΑ ΜΕ ΤΗΝ ΗΛΙΚΙΑΜΙΚΡΟΒΙΑΚΟΙ ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΣΕ ΣΥΣΧΕΤΙΣΜΟ ΜΕ ΤΟΝ ΤΥΠΟ ΤΗΣ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣΜΙΚΡΟΒΙΑΚΟΙ ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΣΕ ΣΥΣΧΕΤΙΣΜΟ ΜΕ ΤΟ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝ ΤΟΥ ΑΣΘΕΝΟΥΣΠΑΘΟΓΟΝΑ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΣΕ ΣΥΣΧΕΤΙΣΜΟ ΜΕ ΤΟΝ ΤΥΠΟ ΤΗΣ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ ΚΑΙ ΤΟΝ ΤΡΟΠΟ ΜΕΤΑΔΟΣΗΣ ΤΟΥ ΠΑΘΟΓΟΝΟΥΔΙΑΦΟΡΟΙ ΤΥΠΟΙ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣΤΑ ΠΙΟ ΣΥΝΗΘΙΣΜΕΝΑ ΠΑΘΟΓΟΝΑΑΙΤΙΑ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ ΕΠΙ ΕΔΑΦΟΥΣ ΑΛΛΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ Ή ΚΑΤΑΣΤΑΣΗΣΔΙΑΓΝΩΣΗ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ ΤΗΣ ΚΟΙΝΟΤΗΤΑΣΒασικοί Εργαστηριακοί ΆξονεςGram χρώση και καλλιέργεια πτυέλωνΚαλλιέργεια αίματος Ορολογικός έλεγχοςΑντιγονικές δοκιμασίες Nucleic acid amplification testsΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ πρόσθετες εργαστηριακές εξετάσεις που μπορούν να βοηθήσουν στην οριστική διάγνωση Γενική αίματος – τύπος λευκοκυττάρων Βιοχημικός έλεγχος – γλυκόζη, ουρία, ηλεκτρολύτεςΟρολογικός έλεγχος HIV με σύμφωνη γνώμη του ασθενούςΑέρια αίματοςGram χρώση και καλλιέργεια πτυέλωνκαλλιέργειες αίματος για βακτηρίδια, μύκητες - θετικές στο 15-25% ενδονοσοκομειακών πνευμονιώνορολογικός έλεγχος IgG, IgM – όχι ρουτίνα (Chlamydia, Legionella, Mycoplasma) έλεγχος P. jiroveci (PCP)ορολογική ανίχνευση αντισωμάτων (π.χ., ψυχροσυγκολλητίνες M. Pneumoniae με αντιγόνα από τον παθογόνο παράγοντα (π.χ., για S. pneumoniae, H. Influenzae και RSV το χειμώνα)έλεγχος για μύκητες έλεγχος για Coxiella burnetii (αγρότες)PCR σε δείγματα πτυέλων για να καθορίσουν γρήγορα την αιτία της πνευμονίας (π.χ. φυματίωση)αντιγόνο ούρων LegionellaΔΕΙΓΜΑΤΑ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥπτύελα αποβαλλόμενα με φυσική απόχρεμψηπτύελα μετά από πρόκληση βήχαβρογχικά εκκρίματα ληφθέντα με προστατευμένη βούρτσα (PSB) – ευαισθησία 40-100%, ειδικότητα 50-80% - αξιολόγηση ≥ 103cfu/ml αντανακλά σε 106 cfu/mlβρογχοκυψελιδικό έκπλυμα(BAL) – ευαισθησία περίπου 70%, αξιολόγηση ≥ 104cfu/ml BAL βρογχικά εκκρίματα ληφθέντα με βιοψία (ανοιχτή διαβρογχική)βρογχικά εκκρίματα ληφθέντα με διατραχειακή αναρρόφηση (ΤΤΑ)ΔΕΙΓΜΑΤΑ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥΟξεία πνευμονία –> πτύελαΣυνδεδεμένες με αναπνευστήρα πνευμονίες –> βρογχοκυψελιδικό έκπλυμα - BALΧρόνια πνευμονία –> πτύελα, BAL Τα αποβαλλόμενα πτύελα πρέπει να λαμβάνονταιμετά από βαθύ βήχαΣΥΛΛΟΓΗ ΔΕΙΓΜΑΤΟΣ ΠΤΥΕΛΩΝΣωστή καθοδήγηση ασθενών Λήψη τροφής απαγορευτική 1-2 ώρες πριν από την απόχρεμψη Ξέπλυμα στόματος με φυσιολογικό ορό ή νερό Βαθιές αναπνοές και βήχας από τον ασθενή Ο ασθενής θα πρέπει να αποβάλλει το περιεχόμενο σε αποστειρωμένο δοχείο Η μεταφορά θα πρέπει να γίνεται άμεσα στο εργαστήριο (Χρώση Gram και καλλιέργεια το συντομότερο δυνατόΔεν θα πρέπει να γίνεται εργαστηριακή επεξεργασία σε δείγματα κάτω των 2 ml που δ

Citation preview

Page 1: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ

ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΙΩΑΝΝΗΣ Σ. ΠΑΠΑΔΑΚΗΣΕΙΔΙΚΕΥΟΜΕΝΟΣ ΒΙΟΠΑΘΟΛΟΓΙΑΣ

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΠΑΓΝΗ02-11-2011

Page 2: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΑΝΑΤΟΜΙΚΑ ΣΤΟΙΧΕΙΑ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ ΣΥΣΤΗΜΑΤΟΣ

Page 3: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΚΥΡΙΟΤΕΡΕΣ ΑΣΘΕΝΕΙΕΣ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Ανώτερο αναπνευστικό Κοινό κρυολόγημα Ρινίτιδα Φαρυγγίτιδα Διφθερίτιδα

Αεραγωγοί Croup (οξεία λαρυγγίτιδα, λαρυγγοτραχειοβρογχίτιδα, επιγλωττίτιδα) Γρίπη Κοκκύτης Οξεία βρογχίτιδα Βρογχιολίτιδα

Κατώτερο αναπνευστικό

Πνευμονία

Page 4: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΛΟΙΜΩΞΕΙΣ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΠΝΕΥΜΟΝΙΕΣ

Page 5: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ

Λοίμωξη πνευμονικών κυψελίδων + παρεγχύματος

Διάγνωση πνευμονίας σχετικά απλή

δεδομένου ότι τόσοι πολλοί μικροοργανισμοί μπορούν

να προκαλέσουν πνευμονία, ο προσδιορισμός της αιτίας μιας πνευμονίας μπορεί να

είναι πολύ δύσκολος

Page 6: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΠΑΘΟΓΟΝΑ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ

πολυάριθμοι μικροοργανισμοί μπορούν να προκαλέσουν πνευμονία

συνήθως προκαλείται από βακτήρια

συνήθη παθογόνα πνευμονίας σχετίζονται με →• κατάσταση ανοσοποιητικού συστήματος ασθενούς, • περιβάλλον ασθενούς, • ηλικία ασθενούς,• τύπο πνευμονίας ασθενούς (π.χ., τυπική έναντι

διάμεσης πνευμονίας)

Page 7: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΟΙ ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΑΝΑΛΟΓΑ ΜΕ ΤΗΝ ΗΛΙΚΙΑ

Page 8: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΟΙ ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΣΕ ΣΥΣΧΕΤΙΣΜΟ ΜΕ ΤΟΝ ΤΥΠΟ ΤΗΣ

ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ

Page 9: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΟΙ ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΣΕ ΣΥΣΧΕΤΙΣΜΟ

ΜΕ ΤΟ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝ ΤΟΥ ΑΣΘΕΝΟΥΣ

Page 10: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΠΑΘΟΓΟΝΑ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΣΕ ΣΥΣΧΕΤΙΣΜΟ ΜΕ ΤΟΝ ΤΥΠΟ ΤΗΣ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ ΚΑΙ ΤΟΝ

ΤΡΟΠΟ ΜΕΤΑΔΟΣΗΣ ΤΟΥ ΠΑΘΟΓΟΝΟΥ

Page 11: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΔΙΑΦΟΡΟΙ ΤΥΠΟΙ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣΤΑ ΠΙΟ ΣΥΝΗΘΙΣΜΕΝΑ ΠΑΘΟΓΟΝΑ

Page 12: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΑΙΤΙΑ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ ΕΠΙ ΕΔΑΦΟΥΣ ΑΛΛΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ Η ΚΑΤΑΣΤΑΣΗΣ

Page 13: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΔΙΑΓΝΩΣΗ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ ΤΗΣ ΚΟΙΝΟΤΗΤΑΣ

Βασικοί Εργαστηριακοί Άξονες

• Gram χρώση και καλλιέργεια πτυέλων• Καλλιέργεια αίματος • Ορολογικός έλεγχος• Αντιγονικές δοκιμασίες • Nucleic acid amplification tests

Page 14: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ πρόσθετες εργαστηριακές εξετάσεις που μπορούν να βοηθήσουν στην οριστική διάγνωση

Γενική αίματος – τύπος λευκοκυττάρων

Βιοχημικός έλεγχος – γλυκόζη, ουρία, ηλεκτρολύτες

Ορολογικός έλεγχος HIV με σύμφωνη γνώμη του ασθενούς

Αέρια αίματος

Gram χρώση και καλλιέργεια πτυέλων

καλλιέργειες αίματος για βακτηρίδια, μύκητες - θετικές στο 15-25% ενδονοσοκομειακών πνευμονιών

ορολογικός έλεγχος IgG, IgM – όχι ρουτίνα (Chlamydia, Legionella, Mycoplasma)

έλεγχος P. jiroveci (PCP)

ορολογική ανίχνευση αντισωμάτων (π.χ., ψυχροσυγκολλητίνες M. Pneumoniae με < 25% θετικά αποτελέσματα, ανίχνευση αντισωμάτων καψιδίου S. pneumoniae)

αντιγόνα από τον παθογόνο παράγοντα (π.χ., για S. pneumoniae, H. Influenzae και RSV το χειμώνα)

έλεγχος για μύκητες

έλεγχος για Coxiella burnetii (αγρότες)

PCR σε δείγματα πτυέλων για να καθορίσουν γρήγορα την αιτία της πνευμονίας (π.χ. φυματίωση)

αντιγόνο ούρων Legionella

Page 15: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΔΕΙΓΜΑΤΑ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

• πτύελα αποβαλλόμενα με φυσική απόχρεμψη

• πτύελα μετά από πρόκληση βήχα

• βρογχικά εκκρίματα ληφθέντα με προστατευμένη βούρτσα (PSB) – ευαισθησία 40-100%, ειδικότητα 50-80% - – αξιολόγηση ≥ 103cfu/ml αντανακλά σε 106 cfu/ml

• βρογχοκυψελιδικό έκπλυμα(BAL) – ευαισθησία περίπου 70%, αξιολόγηση ≥ 104cfu/ml BAL

• βρογχικά εκκρίματα ληφθέντα με βιοψία (ανοιχτή διαβρογχική)

• βρογχικά εκκρίματα ληφθέντα με διατραχειακή αναρρόφηση (ΤΤΑ)

Page 16: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΔΕΙΓΜΑΤΑ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

BAL

Πτύελα φυσική απόχρεμψη

προστατευμένη βούρτσα (PSB)

βρογχικά εκκρίματα διατραχειακή αναρρόφηση

Page 17: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΔΕΙΓΜΑΤΑ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

• Οξεία πνευμονία –> πτύελα• Συνδεδεμένες με αναπνευστήρα πνευμονίες

–> βρογχοκυψελιδικό έκπλυμα - BAL• Χρόνια πνευμονία –> πτύελα, BAL

Τα αποβαλλόμενα πτύελα πρέπει να λαμβάνονταιμετά από βαθύ βήχα

Page 18: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΣΥΛΛΟΓΗ ΔΕΙΓΜΑΤΟΣ ΠΤΥΕΛΩΝ• Σωστή καθοδήγηση ασθενών

– Λήψη τροφής απαγορευτική 1-2 ώρες πριν από την απόχρεμψη – Ξέπλυμα στόματος με φυσιολογικό ορό ή νερό – Βαθιές αναπνοές και βήχας από τον ασθενή

• Ο ασθενής θα πρέπει να αποβάλλει το περιεχόμενο σε αποστειρωμένο δοχείο • Η μεταφορά θα πρέπει να γίνεται άμεσα στο εργαστήριο (< 2 hr ) και ψύξη του

δείγματος αν καθυστερήσει η ανάλυση• Χρώση Gram και καλλιέργεια το συντομότερο δυνατό• Δεν θα πρέπει να γίνεται εργαστηριακή επεξεργασία σε δείγματα κάτω των 2 ml

που δεν είναι εμφανώς πυώδη• Μόνο 1 εξέταση ανά 24 hr θα πρέπει να προσκομίζεται• Θα πρέπει να χρησιμοποιείται κάποιο σύστημα βαθμονόμησης για την

απόρριψη δειγμάτων επιμολυσμένων με φυσιολογική χλωρίδα• Χειρισμός δειγμάτων χρησιμοποιώντας βασικούς κανόνες προφύλαξης στο

εργαστήριο

Page 19: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΓΕΝΙΚΕΣ ΑΡΧΕΣ ΛΗΨΗΣ ΔΕΙΓΜΑΤΟΣ ΠΤΥΕΛΩΝ

• Κύρια πηγή επιμόλυνσης δείγματος πτυέλων – βακτηριακές επιμολύνσεις από ανώτερο αναπνευστικό και λάρυγγα (π.χ. S. pneumoniae, H. influenzae)

• Τραχειοβρογχικό δέντρο στείρο ή με ελάχιστο αριθμό μικροοργανισμών σε υγιή άτομα

• Βακτηριακά παθογόνα κατώτερου αναπνευστικού ≥ 106/mL στις αναπνευστικού εκκρίσεις = «μέτρια" έως «μεγάλη" ανάπτυξη στην απομόνωση σε καλλιέργεια

• Καλύτερα τα πρώτα πρωινά δείγματα (ολονύχτιες εκκρίσεις πλούσιες σε παθογόνα)

Page 20: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 21: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 22: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΜΑΚΡΟΣΚΟΠΙΚΗ ΕΜΦΑΝΙΣΗ ΠΤΥΕΛΩΝ ΚΑΙ ΣΥΣΧΕΤΙΣΜΟΣ ΜΕ ΠΑΘΟΓΟΝΑ

Page 23: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

“Η καλλιέργεια δειγμάτων του κατώτερου αναπνευστικού μπορεί να οδηγήσει στις πιο ατελέσφορες προσπάθειες μικροβιολογικής

ανάλυσης από οποιοδήποτε άλλο τύπο δείγματος"

Raymond C Bartlett

Page 24: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΕΠΙΜΟΛΥΝΣΕΙΣ ΑΠΟ ΟΡΟΦΑΡΥΓΓΑ

Viridans group streptococci άλλοι από τον Streptococcus pneumoniae

Coagulase-negative StaphylococcusNeisseria (σαπροφυτικά είδη)

Corynebacterium species

Αναπτύσσονται στην κλασική καλλιέργεια πτυέλων αλλά ΔΕΝ αναφέρονται

Page 25: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΗ ΧΛΩΡΙΔΑ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Page 26: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΚΥΡΙΟΤΕΡΑ ΠΑΘΟΓΟΝΑ ΑΝΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Page 27: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΚΥΡΙΟΤΕΡΑ ΠΑΘΟΓΟΝΑ ΤΩΝ ΑΕΡΑΓΩΓΩΝ

Page 28: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 29: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 30: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 31: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Bronchoalveolar Lavage (BAL) ΚΑΤΑΛΛΗΛΟΤΗΤΑ ΔΕΙΓΜΑΤΟΣ

• Μικροσκοπική εξέταση με Gram χρώση– Αποδεκτό όταν < 1% των κυττάρων είναι

πλακώδη επιθηλιακά κύτταρα– Μη αποδεκτό όταν > 1% των κυττάρων είναι

πλακώδη επιθηλιακά κύτταρα

Thorpe JE et. al. 1987. Bronchoalveolar lavage for diagnosing acute bacterial pneumonia. J. Infect. Dis. 155:855-861

Page 32: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΠΡΟΕΤΟΙΜΑΣΙΑ ΕΠΙΧΡΙΣΜΑΤΟΣ ΠΤΥΕΛΩΝ• Πλύσιμο πτυέλων με

φυσιολογικό ορό 1:1 3 φορές

• Θραύση πτυέλων με sputazole (1:1)

• Vortex• Κλίβανος στους 37οC

για 30 min• Vortex• 10 λεπτά στον πάγκο

Page 33: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ

Gram χρώση των πτυέλων από έναν ασθενή με υποψία

πνευμονίας μπορεί να είναι χρήσιμη για τον

τεκμηριωμένο προσδιορισμό της

αιτίας της πνευμονίας

Page 34: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 35: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Gram ΧΡΩΣΗ ΚΑΙ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑ ΠΤΥΕΛΩΝ

Υποστηρικτές

Ο κυρίαρχος μορφότυπος στη χρώση Gram καθοδηγεί σε θεραπεία

Η ακρίβεια είναι καλή όταν χρησιμοποιούνταιαυστηρά κριτήρια

Μη δαπανηρή μέθοδος

Αμφισβητίες

Συνήθως κακή συλλογή

Υποκειμενικότητα εργαστηριακής ερμηνείας χρώσης Gram

Χαμηλή ευαισθησία και ειδικότητα

Εμπειρική θεραπεία με βάση κατευθυντήριες γραμμές

Page 36: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑ ΒΡΟΓΧΟΚΥΨΕΛΙΔΙΚΩΝ ΕΚΠΛΥΜΑΤΩΝ ΚΑΙ ΠΤΥΕΛΩΝ

• ΑιματούχοΒρογχικά (4 τρυβλία – τα 3 με αραιώσεις ομογενοποιημένου δείγματος 10-

3, 10-5, 10-7)Πτύελα (3 τρυβλία – τα 2 με αραιώσεις 10-5, 10-7)

• Σοκολατόχρωμο (4 τρυβλία στα βρογχικά με τις αντίστοιχες

αραιώσεις – 3 τρυβλία στα πτύελα με τις αντίστοιχες αραιώσεις)

• Chapman

• Sabouraud

• Drigalski

Page 37: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 38: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 39: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑ ΠΤΥΕΛΩΝ

Με ποσοτικό προσδιορισμό στο αιματούχο άγαρ, παρατηρείται γενικά μια κυρίαρχη ανάπτυξη ενός έως

τριών δυνητικών παθογόνων παραγόντων των αναπνευστικών οδών

Ευαισθησία καλλιέργειας πτυέλων για πνευμονιοκοκκική πνευμονία με βακτηριαιμία = 50-55%

Ευαισθησία καλλιέργειας πτυέλων για πνευμονία από Haemophilus influenzae με βακτηριαιμία = 53-66 %

Επιμόλυνση πτυέλων από αποικισμό gram αρνητικών = 32% καλλιεργειών

Page 40: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑΣ ΠΤΥΕΛΩΝ ΚΑΙ ΕΝΔΟΤΡΑΧΕΙΑΚΩΝ ΑΝΑΡΡΟΦΗΣΕΩΝ

• Αξιολόγηση μικροβίων σε συγκέντρωση > 105

• Αναγνώριση και εκτέλεση δοκιμασιών τυποποίησης σε 2-3 δυνητικά παθογόνα που θεωρούνται ως κυρίαρχα στη χρώση Gram

• Δ/Δ S. pneumoniae από στρεπτοκόκκους ομάδας Α• Δ/Δ Cryptococcus neoformans από άλλους μύκητες• S. aureus, Gram (-) βάκιλλοι < φυσιολογική χλωρίδα, ποσοτικός

προσδιορισμός και περιορισμός στην αναφορά της ταυτότητας των παθογόνων που ανήκουν σε αυτήν

• Προσθήκη σχολίου ότι δεν υπάρχει κυρίαρχο παθογόνο στη Gram

• Ταυτοποίηση των μυκήτων, των μυκοβακτηριδίων ή των Nocardia spp.

.

Page 41: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Συνηθέστερα αίτια Πνευμονίας της Κοινότητας

• Streptococcus pneumoniae• Haemophilus influenzae• Moraxella catarrhalis• Staphylococcus aureus• Klebsiella pneumoniae

Page 42: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Streptococcus pneumoniae

• Gram(+) λογχοειδής διπλόκοκκος, καταλάση - , κατά ζεύγη ή μικρές αλυσίδες

• Αιματούχο, Σοκολατούχο (CO2%)• α-αιμόλυση, ‘ξάσπρισμα’ στο Σοκολατούχο,

σαν ‘πιατάκια’ στα παλιά καλλιεργήματα• Ε στην οπτοχίνη (για διαχωρισμό από

πρασινίζοντες)• + δοκιμασία διαλυτότητας στη χολή

Page 43: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 44: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 45: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Streptococcus pneumoniae

Page 46: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Streptococcus pneumoniae

Page 47: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 48: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 49: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Haemophilus influenzae

• Gram(-) εξωκυττάριοι μικροί βάκιλοι/κοκκοβάκιλοι

• μόνο Σοκολατούχο (CO2%) (γκριζωπές στιλπνες αποικίες)

• Απαραίτητοι παράγοντες V και X (διαφορά με H.parainfluenzae: V)

Page 50: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 51: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Haemophilus influenzae

Page 52: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Haemophilus influenzae

Page 53: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Moraxella catarrhalis

• Gram(-) διπλόκοκκος, OX +, αυστηρά αερόβιο

• Αιματούχο, Σοκολατούχο (CO2%)

Page 54: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 55: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Moraxella catarrhalis

Page 56: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Staphylococcus aureus

• Gram (+) κόκκος δυνητικά αναερόβιος, καταλάση + , κοαγκουλάση +, σαν ‘σταφύλια’

• Αιματούχο (χρυσοκίτρινες αποικίες) Σοκολατούχο (CO2%), Chapman(κίτρινες αποικίες)• Β-αιμόλυση

Page 57: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 58: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

S. aureus

Page 59: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Klebsiella pneumoniae

• Gram (-) βάκιλος,ακίνητος, δυνητικά αναερόβιος, ΟΧ (-), λακτόζη (+)

• Αιματούχο, Σοκολατούχο (CO2%),Drigalsky (κίτρινες αποικίες), Mc Conkey (ροζ αποικίες)

Page 60: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ

μερικά παθογόνα βάφονται κατά Gram ανεπαρκώς ή δεν χρωματίζονται κατά Gram, οπότε αν υπάρχει

υποψία για συγκεκριμένους παθογόνους παράγοντες είναι καλό να πραγματοποιούνται οι

ακόλουθες χρώσειςLegionella sp. - Dieterle silver stain

Μυκοβακτηρίδια – οξεάντοχη χρώση

Μύκητες ή Pneumocystis - Gomori methenamine silver stain

Page 61: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Legionella sp. - Dieterle silver stain

Page 62: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Ziehl – Neelsen οξεάντοχη χρώση

Page 63: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Gomori’s Silver Stain P. jiroveci

Lung Biopsy Impression Smear

Page 64: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 65: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΕΜΠΛΟΥΤΙΣΜΟΣ ΚΑΙ ΑΝΑΕΡΟΒΙΑ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑ

Λόγω των επιμολύνσεων από τη φυσιολογική χλωρίδα, τα δείγματα πτυέλων και τα βρογχικά

εκπλύματα δεν ενδείκνυνται να μπαίνουν σε εμπλουτιστικό ζωμό ή αναερόβια καλλιέργεια

Μόνο τα δείγματα που προκύπτουν από διαδερμική αναρρόφηση(συμπεριλαμβανομένων των

διατραχειακών αναρροφήσεων) και με προστατευμένη βούρτσα είναι κατάλληλα για

αναερόβια ποσοτική καλλιέργεια – εμβολιασμός σε εμπλουτισμένο thioglycollate ζωμό, και

καλλιέργεια σε στερεά υλικά

Για εικαζόμενες περιπτώσεις νόσου λεγεωνάριων επώαση σε εκλεκτικό buffered charcoal –yeast

extract (BCYE) agar

Page 66: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΕΚΛΕΚΤΙΚΑ ΘΡΕΠΤΙΚΑ ΥΛΙΚΑΔείγματα από ασθενείς που είναι

γνωστό ότι έχουν κυστική ίνωση πρέπει να καλλιεργούνται σε

εκλεκτικό άγαρ, όπως το Chapman (μανιτόλη + άλας) για την ανάκτηση του S .aureus και εκλεκτικό σοκολατόχρωο άγαρ

με βακιτρακίνη για την ανάκτηση του H. influenzae που μπορεί να συγκαλυφθεί από τη βλεννώδη P.

aeroginosa σε συνήθη μέσα. Συνιστάται η χρήση επιλεκτικού

μέσου για B. cepacia, όπως PC ή OFPBL άγαρ.

Page 67: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΚΗ ΠΡΟΣΕΓΓΙΣΗ ΕΙΔΙΚΩΝ ΠΑΘΟΓΟΝΩΝ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΟΥΝ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ

Legionella (καλλιέργεια σε ειδικό θρεπτικό υλικό, ούρα, ορολογική)

Chlamydophila pneumoniae (ορολογική)

Mycoplasma pneumoniae (ορολογική)

Αναερόβια βακτήρια (προστατευμένη βρογχοσκόπηση με βούρτσα για αναερόβια

καλλιέργεια)

Page 68: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Clin Microbiol Infect 2006; 12 (Suppl. 3): 12–24

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΑ ΕΥΡΗΜΑΤΑ

Page 69: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΑ ΤΗΣ LEGIONELLA

ΠλεονεκτήματαGold standard – δεν αφήνει καμία αμφιβολία για τη διάγνωσηΑπομονωθέντα παθογόνα επιτρέπουν το συσχετισμό με απομονωθέντα

παθογόνα του περιβάλλοντος σε μελέτες PFGE

ΜειονεκτήματαΑπαιτεί εκλεκτικά μέσα: BCYE άγαρΑπαιτεί χρόνο 5-7 ημερών για να αναπτυχθεί. Ενδοκυττάριο παθογόνο, οι ασθενείς συχνά δεν παράγουν πτύελα.

Page 70: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΑΝΤΙΓΟΝΟ ΟΥΡΩΝ LEGIONELLA

• Μέθοδοι – RIA – Radio immuno assay– EIA – Enzyme Immuno assay– ICT - Immuno chromagraphic test (~pregnancy test).– Παροόμοια ευαισθησία και ειδικότητα

• Πλεονεκτήματα– Υψηλή ευαισθησία (80-90%) – Υψηλή ειδικότητα (~ 100%) – Ταχεία – διαρκεί μόνο λίγες ώρες

• Μειονεκτήματα– Αντιγόνο μπορεί να εντοπισθεί για μήνες μετά την προσβολή - αμφιβολίες σχετικά με την

πηγή μόλυνσης και στάδιο της νόσου– Ανιχνεύει μόνο L. pneumophila 1. (Αν και ορισμένες δοκιμασίες δίνοθν διασταυρούμενες

αντιδράσεις με τον ορότυπο 3). – Ορισμένοι ασθενείς δεν μπορούν να παράγουν ούρα

Page 71: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΟΡΟΛΟΓΙΚΕΣ ΔΟΚΙΜΑΣΙΕΣ ΓΙΑ LEGIONELLA

• Πλεονεκτήματα– Επιτρέπει εκ των υστέρων μελέτες – Ορισμένες IFAs ανιχνεύουν IgM – Τα περισσότερα κιτ ανιχνεύουν L.

pneumophila οροτύπων 1-6

• Μειονεκτήματα– Απαιτούνται μήνες για να προβούμε σε μια

διάγνωση. – IFA έχει χαμηλότερη ειδικότητα – Μεμονωμένοι θετικοί τίτλοι μπορεί να είναι

χωρίς νόημα! – Δεν θα εντοπίζουν άλλους ορότυπους εκτός

από serogroups 1-6

Page 72: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Legionella sp. - Dieterle silver stain

Page 73: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Standardizing Chlamydia pneumoniae Assays:

Recommendations from the Centers for Disease

Control and Prevention (USA) and the

Laboratory Centre for Disease Control (Canada)

Scott F. Dowell,1 Rosanna W. Peeling,5 Jens Boman,6

George M. Carlone,1 Barry S. Fields,1 Jeannette Guarner,1

Margaret R. Hammerschlag,4 Lisa A. Jackson,2 Cho-Chou Kuo,3

Matthias Maass,7 Trudy O. Messmer,1 Deborah F. Talkington,1

Maria Lucia Tondella,1 Sherif R. Zaki,1 and the C. pneumoniae

Workshop Participants

‘There are no wholly satisfactory serological methods for diagnosis of C. pneumoniae

infection’

Clin Infect Dis 2001;33:492-502

Page 74: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ CHLAMYDOPHILA PNEUMONIAE

• Καλλιέργεια ρινοφαρυγγικού επιχρίσματος

• Δοκιμασίες αντισωμάτων (ανοσοκαθήλωση συμπληρώματος και ανοσοφθορισμός) – ανίχνευση IgG, IgM, και IgA– Οξεία λοίμωξη τετραπλή

αύξηση τίτλου IgG, αύξηση τίτλουIgM >16,ή αύξηση τίτλου IgG >512.

– Παλιότερη ή παρελθούσα λοίμωξη : 16<IgG τίτλος<512

• Άμεση ανίχνευση αντιγόνου (άμεσος ανοσοφθορισμός [DFA] και ενζυμικές ανοσολογικές δοκιμασίες [EIA])

• Αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR)– Γρήγορη και ευαίσθητη

τυποποίηση– Περιορισμός στον έλεγχο

μικροβιακής αντοχής

Page 75: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

CHLAMYDIA PNEUMONIAE

Page 76: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΠΡΟΒΛΗΜΑΤΑ ΣΤΗΝ ΟΡΟΛΟΓΙΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

• Ανάγκη από κατάλληλα ζεύγη δειγμάτων ορού • Οξεία μόλυνση

– Αύξηση των IgM 2-3 εβδομάδες μετά την εκδήλωση – Υψηλός τίτλος IgG υψηλό μόνο μετά από 6-8 εβδομάδες

• Σε επαναμόλυνση τα IgM και IgG δεν αυξάνονται για 1-2 εβδομάδες

• Επίπεδα επίπεδα IgG χαρακτηριστικά σε κάποιες κοινότητες • Έλλειψη τυποποιημένων μεθόδων δοκιμής • Έλλειψη αντιδραστηρίων υψηλής ποιότητας • Υποκειμενική ερμηνεία • Ψευδή +ve IgM αποτελέσματα• Καλλιέργειες +ve, παρουσιάζουν MIF –ve!

Page 77: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ ΑΠΟ Mycoplasma• Καλλιέργεια (οριστική

διάγνωση) – Πτύελα (συνήθως

σπάνια) ή εκπλύματα από τον λαιμό

– Ειδικό μεταφορικό μέσο σε υποψία M. pneumoniae

– Μπορεί να πάρει 2-3 εβδομάδες

• Ορολογικές εξετάσεις – Ανοσοκαθήλωση

συμπληρώματος (4 - 6 εβδομάδες) με τετραπλασιασμό τίτλου

– Ψυχροσυγκολλητίνες (1/3 - 2/3 των ασθενών)

• ELISA• PCR

Page 78: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Mycoplasma pneumoniae

Page 79: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 80: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 81: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΠΤΥΕΛΑ ΧΡΟΝΙΑΣ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑΣ

Χρώση Gram για NocardiaΟξεάντοχη χρώση για μυκοβακτηρίδια

Χρώση Gomori methenamine silver ή χρώση periodic acid-Schiff (ιστόπλασμα) για μύκητες

Αρνητική χρώση σινικής μελάνης για κρυπτόκοκκο

Κυτταρολογική εξέταση για νεοπλασματικά κύτταρα και μύκητες

Page 82: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΕΣ ΣΤΗ ΧΡΟΝΙΑ ΠΝΕΥΜΟΝΙΑ

• Μυκοβακτηρίδια: Lowenstein-Jensen slants, Middlebrook agars (7H10, 7H11, S7H11), Middlebrook broths

• Μύκητες: Brain heart infusion (BHI) agar, inhibitory mold agar (με chloramphenicol), cornmeal agar

Page 83: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Result Reporting of AFS

AFB* Acid Fast Bacilli

Page 84: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΙΑ ΔΕΙΓΜΑΤΟΣ ΓΙΑ ΤΒ

Page 85: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

Ziehl – Neelsen οξεάντοχη χρώση

Page 86: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ΔΟΚΙΜΑΣΙΑ IFN- ΣΕ ΟΛΙΚΟ ΑΙΜΑ QuantiFERON-TB Test

ESAT-6 CFP 10MitogenControl

TMB

COLOR

Stage 1 Whole Blood Culture

Stage 2 IFN-gamma ELISA

NilControl

Incubate → INF- from sensitized T-

cells

Draw blood + heparin

Aliquot blood & add antigen

Harvest plasma from above settled

cells

Measure [ IFN- g ] in ‘Sandwich’ ELISA

Computerizedinterpretation

Page 87: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

QuantiFERON®-TB Gold Test MethodΠΛΕΟΝΕΚΤΗΜΑΤΑ ΚΑΙ ΜΕΙΟΝΕΚΤΗΜΑΤΑ

• Πλεονεκτήματα: – Μόνο μία επίσκεψη απαιτείται– Αντικειμενική και αναπαραγώγιμη - Δεν εξαρτάται από το

χειριστή – Δε δίνει διασταυρούμενη αντίδραση με BCG, λίγες

διασταυρούμενες αντιδράσεις με μη-φυματιώδη μυκοβακτηρίδια

– Έλεγχος για χαμηλή ή καθόλου ανοσολογική απάντηση – Καμία πιθανότητα του εξέλκωσης λόγω της έντονης

αντίδρασης κατά τη δερματική δοκιμασία • Μειονεκτήματα: – Αίμα πρέπει να παραληφθεί στο εργαστήριο μέσα σε 12 ώρες – Εντατική εργασία για το εργαστήριο – Όχι πολλά στοιχεία για κάποιες ομάδες ασθενών

Page 88: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ
Page 89: ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΣΗ ΛΟΙΜΩΞΕΩΝ ΚΑΤΩΤΕΡΟΥ ΑΝΑΠΝΕΥΣΤΙΚΟΥ

ευχαριστώ για την προσοχή σας