Upload
others
View
3
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
การศกษาความสมพนธทางพนธกรรมของพรรณไมสกลเสยว (Bauhinia)โดยใชขอมล trnL-F:
กรณศกษาชนดทพบในไทยบางชนด
นางสาวสนนาท ทาซายสาขาวทยาศาสตรชวภาพปาไม ภาควชาชววทยาปาไม
คณะวนศาสตร มหาวทยาลยเกษตรศาสตรอาจารยทปรกษา อ.ดร. สธร ดวงใจ
หวขอการนาเสนอ
บทนาวตถประส
งคอปกรณและวธการ
วตถประสงคอปกรณและ
วธการผลและวจารณสรปผล
ขอเสนอแนะ
บทนาพรรณไมสกลเสยว(Bauhinia)
วงศ:Leguminosaeวงศยอย:Caesalpinioideaeเผา: Cercideaeเผายอย:Bauhiniinaeวสย: ไมตน ไมพม ไมเถา ไมเลอยใบ: ใบเดยวเรยบ/แยกเปนสองแฉกดอก: ดอกเดยว/ชอกระจะ-แยกแขนงผล: แบน ไมมปกประโยชน: ไมประดบ,ยา
วงศ:Leguminosaeวงศยอย:Caesalpinioideaeเผา: Cercideaeเผายอย:Bauhiniinaeวสย: ไมตน ไมพม ไมเถา ไมเลอยใบ: ใบเดยวเรยบ/แยกเปนสองแฉกดอก: ดอกเดยว/ชอกระจะ-แยกแขนงผล: แบน ไมมปกประโยชน: ไมประดบ,ยา
บทนา (ตอ)พรรณไมสกลเสยว(Bauhinia) ทพบในไทยกาหลง (Bauhiniaacuminata)ใบสทอง (Bauhiniaaureifolia)เครอเขาหนง (Bauhiniabassacensis)
ยานตนควาย (Bauhiniaferruginea)Bauhinia glabrifoliaชงโค (Bauhinia glauca)ชงโคขไก (Bauhiniahamsiana)*เสยวนอย (Bauhiniahirsuta)
เสยวปา (Bauhiniasaccocalyx)เสยวพระวหาร (Bauhiniasaigonensis)กระไดลง (Bauhiniascandens)
Bauhinia tubicalyxเสยวดอกขาว (Bauhiniavariegata)เสยวฟอม (Bauhiniaviridescens)ชงโคภคา (Bauhiniawallichii)อรพม (Bauhinia winitii)เสยวแพะ (Bauhiniayunnanensis)
เถาไฟ (Bauhiniaintegrifolia)*แสลงพน (Bauhiniainvolucellata)สมเสยวเถา (Bauhinialakhonensis)*
แสลงพนเถา (Bauhiniapulla)ชงโค (Bauhiniapurpurea)ชงโคนา (Bauhiniaracemosa)Bauhinia ridleyi
43 ชนด (ไมมขอมลในGenbank 23 ชนด)
43 ชนด (ไมมขอมลในGenbank 23 ชนด)
เครอเขาหนง (Bauhiniabassacensis)ชงโคปาดอกแดง (Bauhiniabidentata)แสลงพน (Bauhinia binata)เสยวเชยงดาว (Bauhiniabrachycarpa)ปอเจยน (Bauhiniabracteata)ยานชงโค (Bauhiniaconcreta)เครอเขาแกบ (Bauhiniacurtisii)ยานตนควาย (Bauhiniaferruginea)Bauhinia glabrifoliaชงโค (Bauhinia glauca)ชงโคขไก (Bauhiniahamsiana)*เสยวนอย (Bauhiniahirsuta)
กระไดลง (Bauhiniascandens)สรอยสยาม (Bauhiniasiamensis)แสลงพนกระดก (Bauhiniasimillis)สรนธรวลล (Bauhiniasirindhorniae)*ขยน (Bauhiniastrychnifolia)โชคนย (Bauhiniastrychnoidea)ชงโคดอกเหลอง (Bauhiniatomentosa)Bauhinia tubicalyxเสยวดอกขาว (Bauhiniavariegata)เสยวฟอม (Bauhiniaviridescens)ชงโคภคา (Bauhiniawallichii)อรพม (Bauhinia winitii)เสยวแพะ (Bauhiniayunnanensis)
สมเสยวเถา (Bauhinialakhonensis)*เสยวใหญ (Bauhiniamalabarica)โยทะกา (Bauhiniamonandra)เสยวแกว (Bauhinianervosa)โคคลาน (Bauhinia ornata)เสยวแดง (Bauhiniapenicilliloba)ชงโคดา (Bauhinia pottsii)
แสลงพนเถา (Bauhiniapulla)ชงโค (Bauhiniapurpurea)ชงโคนา (Bauhiniaracemosa)Bauhinia ridleyi
บทนา (ตอ)ระบบการจดจาแนกพรรณไมสกลเสยว
BreniereaBrenierea
BarklyaBarklya BarklyaBarklya
BauhiniaBauhinia BauhiniaBauhinia
GigasiphonGigasiphon GigasiphonGigasiphon
LysiphyllumLysiphyllum LysiphyllumLysiphyllum
Wunderlin et al.(1987)Wunderlin et al.(1987)
Wunderlin(2010)Wunderlin(2010)
Lewis et al.(2013)Lewis et al.(2013)
BauhiniinaeBauhiniinae
BreniereaBrenierea
BauhiniaBauhinia
LysiphyllumLysiphyllum LysiphyllumLysiphyllum
PhaneraPhanera
PhaneraPhanera
LasiobemaLasiobema
PiliostigmaPiliostigma PiliostigmaPiliostigma
TylosemaTylosema TylosemaTylosema
SchnellaSchnella SchnellaSchnella
บทนา (ตอ)ระบบการจดจาแนกพรรณไมสกลเสยวและสกลใกลเคยงWunderlin et al.
(1987)Lewis and Forest
(2005)Wunderlin (2010) Lewis et al.
(2013)Subtribe:Cercideae
genus 1.Adenolobus
2. Cercis3.
GriffoniaSubtribe:Bauhiniinae
genus 1.Brenierea
2.Bauhinia
genus 1.Adenolobus
2. Barklya3. Bauhinia4.
Brenierea5. Cercis6.
Gigasiphon7. Griffonia8.
Lasiobema9.
Lysiphyllum10.
Phanera11.
Piliostigma12.
Tylosema
Subtribe:Cercideae
genus 1.Adenolobus
2. Cercis3.
GriffoniaSubtribe:Bauhiniinae
genus 1.Barklya
2.Bauhinia
3.Brenierea
4.Gigasiphon
5.Lysiphyllum
6.Phanera
7.Piliostigma
8.Schnella
9.Tylosema
genus 1.Adenolobus
2.Barklya
3.Bauhinia
4.Brenierea
5. Cercis6.
Gigasiphon7.
Griffonia8.
Lasiobema9.
Lysiphyllum10.
Phanera11.
Piliostigma12.
Schnella13.
Tylosema
Subtribe:Cercideae
genus 1.Adenolobus
2. Cercis3.
GriffoniaSubtribe:Bauhiniinae
genus 1.Brenierea
2.Bauhinia
genus 1.Adenolobus
2. Barklya3. Bauhinia4.
Brenierea5. Cercis6.
Gigasiphon7. Griffonia8.
Lasiobema9.
Lysiphyllum10.
Phanera11.
Piliostigma12.
Tylosema
Subtribe:Cercideae
genus 1.Adenolobus
2. Cercis3.
GriffoniaSubtribe:Bauhiniinae
genus 1.Barklya
2.Bauhinia
3.Brenierea
4.Gigasiphon
5.Lysiphyllum
6.Phanera
7.Piliostigma
8.Schnella
9.Tylosema
genus 1.Adenolobus
2.Barklya
3.Bauhinia
4.Brenierea
5. Cercis6.
Gigasiphon7.
Griffonia8.
Lasiobema9.
Lysiphyllum10.
Phanera11.
Piliostigma12.
Schnella13.
Tylosema
บทนา (ตอ)
monophyletic(monophyly)monophyletic(monophyly)paraphyletic(paraphyly)paraphyletic(paraphyly)
ขอขดแยง
การววฒนาการจากกลมบรรพบรษไปเปนกลมสกลตางๆ แบงออกเปนกลมๆ อยางเปนระเบยบ ไมมสกลลกหลานปะปนสลบกนไปมา
การววฒนาการจากกลมบรรพบรษไปเปนกลมสกลตางๆ แบงออกเปนกลมๆ อยางเปนระเบยบ ไมมสกลลกหลานปะปนสลบกนไปมาการววฒนาการจากกลมบรรพบรษไปเปนกลมสกลตางๆ ในขณะเดยวกนกมการแบงกลมออกไปอกกลมจากบรรพบรษกลมทแยกออกกยงปรากฏสกลเดยวกนกบกลมแรกมาคนกลาง
การววฒนาการจากกลมบรรพบรษไปเปนกลมสกลตางๆ ในขณะเดยวกนกมการแบงกลมออกไปอกกลมจากบรรพบรษกลมทแยกออกกยงปรากฏสกลเดยวกนกบกลมแรกมาคนกลาง
polyphyletic(paraphyly)polyphyletic(paraphyly)
ABC
การววฒนาการจากกลมบรรพบรษไปเปนกลมสกลตางๆ ในขณะเดยวกนกมการแบงกลมออกไปอกกลมจากบรรพบรษกลมทแยกออกกยงปรากฏสกลเดยวกนกบกลมแรกมาคนกลาง
การววฒนาการจากกลมบรรพบรษไปเปนกลมสกลตางๆ ในขณะเดยวกนกมการแบงกลมออกไปอกกลมจากบรรพบรษกลมทแยกออกกยงปรากฏสกลเดยวกนกบกลมแรกมาคนกลาง
polyphyletic(paraphyly)polyphyletic(paraphyly)C
A B C
รวมเปนกลมเดยว?
แยกออก?
บทนา (ตอ)ยนtrnL-FยนtrnL-F
ยนmatK
บทนา (ตอ)
Monophyleticgroup?Monophyleticgroup?paraphyleticgroup?paraphyleticgroup?polyphyleticgroup?polyphyleticgroup?
แผนภมตนไมแสดงความสมพนธของพรรณไมสกลเสยว(Bauhinia)
polyphyleticgroup?polyphyleticgroup?
วตถประสงค
1. เพอศกษาความสมพนธทางพนธกรรมของพรรณไมสกลเสยว (Bauhinia) โดยใชขอมลtrnL-F2. เพอประเมนระบบการจดจาแนกของพรรณไมสกลเสยว (Bauhinia) และสกลใกลเคยง โดยใชขอมลความสมพนธทางพนธกรรม
1. เพอศกษาความสมพนธทางพนธกรรมของพรรณไมสกลเสยว (Bauhinia) โดยใชขอมลtrnL-F
อปกรณและวธการ1. สกดดเอนเอ
2. ตรวจสอบปรมาณและ
คณภาพ3. เพมปรมาณดเอนเอสวน trnL-F โดย PCR
2
1
3. เพมปรมาณดเอนเอสวน trnL-F โดย PCR4. สงไป
Sequence5. หาความสมพนธ
แบบ Maximumparsimony
(PAUP)6. ประเมนระบบการจดจาแนก
A,T,C,G
4 5C F
trnL 5’ exon trnF exontrnL 3’ exontrnL intron trnL-F spacer
3
ผลและวจารณผลการสกดดเอนเอและ
การตรวจสอบคณภาพดเอนเอของตวอยางพรรณไมสกลเสยว (Bauhinia)
ผลและวจารณ
(ตอ)การเพมปรมาณดเอนเอ (PCR)ในสวนของยนtrnL-F ของตวอยางพรรณไมสกลเสยว(Bauhinia)
แผนภมตนไมแสดงความสมพนธของพรรณไมสกลเสยว (Bauhinia)จากขอมลลาดบนวคลโอไทดในสวนยน trnL-F
ผลและวจารณ
(ตอ)สกลGriffoniaมขวเมลดรปวงกลม
สกลGriffoniaมขวเมลดรปวงกลม
A
Bแผนภมตนไมแสดงความสมพนธของพรรณไมสกลเสยว (Bauhinia)จากขอมลลาดบนวคลโอไทดในสวนยน trnL-F C
ผลและวจารณ
(ตอ)TylosemaLysiphyllumLysiphyllumPhaneraPhaneraLasiobemaLasiobema
B
LasiobemaLasiobema
SchnellaBarklya
Gigasiphonชงโคขไก (B. hamsiana) สรนธรวลล
(B. sirindhorniae )ชงโคขไก (B. hamsiana) สรนธรวลล(B. sirindhorniae )
ผลและวจารณ
(ตอ)
ไมเลอย
สรอยสยาม (Bauhiniasiamensis)สรอยสยาม (Bauhiniasiamensis)
กลมBกลมB
ไมเลอยใบสทอง (Bauhiniaaureifolia)ใบสทอง (Bauhiniaaureifolia)Lasiobema (ปอเจยน Bauhinia bracteata ชงโค B. glaucaชงโคขไก B. hamsiana สมเสยวเถา B. lakhonensis กระไดลงB. scandens)Phanera (ใบสทอง Bauhinia aureifolia เถาไฟ B. integrifoliaแสลงพนเถา B. pulla สรนธรวลล B. sirindhorniae ขยน B.strychnifolia เสยวแพะ B. yunnanensis) เกศรเพศผม 3Lysiphyllum (แสลงพน Bauhinia binata อรพม B. winitii) เกศรเพศผม 10
ผลและวจารณ
(ตอ)PiliostigmaPiliostigmaBrenierea
C
Brenierea Bauhini
aBauhinia
Brenierea
ไมยนตน
ผลและวจารณ
(ตอ)โยทะกา (Bauhiniamonandra)โยทะกา (Bauhiniamonandra)
กลมCกลมC
ชงโค (B.purpurea)ชงโค (B.purpurea)ไมยน
ตน
ชงโค (B.purpurea)ชงโค (B.purpurea)
Bauhinia (โยทะกา Bauhinia monandra ชงโคดา B. pottsii ชงโคB. purpurea ชงโคนา B. racemosa เสยวปา B. saccocalyx เสยวพระวหาร B. saigonensis ชงโคดอกเหลอง B. tomentosa เสยวดอกขาว B. variegata เสยวฟอม B. viridescens) กลบเลยงแยกออกคลายกาบPiliostigma (เสยวใหญ Bauhinia malabarica) กลบเลยงเชอมตดกน
เสยวใหญ (B.malabarica)เสยวใหญ (B.malabarica)
ผลและวจารณ
(ตอ)
BreniereaBrenierea
BarklyaBarklya BarklyaBarklya
BauhiniaBauhinia BauhiniaBauhinia
GigasiphonGigasiphon GigasiphonGigasiphon
Wunderlin et al.(1987)Wunderlin et al.(1987)
Wunderlin(2010)Wunderlin(2010)
Lewis et al.(2013)Lewis et al.(2013)
A
B
ระบบการจดจาแนกทสอดคลอง
ระบบการจดจาแนกทสอดคลอง
BreniereaBrenierea
BauhiniaBauhinia
LysiphyllumLysiphyllum LysiphyllumLysiphyllum
PhaneraPhanera
PhaneraPhanera
LasiobemaLasiobema
TylosemaTylosema TylosemaTylosema
SchnellaSchnella SchnellaSchnella
C
สรปผล1. แผนภมตนไมแยกพรรณไมสกลเสยวออกเปน 3
เคลด โดยเคลด A ม 1 สกล คอ สกล Griffoniaสวนเคลด B ม 7 สกล ไดแก สกล GigasiphonBarklya Schnella Lasiobema Phanera Lysiphyllumและ Tylosema และเคลด C ม 3 สกล ไดแก สกลPiliostigma Brenierea และ Bauhinia s.s.
2. พรรณไมสกลเสยว (Bauhinia) ในไทยอยในเคลด B และ C โดยในเคลด B พบอยใน 3 สกลไดแก Lasiobema Phanera และ Lysiphyllum สวนในเคลด C พบอยใน 2 สกล ไดแก Bauhinia และPiliostigma
3. ระบบการจดจาแนกพรรณไมสกลเสยว(Bauhinia) สอดคลองกบระบบของ Wunderlin (2010)และระบบของ Lewis et al. (2013)
1. แผนภมตนไมแยกพรรณไมสกลเสยวออกเปน 3เคลด โดยเคลด A ม 1 สกล คอ สกล Griffoniaสวนเคลด B ม 7 สกล ไดแก สกล GigasiphonBarklya Schnella Lasiobema Phanera Lysiphyllumและ Tylosema และเคลด C ม 3 สกล ไดแก สกลPiliostigma Brenierea และ Bauhinia s.s.
2. พรรณไมสกลเสยว (Bauhinia) ในไทยอยในเคลด B และ C โดยในเคลด B พบอยใน 3 สกลไดแก Lasiobema Phanera และ Lysiphyllum สวนในเคลด C พบอยใน 2 สกล ไดแก Bauhinia และPiliostigma
3. ระบบการจดจาแนกพรรณไมสกลเสยว(Bauhinia) สอดคลองกบระบบของ Wunderlin (2010)และระบบของ Lewis et al. (2013)
ขอเสนอแนะ
ในการศกษาครงนพบวาพรรณไมสกลเสยว(Bauhinia) บางสกลยงมขอมลลาดบนวคลโอไทดไมเพยงพอตอการวเคราะหขอมลเพอทาการยายสกล ในการศกษาครงหนาจงควรเพมจานวนตวอยางในแตละสกล
ในการศกษาครงนพบวาพรรณไมสกลเสยว(Bauhinia) บางสกลยงมขอมลลาดบนวคลโอไทดไมเพยงพอตอการวเคราะหขอมลเพอทาการยายสกล ในการศกษาครงหนาจงควรเพมจานวนตวอยางในแตละสกล
ขอขอบพระคณ
• อ.ดร. สธร ดวงใจ• พสลนลา บญเทยม• เพอน
ภสรา เตมวฒปรชาเพญพชชา ชสงา
จงด เจรญรปวรญญา ตนด
สทธกานต ศรสดสข• ครอบครว• ผรวมสมมนา
• อ.ดร. สธร ดวงใจ• พสลนลา บญเทยม• เพอน
ภสรา เตมวฒปรชาเพญพชชา ชสงา
จงด เจรญรปวรญญา ตนด
สทธกานต ศรสดสข• ครอบครว• ผรวมสมมนา
• อ.ดร. สธร ดวงใจ• พสลนลา บญเทยม• เพอน
ภสรา เตมวฒปรชาเพญพชชา ชสงา
จงด เจรญรปวรญญา ตนด
สทธกานต ศรสดสข• ครอบครว• ผรวมสมมนา
• อ.ดร. สธร ดวงใจ• พสลนลา บญเทยม• เพอน
ภสรา เตมวฒปรชาเพญพชชา ชสงา
จงด เจรญรปวรญญา ตนด
สทธกานต ศรสดสข• ครอบครว• ผรวมสมมนา
ขอบคณขอบคณคะคะ
ขอบคณขอบคณคะคะ