Antibiotiques, antibiorésistance et environnement des ... ?· relation avec les résistances aux antibiotiques…

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  • Ordre du jour de la sance penta-acadmique 2016.06.15 VF3

    Antibiotiques, antibiorsistance et environnement : des raisons desprer !

    Sance thmatique penta-acadmique

    Avec la participation

    de lAcadmie dAgriculture de France,

    de lAcadmie Nationale de Chirurgie Dentaire

    de lAcadmie nationale de mdecine

    de lAcadmie nationale de Pharmacie

    de lAcadmie Vtrinaire de France

    Sous le Haut-Patronage de Madame la Ministre de lEnvironnement, de lnergie et de la Mer, Sgolne ROYAL

    Sous le Haut-Patronage de Madame la Ministre des Affaires Sociales et de la Sant, Marisol TOURAINE

    Sous le Haut-Patronage de Monsieur le Ministre de l'agriculture, de l'agroalimentaire et de la fort, Stphane LE FOLL

    Sous le Haut-Patronage de Monsieur le Secrtaire dtat pour lEnseignement et la Recherche, Thierry MANDON

    Mercredi 15 juin 2016 9h00

    Institut Curie, Paris 12 rue Lhomond 75005

    RER B (arrt Luxembourg)

    Mtro ligne 10 (Cardinal Lemoine) ; ligne 7 (Place Monge)

    Autobus lignes 21, 27(Saint-Jacques-Gay-Lussac), 84, 89 (Mairie du 5e-Panthon)

    Parking Rue Soufflot

  • Ordre du jour de la sance penta-acadmique 2016.06.15 VF3

    PROGRAMME

    Matine

    - Accueil partir de 8h30

    - 9h00-9h15 : Discours introductif de Claude MONNERET au nom des cinq Acadmies

    - 9h15-9h30 : Ouverture par Christian BRUN-BUISSON, Dlgu interministriel lAntibiorsistance

    1RE SESSION

    ANTIBIORSISTANCE ET ENVIRONNEMENT

    Modrateurs : Pierre BGU (Anm) et Arlette LAVAL (AAF)

    - 9h30-9h50 : Fabienne PETIT Vulnrabilit des environnements aquatiques la contamination par des bactries

    antibiorsistantes

    La contamination des eaux par les antibiotiques et les bactries antibiorsistantes est une problmatique

    dcologie et de sant publique. Un des enjeux majeurs des prochaines dcennies sera dvaluer la

    vulnrabilit microbiologique mais aussi la capacit de rsilience des eaux la contamination des

    germes fcaux qui, dans les pays industrialiss saccompagne dune contamination par des molcules

    mdicamenteuses, commencer par les antibiotiques, prescrites en mdecine humaine ou vtrinaire.

    Dans ce contexte, il est important dtudier finement la relation entre la prescription en antibiotiques,

    loccurrence de bactries antibiorsistantes (Escherichia coli, Enterococcus) et de molcules

    antibiotiques dans leau, lchelle dun continuum entre un site trs contamin, savoir un centre

    hospitalier station de traitement des eaux uses rivire. Dans une tude rcente, les rsultats

    montrent que dans leau les antibiotiques les plus persistants sont prsents, et quil nexiste pas de

    relation avec les rsistances aux antibiotiques des souches isoles dans ce mme environnement. Alors

    que les pnicillines sont majoritairement prescrites, seuls les antibiotiques les plus stables sont dtects

    (fluoroquinolones, sulfamides, macrolides), mais leurs concentrations restent trop faibles, de lordre du

    ng/L pour exercer une pression de slection sur les microorganismes. Le long du continuum, le nombre

    de souches hospitalires porteuses de supports gntiques impliqus dans lantibiorsistance (intgrons

    de classe 1 chez E. coli, gne erm(B) et complexe clonal CC17 chez E. faecium) dcroit le long du

    continuum au profit de souches mieux adaptes lenvironnement. Les estuaires constituent un milieu

    particulier, dont les sdiments sont exposs de faon chronique de multiples contaminants chimiques,

    dont les antibiotiques, auxquels sajoutent des apports en bactries rsistantes. Ce sont, de ce fait, des

    environnements vulnrables, dautant plus quils sont proches des sources de contamination (STEP,

    rejet hospitalier, rejet industriel ou pisciculture). Lenrichissement du rsistome bactrien des sdiments

    en gnes de rsistance dans un environnement o des concentrations subinhibitrices en antibiotiques

    pourraient tre atteintes rend ce compartiment propice la dissmination de gnes de rsistance au sein

    des communauts microbiennes.

    - 9h50-10h10 : Christophe DAGOT valuation dactivits anthropiques sur la dissmination de lantibiorsistance dans

    lenvironnement UMR Inserm 1092, Universit de Limoges, 87000 Limoges

    Lantibiothrapie a permis de faire grandement reculer la mortalit lie aux maladies infectieuses

    bactriennes et contribuer la prservation de la sant. La face ngative de ce progrs sanitaire est

    lapparition croissante de bactries rsistances et multirsistantes du fait dune utilisation massive et

    rpte de ces molcules. Les consquences de cette (multi) rsistance sont considres comme

    dramatiques aussi bien dun point de vue mdical (baisse de lefficacit de lantibiothrapie,

    augmentation de la mortalit), quconomique (cout des soins et de la recherche) et social (ingalit

    nord/sud). Lanalyse globale des flux de mdicaments, dont les antibiotiques et des rsistances

    susceptibles dy tre lis, de leur production jusquau rejet dans les matrices environnementales,

    montrent la complexit actuelle du systme de dissmination lie lactivit humaine : production

    industrielle, centre de soins, activit vtrinaire, levage, ). Cela soulve de nombreuses questions

  • Ordre du jour de la sance penta-acadmique 2016.06.15 VF3

    mthodologiques pour arriver une analyse systmique de cette problmatique dont lissue doit tre une

    capacit dfinir une analyse des risques rigoureuse aboutissant la mise en place de mesures

    (multiples) de prservation de la qualit des soins et de la sant.

    Ainsi la lutte contre lantibiorsistance se dcloisonne pour apprhender le problme et les solutions

    dans leur globalit, associant diffrentes spcialits : mdicales, hospitalires, environnementales,

    biologie molculaire et bioinformatiques, procds, spcialistes du risques, mais aussi sociologues,

    parties prenantes, dcideurs. De nouveaux outils ont t dvelopps issus des avancs et des baisses des

    cots en biologie molculaire permettant une exploitation (trs) fine des bactries, des gnes, de leur

    expressions, de leur transfert.

    Le modle intgrons fait partie de ces nouveaux outils, prsentant lavantage dtre, dans une premire

    analyse, une sorte dindicateur de rsistance et de tracer de manire quantitative une dissmination

    globale de rsistance dans le tissus urbains et les matrices environnementales. Ainsi le suivi des

    intgrons de rsistance de classe 1, 2 et 3 (IMR) a t men sur le site Pilote de SIPIBEL, sur diffrents

    tablissements de soin lchelle europenne, sur des technologies de traitement avanc, sur le milieu

    naturel, dans des sols.

    Les rsultats, prsents, ont montr une concentration leve et la diversit des micro-organismes dans

    des chantillons des effluents hospitalier, avec une prvalence leve dIMR et une omniprsence de

    ces lments avec une prvalence leve dans les eaux uses.

    La standardisation des mthodes dvaluation, limportance des bilans quantitatifs et qualitatifs, la

    comprhension des mcanismes dexpression et de transmission des gnes dans les systmes

    anthropiss, lexploitation des rsultats en terme dvaluation des risques, limportance du quadrillage

    du territoire, voire des pays, en site pilote afin de rcolter des donnes en terme dobservatoire, sont

    autant de pistes indispensables la connaissance et la matrise de mcanismes de rsistances. 10h10-

    10h10 - 10h20 : Questions sur les deux exposs

    Pause-caf : 25 mn

    2ME SESSION

    ANTIBIOTIQUES ET RSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES DANS LES EFFLUENTS DLEVAGES

    Modrateurs : Pierre BGU (Anm) et Arlette LAVAL (AAF)

    - 10h55-11h15 : Isabelle KEMPF, ANSES (Agence Nationale de Scurit Sanitaire de lalimentation, de lenvironnement et de la sant au travail) - Laboratoire de Ploufragan

    Prsence des bactries rsistantes et gnes de rsistance dans les effluents dlevage

    Les animaux peuvent tre porteurs de bactries pathognes, zoonotiques (Salmonella,

    Campylobacter) ou commensales (Escherichia coli, Enterococcus) rsistantes aux antibiotiques.

    Le microbiote intestinal joue vraisemblablement un rle majeur dans la dissmination de

    lantibiorsistance de lanimal vers lenvironnement. En effet, les matires fcales contiennent les

    bactries rsistantes, les gnes de rsistance et leurs supports gntiques (plasmides par exemple) ainsi

    que parfois des antibiotiques ou leur rsidus. Ces matires fcales peuvent tre pandues dans

    lenvironnement soit directement (pturages, pandages sans stockage) ou aprs stockage, compostage

    ou autres traitements des fumiers et lisiers. Au cours de lexpos, nous dcrirons la slection, la

    diffusion et la persistance des bactries rsistantes dans la flore intestinale des animaux de rente, ainsi

    que la prvalence en France ou en Europe des rsistances les plus proccupantes pour la sant publique

    ou vtrinaire. Quelques donnes prliminaires concernant lutilisation des antibiotiques en pisciculture

    et lantibiorsistance dans lenvironnement aquatique en France seront galement prsentes. La

    rduction de lutilisation des antibiotiques chez lanimal couple des mthodes adaptes de traitement

    des effluents dlevage doivent permettre de rduire la diffusion de lantibiorsistance vers

    lenvironnement.

  • Ordre du jour de la sance penta-acadmique 2016.06.15 VF3

    - 11h15-11h35 : Dominique PATUREAU, Directeur de recherche, Laboratoire de Biotechnologie de lenvironnement, INRA LBE

    Prsence des antibiotiques dans les effluents dlevage et leur devenir au cours du

    compostage et de la mthanisation

    Les effluents dlevage son