90
Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей Джеральд С. Белл, ДВН Школа Ветеринарной Медицины Тафтс Каммингс Н. Грэфтон, Массачусетс,США

Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей. Джеральд С. Белл, ДВН Школа Ветеринарной Медицины Тафтс Каммингс Н. Грэфтон, Массачусетс,США. Типы скрещивания. Инбридинг : близкородственное скрещивание - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Генетическое тестирование и консультации для

практикующих ветеринарных врачей

Джеральд С. Белл, ДВН Школа Ветеринарной Медицины Тафтс Каммингс Н. Грэфтон, Массачусетс,США

Page 2: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 3: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 4: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Типы скрещивания

Инбридинг: близкородственное скрещивание

Линейное скрещивание (лайнбридинг): мягкая форма инбридинга; приводит к концентрированию генов определенного предка

Аутбридинг: скрещивание животных, находящихся в более отдаленном родстве, чем в среднем в популяции

Кроссбридинг: скрещивание двух разных пород

Page 5: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Линейное скрещивание (лайнбридинг), эффекты

Повышает гомозиготность Не вводит новых дефектных генов

Выявляет дефектные гены за счет повышения гомозиготности

Способствует предсказуемости и воспроизводимости результатов скрещивания

Page 6: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Аутбридинг, эффекты Повышает гетерозиготность

Способствует внесению новых генов

Увеличивая гетерозиготность, в какой-то мере предупреждает развитие наследственных болезней, обусловленных рецессивными генами

Не элиминирует рецессивные гены

Способствует повышению генетического разнообразия в пометах

Page 7: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Коэффициент инбридинга (коэффициент Райта)

Относительное содержание всех вариабельных пар генов, по которым может возникнуть гомозиготность в случае наследования только одного из парных генов от предков, общих для самки и самца

Вероятность того, что особь будет гомозиготной по данному гену, полученному от общего для самки и самца предка

Page 8: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Коэффициент родства

Мера вероятного генетического сходства особи с определенным ее предком

Вероятный процент генов, общих у особи и ее предка и унаследованных от более отдаленных предков

Page 9: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

0 1 2 3 <- Поколения --<<<<< AmCH Sutherland Gallant AmCH Loch Adair Foxfire AmCH Sutherland Lass of Shambray AmCH Braxfield Andrew of Aberdeen AmCanCH Forecast Trade Winds AmCH Afternod Ember VI AmCH Afternod Ember V Laurel Hill Braxfield Bilye AmCH Sutherland MacDuff AmCH Kendelee Pendragon AmCH Afternod Nighean Kendelee AmCH Halcyon Belle-Amie AmCH Sutherland Gallant AmCH Loch Adair Firefly AmCH Sutherland Lass of Shambray

Page 10: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Bilye

Andrew

Belle

Foxfire

Firefly

Ember

Pendragon

T

EPM

Lass

Gallant

MacDuff

N

S FidemacAS

HAmber

Callant

C

Drambuie

K

K

P Diana

WD

A

PL

X

JW

C

M

Page 11: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Вязка двоюродных

брата и сестры

Коэффициент инбридинга = 6,25%

Коэффициент родства G и H = 25%

A

B

XED

C

X

A

B

D

F

F

H

GH

G

H

G

Page 12: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Анализ родословной собаки Laurel Hill Braxfield Bilye

№ поколения Коэффициент инбридинга 4 7.81% 5 13.34% 6 18.19% 7 22.78% 8 24.01%10 28.63%12 30.81%

Page 13: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Анализ родословной той же собаки.

Коэффициент инбридинга = 28,63Линейные предки Кэф.родства 1-е поколение Число раз

Afternod Drambuie 32.09% 6 33Afternod Callant 26.54% 5 13Sutherland Gallant 25.49% 3 2Sutherland MacDuff 25.07% 3 3Sutherland Lass of Shambray 25.05% 3 2Afternod Sue 23.78% 7 45Loch Adair Diana of Redchico17.63% 5 12Afternod Buchanan 17.34% 7 35Afternod Hickory 14.67% 6 24Peter of Crombie 12.76% 11 3,887Heather Grouse 10.45% 16 1,129,656

Page 14: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Если вы хотите воспроизвести

признаки аутбредного предка,

то следует подобрать для

вязки партнеров, генетическое

происхождение которых сходно

с таковым у родителей предка

Page 15: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

БультерьерКоэффициент инбридинга

на протяжении трех десятилетий

(Собаки с 5+ потомками )

Период Средний коэффициент 10 поколений

1990-1999 19.01% +/- 6.23

1980-1989 21.54% +/- 5.69

1970-1979 23.11% +/- 6.04

Page 16: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Генетическое разнообразие

Page 17: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

От заводчиков зависит

генетическое

разнообразие

разводимых ими

животных

Page 18: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Некоторые заводчики, стремящиеся к генетическому разнообразию с охватом всех

признаков породы, предлагают скрещивать только тех

животных, которые имеют минимальную степень родства

Селекция, а не тип скрещивания, ведет к снижению разнообразия

Page 19: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Сравнение аутбридинга и линейного скрещивания на примере 4 собак

ABAB

ABAB

Поколение потомков:

Генные частоты:

50% A и 50% B

AAAA

BBBB

Поколение потомков:

Генные частоты:

50% A и 50% B

AA x AA BB x BB

Собака 1 Собака 2 Собака 3 Собака 4

Поколение родителей:

Генные часоты:

50% A и 50% B

AA x BB AA x BB

Собака 1 Собака 2 Собака 3 Собака 4

Поколение родителей:

Генные частоты:

50% A и 50% B

Page 20: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Теоретическое скрещивание, дающее 4 потомков

x

=

A B

C D

Кобель Дама

Page 21: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Синдром популярного

кобеля

Page 22: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 23: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Синдром популярного кобеля

Чрезмерное использование одного производителя, как правило, вызывает:

Снижение генетического разнообразия

(эффект узкого горлышка бутылки)

Распространение дефектных генов

(эффект основателя)

Page 24: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Синдром популярного кобеля

Чрезмерное использование одних и тех же производителей исключает

или снижает вклад других качественных кобелей, тем самым

сокращая разнообразие генов в породе

Page 25: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Генетическое

разнообразие

=

Разнообразие тактики

заводчиков

Page 26: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Генетическое разнообразие породы поддерживается тем,

что заводчики, по-разному представляя себе, какой должна быть идеальная

собака, соответственно по-разному подходят к отбору

производителей

Page 27: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Распространенные генетические дефекты

Page 28: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 29: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Злокачественные новообразования

Первая по частоте причина смерти собак, обусловленной болезнями

Наследственная предрасположенность

к раку опосредуется:

Генами-супрессорами опухолей

Онкогенами

Примеры: waf-1, PTEN, p53, c-kit

Page 30: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Прогрессирующая атрофия сетчатки (ПАС)

Представлена совокупность наследственных дегенеративных патологий сетчатки Самая распространенная форма ПАС – прогрессирующая дегенерация палочек и колбочек, результат одиночной мутации у предков большинства пород Практически все ПАС считаются аутосомными рецессивными заболеваниями, за исключением:

Доминантной ПАС (бульмастиффы и мастиффы) ПАС, сцепленной с Х-хромосомой (самоедские и сибирские хаски)

Page 31: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Идиопатическая эпилепсия собак

Группа заболеваний, сопровождающихся судорожными припадками

Ответственный за заболевания ген пока не установлен, но анализ родословных подтверждает участие определенного рецессивного главного гена у ирландского волкодава и венгерской короткошерстной легавой

Бельгийский тервюрен: 77% наследственной предрасположенности определяется вкладом одного главного гена

Page 32: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Дисплазия тазобедренного сустава у собак

Page 33: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 34: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 35: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Гипотиреоз собак

Врожденный аутоиммунный тиреоидит

У 9,84% всех собак выявляются аутоиммунные антитела

Возрастной диапазон проявления болезни – 2–4 года с пиком в возрасте 4 лет

После разрушения щитовидной железы уровень аутоиммунных антител к ее ткани снижается, и собаки переходят в конечную стадию гипотиреоза

Page 36: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Наследственные пороки сердца

Page 37: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Атопические/Аллергические

болезни кожи

Page 38: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Вывих коленной чашечки

Page 39: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Дисплазия локтевого сустава

Page 40: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Болезнь Виллебранда (ангиогемофилия)

Наследственное нарушение свертывания крови

Выделяют три типа – все аутосомно-рецессивные

Тип I – (слабая степень) бернский зенненхунд, доберман пинчер, немецкий пинчер, кэрри-блю-терьер, манчестерский терьер, папильон, пемброк-вельш-корги, пудель и многие другие породы

Тип II – (тяжелая степень) немецкий короткошерстный и жесткошерстный пойнтеры

Тип III – (тяжелая степень) скотчтерьер, шотландская овчарка

Page 41: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Чувствительность

к лекарствам/ивермектину

Мутации в гене MDR1 (резистентность ко многим препаратам)

Нефротоксический эффект вызывают: Ивермектин, лоперамид, винкристин и другие препараты

Аутосомный рецессивный ген

Генетический тест проводится в Университете шт.Вашингтон

Page 42: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Генетический анализ

Page 43: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Оценка тазобедренных и коленных суставов

Анализ поведения

Коагуляционные тесты

Выявление возможной злокачественной опухоли

Анализ на наличие камней в мочевом пузыре

Генетическое тестирование собак – компаньонов и

производителей

Page 44: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Простое (один ген) наследование Проще контролировать при селекции

Полигенное наследование Труднее контролировать при селекции

Формы наследования

Page 45: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Анализ генотипа:

Прямое определение генов Тесты, основанные на сцеплении

Анализ фенотипа: Исследование тазобедренного сустава, определение аутоиммунных антител к щитовидной железе, проверка слуха, ультразвуковое исследование, особенности поведения, биопсия …

Page 46: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Анализ рецессивного заболевания с помощью полимеразной цепной реакции

(ПЦР)Нормальный фенотип

Дефектный фенотип

Нормальный ген

Дефектный ген

Page 47: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Правильное использование генетических тестов

Если всех носителей, выявленных с помощью генетических тестов, исключать из разведения, это существенно ограничит генофонд

Не следует решать вопрос об использовании животного в разведении, основываясь на результатах тестирования одного гена

Page 48: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Правильное использование генетических тестов

В случае выявления дефектного гена у

качественного животного скрещивайте его с

нормальными партнерами и затем

заменяйте родителя–носителя

качественным нормальным потомством

Page 49: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Заводчики собак – хранители чистоты породы

и ее генофонда

Главное – не навреди

Нужно рекомендовать заводчикам использовать генетические тесты в интересах сохранения породы

Page 50: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Генетические тестыПрямое генетическое тестирование

Определение генотипа

Нужно только для прогнозирования результатов скрещивания и принятия решения при отборе производителей

Фенотипическое тестирование; анализ сцепления; либо без проведения тестов на носительство

Результаты тестирования, выявление носительства и сведения о врожденных дефектах у родственников – очень важны

Page 51: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Наша роль в проведении

генетических регистраций

Page 52: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

«Пока мы будем держать проблемы в «секрете» мы

не сможем их решить»

Page 53: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Необходимо информировать заводчиков

о проблемах, возникших в потомстве их собак

Page 54: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 55: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 56: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 57: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

ИНФОРМАЦИОННЫЙ ЦЕНТР ЗДОРОВЬЯ СОБАК (CHIC)

Животные могут получить сертификат CHIC на основании прохождения требуемых генетических тестов, НЕЗАВИСИМО от их результатов Чем больше появляется тестов на различные наследственные болезни, тем выше вероятность того, что у каждого животного будут обнаружены какие-то дефектные гены

Page 58: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Создан не для регистрации нормального здоровья

А для предупреждения о нездоровье

Page 59: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 60: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 61: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 62: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Генетические консультации и тактика в случаях

генетических болезней

Page 63: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

«Просто больше не

вяжите их

друг с другом»

Page 64: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

«Вяжите с неродственным

производителем – и тогда,

вероятно,

Вы больше не столкнетесь с

этой проблемой»

Page 65: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

«Кастрируйте своих собак и начните работу с другими»

Page 66: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Заводчики всегда спрашивают, что нужно

сделать, чтобы сохранить их линии

Page 67: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Цели разведения Основная цель: сохранить и улучшить качество породы

Второстепенная цель: контролировать появление генетических болезней

Не воспроизводить больных животных

Снижать частоту (носительство) дефектных генов

Page 68: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Контролирование рецессивных генов

С проведением тестов на носительство: Скрещивайте носителей с генетически нормальными животными

Заменяйте носителей их генетически нормальным потомством

Ведите селекцию против носителей

Page 69: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Без тестов на носительство:

Скрещивайте особей высокого риска с особями низкого риска

Заменяйте особей высокого риска их потомством, имеющим низкий риск

Повторите процесс в следующем поколении

Page 70: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

АНАЛИЗ ОТНОСИТЕЛЬНОГО / РЕКУРРЕНТНОГО РИСКА

Page 71: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Анализ относительного риска по родословной

Требует подтверждения рецессивного типа наследования

Нуждается в открытой регистрационной базе здоровья

Необходима открытость между заводчиками и владельцами в отношении диагностики

Page 72: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Надписи

Больной

Носитель

Неизвестно

?

1.0

.5

.5

.25

.25

.125

.125 .063

Риск заболевания = 0.78%

Риск носительства = 17.97%

1.0

Page 73: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Контролирование

доминантных генов

Заменяйте больного животного его здоровыми сибсами (животными из того же помета), родителем или ранее полученным потомством

Идеально было бы вообще не вязать животных с доминантных дефектным геном, чтобы не производить новых больных

Page 74: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Managing Dominant Genes

Больной

Нормальный

Page 75: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Контролирование

Х-сцепленных генов

Следуйте тем же рекомендациям «скрещивать и заменять», что и для аутосомных рецессивных генов, но учтите:

Использование здорового производителя всегда приводит к потере дефектного гена

Page 76: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Здоровый БольнойСамец Самка

Неонатальная гибельСамка облигатный носитель

Page 77: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Контролирование полигенных заболеваний

Дисплазия тазобедренного сустава

у собак

Page 78: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Полигенные заболевания характеризуются

пороговыми признаками

Животное оказывается больным только в том случае, если у него имеется ряд

дефектных генов и их совместное действие превышает пороговый эффект

Page 79: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

X

7x

3

3+1 4+2 5+1

= = =

4

X

6

X

6

2x

3

2+3 1+1 0+1

= = =

2 15

X

Пороговые признаки

Page 80: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 81: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Для полигенных заболеваний

Попытайтесь разбить

фенотип на отдельные

компоненты, которые могут

достаточно полно отражать

эффект отдельных генов

Page 82: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 83: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 84: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 85: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей
Page 86: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Диагностика дисплазии тазобедренного сустава у собак

Клинические признаки Пальпация с проведением анестезии или без нее Рентгенологическая картина Рентгенологическое определение растяжения/избыточной подвижности сустава

Page 87: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

X X X X X

?

Передача признака потомству

Page 88: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Каждый заводчик должен оценивать своих производителей и степень достигнутого

прогресса

Заменяйте носителей здоровым потомством

С каждым поколением снижайте частоту (риск) носительства

Page 89: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей

Программа здорового разведения

Не увеличивайте постоянно число носителей Разведение должно быть направлено на производство качественных, генетически нормальных животных

Page 90: Генетическое тестирование и консультации для практикующих ветеринарных врачей