文献管理软件（ Endnote ）和数据处理软件（ Origin ）的使用

化学信息学（曹郁教授）

文献管理软件（文献管理软件（ EndnoteEndnote ））和数据处理软件（和数据处理软件（ Origin Origin ））

的使用的使用


目的目的掌握文献管理软件（掌握文献管理软件（ EndnotEndnotee ）的使用）的使用

掌握数据处理软件（掌握数据处理软件（ Origin Origin ））的使用的使用


EndNoteEndNote – – 文献信息管理软文献信息管理软件件


网址： isiknowledge.com

Sirna or short interfer* RNA or small interfer* RNA

9762 条记录

排序工具：选择按被引次数排序


Export to Reference Software



1999 年 Hamilton AJ 首次 PTGS 植株中发现了长度为 25nt 的 RNA 中间产物

2000 年 Hammond SM RNA 干扰


1999 年 Hamilton AJ 首次 PTGS 植株中发现了长度为 25nt 的 RNA 中间产物


siRNA


在研究过程中，不断收集文献资料在研究过程中，不断收集文献资料

从数据库检索，筛选信息从数据库检索，筛选信息– 直接导入到直接导入到 EndNote (EndNote ( 以数据库以数据库 Web of KnowledWeb of Knowled

gege 为例）为例）– 从数据库下载纯文本数据导入从数据库下载纯文本数据导入 EndNoteEndNote

在图书馆浏览纸本期刊、书籍时，收集到的信在图书馆浏览纸本期刊、书籍时，收集到的信息息

– 手工操作导入手工操作导入 EndNoteEndNote

直接从直接从 EndNoteEndNote 连接数据库进行检索、下载相连接数据库进行检索、下载相关信息关信息

收集资料的方式


siRNA

Medline





从数据库检索，筛选信息从数据库检索，筛选信息– 直接导入到直接导入到 EndNote (EndNote ( 以数据库以数据库 Web of KnowledgeWeb of Knowledge 为为

例）例）– 从数据库下载纯文本数据导入从数据库下载纯文本数据导入 EndNoteEndNote

在图书馆浏览纸本期刊、书籍时，收集到的信息在图书馆浏览纸本期刊、书籍时，收集到的信息– 手工操作导入手工操作导入 EndNoteEndNote

直接从直接从 EndNoteEndNote 连接数据库进行检索、下载相关信息连接数据库进行检索、下载相关信息





从数据库检索，筛选信息从数据库检索，筛选信息– 直接导入到直接导入到 EndNote (EndNote ( 以数据库以数据库 Web of KnowledgeWeb of Knowledge 为例）为例）– 从数据库下载纯文本数据导入从数据库下载纯文本数据导入 EndNoteEndNote

支持支持 582582 种数据库的格式种数据库的格式可以根据需要自己定义格式可以根据需要自己定义格式

在图书馆浏览纸本期刊、书籍时，收集到的信息在图书馆浏览纸本期刊、书籍时，收集到的信息– 手工操作导入手工操作导入 EndNoteEndNote

直接从直接从 EndNoteEndNote 连接数据库进行检索、下载连接数据库进行检索、下载相关信息相关信息




EndNote——EndNote—— 个人的数据库个人的数据库将不同来源的资料将不同来源的资料以一致的形式以一致的形式储存储存资料可以进行编辑修改资料可以进行编辑修改

– 新增新增、、修改修改、、删除、随时检索删除、随时检索重复资料的管理重复资料的管理

–找出找出 LibraryLibrary 中中重复的资料重复的资料– 避免导入重复的资料避免导入重复的资料


Link to PDF

化学信息学（曹郁教授）ReferenceReference 栏位栏位

作者作者– 可可输输入多位作者入多位作者–每位作者必須每位作者必須单独单独一列一列

ImageImage–可插入可插入图图片或片或表格表格– Reference → Insert Picture (Reference → Insert Picture ( 或或 Insert Object) → Insert Object) → 找到找到档案档案 → → 开启开启– 输入完毕将鼠标输入完毕将鼠标移至移至 CaptionCaption 一一栏栏，，输入图片名称输入图片名称即可即可

URLURL– 可可输入文档路径或网址输入文档路径或网址– 鼠标移鼠标移到到 URLURL 一一栏后，鼠标变成手的图示，点选该栏后，鼠标变成手的图示，点选该 URLURL即可即可开启开启

预设浏览器连至该网站预设浏览器连至该网站；亦可利用工具列上方的；亦可利用工具列上方的 Open LinkOpen Link 进行连进行连接接

Link to PDFLink to PDF–请请利用打字或利用打字或粘贴粘贴的方式將的方式將 PDFPDF 文档的路径文档的路径打在打在该该列列– 输入输入格式：格式： file://C:\Documents\WordTips.pdffile://C:\Documents\WordTips.pdf


hamilton1999


Writing Writing 撰写文章撰写文章

配合配合 WordWord 或或 WordPerfectWordPerfect 等等文档处理软件文档处理软件写文章写文章在文章內文中插入在文章內文中插入参考文献参考文献



170 多种预制的期刊模板



Insert


Insert


随时更改参考文献格式

Browse

2300 多种参考文献格式可供选择


1

23

Remove Field Codes


数据处理与科学作图数据处理与科学作图 OriginOrigin


Origin Origin 软件操作基础软件操作基础


OriginOrigin 的工作界面的工作界面1. 1. 标题栏标题栏2. 2. 菜单栏菜单栏3. 3. 工具栏工具栏4. 4. 子窗口子窗口5. 5. 工程管理器（工程管理器（ Project ExplorerProject Explorer ）：）： The Project Explorer is a The Project Explorer is a tooltool to help to help

you organize your Origin projects you organize your Origin projects

6. 6. 状态栏状态栏


OriginOrigin 的工作界面（的工作界面（ WorkspaceWorkspace ））

工作表窗口

子窗口

工程管理器

图形窗口


扩展工具栏的开启方法扩展工具栏的开启方法 ::

select select ViewView: : ToolbarsToolbars from the menu bar.from the menu bar.


子窗口的种类主要有：子窗口的种类主要有：– The Worksheet WindowThe Worksheet Window

工作表窗口工作表窗口– The Excel Workbook Window The Excel Workbook Window

Excel Excel 工作表窗口工作表窗口– The Graph WindowThe Graph Window

图形窗口图形窗口 – The Function Graph Window The Function Graph Window

函数图形窗口函数图形窗口– The Layout Page WindowThe Layout Page Window

版面编排窗口版面编排窗口

注意注意 : : 每一子窗口都有自己的菜单系统，每一子窗口都有自己的菜单系统，只有当该种类的子窗口处在活动状态时，只有当该种类的子窗口处在活动状态时，相关的菜单和菜单项目才会出现。相关的菜单和菜单项目才会出现。


基本操作基本方法基本操作基本方法1. 1. 使用使用菜单菜单中的相应命令中的相应命令2. 2. 使用使用工具工具按钮按钮3. 3. 右击鼠标右击鼠标，在弹出的快捷菜单中，在弹出的快捷菜单中选相应命令选相应命令4. 4. 选定选定对象对象后双击，打开对话框后双击，打开对话框

说明：对象不同，右键菜单和对话框不同，有些对象并不说明：对象不同，右键菜单和对话框不同，有些对象并不是显性的，如整个图形窗口是一种对象。是显性的，如整个图形窗口是一种对象。


OriginOrigin 文件的保存文件的保存Save a project Save a project

保存工程保存工程

Save a child window separately as a fileSave a child window separately as a file

单独将子窗口作为一个文件保存单独将子窗口作为一个文件保存

Save a template as a file Save a template as a file

保存为模板文件保存为模板文件


文件类型及文件扩展名（文件类型及文件扩展名（ file extensionfile extension ））

Project —— OPJProject —— OPJ– It cannot save as template GraphIt cannot save as template Graph

Worksheet —— OGWWorksheet —— OGW– Template extension is OTWTemplate extension is OTW

Excel Workbook —— XLSExcel Workbook —— XLS– It cannot save as templateIt cannot save as template

Layout Page —— OTP Layout Page —— OTP – It cannot save as fileIt cannot save as file

Matrix —— OGMMatrix —— OGM– Template extension is OTMTemplate extension is OTM

Function Graph —— OGGFunction Graph —— OGG– Template extension is OTPTemplate extension is OTP

Notes —— TXTNotes —— TXT– It cannot save as templateIt cannot save as template


OriginOrigin 数据表格与数据处数据表格与数据处理理


数据文件的建立方法数据文件的建立方法1. Entering data using the 1. Entering data using the keyboardkeyboard. . 键盘输入键盘输入

2. 2. Importing a fileImporting a file. . 导入文件导入文件

3. 3. PastingPasting data from another application using the Clipboard. data from another application using the Clipboard.

4. 4. PastingPasting data from another (or the same) Origin worksheet data from another (or the same) Origin worksheet

using the Clipboard. using the Clipboard. （（ 33 ）和（）和（ 44 ））是粘贴数据是粘贴数据

5. 5. Using Excel Workbook Window. Using Excel Workbook Window. ExcelExcel 工作表工作表

6. 6. Using a functionUsing a function to set column values. to set column values. 用函数设置用函数设置


工作表简介工作表简介工作表由垂直的列和水平的行组成工作表由垂直的列和水平的行组成列与行的交叉处称为单元格列与行的交叉处称为单元格每个单元格内可包含数、文本、日期、时每个单元格内可包含数、文本、日期、时间等间等一个一个 OriginOrigin 项目中可以包含多个工作表项目中可以包含多个工作表


数据的编辑修改数据的编辑修改数据的修改数据的修改– 替换单元格中的数据，点击该单元格，输入新的值替换单元格中的数据，点击该单元格，输入新的值– 修改单元格中的数据，点击该单元格后，在拟修改的位置单击鼠修改单元格中的数据，点击该单元格后，在拟修改的位置单击鼠

标或按标或按 F2F2

在列中插入数据在列中插入数据– 选定拟插入新单元格下方的单元格选定拟插入新单元格下方的单元格– 执行编辑菜单中的插入命令执行编辑菜单中的插入命令 ((Edit: InsertEdit: Insert))– 新单元格将插在所选定单元格的上方新单元格将插在所选定单元格的上方

删除数据删除数据– 删除整个工作表中的内容删除整个工作表中的内容 Edit: Clear WorksheetEdit: Clear Worksheet– 删除单元格或单元格区域中的内容，格子保留删除单元格或单元格区域中的内容，格子保留 Edit: ClearEdit: Clear– 内容和单元格同时删除内容和单元格同时删除 Edit: DeleteEdit: Delete


列的插入、删除和重排列的插入、删除和重排增加列增加列– Column: Add New Columns. Column: Add New Columns. – Add New Columns button Add New Columns button – Right-click , Select Add New Column Right-click , Select Add New Column

插入列插入列– Edit: InsertEdit: Insert– Right-click → select Insert Right-click → select Insert

删除列删除列– Edit: DeleteEdit: Delete– Right-click → select DeleteRight-click → select Delete– Edit: Clear (Edit: Clear ( 保留列保留列 ))

移动列移动列– Column: Move to First. Column: Move to First. – Column: Move to Last.Column: Move to Last.


行的插入和删除行的插入和删除插入行插入行– select Edit: Insert select Edit: Insert – right-click and select Insert right-click and select Insert

删除行删除行– Edit: Delete Edit: Delete – right-click and select Delete. right-click and select Delete.


删除工作表删除工作表点击工作表右上方的关闭窗口按扭点击工作表右上方的关闭窗口按扭在工程管理器中右击工作表图标，在快捷菜单在工程管理器中右击工作表图标，在快捷菜单中选中选 Delete WindowDelete Window

在工程管理器中点击工作表图标，按在工程管理器中点击工作表图标，按 Delete Delete 键键 Delete Delete 与与 Hide Hide 的区别的区别


数据表的格式化数据表的格式化方法：双击工作表的列标签方法：双击工作表的列标签作用：作用：– 1. 1. 改变列的名称（改变列的名称（ Column NameColumn Name ））– 2. 2. 改变列的标识（改变列的标识（ Plot DesignationPlot Designation ））– 3. 3. 改变数据的类型（改变数据的类型（ DisplayDisplay ））– 4. 4. 改变数的格式（改变数的格式（ FormatFormat ））– 5. 5. 改变数的显示格式（改变数的显示格式（ Numeric DisplayNumeric Display ））– 6. 6. 改变列宽（改变列宽（ Column WidthColumn Width ））– 7. 7. 为列标签添加说明（为列标签添加说明（ Column LabelColumn Label ））


改变数的显示格式改变数的格式

十进制格式科学记数格式工程记数格式有千位分隔符的十进制格式

默认的十进制显示数据设置小数点的位置设置有效数字的位数


数据填充和运算数据填充和运算数据填充数据填充– 填充行序号填充行序号 Column: Fill Column With: NumbColumn: Fill Column With: Numb

ersers– 随机数随机数 Uniform Random NumbersUniform Random Numbers– 正态随机数正态随机数 Normal Random NumbersNormal Random Numbers

数据运算数据运算– Column: Set Column ValuesColumn: Set Column Values


其它操作其它操作数据的排序数据的排序– Analysis: Sort RangeAnalysis: Sort Range– Sort ColumnsSort Columns– Sort WorksheetSort Worksheet

数据点的操作数据点的操作– Set As BeginSet As Begin– Set As EndSet As End– Mask Mask

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文献管理软件（ Endnote ） 和数据处理软件（ Origin ） 的使用

文献管理软件（ Endnote ）和数据处理软件（ Origin ）的使用