Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programının Amacı ve Hedefi ...fbe.yeditepe.edu.tr/files/Bologna Paketi Yeni/Biyoteknoloji/BTEC... · dermal ve oküler dozaj ekilleri, farmakokinetik

Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programının Amacı ve Hedefi

Biyoteknoloji Yüksek Lisans programı Eylül 2007 tarihinde Yeditepe Ünivesitesi, Fen ve

Edabiyat Fakültesi bünyesinde kurulmuştur.

Biyoteknoloji programının amacı AR-GE ve eğitim faaliyetleri ile sağlık, tarım, gıda ve çevre

konusundaki sorunlarına çözüm üretebilecek bireyler yetiştirmek ve ülkemize bu alanda

yetişmiş işgücü sağlamaktır.

Biyoteknoloji programının hedefi eğitim ve araştırma alanında ulusal ve uluslar arası

Üniversite, Teknopark ve AR-Ge Enstitüleri ile işbirliği içerisinde çalışarak üniversite –sanayi

projeleri ile ülkemizin geleceğe yönelik bilim ve ekonomi alanında milli politikalarının

oluşturulmasına önemli katkılar sağlamaktır.

Yüksek Lisans Programına Kabul Koşulları:

Yüksek lisans programına başvurabilmek için adayların lisans derecesine sahip olmaları ya

da başvuru döneminin sonuna kadar lisans derecelerini almaları gerekmektedir. Aşağıdaki

başvuru koşullarını sağlayan adaylar programa başlayabilecektir.

- Lisans genel not ortalaması en az 2.00/4.00 olmalıdır.

- ALES skoru en az 55 ya da GRE (Quantitative Reasoning) skoru en az 148 olmalıdır.

- YDS skoru en az 55 ya da TOEFL skoru en az 66 olmalıdır. Dil seviyesini

belgeleyemeyen adayların Yeditepe Üniversitesi’nin İngilizce tespit sınavında başarılı

olmaları gerekmektedir.

- Adayların, başvurdukları programın mülakatında başarılı olmaları gerekmektedir.

BİYOTEKNOLOJİ YÜKSEK LİSANS PROGRAMI

Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programına kayıtlı olan öğrencilerin, kayıt tarihini takip eden ilk

iki dönem içersinde aşağıdaki çizelge uyarınca toplam 22 kredi / 124 ECTS tutarında ders

almaları gerekmektedir. Yeditepe Üniversitesi Biyoteknoloji Yüksek Lisans programı

dışındaki dersler, ancak Danışman ve Anabilim Dalı Başkanı onayı ile alınabilir.

BİYOTEKNOLOJİ YÜKSEK LİSANS DERSLERİ

Zorunlu Dersler

BTEC 501 Temel Biyoteknoloji (4 0 0) 4 / 10 ECTS

BTEC 550 Bilimsel Araştırma Metotları (0 0 3) 3 / 10 ECTS

BTEC 555 Biyoistatistik (1 0 4) 3 / 10 ECTS

BTEC 590 Lisansüstü Seminer NC / 2 ECTS

BTEC 600 Yüksek Lisans Tezi NC / 60 ECTS

Seçmeli Dersler

BTEC 502 Klinik Genetik (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 504 Farmasötik ve Tıbbi Biyoteknoloji (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 505 Mikrobiyoloji (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 506 Bitki Biyoteknolojisi (3 0 0) 4 / 8 ECTS

BTEC 507 İleri Biyokimya (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 510 Biyoteknolojide Laboratuvar Projeleri (1 0 4) 3 / 8 ECTS

BTEC 511 Karşılaştırmalı Fizyoloji (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 512 Ekoloji (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 513 Biyoinformatiğe Giriş . (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 514 Kanser Genetiği (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 516 Nanobiyoteknolojiye Giriş (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 517 İmmunobiyoloji (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 519 Gıda Sistemlerindeki Mikroorganizmalar (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 521 Gen Ekspresyonu (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 528 Doğal Kaynaklardan Elde Edilen Biyoaktif Özlerin İşlenmesi (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 532 İlaç Taşıyıcı Sistemler ve Cihazlar (3 0 0 ) 3 / 8 ECTS

BTEC 533 Doku Mühendisliğinde Kullanılan Biyomateryaller (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 534 Transgenik ve Gen Terapisi (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 535 Memeli Doku Mühendisliği (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 536 Kök Hücre (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 537 Protein ve Peptidlerde Dozaj Şekilleri (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 538 Nütrigenomik (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 539 Protein Kimyası (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 550 Bilimsel Araştırma Metotları (0 0 3) 3 / 8 ECTS

BTEC 582 Seçilmiş Konular : Sinyal İletim Yolakları (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 584 Seçilmiş Konular : Erişkin Nörojenez (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 585 Seçilmiş Konular : Mikrobiyal Metabolizma (3 0 0) 3 / 8 ECTS

BTEC 586 Seçilmiş Konular : Araştırma Odaklı Biyoistatistik Uygulamaları

(3 0 0) 3 / 8 ECTS

2. YIL

TEZ ÇALIŞMASI

DERS İÇERİKLERİ

BTEC 501 Temel Biyoteknoloji (4 0 0) 4

Fermantasyon teknolojisi; biyoteknolojide kullanılan bazı temel işlemler; şehir ve endüstri

atıksularının özellikleri ve biyolojik arıtma yöntemleri; atıkların değerlendirilmesi ve anaerobik

fermantasyonla biyoenerji üretimi, malt ve bira teknolojisi, şarap, sirke teknolojisi, laktik asit

fermantasyonu, ekmek mayası üretimi.

BTEC 502 Klinik Genetik (3 0 0) 3

Temel tıbbi genetik, soyağacı analizi, genetik değerlendirmelerde kullanılan metodlar, tıbbi

genetikte istatistiki metodlar, topluluklarda gen frekansı, seçim baskısı ve mutasyon hızı,

genetik dağılım ve akraba evlilikleri, ayrılma ve ayrılmama analizleri, monogenik ve poligenik

özellikler, belirli hastalıkların değerlendirilmesi, kromozomlar ve karyotipleme, klinik

sitogenetik, doğum öncesi tanı metodları.

BTEC 504 Farmasötik ve Tıbbi Biyoteknoloji (3 0 0) 3

Bu ders biyoteknolojik tekniklerin ve tedavideki ürünlerin uygulanması, gen tedavisi, gen

uygulama yöntemleri, doku mühendisliği, antikor mühendisliği, monoklonal antikorlar, aşılar,

serumlar ve ilaç uygulamasını kapsar.

BTEC 505 Mikrobiyoloji (3 0 0) 3

Bu ders mikroorganizmaların insanlar ve çevre için önemi üzerine etkilerine yoğunlaşacaktır.

Mikroorganizmaların büyümeleri, sınıflandırılmaları, insan ve bitki hastalıklarındaki önemi,

suyun ve toprağın mikrop ekolojisi, bakteri genetiği, yiyecek ve endüstriyel teknolojilerde,

tarımda, çevre kirliliğinde ve biyoteknolojideki uygulamaları ile incelenecektir. Ayrıca

mikrobiyal teknikler, insan genetiği ve biyoetik konuları da ele alınacaktır.

BTEC 506 Bitki Biyoteknolojisi (3 0 0) 4

Bitki fizyolojisi, büyüme kontrolü ve hormonlar, bitki doku mühendisliği teknikleri, protoplast

kültürler, somatik embriyogenez, transformasyon ve rejenerasyon teknikleri, bitki genetiği ve

A. thaliana modifikasyonu, transgenik tohum çalışmaları, tohum üretimi ve kalitesinin

arttırılması, biyokütlenin arttırılması, bitki patojenleri ve patojen dirençliliğinin arttırılması,

soğuk ve kuraklık direncinin arttırılması, protein, antijen ve antikor üretiminde bitkisel

reaktörler

BTEC 507 İleri Biyokimya (3 0 0) 3

Moleküllerin hayatı, karbonhidratların yapısı ve fonksiyonları, yağlar, proteinler ve nükleik

asitler, genetik bilginin akışı, enzimler ve enzim kinetiği, zar yapısı, dinamiği ve fonksiyonu,

biyoenerjitiklerin tanıtımı, termodinamik kuralları, ATP ve enerji, hücresel metabolizma ve

fermantasyon, glikolizis, TCA döngüsü, oksidatif fosforilasyon, fotosentez, amino asit

metabolizması, nükleik asit metabolizması, yağ asidi metabolizması

BTEC 510 Biyoteknolojide Laboratuvar Projeleri (1 0 4) 3

Yüksek Lisans adaylarının, muhtemel tez danışmanının vereceği proje çalışmasından

oluşmaktadır. Yüksek Lisans programının ilk 2 döneminde alınması zorunludur.

BTEC 511 Karşılaştırmalı Fizyoloji (3 0 0) 3

Hücre fizyolojisi, hücre içi haberci sistemleri, endositoz, sinir sistemi ve evrimi, kas, solunum,

dolaşım, boşaltım sistemlerinin fizyolojileri, özel duyular ve hormonlar.

BTEC 512 Ekoloji (3 0 0) 3

Organizmaların biyolojik ve fiziksel çevreleri ile etkileşimleri, ekosistem kavramları,

organizmaların çevresel gereksinimleri, sınırlayıcı etkenler, ekosistemlerdeki enerji çevrimleri,

biyojeokimyasal çevrimler, popülasyon ekolojisi ve komünite ekolojisinin ilkeleri, bitki

entomolojisi.

BTEC 513 Biyoinformatiğe Giriş (3 0 0) 3

Biyolojik sekans (DNA, RNA, protein) analizi: hizalama, puanlama matrisleri, sekans

benzerliği ve farklılığı, motif tarama; moleküler yapı öngörüsü: RNA ikincil yapı öngörüsü,

protein katlanması, protein düğümleme, homoloji modellemesi; fonksiyonel genomik ve

proteomik: mikrodizi veri analizi, transkriptomik, SNP ve ekzon dizi analizi, yüksek çıktılı

protein profillemesi; patika analizi: ağ modellemesi, grafik teorisi, biyokimyasal ve metabolik

patika simulasyonları; bioinformatik araçlar: Internet üzerinde olan biyolojik veri tabanları ve

biyolojik veri analizinde kullanılan yazılım araçlarının tanıtılması, bu yazılım ve veri

tabanlarına aşinalık sağlanması ve yapımlarında kullanılan prensip ve konseptlerin açıklanması.

BTEC 514 Kanser Genetiği (3 0 0) 3

Hücre bölünmesi ve moleküler mekanizması, hücre döngüsü ve düzenlenmesi, onkogenler ve

tümör baskılayıcılar, teşhis ve tedavisi. Kansere neden olan virütik, kimyasal ve fiziksel ajanlar,

tümör çeşitleri, Embriyonik ve Neoblastik hücrelerin kıyaslanması, kanser hücrelerinin

moleküler ve metabolik özellikleri, hücre bölünme döngüsü, ve kanser biyolojisindeki son

gelişmeler.

BTEC 516 Nanobiyoteknolojiye Giriş (3 0 0) 3

Bu derste nanoteknoloji dünyasının biyoteknoloji ve biyotıptaki uygulamaları incelenecektir.

Nanoteknoloji ve nano fabrikasyon için kullanılan yöntemler, tıbbi ve biyoteknolojik

alanlardaki uygulamalar, nanobiyoteknolojinin geleceği ve hastalık tanısında, nano

fabrikasyonda, karbon nanotüplerdeki kullanım alanları ile moleküler üretim yolları,

nano/moleküler iletişim, moleküler taşınma, self-assembly proses, nano materyallerin biyolojik

moleküller ile birleştirilerek hibrit yapıların oluşturulması, nano güç, nano gezinti, nano

seviyede manipülasyon ve kontrol, nano robotlar/makineler gibi konuların tıbbi ve

biyoteknolojik alandaki uygulamalarını da incelenecektir.

BTEC 517 İmmunobiyoloji (3 0 0) 3

Doğal ve kazanılmış bağışıklık, nakledilen ve hücreler aracılığıyla süregelen bağışıklık, B-

lenfositlerinin aktivasyonu ve farklılaşması, antikor molekülünün yapısı ve fonksiyonu, antijen-

antikor arası ilişkiler, farklılık mekanizması, monoklonal antikorlar, lenfoid sistem, MHC

sınırlaması, T-lenfositlerinin aktivasyonu ve farklılaşması, immunolojik tolerans, bağışıklık

hastalıkları, hassaslık, ateş, allerji, aşılar, otoimmunite, immun yetersizlik, AIDS.

BTEC 519 Gıda Sistemlerindeki Mikroorganizmalar (3 0 0) 3

Gıda zincirinde üretimden tüketime her aşamada gıda güvenliği politika ve regulasyonlarının

ulusal ve uluslararası etkileri; Gıda fermentasyon, gıda bozulmaları ve gıda zehirlenmelerinin

oluşumuna neden olan mikroorganizmaların fiziksel, metabolik ve genetik özellikleri; Gıda

kökenli mikroorganizmaların (fermentasyon, bozulma ve patojenik) ekolojisi; Mikrobiyel

zedelenme; Fermentasyonda rol alan mikroorganizmaların gıda bozulma ve zehirlenmesine

neden olan mikroorganizmalarla olan etkileşimleri; Fermentasyon ve patojenik

mikroorganizmaların fenotipik ve genetik özelliklerinin deneysel incelenme teknikleri; Gıda

kökenli mikroorganizmaların belirlenmesi ve tanımlanmasında kullanılan moleküler ve

immünolojik teknikler

BTEC 528 Doğal kaynaklardan elden edilen biyoaktif özlerin işlenmesi (3 0 0) 3

Doğal kaynaklardan elde edilen biyoaktif bitkisel kimyasallar: fenolik bileşenler, polifenoller,

yağlar ve yağ bileşenleri, uçucu yağlar; bu materyallerin işlenmeleri, karakterizasyonları, ve

biyoaktivitelerinin belirlenmesi. İşlenmeleri için kullanılan ekstraksiyon teknikleri: distilasyon,

çözücü ekstraksiyonu, süperkritik karbon dioksit ekstraksiyonu, basınçlı sıvı ekstraksiyonu.

BTEC 532 İlaç Taşıyıcı Sistemler ve Cihazlar (3 0 0 ) 3

Bu dersin kapsamındaki konular: İlaç taşıyıcı sistemlere giriş; ilaç taşıyıcı sistemlerin tasarımı,

hedeflendirilmiş ilaç taşıyıcı sistemler, bu sistemlerin tasarımında kullanılan polimerler vb,

ilacın transportu ve farmakokinetiği, değişik ilaç salıverme mekanizmaları, farmasötik ilaç

taşıyıcı sistemler ve klinik uygulamaları

BTEC 533 Doku Mühendisliğinde Kullanılan Biyomateryaller (3 0 0) 3

Materyallerin özellikleri; Tıpta kullanılan materyal sınıfları; Biyomateryal üzerindeki

reaksiyonlar ve bunların değerlendirilmesi; Biyomateryalin biyolojik olarak test edilmesi;

Biyolojik ortamda materyallerin bozunması; Materyallerin tıpta uygulamaları; Doku

mühendisliğinde biyoloji, yapay organlar ve biyomateryaller.

BTEC 534 Transgenik ve Gen Terapisi (3 0 0) 3

Transgen ve hayvan klonlanması, biyoteknoloji, tarım ve ilaç endüstrisinde transgenlerin

kullanımı, temel gen terapi teknikleri, viral vektörler ve viroterapi, sini rve bağışıklık sistemi

bozukluklarında gen terapisi ve örnek durumlar, kanserin gen terapisi ve bazı problemler, insan

klonlanması ve etik sorunlar

BTEC 535 Memeli Doku Mühendisliği (3 0 0) 3

Doku mühendisliğine giriş; Hücre tipleri ve organizasyonları, Hücresel süreçler ve hücre-hücre

dışı matriks etkile interaction; Hücre ve Doku Kültürü, Biyoreaktörler; Gen ifadesi, Hücre

belirlenmesi; Büyüme Faktörleri (Hücre farklılaşması); Biyomateryaller I (Özellikler, Yüzey

modifikasyonları); Biyomateryaller II (Biyoayrışımsal Polimerler); Hücre-Biyomateryal

İlişkileri

BTEC 536 Kök Hücre (3 0 0) 3

Kök hücrelerin izolasyonu, büyümeleri ve değişme potansiyelleri, embryonik kök hücre

teknolojileri, embryonik kök hücrelerinin sınırlanması ve farklılaşması, yetişkin kök hücreleri

ve doku tamiri, kemik iliği orjinli kök hücreleri, klonlanmış embryonik insan kök hücreleri ve

potansiyel uygulamaları, terapiye yönelik klonlama, kök hücre teknolojilerinin olası kullanımı,

etik konular

BTEC 537 Protein ve Peptidlerde Dozaj Şekilleri (3 0 0) 3

Protein ve Peptidlerde Dozaj Şekli Tasarımı I, protein ve peptid tanımı, fiziksel ve kimyasal

stabilite, preformülasyon ve formülasyonda dikkat edilecek özellikler, ticari preparatlar ve

kontroller. EFB Protein ve Peptidlerde Dozaj şekli Tasarımı II Oral, parenteral, rektal, nazal,

dermal ve oküler dozaj şekilleri, farmakokinetik özellikler, absorbsiyon, in vivo stabilitede

enzimatik engeller, prodrug yaklaşım

BTEC 538 Nütrigenomik (3 0 0) 3

Beslenmenin moleküler fizyoloji üzerine etkileri, Diyet- gen ve kanser-diyet ilişkileri ve

kompleks hastalıklar, bireysel genetik farklılıklar ve buna bağlı olarak diyete verilen cevaplar,

metabolik sendromlar, fonksiyonel gıdalar ve nutraceutikıllar, fonksiyonel nütrigenomik,

transkriptomik, ve proteomik, nütrigenomik teknolojisindeki son yenilikler ve uygulamalar.

BTEC 539 Protein Kimyası (3 0 0) 3

Biyolojik açıdan önemli makromoleküllerin sayısal analiz ve teknik teorileri; ayrıştırma

yöntemlerinin altında yatan termodinamik ve kinetik prensipler, protein yapısı ve işlevine giriş,

proteinlerin katlanması ve şaperonlar, protein stabilitesi ve döngüsü, proteazom ve protein

parçalanması, ubikitinasyon ve sumoilasyon, enzim kinetiği ve çalışması, protein-protein

etkileşimleri, DNA çoğalması, DNA bileşkeleri.

BTEC 550 Bilimsel Araştırma Metotları (0 0 3) 3

Makale okunması ve yazımı, proje hazırlanması ve sunumu, biyoetik, biyogüvenlik, istatistik

metodlar, uzmanlık alanına göre bazı bilimsel yazılımların kullanımı

BTEC 555 Biyoistatistik (1 0 4) 3

Biyoistatistikte temel kavramlar, çeşitli istatistiki testler (Mann-Whitney, Wilcoxon, Friedman

vb), ANOVA, Yüksek hacimli verilerin değerlendirilmesi, Korelasyon analizi, Biyolojik

sistemler için deney tasarımında temel kavramlar, Kuvvet analizi, Dizileme verilerinin

analizinde istatistik yöntemler, örnekleme metodları, regresyon analizi, model tabanlı istatistiki

optimizasyon

BTEC 582 Seçilmiş Konular: Sinyal İletim Yolakları (3 0 0) 3

Hücrelerarası iletişim ve sinyal mekanizmaları; sinyaller ve reseptörler; adaptör proteinler;

kinazlar ve fosfatazlar; G proteini sinyal kaskadı; küçük GTP-bağlayıcı proteinler; fosfatidil

inositol sinyal mekanizması; kalsiyum sinyalleşmesi; sinyal iskeleleri ve kaskadlar arası

iletişim; Wnt, Notch, BMP gibi çeşitli sinyal iletim yolaklarından örnekler; gelişme ve

hastalıkta sinyal mekanizmalarının rolü.

BTEC 584 Seçilmiş Konular: Erişkin Nörojenez (3 0 0) 3

Sinir kök hücreleri; nöronal gelişim; erişkin olfaktör sistemde nörojenez; erişkin hipokampal

nörojenez; nörojenik ve nörojenik olmayan bölgeler; nörojenez çalışma teknikleri; nörojenezin

regülasyonu ve işlevi; tıpta nörojenezin uygulamaları.

BTEC 585 Seçilmiş Konular: Mikrobiyal Metabolizma (3 0 0) 3

Mikroorganizmaların metabolik reaksiyonları, mikrobiyal enerji metabolizması (I): glikoliz

TCA döngüsü, mikrobiyal enerji metabolizması, (II): respirasyon, fermentasyon, mikrobiyal

metabolizmanın düzenlenmesi, nitrojen metabolizması, organik bileşiklerin indirgenmesi,

hücresel ürünlerin ve içeriklerin sentezi, metabolizma mühendisliği ve evrim mühendisliği.

BTEC 586 Seçilmiş Konular: Araştırma Odaklı Biyoistatistik Uygulamaları

(3 0 0) 3

Biyolojik ve genetik araştırma çalışmaları için uygun istatistiksel metodların belirlenmesi,

hipotez testleri, kullanılan istatistik metodlarının mantığı, veri ve sonuçlarının irdelenip

anlaşılması, ANOVA, bağımlı ve bağımsız gruplarda t-testi uygulama farklılıkları, ve Kruskal

Wallis istatistiği, Spearman sıra korrelasyonu, Wilcoxon işaretli sıra testi, Log-sıra testi, olasılık

tabloları için Khi-kare testi ve sağkalım analizi gibi diğer istatistiksel analiz metodları.

BTEC 590 Lisansüstü Semineri NC

Genetik, moleküler biyoloji, biyomühendislik, biyobilişim gibi alanlarda fakülte, misafir

konuşmacılar tarafından güncel konularda sunulan seminerler ile öğrencilerin bakış açılarının

genişletilmesinin yanısıra, konferans ve toplantılarda nasıl sunum yapılacağı konusunda teknik

çalışmalar

BTEC 600 Yüksek Lisans Tezi NC

BOLOGNA VE BİYOTEKNOLOJİ Y.LİSANS

PROGRAMI

ÖĞRENİM ÇIKTILARI DERSLER

PY001 OC001.

Matematik, fen, istatistik ve mühendislik bilgilerini uygulama becerisi.

BTEC501, BTEC510, BTEC600,






BTEC537, BTEC550, BTEC586

PY002 OC002. İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci tasarlama becerisi.





PY003 OC003.

Biyoteknoloji ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve bilişim araçları kullanarak çözme becerisi.



BTEC513, BTEC527,

BTEC532, BTEC537,


BTEC586

PY004 OC004. Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi



BTEC586

PY005 OC005. Biyoteknoloji alanında etkin iletişim kurabilme ve kendini sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi

BTEC550, BTEC600

PY006 OC006.

Mesleki ahlak ve sosyal sorumluluk bilinci kazanmış, güncel konularda meslek etiğine uygun söz, beyan ve uygulamalarda bulunma becerisi.






PY007 OC007.

Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık





PY008 OC008. Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi






PY009 OC009.

Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi






PY010 OC010 Kendini global alanda ingilizce olarak yeterli seviyede yazılı ve sözlü olarak ifade becerisi.


PROGRAM YETERLİLİKLERİ

PY001: Gerek akademik gerekse endüstriyel hayatlarında ihtiyaç duyacakları matematik, fen, istatistik ve mühendislik (özellikle biyomühendislik) bilgilerini değerlendirme, yorumlama ve uygulayabilme yeteneği sahiptir.

PY002: Teorik ve uygulamalı temel biyoteknoloji, moleküler biyoloji ve mühendislik alanlarına ait deneyleri tasarlayıp yürütebilme becerilerine sahip olup, alanı ile ilgili soru ve sorunlara bilimsel yöntem ve analitik tekniklerle etkin çözüm üretir.

PY003: Biyoteknoloji alanında deney/inceleme/araştırma sonuçlarını ve/veya verilerini geleneksel yöntemlerle olduğu kadar (klasik genetik hesaplamaları gibi) bilgisayar teknolojilerini de kullanarak (biyoinformatik araçlar gibi) veri toplayıp analiz eder ve bunları yorumlayabilme becerisine sahiptir.

PY004: Multidispliner biyoteknoloji alanındaki çalışmalarda bireysel ve/veya farklı disiplin alanlarıyla ortak çalışmalarda ekip üyesi olarak veri tabanları ve diğer bilgi kaynaklarına ulaşır, kaynak araştırması yaparak analitik düşünce yeteneği ile planlama ve zaman yönetiminde rol alarak karar verme sürecine katılır.

PY005:. Biyoteknoloji alanında ulusal ve uluslararası ortamlarda sistematik ve açık bir şekilde yazılı ya da sözlü olarak çalışmalarını aktarma becerisine sahiptir.

PY006: Biyoteknoloji alanına ait güncel konularda yazılı ve sözlü olarak etkili iletişim kurabilmek için bilişim ve iletişim teknolojileri kullanımı konusunda yetkin, takım çalışması ve disiplinlerarası çalışma yapabilen, sorumluluk duygusu gelişmiş, yaratıcı, girişimci ruhlu, öğrenmeyi bilen, özgüven sahibi, alanında ve/veya alanlararası rekabet edebilen, etik ilkelere ve çevre bilincine bağlı bir mühendis olmayı amaç edinir.

PY007: Biyomühendislik ve biyoteknolojinin evrensel ve toplumsal açılardan etkisinin algılanmasını sağlar, alanındaki sorunlara yönelik yeni ve yaratıcı (uluslararası düzeyde rekabet gücümüzü artırabilecek) çözüm önerilerini proje ve etkinlikler düzenleyerek uzman olan yada olmayan kişilerle paylaşır.

PY008: Bilim ve teknolojideki gelişmeleri yakından izleyerek, biyoteknoloji alanında edindiği bilgi ve becerileri eleştirel yaklaşımla değerlendirir ve kazandığı hayat boyu eğitim, öğrenme ve kendini devamlı yenileyebilme kavramları ışığında kişisel gelişimini sürdürür

PY009: Mesleki ahlak ve sosyal sorumluluk bilinci kazanmış, güncel konularda bilimsel, toplumsal ve kültürel değerlere uygun söz, beyan ve uygulamalarda bulunan, çevre ve insan sağlığını tehlikeye atacak her türlü söz ve faaliyetten kaçınmayı görev bilen bilince ve biyoteknolojik uygulamalarının hukuksal sonuçları hakkında farkındalığa sahiptir.

PY010: İngiliceyi en az Avrupa Dil Portföyü B2 (C1) genel düzeyinde kullanarak sözlü ve yazılı iletişim kurarak ulusal ve/veya uluslararası yayın yapma yeteneğine sahiptir.

DERS BİLGİLERİ

Ders Kodu Yarıyıl T+U Saat Kredi AKTS

GENEL BİYOTEKNOLOJİ BTEC 501 1-2 3 + 0 3 10

Ön Koşul Dersleri YOK

Dersin Dili İngilizce

Dersin Seviyesi MSc

Dersin Türü Zorunlu

Dersin Koordinatörü

Doç.Dr.Fatma Neşe Kök

Dersi Verenler Doç.Dr.Fatma Neşe Kök

Dersin Yardımcıları YOK

STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencileri biyoteknolojinin kapsadığı alanlar, klasik ve modern

biyoteknoloji hakkında bilgilendirmek ve kimyasal teknolojinin

sürdürülebilir bir alternatifi olarak önemini anlatmak

Dersin İçeriği

Fermentasyon teknolojisinin temelleri; protein mühendisliğinin

temelleri; biyomoleküllerin saflaştırılması; biyoreaktörlerin

sınıflandırılması; genetik olarak modifiye edilmiş

mikroorganizmaların kullanımı; transgenik bitki ve hayvanlar;

çevre biyoteknolojisi; etik konular; tıbbi biyoteknoloji;

sürdürülebilirlik

Dersin Öğrenme Çıktıları Program Öğrenme Çıktıları

Öğretim Yöntemleri

Ölçme Yöntemleri

1) Biyoteknolojinin çeşitli alanları konusunda bilgi edinir

1,4,8,9 1,2 A,C

2) Fermantasyon teknolojisi, biyoreaktör çeşitleri ve kullanım alanları konusunda bilgi sahibi olur

1 1,2 A

3) Değişik organizma ve hücrelerin kullanımları hakkında fikir sahibi olur

1 1,2 A

4) Enzim mühendisliği ve rekombinant DNA teknolojisinin biyoteknolojiye etkisini kavrar

1,7,8 1,2 A,C

Öğretim Yöntemleri:

1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması

Ölçme Yöntemleri:

A: Sınav , B: Laboratuvar, C: Ödev, D: Proje

DERS İÇERİĞİ

Hafta Konular Çalışma

Malzemeleri

1

Giriş, biyoteknolojinin disiplinlerarası özelliğinin tanıtılması Ders Kitabı ve Diğer Kaynaklar

2 Fermantasyon teknolojisi ve biyereaktörler-1 Ders Kitabı

3 Fermantasyon teknolojisi ve biyereaktörler-2 Ders Kitabı

4 Biyomoleküllerin saflaştırılması Ders Kitabı

5

Endüstriyel enzimler Ders Kitabı ve

Diğer

Kaynaklar

6

Protein mühendisliği Ders Kitabı ve

Diğer

Kaynaklar

7

Sürdürülebilirlik Ders Kitabı ve

Diğer

Kaynaklar

8 Vize Ders Kitabı

9

Çevre biyoteknolojisi Ders Kitabı ve

Diğer

Kaynaklar

10 Transgenik bitki ve hayvanlar Ders Kitabı

11

Tıbbi biyoteknoloji-1 Ders Kitabı ve

Diğer

Kaynaklar

12

Tıbbi biyoteknoloji-2 Ders Kitabı ve

Diğer

Kaynaklar

13 Sunum Güncel

makaleler

14 Sunum Güncel

makaleler

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Introduction to Biotechnology, 2nd edition, William J. Thieman and

Michael A. Palladino, Pearson Int. Ed., 2009

Introduction to Biotechnology, W. J. Thieman ve M. A. Palladino,

Benjamin Cummings; 2008, ISBN-10: 0321491459

Diğer Kaynaklar Güncel makaleler

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilmektedir

Ödevler Güncel makaleler öğrenciler tarafından taranarak seçilen makale sınıfta sunulur

Sınavlar 1 Arasınav, 1 Sunum ve 1 Final verilmektedir

DEĞERLENDİRME SİSTEMİ

YARIYIL İÇİ ÇALIŞMALARI SAYI KATKI YÜZDESİ

Ara Sınav 1 50

Ödev 1 50

Toplam 100

Final Sınavının Başarıya Oranı 40

Yıl içinin Başarıya Oranı 60

Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Uzmanlık

DERSİN PROGRAM ÇIKTILARINA KATKISI

No Program Öğrenme Çıktıları Katkı Düzeyi

1 2 3 4 5

1 Matematik, fen, istatistik ve mühendislik bilgilerini uygulama becerisi.

X

2 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci tasarlama becerisi.

3 Biyoteknoloji ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve bilişim araçları kullanarak çözme becerisi.

4 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi.

X

5 Biyoteknoloji alanında etkin iletişim kurabilme ve kendini sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi.

6 Mesleki ahlak ve sosyal sorumluluk bilinci kazanmış, güncel konularda meslek etiğine uygun söz, beyan ve uygulamalarda bulunma becerisi.

7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık.

X

8 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi.

X

9 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi.

X

10 Kendini global alanda ingilizce olarak yeterli seviyede yazılı ve sözlü olarak ifade becerisi.

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU

Etkinlik SAYISI Süresi (Saat)

Toplam İş Yükü (Saat)

Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati) 14 3 42

Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme) 14 8 112

Ara Sınav 1 15 15

Laboratuvar - - -

Ödev 1 40 40

Proje - - -

Final Sınavı 1 30 30

Toplam İş Yükü 239

Toplam İş Yükü / 25 (s) 9,56

Dersin AKTS Kredisi 10

DERS BİLGİLERİ


Klinik Genetik BTEC502 Güz 3 3 8



Dersin Seviyesi Yüksek lisans ve doktora

Dersin Türü Seçmeli


Doç. Dr. Ayşegül Kuşkucu

Dersi Verenler Doç. Dr. Ayşegül Kuşkucu

Dersin Yardımcıları Yok

STAJ Yok

Dersin Amacı

İnsanda görülen genetik hastalıkların oluşum süreçleri, kalıtımı,

tanı ve tarama yöntemleri ve de bunların klinik (rutin) uygulama ile

araştırmaları konusunda bilgilenme

Dersin İçeriği

İnsanda görülen genetik hastalıklar, sınıflamaları, kalıtım modelleri

ve hastalıkların tekrarlama riskleri, klinik sınıflamalarına göre

genetik hastalıklar için uygulanacak tanı yöntemleri, prenatal ve

preimplantasyon genetik tanı



Ölçme Yöntemleri

Öğrenciler genetik hastalıkların oluşumundaki temel prensiplerini öğrenir

1,2,3 A

Öğrenciler genetic hastalık ve kalıtsal hastalık arasındaki ayrımı bilir ve tekrarlama risklerini belirler

1,2,3,4 A

Öğrenciler genetic hastalıklarda uygulanması ve önerilmesi gereken tanı yöntemlerini belirler.

1,2,3,4 A

Öğrenciler kliniğe yansıyabilecek çıktı potansiyeli taşıması muhtemel çalışmaları ve fikirleri tartışır.

2,3 A



Ölçme Yöntemleri: A: Sınav , B: Laboratuvar, C: Ödev, D: Proje

DERS İÇERİĞİ

Hafta Konular Çalışma Malzemeleri

1 Tıbbi genetiğe giriş / Klinik bakış açısı

Ders Notları/ Ders Kitabı

2

Genetik Hastalıkların sınıflaması ve oluşum

meaknizmaları


3 Tek gen hastalıkları I Ders Notları/ Ders Kitabı

4 Tek gen hastalıkları II Ders Notları/ Ders Kitabı

5 Kromozomal hastalıklar I Ders Notları/ Ders Kitabı

6 Kromozomal hastalıklar II Ders Notları/ Ders Kitabı

7 Kompleks Hastalıklar Ders Notları/ Ders Kitabı

8

Genetik Hastalıklarda tarama ve tanı yöntemleri

(rutin uygulamalar) Ders Notları/ Ders Kitabı

9

Genetik Hastalıklarda tarama ve tanı yöntemleri

(araştırma aşamasındakiler) Ders Notları/ Ders Kitabı

10 Prenatal ve preimplantasyon genetik tanı Ders Notları/ Ders Kitabı

11 Edinsel genetik hastalıklar Ders Notları/ Ders Kitabı

12 Gelişimsel genetik ve doğumsal anomaliler Ders Notları/ Ders Kitabı

13 Genetik Danışma Ders Notları/ Ders Kitabı

14 Etik ve Yasal uygulamalar Ders Notları/ Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Trunpenny P, Ellard S, Emery’s Elements of Medical Genetics,

Elsevier 2017

Thompson, Medical Genetics, Elsevier 2016

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders slaytları

Ödevler Yok

Sınavlar 1 Final



Ara Sınav Yok

Laboratuvar Yok

Ödev Yok

Proje Yok

Toplam


Yıl içinin Başarıya Oranı

Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Alan Dersleri



1 2 3 4 5



X


X


X


X


X


X


X


X







Ara Sınav -

Laboratuvar --

Ödev -

Proje -





DERS BİLGİLERİ


FARMASÖTİK VE TIBBİ BİYOTEKNOLOJİ

BTEC 504 1-2 3 + 0 3 8



Dersin Seviyesi MSc ve PhD



Prof. Dr.Recep Serdar Alpan

Dersi Verenler Prof. Dr.Recep Serdar Alpan Prof. Dr. Ece Genç


STAJ YOK

Dersin Amacı

Biyoteknolojik tekniklerin ve tedavideki ürünlerin uygulanması,

gen tedavisi, gen uygulama yöntemleri, doku mühendisliği,

antikor mühendisliği, monoklonal antikorlar, aşılar, serumlar ve

ilaç uygulamasının kavramasını sağlamak

Dersin İçeriği

Farmasötik ve Tıbbi Biyoteknolojiye Giriş

Tıbbi Biyoteknolojide Protein izolasyonu ve ekspresyon teknikleri

Farmasötik Üretimde Biyoteknoloji

Doku Mühendisliği

Monoklonal Antikorlar ve Hücresel ve Hedeflendirilmiş

İmmunolojik Tedavi Uygulamaları

Rekombinant DNA Teknolojisi ile İlaç Geliştirme

Tıpta Gen Tedavisi Uygulamaları

siRNA, Mikro-RNA İlaçlar

Rekombinant Aşılar

İlaç Direncini Geri Döndüren İlaçlar



Ölçme Yöntemleri

1) Biyoteknoloji teknikleri ve terapötik maddelerin işlevlerini anlar

2,4,9 1,2 A,C,D

2) Doku Mühendisliğinde kullanılan hücre türlerini ve rekombinant teknolojiyi öğrenir

2,3,4,7 1,2 A,C,D

3) Gen terapisini ve etik konusunda genel durumu anlar ve öğrenir.

2,3,4,7 1,2 A,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Farmasötik ve Tıbbi Biyoteknolojiye Giriş Ders Kitabı ve Güncel Literatür

2

Tıbbi Biyoteknolojide Protein izolasyonu ve ekspresyon

teknikleri

Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

3

Farmasötik Üretimde Biyoteknoloji Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

4

Doku Mühendisliği Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

5

Monoklonal Antikorlar ve Hücresel ve Hedeflendirilmiş

İmmunolojik Tedavi Uygulamaları

Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

6

Rekombinant DNA teknolojisi ile İlaç Geliştirme I Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

7

Rekombinant DNA teknolojisi ile İlaç Geliştirme II Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

8

Mid-term Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

9

İlaç olarak Gen Terapisi Uygulamaları I Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

10

İlaç olarak Gen Terapisi Uygulamaları II Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

11

siRNA, Micro-RNA İlaçları Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

12

Rekombinant Aşılar I Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

13

Rekombinant Aşılar II Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

14

İlaç Direncini Geri Döndüren İlaçlar Ders Kitabı ve

Güncel

Literatür

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Pongracz & Keen, Medical Biotechnology, Churchill Livingston, Elsevier

Diğer Kaynaklar Medikal Biyoteknoloji alanındaki güncel yayınlar

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler Proje sunum konuları ve hazırlık bilgileri öğrencilere verilmektedir




Ara Sınav 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X


X

4 Disiplinlerarası takımlarda verimli çalışabilme ve sorumluluk alarak karar almada belirleyici olma becerisi

X

5 Biyoteknoloji alanında etkin iletişim kurabilme ve kendini sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi


7 Mesleki ve etik sorumluluk bilincinde toplumsal, hukuksal ve ekonomik konularda farkındalık

X

8 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi

9 Biyomühendislik, genetik ve biyoteknoloji ürün ve çözümlerinin, çevresel, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkisini anlama becerisi

X







Ara Sınav 1 3 3

Laboratuvar - - -

Ödev - - -

Proje 1 30 30





DERS BİLGİLERİ


MİKROBİYOLOJİ BTEC 505 1-2 3 + 0 3 8






Yard. Doç. Dr. May Korachi

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. May Korachi


STAJ YOK

Dersin Amacı

Bu ders mikrobiyolojiye girişi şu önemli yeteneklerin

vurgulanmasıyla birleştiriyor: 1) Eleştirel düşünme; 2) Bilimsel

yazma; 3) Toplum önünde sunum yapma. Bu ders önemli

bilimsel konuların ve mikrobiyolojinin toplumdaki öneminin

öğrencilerce anlaşılmasını, onlara eleştirel düşünme yeteneğinin

kazandırılmasını sağlamayı hedefliyor. Ayrıca bu ders doğal

yaşamın öneminin takdir edilmesinin sağlanmasını

gerçekleştirmeye çalışıyor. Taksonomi, morfoloji ve

mikroorganizmaların fizyolojisi çalışmalarında şunları vurguluyor:

1) Onların tıp, endüstri, tarımcılıkla alakalarını ve

biyoteknolojideki kullanımları

Dersin İçeriği

Her ne kadar odaklanılan kısım mikroorganizmalar olsa da bu

ders önemli konuların (örneğin hücresel solunum, enzim

aktivitesi, temel genetik, mikropların genetik çalışmalarda ve

biyoteknolojideki kullanımı) detaylı incelemelerini de dahil ediyor.

Mikroplar genetik çalışmalarda, endüstriyel amaçlarla ve tıbbi

araştırmalar için kullanılır.



Ölçme Yöntemleri

1) Mikrobiyoloji ile ilgili daha ileri seviye konularla

çalışmak isteyen öğrenciler için yeterli alt yapıyı

sağlar 5,8,9 1,2 A,C,D

2) Tıpta, gıdada ve tarımda bulunan temel mikroplara karşı aşinalık sağlar

5,8,9,10 1,2 A,C,D

3) Mikropların, hastalıkların aktarılmasındaki ve

önlenmesindeki rolünü anlar 5,8,9,10 1,2 A,C,D

4) Bilimsel şekilde düşünebilme yeteneğinin geliştirilmesi ve bilginin eleştirel şekilde değerlendirilmesine yardımcı olur

4,5,8,9,10 1,2,4 A,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Anaerobik, aerobik ve mikroaerofilik mikroorganizmalar Ders Kitabı

2

Yiyeceklerde, süt ve süt ürünlerinde bulunan mikroplar

Ders Kitabı

3 Tarımda bulunan mikroplar Ders Kitabı

4 Ağızda bulunan mikroplar Ders Kitabı

5 Hastalığa neden olan mikroplar Ders Kitabı

6 Mikrobiyel çeşitlilik ve Ekstremofiller Ders Kitabı

7 Çevresel Mirkobiyel Teknoloji Ders Kitabı

8 Çevresel Mirkobiyel Teknoloji Ders Kitabı

9 Ara Sınav Ders Kitabı

10 Biyoproses Mühendisliği ve Teknolojileri Ders Kitabı

11 Rekombinant DNA Teknolojisi Ders Kitabı

12 Enzim Teknolojisi Ders Kitabı

13 Fermantasyon Teknolojileri Ders Kitabı

14 Virolojide ve mikrobiyolojide ki son yenilikler Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Microbiology. L.M. Prescott, J.P. Harley, and D.A. Klein. Fifth edition.

WCB/McGraw-Hill Press, Boston, MA 2002.

Diğer Kaynaklar Ders notları ve slaytlar

MATERYAL PAYLAŞIMI






Ara Sınav 1 50

Ödev 1

50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5





X


X




X


X


X






Ara Sınav 1 5 5

Laboratuvar - - -

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40



Toplam İş Yükü / 25 (s) 7.56


DERS BİLGİLERİ


BİTKİ BİYOTEKNOLOJİSİ BTEC 506 1-2 3 + 0 3 8






Yard. Doç. Dr. Andrew Harvey

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Andrew Harvey


STAJ YOK

Dersin Amacı Bitki biyoteknolojisi kavramı içerisindeki temel prensiplerinin

öğretilmesi

Dersin İçeriği

Bitki fizyolojisi, büyüme kontrol ve hormonları, bitki doku

mühendisliği teknikleri, protoplast kültürleri, somatik

embriyojenesis, transformasyon ve rejenarasyon tekniklerieri,

tohum üretimi ve kalitesinin geliştirilmesi, soğuğa ve kuraklığa

dayanıklı bitki geliştirilmesi, biyoreaktörlerin kullanılması ile

protein, antijen ve antikor üretimi



Ölçme Yöntemleri

1) Bitki genetiği ve kalıtım konusunu öğrenir. 1,8 1, 2 A, D

2) Temel bitki biyolojisi ve fizyolojisi ile bitki doku kültürü uygulamalarını anlar.

1,8 1, 2 A, D

3) DNA vektör tasarımı ve bitki transformasyonlarının metotlarını öğrenir.

1,4 1, 2 A, D

4) Transgenik bitkileri öğrenir ve güncel durumunu değerlendirir.

1,4,7 1, 2 A, D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Bitkilerin Genetik Modifikasyonlarına Giriş Ders Kitabı

2 Flavr Savr Domatesi Ders Kitabı

3 Bt Gen Teknolojisi; Roundup Ready Teknolojisi Ders Kitabı

4 Altın Pirinç Teknolojisi Ders Kitabı

5 Ara Sınav 1 Ders Kitabı

6 Fonksiyonel Genomik Teknolojisi I Ders Kitabı

7 Fonksiyonel Genomik Teknolojisi II Ders Kitabı

8 Abiyotik Stres Direnci Ders Kitabı

9 Gıda Sanayi Teknolojileri Ders Kitabı

10 Ödev Teslimi Ders Kitabı

11 Bitki Hücre Duvarı Teknolojileri I Ders Kitabı

12 Bitki Hücre Duvarı Teknolojileri I Ders Kitabı

13 Bitki Hücre Duvarı ve Besinsel Katkısı Ders Kitabı

14 Biyoyakıtlar Teknolojisi Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı “Plant Biotechnology: The genetic manipulation of plants” 2nd Ed., Slater A., Scott N.W., Fowler M.R., Oxford University Press

Diğer Kaynaklar Bitki Biyoteknolojisi konusunda güncel yayınlar

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler Bitki biyoteknolojisi konusunda rapor hazırlaması verilmektedir.




Ara Sınav 1 50

Ödev 1 15

Proje 1 35

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5

1 Matematik, fen, istatistik ve mühendislik bilgilerini uygulama becerisi. X




X




X


X








Ara Sınav 1 3 3

Laboratuvar - - -

Ödev 1 20 20

Proje 1 30 30





DERS BİLGİLERİ


İLERİ BİYOKİMYA BTEC 507 1,2 3 + 3 3 7



Dersin Seviyesi Lisans



Prof. Dr. Mustafa Çulha

Dersi Verenler Prof. Dr. Mustafa Çulha


STAJ YOK

Dersin Amacı

Bu kurs öğrencilerin biyokimyanın ve biyo kimya konularının

önemini ve canlı sistemlerin altında yatan temel proessleri

anlamalarını sağlamak üzere dizayn edilmiştir.

Dersin İçeriği

Moleküllerin hayatı, karbonhidratların yapısı ve fonksiyonları,

yağlar, proteinler ve nükleik asitler, genetik bilginin akışı,

enzimler ve enzim kinetiği, zar yapısı, dinamiği ve fonksiyonu,

biyoenerjitiklerin tanıtımı, termodinamik kuralları, ATP ve enerji,

hücresel metabolizma ve fermantasyon, glikolizis, TCA döngüsü,

oksidatif fosforilasyon, fotosentez, amino asit metabolizması,

nükleik asit metabolizması, yağ asidi metabolizması



Ölçme Yöntemleri

1) Karbon hidratların lipid, protein ve nükleik asitlerin yapını ve genetic bilgi akışını anlar

1,2,4 1,2 A,C

2) Enzimleri, enzim kinetiğini, hücre zarı yapısını, dinamiğini ve fonksiyonunu, termodinamğin kanunlarını anlar

1,2,4 1,2 A,C

3) ATP ve enerjiyi, hücresel metobolizmayı, glikolizi, TCA döngüsünü, oksidative phosforolasyonu, photosentezi, amino asit metabolizmasını ve yağ isidi metobolizmasını anlar

1,2,4 1,2 A,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Hayatın molekülleri, karbon hidratlar, ve fonsiyonları, fermantasyon.

Ders Kitabı

2 Liptler ve proteinler Ders Kitabı

3 Nükleik asitler Ders Kitabı

4 Genetik bilgi akışı Ders Kitabı

5 Enzimler ve enzim kinetiği Ders Kitabı

6 Hücre zarı dinamiği ve fonksiyonu

Ders Kitabı

7 1. Arasınav Ders Kitabı

8 Biyoenerjiye giriş Ders Kitabı

9 Termaodinamiğin kanunları Ders Kitabı

10 Glikolosiz ve TCA döngüsü Ders Kitabı

11 Oksidatif fosforilasyon Ders Kitabı

12 Fotosentez Ders Kitabı

13 Amino acid metabolizması Ders Kitabı

14 2. Ara sınav Ders Kitabı

15 Nukliek asit metabolizması Ders Kitabı

16 Yağ aside metabolizması Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Biochemistry, Matthews, Van Holde, Ahern, 4. Baskı (Uluslararası Baskı) veya benzeri.

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir.

Ödevler Laboratuvar deneyleri her hafta sonunda rapor olarak öğrenciler tarafından teslim edilmektedir.

Sınavlar 2 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.



Ara Sınav 2 55

Ödev 1 45

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5

1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma

X

2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi

X

3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi

4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi

X


6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi


8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi








Ara Sınav 2 3 6

Laboratuvar - - -

Ödev 4 5 20

Proje - - -





DERS BİLGİLERİ


BİYOTEKNOLOJİ LABORATUVAR PROJELERİ

BTEC 510 1-2 1 + 0 0 1



Dersin Seviyesi Yüksek Lisans



Öğrencinin Danışmanı

Dersi Verenler Öğrencinin Danışmanı


STAJ YOK

Dersin Amacı Biyoteknoloji, genetik ve biyomühendislik alanındaki

uygulamalarda laboratuvar tecrübesi kazandırmak.

Dersin İçeriği

Öğrencinin danışmanı tarafından düzenli olarak öğrencinin genel

anlamda laboratuvar uygulamalarını kavraması ve pratik

kazanması amacıyla her hafta bir deney yaptırmasına dayanır.



Ölçme Yöntemleri

1) Biyoteknoloji ve genetik uygulamalarında laboratuva tecrübesi kazanır

3,4,8 1,2 B





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1-14

Öğrencinin danışmanı tarafından her hafta verilen deneyler Yayınlanmış son bilimsel makaleler

KAYNAKLAR

Ders Kitabı -

Diğer Kaynaklar Yayınlanmış son bilimsel makaleler

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Danışman tarafından verilen referans makale

Ödevler -

Sınavlar -



Ara Sınav - -

Laboratuvar 1 100

Ödev - -

Proje - -

Final - -

Toplam 100

Final Sınavının Başarıya Oranı -


Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Uzmanlık Dersleri



1 2 3 4 5




X


X





X








Ara Sınav - - -

Laboratuvar 14 15 210

Ödev - - -

Proje - - -

Final Sınavı - - -




DERS BİLGİLERİ


KARŞILAŞTIRMALI FİZYOLOJİ

BTEC 511 2 3 + 0 3 8






Prof.Dr.Bayram Yılmaz

Dersi Verenler Prof.Dr.Bayram Yılmaz


STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin, insan vücudunun temel fizyolojik prensiplerini ve

farklı organizmaların fizyolojik ihtiyaçları arasındaki farkları

anlamalarını sağlamak.

Dersin İçeriği

Fizyoloji ve homeostasis kavramlarına giriş; Kanın genel

özellikleri ve eritrositler; Dolaşım Sistemi ve Mikrosirkülasyon;

Solunum sistemi (ventilasyon ve perfüzyon), Gaz Değişimi (O2 ve

CO2 taşınması); Böbrek fonksiyonları, Glomerular filtrasyon,

reabsorpsiyon ve sekresyon; Asit-baz dengesi; Vücut sıvıları ve

hücre membranında taşınma mekanizmaları; Membran aksiyon

potansiyelleri ve nöron fonksiyonu; Kas fizyolojisi (iskelet ve düz

kas); Kalp döngüsü ve kan basıncının düzenlenmesi; Kan

pıhtılaşması ve hemostaz; Endokrin sistem.



Ölçme Yöntemleri

1) Homeostasis kavramını anlar 2,8,10 1,2 A,C,D

2) Fizyolojik sistemleri anlar 2,8,10 1,2 A,C,D

3) Fizyolojik sistemlerin nasıl düzenlendiğini kavrar 2,8 1,2 A,C,D

4) In vitrodan in vivoya fizyolojik sistemlerin önemini açıklar

2,4 1,2 A,C,D




A: Sınav , B: Deney, C: Ödev, D: Proje

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Derse giriş ve Sunum konularının tanıtılması

Ders Kitabı

2 Fizyoloji ve Homeostasis kavramının tanımı Ders Kitabı

3 Kanın ve eritrositlerin genel özellikleri Ders Kitabı

4 Kardiyovasküler sistem ve mikrosirkülasyon Ders Kitabı

5 Solunum sistemi (Ventillasyon ve perfüzyon) ve Gaz değişimi (O2 ve CO2’nin traşınması)

Ders Kitabı

6 Böbrek fonksiyonları, Glomerular filtrasyon, reabsorpsiyon ve sekresyon

Ders Kitabı

7 Asit-baz dengesi Ders Kitabı

8 Vücut sıvıları ve hücre membranında taşınma mekanizmaları Ders Kitabı

9 Vize Ders Kitabı

10 Membran aksiyon potansiyelleri ve nöron fonksiyonu Ders Kitabı

11 Kas fizyolojisi (iskelet ve düz kas) Ders Kitabı

12 Kalp döngüsü ve kan basıncının düzenlenmesi Ders Kitabı

13 Kan pıhtılaşması ve hemostaz.

Ders Kitabı

14 Endokrin sistem Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Textbook of medical physiology by Arthur C. Guyton, John E. Hall.

Diğer Kaynaklar Human Physiology by Stuart Ira Fox.

MATERYAL PAYLAŞIMI



Sınavlar 1 Arasınav, 2 Sunum (her öğrenciye) ve 1 Final



Ara Sınav 1 50

Ödev 2 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X



X





X



X






Ara Sınav 1 5 5

Deney - - -

Ödev 2 20 40

Proje - - -





DERS BİLGİLERİ


EKOLOJİ BTEC 512 1-2 3 + 0 3 8






Prof. Dr. Metin TURAN

Dersi Verenler Prof. Dr. Metin TURAN


STAJ YOK

Dersin Amacı

Ekolojinin kavram ve kuramlarını (habitat, popülasyon, ekosistem)

öğrenmek, Sürdürülebilir manada ekolojinin korunmasını

sağlamak, Doğal ekosistemler ve agroekosistemler arasındaki

farklılığı ortaya koymak, Çevre faktörlerinin (klimatik, edafik

faktörler, biyolojik ve topoğrafik faktörler) ekolik denge üzerindeki

etkisini öğretmek hedeflenmiştir.

Dersin İçeriği

Organizmaların biyolojik ve fiziksel çevreleri ile etkileşimleri,

ekosistem kavramları, organizmaların çevresel gereksinimleri,

sınırlayıcı etkenler, ekosistemlerdeki enerji çevrimleri,

biyojeokimyasal çevrimler, popülasyon ekolojisi ve komünite

ekolojisinin ilkeleri, bitki entomolojisi.



Ölçme Yöntemleri

1) Ekolojinin temel ilkeleri ile ekolojik faktörlerini

öğrenir 2 1,2 A, C, D

2) Ekolojinin tanımı, ekosistem ve kavramlarını

öğrenir 4 1,2 A,B,D

3) Ekolojide organizmaların biyolojik ve fiziksel

çevreleri ile etkileşimleri kavrar 3 1,2 A,C,D

4)Ekosistemlerdeki enerji çevrimleri ile

biyojeokimyasal çevrimleri kavrar 5,9 1,2 A,B,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri


Ders Kitabı

2 Ekolojinin tanımı, temel ilkeleri Ders Kitabı

3 Ekosistem kavramları Ders Kitabı

4 Organizmaların biyolojik ve fiziksel çevreleri ile etkileşimleri Ders Kitabı

5 Organizmaların çevre ile olan karşılıklı etkilerinin belirlenmesi (uygulama)

Laboratuvar,

6 Organizmaların çevresel gereksinimleri Ders Kitabı

7 Organizmaların yaşamını ve hayatsal faaliyetini sınırlandıran faktörler

Ders Kitabı

8 Ekosistemlerdeki enerji çevrimleri, biyojeokimyasal çevrimler Ders Kitabı

9 Vize

10 Biyojeokimyasal çevrimler (uygulama) Sea

11 Popülasyon ekolojisi Ders Kitabı

12 Komünite ekolojisi Ders Kitabı

13 Bitki entomolojisi Ders Kitabı

14 Sunum

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Prof. Dr. Metin TURAN, 2006. Ekolojik Tarım Ders Notları. Atatürk Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Toprak Bölümü, Ofset, Erzurum.

Diğer Kaynaklar

Prof. Dr. Nicolas Lampkin, 1990. Organic FarmingPublished by Farming Pres Books and Videos Wharfedale Road Ipswich IP1 4LG, United Kingdom

Prof. Dr. Sücaatin KIRIMHAN, 2005. Organik Tarım Sistemleri ve Çevre 1. Baskı350.s Tuhan Kitabevi, Ofset Matbaacılık Tesisleri, Ankara

Hürriyet Taşbaşlı, Bilal Zeytin, 2003. Organik Tarımın Temel İlkeleri Tarım ve Köy İşleri Banklığı, Araştıram ve Planlama Koordinasyon Kurulu Başkanlığı Anakara.

Prasanthrajan, M. and Mahendran, Agrotech, P.P., 2008. A Text Book on Ecology and Environmental Science.

Basu, R.N., and Naya Udyog, 2004. A Compendium of Terms in Ecology and Environment.

Pandey, B.N. and Jyoti, M.K. 2012. Ecology and Environment.

Bhatia, S.C. 2008. Ecology and Sustainable Development, Vols. I and II Atlantic.

Purohit, S.S. and Rajiv Ranjan, 2003. Ecology, Environment and Pollution, Agrobios.

MATERYAL PAYLAŞIMI



Sınavlar 1 Ara sınav, 1 Laboratuvar, 1 Ödev, 1 Sunum ve 1 Final verilmektedir



Ara Sınav 1 50

Laboratuvar 2 10

Ödev 2 20

Proje 1 20

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X


X


X


x





x





Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14 x toplam ders saati) 14 3 42

Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön çalışma, pekiştirme) 14 5 70

Ara Sınav 1 6 6

Laboratuvar 1 5 5

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


BİYOİNFORMATİĞE GİRİŞ

BTEC 513 1-2 3 +

0 3 8






Prof.Dr.Işıl Kurnaz

Dersi Verenler Prof.Dr. Işıl Kurnaz


STAJ YOK

Dersin Amacı Sinyal iletim yolakları ile bunların normal gelişim ve hastalık

üzerindeki etkilerine ilişkin ileri düzey anlayış geliştirme

Dersin İçeriği

Biyolojik sekans (DNA, RNA, protein) analizi: hizalama, puanlama

matrisleri, sekans benzerliği ve farklılığı, motif tarama; moleküler

yapı öngörüsü: RNA ikincil yapı öngörüsü, protein katlanması,

protein düğümleme, homoloji modellemesi; fonksiyonel genomik

ve proteomik: mikrodizi veri analizi, transkriptomik, SNP ve ekzon

dizi analizi, yüksek çıktılı protein profillemesi; patika analizi: ağ

modellemesi, grafik teorisi, biyokimyasal ve metabolik patika

simulasyonları; bioinformatik araçlar: Internet üzerinde olan

biyolojik veri tabanları ve biyolojik veri analizinde kullanılan yazılım

araçlarının tanıtılması, bu yazılım ve veri tabanlarına aşinalık

sağlanması ve yapımlarında kullanılan prensip ve konseptlerin

açıklanması.



Ölçme Yöntemleri

1) Biyoinformatiğin temelleri hakkında farkındalık kazanır

1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C

2) Temel biyoinformatik yöntemlerini kullanır 1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C

3) Biyoinformatiğin uygulama alanları hakkında farkındalık kazanır

1,3,5,8,9,10 1,3,4 A,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Derse giriş ve kısa tarihçe Ders notları ve

sunum malzemeleri

2

Biyolojik dizi analizi, hizalama araçları, temel hizalama

algoritmaları (Needleman-Wunsch, Smith-Waterman, vb)

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

3 Skorlama matrisleri, dizi benzerlikleri ve uzaklıkları, motif arama

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

4 Moleküler yapı tahminleri: RNA ikincil yapı tahminleri

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

5 Moleküler yapı tahminleri: protein katlanması, protein yumaklanması

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

6 Moleküler yapı tahminleri: homoloji modellemesi

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

7 Işlevsel genomic ve proteomic: mikrodizin very analizi ve transkriptomik

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

8 SNP ve ekson dizin analizi

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

9 Yüksek ölçekli protein profillemesi

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

10

Patika analizi: network modellemesi, grafik teorisi, biyokimyasal

ve metabolik yolak simülasyonları

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

11 Biyoinformatik araçlar: prensiplere giriş, kavramlar ve biyolojik veritabanları ile yazılım araçlarının kullanımı (örn. MINT, DIP, HPRD, GRID, MIPS, KEGG).

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

12 Öğrenci sunumları

Ders notları ve

sunum

malzemeleri


Ders notları ve

sunum

malzemeleri

14 FINAL SINAVI

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar

Diğer Kaynaklar yoktur

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Sınav sonuçları Sonuç Panosuna asılmaktadır ve görmek isteyen öğrencilere sınav kağıdına veya raporuna bakma hakkı verilmektedir.

Ödevler

Dönemin ikinci yarısından itibaren öpencilere o haftaki konuya ilişkin güncel araştırma makalelerinden ödevler verilmektedir. Ayrıca dönem sonunda Trends in Genetics dergisinin reveiw makale formatına uygun bir sonuç raporu yazmaları beklenmektedir.

Sınavlar Öğrenci sunumları ve 1 Final.



Ödev 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X



X



X




X


X







Ara Sınav - - -

Laboratuvar - - -

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


KANSER GENETİĞİ BTEC 514

1-2 3 + 0 3 8






Doç. Dr. Dilek Telci

Dersi Verenler Doç. Dr. Dilek Telci


STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilere kanser gelişimi ve biyolojisi üzerine moleküler

yolakları öğretmek. Öğrencileri kanser tedavisinde kullanılan

moleküler hedefli ilaçlar konusunda bilgilendirmek.

Dersin İçeriği

Moleküler kanser biyolojisini etioloji, kanser gelişimi, genetiği,

tedavisi ve önlenmesi baz alarak açıklamak. Kanserin doğası,

etiolojisi, kanserin oluşma nedenleri (kalıtımsal, kimyasal, viral ve

çevresel faktörler), kanserde oluşan genetik değişiklikler,

onkogenler, tümör baskılayıcı genler, apoptoz ve metastaz .



Ölçme Yöntemleri

1) Kanser oluşumunun ve gelişiminin temel kavramlarını anlar.

8,9 1,2 A,C

2) Onkogenlerin ve tümör baskalıyıcı genlerin kanser gelişimindeki kontrol ve etkilerini mekanizmalarıyla yorumlar.

8 1,2,3 A,C

3) Kanser gelişiminde apoptoz ve yaşam sürdürme sinyal yolaklarının önemini açıklar.

8 1,2,3 A,C

4) Metastaz koordinasyonunu kavrayabilme ve kök hücrelerin kanser gelişimindeki önemini yorumlar.

8 1,2,3 A,C

5) Kanser imunolojisi ve aknsere neden olan microorganizmalar hakkında bilgi edinir.

8,9 1,2 A,C

6) Kanser tedavisinde kullanılan klasik ilaçlar ve hedefli ilaçlar konusunda bilgi edinir.

7,8,10 1,2 A,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Kanser Biyolojisine Giriş; Kanser gelişimi

Ders Kitabı

2

DNA yapısı ve stabilitesi, mutasyon ve DNA hasarı tamir

mekanismaları

Ders Kitabı

3 Gen ifadesi regülasyonu Regulation of gene expression Ders Kitabı

4

Büyüme Faktörü Sinyal İletimi Yolağı ve Onkogenler, Hücre

Siklusu

Ders Kitabı

5 Hücre Büyümesi Inhibasyonu ve tümör baskılayıcı genler Ders Kitabı

6 Dönem ödevi için konu belirleme ve tartışma Ders Kitabı

7 Arasınav I Ders Kitabı

8 Apoptoz Ders Kitabı

9 Ödev konusunda yapılan hazırlıklar üzerinde çalışma Ders Kitabı

10 Kök hücre ve Başkalaşımı Ders Kitabı

11 Metastaz Ders Kitabı

12 Enfeksiyon ve Enflamatuvar Yangı Ders Kitabı

13 Kanser Endüstrisi, ilaç gelişimi ve klinik faz deneyleri. Ders Kitabı

14 Kanser Endüstrisi, ilaç gelişimi ve klinik faz deneyleri. Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Molecular Biology of Cancer, Lauren Pecorino, 3. baskı.

Diğer Kaynaklar Uluslararas dergilerde çıkan son yıllara ayit derleme makaleleri

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler Ödev konusu öğrenciler tarafından seçilmektedir.

Sınavlar 1 Arasınav ve 1 Final verilmektedir



Ara Sınav 1 40

Ödev 1 60

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5








X


X


X


X






Ara Sınav 1 3 3

Laboratuvar - - -

Ödev 1 45 45

Proje - - -





DERS BİLGİLERİ


NANOBİYOTEKNOLOJİYE GİRİŞ

BTEC 516 1-2 3 + 0 3 8






Prof.Dr. Mustafa Çulha

Dersi Verenler Prof.Dr. Mustafa Çulha


STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin, Tıpta kullanılan biyomalzemelerin önemini

anlamasını ve biyomalzemelerin kullanım alanlarının

kavranmasını sağlamak

Dersin İçeriği

Bu derste nanoteknoloji dünyasının biyoteknoloji ve biyotıptaki

uygulamaları incelenecektir. Nanoteknoloji ve nano fabrikasyon

için kullanılan yöntemler, tıbbi ve biyoteknolojik alanlardaki

uygulamalar, nanobiyoteknolojinin geleceği ve hastalık tanısında,

nano fabrikasyonda, karbon nanotüplerdeki kullanım alanları ile

moleküler üretim yolları, nano/moleküler iletişim, moleküler

taşınma, self-assembly proses, nano materyallerin biyolojik

moleküller ile birleştirilerek hibrit yapıların oluşturulması, nano

güç, nano gezinti, nano seviyede manipülasyon ve kontrol, nano

robotlar/makineler gibi konuların tıbbi ve biyoteknolojik alandaki

uygulamalarını da incelenecektir.



Ölçme Yöntemleri

1) Nanoteknoloji konseptinin tıp ve biyoteknolojideki uygulamalarını öğrenir

1,2,3,4 1,2 A,C

2) Tıp ve biyoteknoloji alanlarında kullanılan nanomalzemlerin fabrikasyon ve karakterizayon yöntem ve tekniklerini öğrenir

1,2,3,4 1,2 A,C

3) Nanobiyoteknolojinin geleceği ve hastalık tanısında, nano fabrikasyonda, nano/moleküler iletişim, moleküler taşınma, self-assembly proses, nano materyallerin biyolojik moleküller ile birleştirilerek hibrit yapıların oluşturulmasını anlar

1,2,3,4 1,2 A,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1

Nanoteknoloji ve Nanobiyoteknolji kavramına giriş ve kısa bir

tarihçe Ders Kitabı

2 Küçüklüğün sınırı. Ders Kitabı

3 Ne kadar küçük yapabiliriz? Ders Kitabı

4 Altın, gümüş, CNT’ler gibi bazı nanomalzemler. Ders Kitabı

5 Nanoparçacık üretim ve karakterizayon teknikleri Ders Kitabı

6

Nanodünya için görüntüleme teknikleri: SEM, TEM,

SPMs:AFM, STM, etc

Ders Kitabı

7 1. Arasınav Ders Kitabı

8

Canlı hücrenin bileşenleri

Hücresel ve biyomedikal görüntüleme

Ders Kitabı

9 Nanotıp Ders Kitabı

10 Nanobiyosensörler Ders Kitabı

11 Nanomalzemlerin daha yüksek yapılara düzenlenmesi Ders Kitabı

12 Biyolojik nanomakinalar Ders Kitabı

13 Nanomalzemelerin biyolojik ortamlarda davranışı Ders Kitabı

14 Öğrenci sunumları Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Literatür ve nanobitoteknoloji hakkında yazılmış her türlü bilimsel

kitap.

Diğer Kaynaklar Literatür

MATERYAL PAYLAŞIMI



Sınavlar 1 Arasınav, 1 Sunum, Dönem Raporu ve 1 Final verilmektedir



Ara Sınav 1 40

Ödev 2 60

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X


X


X












Ara Sınav 1 5 5

Laboratuvar - - -

Ödev 3 20 60

Proje - - -





DERS BİLGİLERİ


İMMUNOBİYOLOJİ BTEC 517 1-2 3 + 0 3 8






Yard. Doç. Dr. May Korachi

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. May Korachi


STAJ YOK

Dersin Amacı

Temel olarak doğuştan gelen bağışıklık sisteminde ve edinilmiş

bağışıklık sistemindeki hücreleri, inflamasyon sürecini ve

hücrelerin hastalıklarla nasıl etkileştiğini anlamayı amaçlar.

Dersin İçeriği

Doğal ve kazanılmış bağışıklık, nakledilen ve hücreler aracılığıyla

süregelen bağışıklık, B-lenfositlerinin aktivasyonu ve

farklılaşması, antikor molekülünün yapısı ve fonksiyonu, antijen-

antikor arası ilişkiler, farklılık mekanizması, monoklonal antikorlar,

lenfoid sistem, MHC sınırlaması,T-lenfositlerinin aktivasyonu ve

farklılaşması,immunolojik tolerans,bağışıklık hastalıkları,

hassaslık, ateş, allerji, aşılar, otoimmunite, immun yetersizlik,

AIDS.



Ölçme Yöntemleri

1) Bağışıklık sistemiyle ilgili ileri düzey konularda

çalışmak isteyen öğrenciler için yeterli alt yapıyı

sağlar

5,8,9,10 1,2 A,C,D

2) Bağışıklık sistemindeki hücrelerle ilgili aşinalık sağlar

5,8,9,10 1,2 A,C,D

3) Doğal ve sonradan kazanılmış bağışıklık sisteminin görevlerini anlar

5,8,9,10 1,2 A,C,D

4) İnflamatuvar yolakların ve ana sitokinlerin çalışma prensiplerini anlar

5,8,9,10 1,2,4 A,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 İmmunolojiye Giriş Ders notları ve

slaytlar

2

İmmun sistemin mekanik ve kimyasal savunması Ders notları ve

slaytlar

3

Doğuştan gelen bağışıklık sistemi Ders notları ve

slaytlar

4

B hücreleri ve antikorlar Ders notları ve

slaytlar

5

1. Ara Sınav - Vaka Çalışması Ders notları ve

slaytlar

6

Antijenin sihirli dünyasıyla ilgili sunum Ders notları ve

slaytlar

7

T hücreleri ve sitokinler Ders notları ve

slaytlar

8

Lenfoid organlar ve lenfositlerin hareketi Ders notları ve

slaytlar

9

2. Ara Sınav Ders notları ve

slaytlar

10

İmmunopatoloji Ders notları ve

slaytlar

11

Kanser ve bağışıklık sistemi Ders notları ve

slaytlar

12

İmmunogenetikte ki son araştırmalar Ders notları ve

slaytlar

13

Önemli sitokinlerin ve yolakların sunumları Ders notları ve

slaytlar

14

Önemli sitokinlerin ve yolakların sunumları Ders notları ve

slaytlar

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Janeway et al. Immunobiology The Immune System in Health and

Disease, 6th edition, 2005.

Diğer Kaynaklar Ders notları ve slaytlar

MATERYAL PAYLAŞIMI






Ara Sınav 1

50

Ödev 1

50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5






X




X


X


X






Ara Sınav 1 5 5

Laboratuvar - - -

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


GIDA SİSTEMLERİNDEKİ MİKROORGANİZMALAR

BTEC519 1-2 3 + 0 3 8



Dersin Seviyesi MSc



Doç. Dr. F. Yeşim Ekinci

Dersi Verenler Doç. Dr. F. Yeşim Ekinci


STAJ YOK

Dersin Amacı Dersin amacı mikroorganizmaların gıda sistemlerindeki kullanımı,

önemine ilişkin temel bilgilerin kazanılmasını sağlamak

Dersin İçeriği

Gıda Bilimi ve Endüstrisinde mikroorganizmaların önemi; Gıda

zehirlenmeleri, Gıda bozulmaları ve Fermente edilmiş gıdalarda

mikroorganizmaların fonksiyonları, insan sağlığı ve gıda

endüstrisine olan etkileri, bu mikroorganizmarın gelişimleri,

üremeleri devam ettirdikleri ve çevre ve diğer organizmalarla ile

olan etkileşimlerinin işleyiş mekanizmaları konularını kapsar



Ölçme Yöntemleri

Mikroorganizmaların gıda sistemlerindeki önemine ilişkin temel bilgileri kazanır

3,9 1,2,4 A,C,D

Gıda endüstrisinde fermentasyonda kullanılan yararlı mikroorganizmaların taşıması gereken özellikleri öğrenir

3,9 1,2,4 A,C,D

Gıda üretim hattında mikroorganizmalardan kaynaklanacak kritik kontrol noktalarını belirleyebilme ve gerekli düzeltici uygulamaları tespit etme yetisi kazanır

3,9 1,2,4 A,C,D

Gıda kökenli patojenik ve bozulma oluşturan mikroorganizmalardan kaynaklanan bir problemi saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözme becerisi kazanır

3,9 1,2,4 A,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Giriş: Gıda Güvenliği Konuları/Standartlar ve Kanunlar

Ders Notları

2 Gıdalarda mikrobiyel gelişmeyi etkileyen iç ve dış faktörler; mikroorganizmaların beslenme ihtiyaçları, mikrobiyal zedelenme, korunma, inaktivasyon.

Ders Notları

3

Gram-negatif patojenlerden kaynaklanan gıda zehirlenmeleri, sendromlar, kontrol, alınması gereken tedbirler: Escherichia coli O157:H7 ve karakteristik özellikleri; Salmonella, Campylobacter, gıda kaynaklı vibriolar

Ders Notları

4 Risk assessment; gıda güvenliği konuları Ders Notları

5 Gram-pozitif patojenlerden kaynaklanan gıda zehirlenmeleri, sendromlar, kontrol, alınması gereken tedbirler: Listeria monocytogenes, clostridia, vb.

Ders Notları

6 Bakteriyel kaynaklı olmayan gıda kökenli hastalıklar: Virüsler (hepatitis A, Norwalk, rotaviruses); fungal foodborne illness; parazitik:cryptosporidiosis, cyclosporiasis, amebiasis, giardiasis

Ders Notları

7

Diğer gıda kaynaklı patojenlerden kaynaklanan hastalıklar: scombroid, ciguatera, paralytic shellfish poisoning, bovine spongiform encephalopathy (nv Creutzsfeldt-Jakobs disease and prions)

Ders Notları

8 Hızlı analiz yöntemleri, identifikasyon immünolojik ve moleküler metodlar.

Ders Notları

9 Gıda Güvenliği Konuları: Zirai Biyoteknoloji, GMO; gıda

alerjileri Ders Notları

10 Kontrol ve inaktivasyon teknolojisi: Kimyasal, termal, irradiation, hidrostatik basınç, ozonlama, yüksek yoğunlukta elektrik alanları, ve diğer metodlar

Ders Notları

11 Fermentasyonun temel ilkeleri, gıdalardaki fermentatif bakteriler (özellikle laktik asit bakterileri ve propiyonik asit bakterileri)

Ders Notları

12

Gıda Fermentasyonları: salatalık fermentasyonu, peynir ve diğer

fermente süt ürünleri, sourdough ekmeği. Yöresel fermente edilmiş gıdalar. Starter Kültürler. Gıda fermentasyonunda meydana gelen problemler ve çözümleri. gıda kaynaklı patojenlerin ve bozulmaya neden olan organizmaların biyolojik

Ders Notları

olarak kontrolü.

13

Laktik ve propiyonik asit bakterileri Bakteriyosinleri;

tanımlanması, saflaştırma, genetik, aplikasyonları

Ders Notları

14

Şimdiki ve gelecekteki Gıda Mikrobiyolojisinde önemli olan

konular

Ders Notları

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Ders Notları

Diğer Kaynaklar Uluslararası yayınlar (SCI)

MATERYAL PAYLAŞIMI






Ara Sınav 2 40

Ödev (Sunum) 5 60

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5




x







x







Ara Sınav 2 14 28

Laboratuvar - - -

Ödev (Sunum) 5 10 50

Proje - - -





DERS BİLGİLERİ


GEN EKSPRESYONU BTEC 521 1-2 3 + 0 3 8





Dersin Koordinatörü Doç. Dr. Ahmet ARMAN

Dersi Verenler Doç. Dr. Ahmet ARMAN


STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin, Genetik kod, transcripsiyon, translasyonu ve

prokaryotik RNA polimerazın ve transcripsiyon faktörlerin gen

ekspresyonunda rolünü anlama

Dersin İçeriği Genetik kod, Prokaryotlarda Transkripsiyon ve Translasyon,

Prokaryotik gene regulation örnekleri

Dersin Öğrenme Çıktıları

Program

Öğrenme

Çıktıları

Öğretim

Yöntemleri

Ölçme

Yöntemleri

1) Genetik kodu anlar 1,8,10 1,2 A,C,D

2) Prokaryotlarda transcripsiyon ve translasyonu

öğrenir 1,2,4,8,10 1,2 A,C,D

3) Prokaryotlarda RNA polimeraz ile transkripsiyon

faktörlerin gen regulasyonundaki rolünü öğrenir 1,8,10 1,2 A,C,D

4) Prokaryotlarda değişik sistemlerde gen

regulasyonunu öğrenir 1,8,10 1,2 A,C,D

Öğretim

Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması

Ölçme

Yöntemleri: A: Sınav , B: Laboratuvar, C: Ödev, D: Proje

DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Genetik Kod

Ders Kitabı

2 Prokaryotlarda Transcripsiyon Ders Kitabı

3 Prokaryotlarda Protein Sentezi Ders Kitabı

4 Mutasyonlar Ders Kitabı

5 Prokaryotlarda supressor mutasyonlar Ders Kitabı

6 Gen regulasyonda RNA polimeraz Ders Kitabı

7 Transkripsiyon Faktörler Ders Kitabı

8 Prokaryotlarda Promoter analizleri Ders Kitabı

Vize Ders Kitabı

10 DNA-protein interaksiyonları Ders Kitabı

11 Gen eksprseyonunu belrleyen teknikler Ders Kitabı

12 Prokaryorlarda gen ekspresyon örnekleri Ders Kitabı

13 Sunum Ders Kitabı


15 Sunum

16 Sunum

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Gene Expression and Regulation, Jun MA

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI






Ara Sınav 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri



1 2 3 4 5


x


X



X





X



X


Etkinlik SAYISI Süresi

(Saat)

Toplam

İş Yükü

(Saat)



Ara Sınav 1 5 5

Laboratuvar - - -

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ

Ders Kodu Yarıyıl T+U Saat

Kredi AKTS

DOĞAL KAYNAKLARDAN ELDEN EDİLEN BİYOAKTİF ÖZLERİN İŞLENMESİ

528 1-2 3 + 0 3 8



Dersin Seviyesi MSc



Yrd. Doç. Dr. Özlem Güçlü Üstündağ

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Özlem Güçlü Üstündağ


STAJ YOK

Dersin Amacı

Doğal kaynaklardaki biyoaktif maddeler hakkında bilgi vermek: Kimyaları, karakterizasyonları ve biyolojik aktiviteleri Biyoaktif maddelerin işlenmeleri için kullanılan ekstraksiyon tekniklerinin temellerinin anlaşılmasını sağlamak Proses tasarımına odaklanarak bu tekniklerin biyoaktif maddelerin işlenmesi için uygulanması hakkında bilgi vermek

Dersin İçeriği

Doğal kaynaklardan elde edilen biyoaktif bitkisel kimyasallar: fenolik bileşenler, polifenoller, yağlar ve yağ bileşenleri, uçucu yağlar; bu materyallerin işlenmeleri, karakterizasyonları, ve biyoaktivitelerinin belirlenmesi. İşlenmeleri için kullanılan ekstraksiyon teknikleri: distilasyon, çözücü ekstraksiyonu, süperkritik karbon dioksit ekstraksiyonu, basınçlı sıvı ekstraksiyonu.



Ölçme Yöntemleri

1) Doğal maddelerdeki biyoaktif maddeler hakkında bilgi sahibi olur

1 1,2 A,C

2) Doğal maddelerin işlenmeleri için kullanılan ekstraksiyon teknikleri hakkında bilgi sahibi olur

1,2,3 1,2 A,C

3) Proses amaçlarını, hedeflenen maddeleri, ve eldeki kaynakları değerlendirerek en uygun ekstraksiyon yöntemini (yöntemlerini) seçer

1,3,5,10 1,2 A,C

Öğretim Yöntemleri: 1: Anlatım, 2: Soru-Cevap, 3: Tartışma, 4:Vaka Çalışması


DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Giriş: Biyoaktif maddeler ve sağlığa etkileri Ders notları,

zorunlu okumalar

2 Biyoaktif maddelerin kimyası: fenolikler, yağlar ve yağ bileşenleri ve uçucu yağlar

Ders notları, zorunlu okumalar

3 Biyoaktif maddelerin kimyası: fenolikler, yağlar ve yağ bileşenleri ve uçucu yağlar


4 Biyoaktif maddelerin kimyası: fenolikler, yağlar ve yağ bileşenleri ve uçucu yağlar, Sunumlar


5 Karakterizasyon ve biyolojik aktivite Arasınav 1


6 Karakterizasyon ve biyolojik aktivite Sunumlar


7 Karakterizasyon ve biyolojik aktivite Ekstraksiyon teknikleri ve temelleri


8 Ekstraksiyon teknikleri ve temelleri Ders notları,

zorunlu okumalar

9 Ekstraksiyon teknikleri ve temelleri Ders notları,

zorunlu okumalar

10 Biyoaktif maddelerin işlenmesi: uygulamalar ve proses tasarımı Arasınav 2


11 Biyoaktif maddelerin işlenmesi: uygulamalar ve proses tasarımı Ders notları,

zorunlu okumalar

12 Biyoaktif maddelerin işlenmesi: uygulamalar ve proses tasarımı Sunumlar



zorunlu okumalar


zorunlu okumalar

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Öğretim üyesi tarafından hazırlanan ders notları

Diğer Kaynaklar

Zorunlu okuma materyali olarak güncel literatürden seçilmiş

okumalar

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları ve zorunlu okumalar öğrencilere verilmektedir

Ödevler Sunum ve ödev konuları ve hazırlık bilgileri öğrencilere verilmektedir




Ara Sınav 2 30

Ödev 7 70

Toplam 100



Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Uzmanlık / Alan Dersleri



1 2 3 4 5


X


X


X



X






X






Ara Sınav 2 15 30

Ödev 7 5 35





DERS BİLGİLERİ


İLAÇ TAŞIYICI SİSTEMLER VE CİHAZLAR

BTEC 532 1,2 3 + 0 3 8






Yrd. Doç. Dr. Gülengül Duman

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Gülengül Duman


STAJ YOK

Dersin Amacı Bu programın amacı öğrencilere yeni dozaj şekilleri ve ilac

taşıyıcı sistemler konusunda temel bilgilerin verilmesidir

Dersin İçeriği

Yeni ve modern İlaç taşıyıcı sistemlerde taşıyıcı olarak kullanılan kullanılan materyellerin, biyometaryellerin tanıtılması vetasarımının tartışılması : Mikropartiküler sistemler , Lipozom kompozisyonu, Transdermal İlaç taşıyıcı sistemle, İyontoforez uygulamaları, Peptit, protein ve gen taşıyıcı sistemler, infüzyon pompaları, İmplant ilaç taşyıcı sistemler, İnhaler taşyıcı sistemler, Mikroiğne ve mikroçip teknolojiler

Dersin Öğrenme Çıktıları Program

Öğrenme Çıktıları Öğretim

Yöntemleri Ölçme

Yöntemleri

1) Ilaç taşıyıcı sistemler, Drug Delivery Systems (DDS)’ materyeller, biyometaryeller hakkında yeterli bilgi kazanır

1,2,8,10

1,2,4 A,C,D

2) Inhaler cihazlar, Lipozomlar, Infüzyon pompaları, Mikropartiküller, Mikroiğneler, Mikroçip teknoloji, İmplantlar ve insertler, Protein ilaç taşıyıcı sistemler hakkında yeterli bilgi kazanır

1,2,4,10

1,2,4 A,C,D

3) Ilaç taşıyıcı sistemler, Drug Delivery Systems (DDS) uygulamalari tartışılır ve öğrenir

1,2,4,5,10 1,2,4 A,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Yeni ilaç taşyıcı sistemler avantajları, mekanizmaları ve kullanılan malzemeler

Textbook, Ders notları, Video

2 Yeni ilaç taşıyıcı sistemlerin sıflandırılması

Textbook, Ders

notları, Video

3 Oküler ilaç taşıyıcı sistemler

Textbook, Ders

notları, Video

4 Transdermal ilaç taşıyıcı sistemler

Textbook, Ders

notları, Video

5 Iyontoforez uygulamaları

Textbook, Ders

notları, Video

6 Mikro-iğne teknolojisi, mikroçip uygulamaları

Textbook, Ders

notları, Video

7 Oral verilişte yeni ilaç taşıyıcı sistemler: Osmotik pompa vb.

Textbook, Ders

notları, Video

8 Implantlar: Gliadel Wafer, Duros vb.

Textbook, Ders

notları, Video

9 Vajinal veriliş yolları: ‘Intrauterine devices’

Textbook, Ders

notları, Video

10 Nano Teknoloji

Textbook, Ders

notları, Video

11 Lipozom,’ Stealth Liposome’

Textbook, Ders

notları, Video

12 Infuzyon pompaları

Textbook, Ders

notları, Video

13 Biyoteknolojik ilaçlar

Textbook, Ders

notları, Video

14 Protein ilaç taşyıcı sistemler

Textbook, Ders

notları, Video

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Lanza R.P., Langer R., Chick W.L., Principles of Tissue Engineering, Academic Press

Diğer Kaynaklar

Yaszemski M.J. etal., Tissue Engineering and Novel Delivery Systems, Marcel Dekker Shi D., Biomaterials and Tissue Engineering, Springer

MATERYAL PAYLAŞIMI



Sınavlar 1 Sunum 1 proje ve 1 Final verilmektedir



Ödev 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X



X


X




X



X






Ara sınav - - -

Laboratuvar - - -

Ödev 1 20 30

Proje 1 20 30





DERS BİLGİLERİ


İLERİ BİYOMALZEMELER BTEC 533 1-2 3 + 0 3 8






Prof.Dr.Gamze Torun Köse

Dersi Verenler Prof.Dr.Gamze Torun Köse


STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin, Tıpta kullanılan biyomalzemelerin önemini

anlamasını ve biyomalzemelerin kullanım alanlarının

kavranmasını sağlamak

Dersin İçeriği

Materyallerin mekanik ve yüzey özellikleri, Yüzey

Karakterizasyonu, Tıpta Kullanılan Materyaller, Biyomateryallere

Karşı Konakçı Reaksiyonu ve Değerlendirilmesi, Doku

Mühendisliği



Ölçme Yöntemleri

1) Tıpta kullanılan malzeme çeşitlerini ve kullanım alanlarını öğrenir

2,4 1,2 A,D

2) Biyomalzemelerin özelliklerini öğrenir 2,4 1,2 A,D

3) Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonları ve bunların değerlendirmesini kavrar

2 1,2 A,D

4) Doku Mühendisliğini kavrar 1,2,4,7 1,2 A,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri


Ders Kitabı

2 Malzeme özellikleri I Ders Kitabı

3 Malzeme özellikleri II Ders Kitabı

4 Tıpta kullanılan malzemelerin sınıflandırması I Ders Kitabı

5 Tıpta kullanılan malzemelerin sınıflandırması II Ders Kitabı

6

Biyomalzemelerin vucutta yaratabileceği reaksiyonlar ve

değerlendirmesi

Ders Kitabı

7 Biyomalzemelerin biyolojik testi Ders Kitabı

8 Biyolojik ortamda biyomalzemelerin bozunması Ders Kitabı

9 Tıp, Biyoloji ve Yapay organda malzeme uygulamaları Ders Kitabı

10 Vize Ders Kitabı

11 Doku Mühendisliği Ders Kitabı




KAYNAKLAR

Ders Kitabı Biomaterials Science – Ratner, Hoffman, Schoen, Lemons

Diğer Kaynaklar

Biomaterials: Principles and Applications – J.B.Park and

J.D.Bronzino

MATERYAL PAYLAŞIMI






Ara Sınav 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


X



X




X









Ara Sınav 1 5 5

Laboratuvar - - -

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


TRANSGENİK VE GEN TERAPİSİ

BTEC 534 1-2 3 + 0 3 8



Dersin Seviyesi MSc



Yard. Doç. Dr. Hüseyin Çimen

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Hüseyin Çimen


STAJ YOK

Dersin Amacı

Transgen teknolojisini anlayarak gen terapisi uygulama alanları

konularında bilgilenmek ve etik sorunlarını tartışılmasını

sağlamak

Dersin İçeriği

Transgen ve hayvan klonlanması, biyoteknoloji, tarım ve ilaç

endüstrisinde transgenlerin kullanımı, temel gen terapi teknikleri,

viral vektörler ve viroterapi, sinir ve bağışıklık sistemi

bozukluklarında gen terapisi ve örnek durumlar, kanserin gen

terapisi ve bazı problemler, insan klonlanması ve etik sorunlar.



Ölçme Yöntemleri

1) Rekombinant DNA teknolojisini ve kullanim alanlarını öğrenir.

2, 8 1, 2 A, D

2) Gen klonlanmasını ve gen terapisinde uygulamasını kavrar.

2, 8 1, 2 A, D

3) Transgenik organizma üretimini ve ilgili etik sorunlarını öğrenir ve tartışır.

2, 6, 8, 9 1, 2, 3 A, D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Derse giriş ve sunum konularının belirlenmesi

2 Rekombinant DNA teknolojisi Ders Kitabı

3 Transgen ve biyoteknolojide kullanım alanları Ders Kitabı

4 Hayvanlarda gen klonlama Ders Kitabı

5 Bitkilerde gen klonlama Ders Kitabı

6 Genetiği değiştirilmiş organizmalar I Ders Kitabı

7 Genetiği değiştirilmiş organizmalar II Ders Kitabı

8 Genetiği değiştirilmiş organizmalar: Tartışma Ders Kitabı

9 Vize Ders Kitabı

10 Gen terapisi ve uygulama örnekleri Ders Kitabı

11 Gen terapisi etiği: Tartışma Ders Kitabı




KAYNAKLAR

Ders Kitabı Anthony J.F. Griffiths v.d., An Introduction to Genetic Analysis, 7th ed., W. H. Freeman and Company

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler




Ara Sınav 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X





X



X


X







Ara Sınav 1 10 10

Laboratuvar - -

Ödev - - -

Proje (Sunum) 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


MEMELİ DOKU MÜHENDİSLİĞİ

BTEC 535 1-2 3 + 0 3 8






Prof.Dr.Gamze Torun Köse

Dersi Verenler Prof.Dr.Gamze Torun Köse


STAJ YOK

Dersin Amacı

Öğrencilerin, hasarlı dokunun tedavisi için kullanılacak yapay

doku materyallerinin geliştirilmesini ve fabrikasyonlarını

kavramasını sağlamak

Dersin İçeriği

Doku mühendisliğine giriş; Hücre tipleri ve organizasyonları,

Hücresel süreçler ve hücre-hücre dışı matriks etkile interaction;

Hücre ve Doku Kültürü, Biyoreaktörler; Gen ifadesi, Hücre

belirlenmesi; Büyüme Faktörleri (Hücre farklılaşması);

Biyomateryaller I (Özellikler, Yüzey modifikasyonları);

Biyomateryaller II (Biyoayrışımsal Polimerler); Hücre-

Biyomateryal İlişkileri



Ölçme Yöntemleri

1) Doku Mühendisliğinde kullanılan malzemeleri öğrenir

2,4 1,2 A,C,D

2) Doku Mühendisliğinde kullanılan hücre türlerini öğrenir

2,4 1,2 A,C,D

3) Büyüme faktörlerinin etkisini kavrar 2,4 1,2 A,C,D

4) Doku Mühendisliğinin endüstride kullanımını kavrar

1,2,4,7 1,2 A,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri


Ders Kitabı

2 Hücrelerin organizasyonu Ders Kitabı

3 Hücresel işlevler ve Hücre-ECM etkileşimi Ders Kitabı

4 Gen ekspresyonu, hücre tayini ve özelleşmesi Ders Kitabı

5 Hücre ve doku kültürü Ders Kitabı

6 Biyomateryallerin Doku Mühendisliği için şekillendirilmesi Ders Kitabı

7 Büyüme faktörleri Ders Kitabı

8 Hasarlı doku ile entegrasyon Ders Kitabı

9 Vize Ders Kitabı

10 Ex vivo kültür çalışması Ders Kitabı

11 Doku Mühendisliği endüstri etkileşimi Ders Kitabı




KAYNAKLAR

Ders Kitabı Lanza R.P., Langer R., Chick W.L., Principles of Tissue Engineering, Academic Press

Diğer Kaynaklar

Yaszemski M.J. etal., Tissue Engineering and Novel Delivery Systems, Marcel Dekker Shi D., Biomaterials and Tissue Engineering, Springer

MATERYAL PAYLAŞIMI






Ara Sınav 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


X



X




X









Ara Sınav 1 5 5

Laboratuvar - - -

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


Kök Hücre BTEC 536

Güz ve Bahar 3 + 0 3 8



Dersin Seviyesi Yüksek Lisans ve Doktora



Prof. Dr. Fatih Kocabaş

Dersi Verenler Prof. Dr. Fatih Kocabaş


STAJ YOK

Dersin Amacı Kök hücre teknolojilerinin anlaşılması

Dersin İçeriği

Ders, deri, saç, diş, kornea, merkezi sinir dokusu ve benzeri

dokuların yenilenmesi, sindirim, solunum, ürogenital , kas-iskelet

ve kardiyovasküler sistemlerinin yenilenmesi ve onların rejeneratif

tıp uygulamalarını içermektedir. Ayrıca kurbağa, salamender ve

memelilerde rejenerasyon gibi güçlü rejeneratif biyoloji araştırma

modellerini içerecektir. Buna ek olarak, iPSC oluşturulması ve

transdiferansiyonun rejeneratif biyolojideki önemi ve uygulamaları

tartışılacaktır.



Ölçme Yöntemleri

Öğrenciler rejenerasyonun temel prensiplerini öğrenir

2,3,8 1,2 A,D

Öğrenciler yaşın, doko hasarının, doku tipi ve organizma farkının rejenerasyondaki etkisini yorumlar

2,8,9 1,2 A,D

Öğrenciler rejenerasyonun seviyesini analiz eden metotları öğrenir, onların etik yönlerini irdeler.

2,3,7 1,2 A,D

Öğrenciler farklı hayvan modellerini tanımlar, onlarla ilgili sunum yapar ve tartışır.

2,5, 6,8,9 1,2,3 A,D




DERS İÇERİĞİ

Hafta Konular Çalışma Malzemeleri

1 Kök hücre biyolojisine giriş


2 Temel ve traslasyonal kök hücre biyolojisi Ders Notları/ Ders Kitabı

3 İnsan embriyonik kök hücreleri Ders Notları/ Ders Kitabı

4 Pluripotent kö hücre eldesi Ders Notları/ Ders Kitabı

5

Primordiyal, embriyonik germ hücrelerin, trofoblast

kök hücreleri, ekstaembriyonik endoterm kök

hücrelerinin orijinleri


6

Sinin kök hücreleri, hematopoetik kök hücreler,

retinal kök hücreleri , saç folikül kök hücreleri Ders Notları/ Ders Kitabı

7

Vasküler projenitörler, kas kök hücreleri , kardiyak

kök hücreleri , böbrek kök hücreleri Ders Notları/ Ders Kitabı

8 Mezankimal kök hücreleri Ders Notları/ Ders Kitabı

9 Karaciper, pankreas, bağırsak ve diş kök hücreleri Ders Notları/ Ders Kitabı

10

Mezankimal ve neural kök hücrelerle doku

mühendisliği Ders Notları/ Ders Kitabı

11

Kalp hasarının tedavisi ve B-hücre terapisindeki

Preklinik kök hücre çalışmaları Ders Notları/ Ders Kitabı

12

Kas distrofisinde kök hücre tedaviler, epidermisin

kök hücreler ile rejenerasyonu, kök hücreleriin kemik

rejenerasyonuna uygulaması


13

kök hücre gen terapiler, viral ve non-viral vektörler,

genetiği düzeltilmiş kök hücreler ve gen terapileri Ders Notları/ Ders Kitabı

14 kök hücreleri araştırmalarında etik Ders Notları/ Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Essentials of Stem Cell Biology, Robert Lanza and Anthony Altala,

2nd Edition.

Diğer Kaynaklar Ders Notları, internet kaynakları

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları öğrencilere verilmektedir.

Ödevler 1 ödev.

Sınavlar 1 Arasınav ve 1 Final verilmektedir.



Ara Sınav 1 60

Laboratuvar

Ödev

Proje 1 40

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5



X


X



X


X


X


X


X







Ara Sınav 1 10 10

Laboratuvar

Ödev

Proje 1 20 20





DERS BİLGİLERİ


PROTEİN VE PEPTİDLERDE DOZAJ ŞEKİLLERİ

BTEC 537 1-2 3 + 0 3 8



Dersin Seviyesi Yüksek Lisans ve Doktora



Yard. Doç. Dr. Gülengül DUMAN

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Gülengül DUMAN


STAJ YOK

Dersin Amacı

Peptit ve protein ilaç taşıyıcı sistemlerinin geliştirilmesi için amino

asit, peptid ve proteinler de dahil olmak üzere temel ilkelerini

anlamak

Dersin İçeriği

Amino asitler, peptitler, proteinler ve işlevlerinin temel yapısal

ilkelerine giriş;

Protein stabilitesi ve farklı polimerler veya biyolojik materyaller

kullanılarak peptit - protein ilaç taşıyıcı sistemleri.

Dersin Öğrenme Çıktıları Program

Öğrenme Çıktıları Öğretim

Yöntemleri Ölçme

Yöntemleri

1) Amino asitler, peptid ve proteinlerin temel yapısal ilkelerini anlar

1,2 1,2,4 A,C,D

2) Amino asitler, peptidler, proteinler ve fonksiyonlarını anlar

1,2,4 1,2,4 A,C,D

3) Protein stabilitesi ve peptid ve proteinlerin ilaç taşıyıcı sistemlerinin stabilitesi ve formülasyonunu anlar

2,4,5,6 1,2,4 A,C,D




DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Amino asitler, peptid ve proteinlerin temel prensiplerine giriş Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

2 Amino asitler, peptid ve protein temel yapısal ilkeleri Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

3 Amino asitler, peptid ve proteinler ve bunların işlevleri Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

4 Peptit ve protein stabilitesi Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

5 Peptit ve protein stabilitesi Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

6 Farklı polimerler veya biyolojik materyaller kullanılarak

oluşturulan protein ilaç taşıyıcı sistemler Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

7 Farklı polimerler veya biyolojik materyaller kullanılarak

oluşturulan protein ilaç taşıyıcı sistemler Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

8 Peptit ve protein ilaç taşıyıcı sistemleri Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

9 Peptit ve protein ilaç taşıyıcı sistemleri Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

10 Peptit ve protein ilaç taşıyıcı sistemleri ve cihazları Ders Kitabı, Ders notları, Videolar

11 Sunumlar Ders Kitabı, Ders notları, Videolar




KAYNAKLAR

Ders Kitabı Ansel, H.C., Pharmaceutical dosage forms and drug delivery systems. Lea and Febiger, Philadelphia

Diğer Kaynaklar Carl Branden John Tooze’ Introduction to Protein Structure’ ,Garland Publishing , London UK.

MATERYAL PAYLAŞIMI



Sınavlar 1 Sunum 1 proje ve 1 Final verilmektedir



Sunum 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X


X



X


X


X










Ara sınav - - -

Laboratuvar - - -

Ödev 1 20 30

Proje 1 20 30





DERS BİLGİLERİ


NÜTRİGENOMİK 538 1-2 3 + 0 3 8



Dersin Seviyesi MSc



Doç. Dr. F. Yeşim Ekinci

Dersi Verenler Doç. Dr. F. Yeşim Ekinci


STAJ YOK

Dersin Amacı

Bu dersin amacı gen-besin ilişkisi, gen-beslenme-hastalık ilişkisi

ve genetik beslenmeye ilişkin bilgi ve becerilerin artırılması ve

son bilimsel gelişmelerin takip edilmesinin sağlanmasıdır

Dersin İçeriği

Beslenmenin moleküler fizyoloji üzerine etkileri, Diyet- gen ve kanser-diyet ilişkileri ve kompleks hastalıklar, bireysel genetik farklılıklar ve buna bağlı olarak diyete verilen cevaplar, metabolik sendromlar, fonksiyonel gıdalar ve nutraceutikıllar, fonksiyonel nütrigenomik, transkriptomik, ve proteomik, nütrigenomik teknolojisindeki son yenilikler ve uygulamalar.



Ölçme Yöntemleri

1) Temel genetik, genomik ve gen regulasyonunun beslenme ile olan ilişkisini öğrenir

1,7 1,2,4 A,D

2) Moleküler beslenme konularının beslenme araştırmalarındaki yerinin tespiti (sinyaller ve sinyal yolakları, diet sensörlerini (nükleer reseptörler, hayvan modelleri) öğrenir

1,7 1,2,4 A,D

3) Nütrigenetik konseptinin anlaşılması (genetik duyarlılık, SNP’ler, polijenik (kompleks hastlaıklar, kişiye özel beslenme) öğrenir

1,7 1,2,4 A,D

4) Doğru kaynaklardan moleküler beslenme çalışmalarına erişim yetisi kazanır

1,7 1,2,4 A,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1-2 Nütrigenomik çalışmaların karakteristik özellikleri Ders Notları

3 Mikroarrayler Ders Notları

4-5 Nütrigenetik alanında kullanılan metodlar. SNP’ler Ders Notları

6 Transkriptomik çalışmalarda kullanılan metodlar. Ders Notları

7 Proteomik çalışmaların teknik özellikleri Ders Notları

8-9 Proteomik çalışmaların Nütrigenomik uygulamaları Ders Notları

10 Metabonom çalışmlarına olan yaklaşımlar Ders Notları

11-12

Törapotik Uygulamalar Ders Notları

13-14

Gıda –Beslenme Uygulamaları Ders Notları

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Ders Notları

Diğer Kaynaklar Yasal web siteleri ve araştırma veritabanları

MATERYAL PAYLAŞIMI



Sınavlar 2 Arasınav, 5 Ödev ve 1 Final verilmektedir



Ara Sınav 2 40

Ödev 5 60

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


x







x









Ara Sınav 2 14 28

Laboratuvar - - -

Ödev (Sunum) 5 10 50

Proje - - -





DERS BİLGİLERİ


PROTEİN KİMYASI BTEC 539 1-2 3 + 0 3 8






Yard. Doç. Dr. Hüseyin Çimen

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Hüseyin Çimen


STAJ YOK

Dersin Amacı

Proteinlerin sentezi ve biyomoleküler mekanizmalarda rolü,

protein mühendisliği ve bunun biyoteknolojide kullanımı hakkında

bilgilenmek.

Dersin İçeriği

Biyolojik açıdan önemli makromoleküllerin sayısal analiz ve

teknik teorileri; ayrıştırma yöntemlerinin altında yatan

termodinamik ve kinetik prensipler, protein yapısı ve işlevine

giriş, proteinlerin katlanması ve şaperonlar, protein stabilitesi ve

döngüsü, proteazom ve protein parçalanması, ubikitinasyon ve

sumoilasyon, enzim kinetiği ve çalışması, protein-protein

etkileşimleri, DNA çoğalması, DNA bileşkeleri.



Ölçme Yöntemleri

1) Protein sentezinde genel prensipleri öğrenir. 8 1, 2 A, D

2) Protein yapı ve fonksiyonunu çalışmak için kullanılan teknikleri kavrar.

3, 8 1, 2 A, D

3) Moleküler tıpta, protein mühendisliği araçlarının kullanımını öğrenir ve tartışır.

3, 8 1, 2, 3 A, D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Derse giriş ve sunum konularının belirlenmesi

2 Protein kimyası ve fonksiyonu Ders Kitabı

3 Protein sentezi ve kinetiği Ders Kitabı

4 Protein işlenişi ve döngüsü Ders Kitabı

5 Organizmalarda protein ifadesi Ders Kitabı

6 Protein saflaştırılması Ders Kitabı

7 Protein tanımlaması Ders Kitabı

8 Protein yapısının belirlenmesi için kullanılan teknikler Ders Kitabı

9 Vize Ders Kitabı

10 Moleküler tıpta protein mühendisliği Ders Kitabı

11 Moleküler tıpta protein mühendisliği: Tartışma Ders Kitabı




KAYNAKLAR

Ders Kitabı David Whitford, Proteins: Structure and Function, Wiley

Diğer Kaynaklar

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler




Ara Sınav 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5




X






X








Ara Sınav 1 10 10

Laboratuvar - - -

Ödev - - -

Proje 1 40 40





Ders Bilgileri


BİLİMSEL ARAŞTIRMA METHODLARI BTEC 550 1-2 3 + 0 3 8



Dersin Seviyesi Yüksek Lisans ve Doktora Dereceleri



Yard. Doç. Dr. Mayur Tamhane

Dersi Verenler Yard. Doç. Dr. Mayur Tamhane

Dersin Yardımcıları Yok

STAJ Yok

Dersin Amacı

Bu ders, Bilimsel Araştırmalarda kullanılan methodlar ve becerilere

deyinmekle beraber aynı zamanda, gerçek dünyanın fenomenlerini

açıklamaya bilimin katkılarını temsil etmektedir

Dersin İçeriği

Bilimsel Araştırma Methodolojisi, Bilimsel Araştırmanın Elementler,

Bilimsel Filozofinin Tarihi, Ampirik Araştırmanın Ana Hatları, Sahte

Bilim ve Gerçek Bilim, Bilimsel Methodun Basamakları-Araştırma,

Problem, Hipotez, Deney, Sonuçlar, Tartışma, ve Karar, Araştırma

Makalesi Yazmak- Rehber, Araştırma Makalesinin Yapısı- Başlık,

Özet, Giriş, Metodoloji, Sonuçlar, Tartışma, Karar, Referanslar,

Araştırma Çalışmaları Dizayn Etme Türleri- Deneysel, Gözlemsel,

Kalitatif, Kantitatif, Fikre Dayalı, Yarı-Deneysel, Betimlemeli,

Bağıntılayıcılı, Literatür Araştırması ve Anlamlılığı, Data Analizi-

Ham Verinin İstatiksel Olarak Yorumlanması, Hibeler ve Araştırma

Teklifleri- Veritabanına ulaşma ve Makale Sunuş Sürecinin

İncelenmesi.



Ölçme Yöntemleri

1) Bilimsel Filozofinin temellerini kazanır 7,8 1 A,C

2) Araştırma Hipotezi oluşturma ve geliştirme yapısını anlar

2,6 1,2 A,D

3) Etik araştırma teknikleri ve analizleri oluşturmayı öğretme ve bunları eğitim amacı da dahil olmak üzere bilimsel tecrübe için kullanır

7,9 1,2 A,D

4) Grantsmanship ile bağımsız araştırma programları oluşturma basamaklarını öğrenir

2,3 1,2,4 C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Bilimsel Araştırma Methodolojisi Ders Kitabı

2 Bilimsel Araştırmanın Elementler Ders Kitabı

3 Bilimsel Filozofinin Tarihi Ders Kitabı

4 Ampirik Araştırmanın Ana Hatları Ders Kitabı

5 Sahte Bilim ve Gerçek Bilim Ders Kitabı

6 Bilimsel Methodun Basamakları-Araştırma, Problem, Hipotez, Deney, Sonuçlar, Tartışma, ve Karar-1

Ders Kitabı

7 Bilimsel Methodun Basamakları-Araştırma, Problem, Hipotez, Deney, Sonuçlar, Tartışma, ve Karar-2

Ders Kitabı

8 Araştırma Makalesinin Yapısı- Başlık, Özet, Giriş, Metodoloji, Sonuçlar, Tartışma, Karar, Referanslar -1

Ders Kitabı

9 Araştırma Makalesinin Yapısı- Başlık, Özet, Giriş, Metodoloji, Sonuçlar, Tartışma, Karar, Referanslar -1

Ders Kitabı

10 Araştırma Çalışmaları Dizayn Etme Türleri- Deneysel, Gözlemsel, Kalitatif, Kantitatif, Fikre Dayalı, Yarı-Deneysel, Betimlemeli, Bağıntılayıcılı

Ders Kitabı

11 Literatür Araştırması ve Anlamlılığı Ders Kitabı

12 Data Analizi- Ham Verinin İstatiksel Olarak Yorumlanması Ders Kitabı

13 Hibeler ve Araştırma Teklifleri- Veritabanına ulaşma ve

Makale Sunuş Sürecinin İncelenmesi-2

Ders Kitabı

14 Hibeler ve Araştırma Teklifleri- Veritabanına ulaşma ve

Makale Sunuş Sürecinin İncelenmesi-2

Ders Kitabı

15 SEMİNER PREZENTASYON Ders Kitabı

16 FINAL EXAM Ders Kitabı

KAYNAKLAR

Ders Kitabı 1. How to Write a Research Paper – Year 2011 Shuttleworth M,

Experiment-Resources

Diğer Kaynaklar 2. 2. Explorable website – www.explorable.com

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Ders notları pdf olarak öğrencilerin email adreslerine gönderilmektedir

Ödevler Verilen ödevler bir hafta sonra toplanmaktadır

Sınavlar 1 Final sınavı



Ödevler 6 20

Proje 1 80

Toplam 50



Toplam 100




1 2 3 4 5

1 Matematik, fen ve biyomühendislik alanında ileri düzeyde bilgilere sahip olma

2 Genetik ve Biyomühendislik konularındaki mühendislik problemlerini saptama, tanımlama ve en güncel teknik ve araçları kullanarak çözüm önerisi sunma becerisi

X

3 Genetik ve biyomühendislik konularında uygulama becerisine sahip olup, bağımsız olarak deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi

X

4 İstenen gereksinimleri/ürünleri karşılayacak biçimde biyolojik bir sistemi, işlemi ya da süreci modern teknikler ile tasarlama becerisi


6 Araştırıcı, üretici ve girişimci kapasiteye sahip olarak yeni, özgün ve yaratıcı öneri ve proje üretebilme becerisi

X


X

8 Etkin iletişim kurabilme ve kendini ulusal ve uluslararası sosyal ve bilimsel arenalarda ifade edebilme becerisi

X


X







Ara Sınav - - -

Laboratuvar - - -

Ödev 6 7 42

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


ÖZEL KONULAR SİNYAL İLETİM YOLAKLARI

BTEC 582 (daha önce

BTEC 522 olarak açılmıştır)

1-2 3 +

0 3 8









STAJ YOK

Dersin Amacı Sinyal iletim yolakları ile bunların normal gelişim ve hastalık

üzerindeki etkilerine ilişkin ileri düzey anlayış geliştirme

Dersin İçeriği

Hücrelerarası iletişim ve sinyal mekanizmaları; sinyaller ve

reseptörler; adaptör proteinler; kinazlar ve fosfatazlar; G proteini

sinyal kaskadı; küçük GTP-bağlayıcı proteinler; fosfatidil inositol

sinyal mekanizması; kalsiyum sinyalleşmesi; sinyal iskeleleri ve

kaskadlar arası iletişim; Wnt, Notch, BMP gibi çeşitli sinyal iletim

yolaklarından örnekler; gelişme ve hastalıkta sinyal

mekanizmalarının rolü



Ölçme Yöntemleri

1) Sinyaller, reseptörler ve iletim yolaklarının temel türlerini anlar

1,3,5,8,9,10 1,2,4 A,C

2) Sinyalleşmenin normal gelişime olan etkilerini algılar

1,3,5,8,9,10 1,2,4 A,C

3) Sinyalleşme ve hastalıkları bir çerçeveye oturtur

1,3,5,8,9,10 1,2,4 A,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Derse giriş; hücrelerarası iletişim ve sinyalleşme mekanizmaları

Ders notları ve sunum

malzemeleri

2

Sinyaller ve reseptörler

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

3 Adaptör proteinler

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

4 Kinazlar ve fosfatazlar; protein kinaz A

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

5 G protein sinyal yolağı; küçük GTP’ye bağlı proteinler

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

6 Fosfatidil inositol sinyal yolağı; kalsiyum sinyali

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

7 Lipid sinyalleri ve nükleer reseptörler

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

8 Sinyal iskeletleri; kaskadlar arası konuşmalar Öğrenci sunumları

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

9

Sinyal yolaklarının altındaki hedefler

Öğrenci sunumları

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

10

Wnt sinyali; Notch sinyali


Ders notları ve

sunum

malzemeleri

11 BMP sinyali


Ders notları ve

sunum

malzemeleri

12 Büyüme hormonu sinyali


Ders notları ve

sunum

malzemeleri

13 Gelişim ve hastalıkta sinyalleşme


Ders notları ve

sunum

malzemeleri

14 FINAL SINAVI

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

KAYNAKLAR

Ders Kitabı Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar


MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler





Ödev 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X



X



X




X


X







Ara Sınav - - -

Laboratuvar - - -

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


ÖZEL KONULAR: ERİŞKİN NÖROJENEZ

BTEC 584 (daha önce

BTEC 524 olarak açılmıştır)

1-2 3 +

0 3 8









STAJ YOK

Dersin Amacı Erişkinlerdeki nörojeneze ilişkin ileri düzey algılama

Dersin İçeriği

Sinir kök hücreleri, sinir gelişimi, erişkin olfakter sistemdeki

nörojenez, erişkin hipokampal nörojenez, nörojenik olan ve

olmayan bölgeler, nörojenez araştırma metodları, nörojenezin

tıptaki uygulamaları



Ölçme Yöntemleri

1) Erişkin nörojenezi, nöral kök hücreleri ve rejenerasyonu anlar

1,3,5,8,9,10 1,2,4 A,C

2) Nörojenez araştırmalarındaki güncel teknikleri takip eder

1,3,5,8,9,10 1,2,4 A,C

3) Nörojenezi tıp uygulamaları açısından çerçeveye oturtur

1,3,5,8,9,10 1,2,4 A,C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Erişkin nörojeneze giriş

Ders notları ve sunum

malzemeleri

2 Sinir kök hücreleri

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

3 Sinir gelişimi

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

4 Erişkin olfakter sistemdeki nörojenez

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

5 Erişkin hipokampal nörojenez

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

6 Teknik notlar

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

7 Nörojenik olan ve olmayan bölgeler

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

8 Regülasyon

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

9 İşlev

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

10 Tıp

Ders notları ve

sunum

malzemeleri


Ders notları ve

sunum

malzemeleri

12

Öğrenci sunumları Ders notları ve

sunum

malzemeleri

13

Öğrenci sunumları Ders notları ve

sunum

malzemeleri

14 FINAL SINAVI

Ders notları ve

sunum

malzemeleri

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

1. Araştırma makaleleri; ders notları; sunumlar

2. Adult Neurogenesis; G. Kempermann, OUP; ISBN: 978-0-19-

517971-2


MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler





Ödev 1 50

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


X



X



X




X


X


X






Ara Sınav - - -

Laboratuvar - - -

Ödev 2 20 40

Proje 1 40 40





DERS BİLGİLERİ


MİKROBİYAL METABOLİZMA BTEC585 1-2 3 + 0 3 8






Prof. Dr. Zeynep Petek ÇAKAR

Dersi Verenler Prof. Dr. Zeynep Petek ÇAKAR


STAJ YOK

Dersin Amacı

Mikrobiyal metabolizmanın temel prensiplerini anlamak ve

mikrobiyal metabolizmanın sistem biyolojisi uygulamaları olan

metabolizma mühendisliği ve evrimsel mühendislik hakkında fikir

sahibi olmak.

Dersin İçeriği

Mikroorganizmaların metabolik reaksiyonları, mikrobiyal enerji

metabolizması (I): glikoliz, TCA döngüsü, mikrobiyal enerji

metabolizması (II): respirasyon, fermentasyon, mikrobiyal

metabolizmanın düzenlenmesi, azot metabolizması, organik

bileşiklerin yıkımı, hücresel ürünlerin ve bileşenlerin sentezi,

metabolizma mühendisliği ve evrimsel mühendislik.



Ölçme Yöntemleri

1) Mikrobiyal metabolizmanın temel prensiplerini ve metabolizma mühendisliği ve evrimsel mühendislik uygulamalarını anlar

1,2,3,6,7,8,9 1,2 A,D

2) Mikrobiyal metabolizma konusunda bir bilimsel makale sunumu yapabilme becerisini kazanır

1,5,10 1,2 C,D

3) İlgi duyulan bir mikrobiyal metabolizma/ metabolizma mühendisliği konusunda detaylı bir literatür taraması yapma becerisini kazanır

1,2,3,8 1,2 C,D

4) Bilimsel formatta bir derleme makalesi hazırlayarak sınıf içinde sunumunu yapma becerisi kazanır

1,2,3,5,6,7,10 1,2 A,C,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Mikroorganizmaların metabolik reaksiyonları Ders Kitabı

2

Mikrobiyal enerji metabolizması (I): Glikoliz ve TCA döngüsü

Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

3

Mikrobiyal enerji metabolizması (II): solunum, fermentasyon

Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

4

Mikrobiyal metabolizmanın düzenlenmesi (regülasyonu) Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

5

Azot metabolizması Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

6

Organik bileşiklerin yıkımı Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

7

Hücresel bileşenlerin ve ürünlerin sentezi Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

8

Metabolizma mühendisliği (I) Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

9

Metabolizma mühendisliği (II) Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

10 Evrimsel mühendislik (I)

Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

11 Evrimsel mühendislik (II)

Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

12 Derleme makalesi sunumları(I)

Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

13 Derleme makalesi sunumları (II)

Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

14 Derleme makalesi sunumları (III)

Ders Kitabı ve

bilimsel makaleler

KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Brock Biology of Microorganisms, thirteenth edition, 2011, M.T.

Madigan, J.M.Martinko, Pearson

An introduction to metabolic and cellular engineering, second edition,

2012, S. Cortassa, M.A. Aon, A.A. Iglesias, J.C. Aon, D. Lloyd, World

Scientific

Herhangi bir biyokimya ders kitabı (e.g. by Stryer, Zubay, Lehninger

etc.)

Diğer Kaynaklar

SCI’de taranan bir biyoteknoloji dergisinde yayınlanmış, güncel

bilimsel araştırma makaleleri.

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler

Derste bir araştırma makalesi sunumu yapılmakta, mikrobiyal metabolizma/metabolizma mühendisliğinin ilgilenilen bir konusunda yazılı bir derleme makalesi proje ödevi verilmekte, dönem sonunda sınıfta bu derleme makalelerinin sunumu yapılmaktadır.

Sınavlar 1 Arasınav ve 1 Final verilmektedir



Ara Sınav 1 25

Ödev 1 25

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100




1 2 3 4 5


x


x


x



x


x


x


x


x


x






Ara Sınav 1 5 5

Laboratuvar - - -

Ödev 1 30 30

Proje 1 50 50





DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

SEÇİLMİŞ KONULAR: ARAŞTIRMA ODAKLI BİYOİSTATİSTİK UYGULAMALARI

BTEC 586

1 3 + 0 3 8






Yrd. Doç. Dr. Esin Öztürk Işık

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Esin Öztürk Işık


STAJ YOK

Dersin Amacı

Biyoistatistiğin temel prensiplerinin anlaşılması, istatistiksel

hipotez testleri için değişik istatistiksel yöntemler, biyoistatistiğin

biyoteknoloji konularında uygulamaları

Dersin İçeriği

Biyolojik ve genetik araştırma çalışmaları için uygun istatistiksel metodların belirlenmesi, hipotez testleri, kullanılan istatistik metodlarının mantığı, veri ve sonuçlarının irdelenip anlaşılması, ANOVA, bağımlı ve bağımsız gruplarda t-testi uygulama farklılıkları, ve Kruskal Wallis istatistiği, Spearman sıra korrelasyonu, Wilcoxon işaretli sıra testi, Log-sıra testi, olasılık tabloları için Khi-kare testi ve sağkalım analizi gibi diğer istatistiksel analiz metodları.



Ölçme Yöntemleri

Değişik biyoistatistiksel yöntemleri öğrenir 1 1,2,3 A,C

Ödevleri cevaplar 1 1,2,3 A,D

Biyoteknoloji çalışanlarının istatistiksel etik sorumluluklarını öğrenir

6,7 1,2,3 A

Biyoistatistiğin sağlık alanında önemini öğrenir 9 1,2,3 A,C

Proje seçer ve sunumunu yapar 1,5,8,10 1,2,3 A,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Giriş, Veri alımı, Deneysel yaklaşım, Ölçme Ders Kitabı+

Ders Notları

2 Tanımlayıcı İstatistiksel Veriler

Ders Kitabı+ Ders Notları

3 Varyans Analizi (ANOVA)


4 t-testi


5 Çoklu Karşılaştırma Testleri

Ders Kitabı+

Ders Notları

6 z-testi ve Ki-Kare Testi

Ders Kitabı+

Ders Notları

7 Güç ve Örnekleme Sayısı

Ders Kitabı+

Ders Notları

8 Regresyon ve Korrelasyon Analizi

Ders Kitabı+

Ders Notları

9 Tekrarlamalı Ölçümler (eşli t-testi)

Ders Kitabı+

Ders Notları

10 Tekrarlamalı Ölçümler (Tekrarlamalı ölçümler için ANOVA)

Ders Kitabı+

Ders Notları

11 Parametrik Olmayan Metodlar

Ders Kitabı+

Ders Notları

12 Sağkalım Analizi

Ders Kitabı+

Ders Notları

13 Proje Sunumları -


KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Primer of Biostatistics (6th ed.) By Stanton A. Glantz (McGraw-Hill)-

2005

Diğer Kaynaklar -

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler -

Sınavlar -



Ara Sınav 1 40

Ödev 10 40

Proje 1 20

Toplam 100



100




1 2 3 4 5


X





X


X


X


X


X


X






Ara Sınav 1 15 15

Laboratuvar - - -

Ödev 10 5 50


Proje 1 40 40




DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

SEÇİLMİŞ KONULAR: ARAŞTIRMA ODAKLI BİYOİSTATİSTİK UYGULAMALARI

BTEC 586

1 3 + 0 3 8






Yrd. Doç. Dr. Esin Öztürk Işık

Dersi Verenler Yrd. Doç. Dr. Esin Öztürk Işık


STAJ YOK

Dersin Amacı

Biyoistatistiğin temel prensiplerinin anlaşılması, istatistiksel

hipotez testleri için değişik istatistiksel yöntemler, biyoistatistiğin

biyoteknoloji konularında uygulamaları

Dersin İçeriği

Biyolojik ve genetik araştırma çalışmaları için uygun istatistiksel metodların belirlenmesi, hipotez testleri, kullanılan istatistik metodlarının mantığı, veri ve sonuçlarının irdelenip anlaşılması, ANOVA, bağımlı ve bağımsız gruplarda t-testi uygulama farklılıkları, ve Kruskal Wallis istatistiği, Spearman sıra korrelasyonu, Wilcoxon işaretli sıra testi, Log-sıra testi, olasılık tabloları için Khi-kare testi ve sağkalım analizi gibi diğer istatistiksel analiz metodları.



Ölçme Yöntemleri

Değişik biyoistatistiksel yöntemleri öğrenir 1 1,2,3 A,C

Ödevleri cevaplar 1 1,2,3 A,D

Biyoteknoloji çalışanlarının istatistiksel etik sorumluluklarını öğrenir

6,7 1,2,3 A

Biyoistatistiğin sağlık alanında önemini öğrenir 9 1,2,3 A,C

Proje seçer ve sunumunu yapar 1,5,8,10 1,2,3 A,D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1 Giriş, Veri alımı, Deneysel yaklaşım, Ölçme Ders Kitabı+

Ders Notları

2 Tanımlayıcı İstatistiksel Veriler


3 Varyans Analizi (ANOVA)


4 t-testi


5 Çoklu Karşılaştırma Testleri

Ders Kitabı+

Ders Notları

6 z-testi ve Ki-Kare Testi

Ders Kitabı+

Ders Notları

7 Güç ve Örnekleme Sayısı

Ders Kitabı+

Ders Notları

8 Regresyon ve Korrelasyon Analizi

Ders Kitabı+

Ders Notları

9 Tekrarlamalı Ölçümler (eşli t-testi)

Ders Kitabı+

Ders Notları

10 Tekrarlamalı Ölçümler (Tekrarlamalı ölçümler için ANOVA)

Ders Kitabı+

Ders Notları

11 Parametrik Olmayan Metodlar

Ders Kitabı+

Ders Notları

12 Sağkalım Analizi

Ders Kitabı+

Ders Notları



KAYNAKLAR

Ders Kitabı

Primer of Biostatistics (6th ed.) By Stanton A. Glantz (McGraw-Hill)-

2005

Diğer Kaynaklar -

MATERYAL PAYLAŞIMI


Ödevler -

Sınavlar -



Ara Sınav 1 40

Ödev 10 40

Proje 1 20

Toplam 100



100




1 2 3 4 5


X





X


X


X


X


X


X






Ara Sınav 1 15 15

Laboratuvar - - -

Ödev 10 5 50


Proje 1 40 40




DERS BİLGİLERİ


YÜKSEK LİSANS SEMİNERİ BTEC 590 1-2 1 + 0 0 1



Dersin Seviyesi Yüksek Lisans



Doç.Dr. Dilek Telci

Dersi Verenler Doç.Dr. Dilek Telci


STAJ YOK

Dersin Amacı

Biyoteknolojide gelişen alanlar konusunda yapılan araştırmalar

ve şirketkerde yürütülen AR-GE çalışmaları konusunda bilgi

sahibi olmak.

Dersin İçeriği

Genetik, moleküler biyoloji, biyomühendislik, biyobilişim gibi

alanlarda fakülte, misafir konuşmacılar ve doktora öğrencileri

tarafından güncel konularda sunulan seminerler ile öğrencilerin

bakış açılarının genişletilmesinin yanısıra, öğrenciler tarafından

tez konularında hazırlayacakları sunumlar vasıtasıyla konferans

ve toplantılarda nasıl sunum yapılacağı konusunda teknik ve

pratik çalışmalar



Ölçme Yöntemleri

1) Biyoteknolojide gelişen alanlar konusunda yapılan araştırmalar ve şirketkerde yürütülen AR-GE çalışmaları konusunda bilgi sahibi olmak.

7,8,9 1,2 C





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1-14

Biyoteknolojide gelişen teknoloji alanında çalışmalar yapan

konuk bilim adamları yada şirketkerden AR-Ge sorumluları

tarafından verilen seminerler. Sunum

KAYNAKLAR

Ders Kitabı -

Diğer Kaynaklar

Biyoteknolojide gelişen teknoloji alannda çalışmalar yapan konuk

bilim adamları yada şirketkerden AR-Ge sorumlularının verdikleri

seminerlerden alınan notlar.

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar Biyoteknolojide gelişen teknoloji alannda çalışmalar yapan konuk bilim adamları yada şirketkerden AR-Ge sorumlularının verdikleri seminerlerden alınan notlar.

Ödevler Öğrenciler en çok ilgi duydukları bir seminar hakkında ödev hazırlarlar.

Sınavlar -



Ödev 1 100

Toplam 100

Final Sınavının Başarıya Oranı -


Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Uzmanlık Dersleri



1 2 3 4 5








X


X


X





Ders Süresi (Sınav haftası dahildir: 14x toplam ders saati)

14 1 14


Ara Sınav - - -

Laboratuvar - - -

Ödev 1 3 3

Proje - - -

Final Sınavı - - -




DERS BİLGİLERİ


Kredi AKTS

Yüksek Lisans Tezi BTEC 600 3-4 1 + 0 0 30

Ön Koşul Dersleri


Dersin Seviyesi Doktora



Prof. Dr. Fikrettin Şahin

Dersi Verenler Tez danışmanı öğretim üyesi


STAJ YOK

Dersin Amacı

Biyoteknoloji alanındaki bir konuyla ilgili yeni ve özgün bir

çalışmayı bütünlük içerisinde tamamlamak. Öğrencinin bir

çalışmanın gerçekleştirilmesi için gerekli olan öğelerin neler

olduğunu anlaması ve bilginin kullanılmasını öğrenmesidir.

Dersin İçeriği

Tez çalışmasının gerekliliğine göre biyoteknolojinin herhangi bir

alanındaki güncel bilimsel çalışmalara ulaşılması, yorumlanması,

bu bilgilere göre çalışmanın şekillendirilmesi ve uygun deneyler

yaparak verilerin elde edilmesi ile bunların yorumlanarak sonuca

ulaşılmasıdır.



Ölçme Yöntemleri

Tez çalışması sırasında yapılacak olan deneylerle ve bunların yorumlanmasıyla elde edilecek bilgi ve tecrübe birikimi

1,2,3,4,5,6,7,8,9 2, 3 B, D





DERS İÇERİĞİ


Malzemeleri

1-14

Tez çalışması sırasında yapılacak olan deneylerle ve bunların

yorumlanmasıyla elde edilecek bilginin yorumlanması Bilimsel makaleler

KAYNAKLAR

Ders Kitabı -

Diğer Kaynaklar -

MATERYAL PAYLAŞIMI

Dökümanlar -

Ödevler -

Sınavlar -



Ara Sınav

Laboratuvar 14 50

Ödev

Proje 1 50

Toplam 100



Toplam 100

DERS KATEGORİSİ Zorunlu Ders



1 2 3 4 5



X


X


X


X


X


X


X


X


X





Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme)

Ara Sınav

Laboratuvar

Ödev

Proje





Dersler İle Biyoteknoloji Y.Lisans Programı Öğrenme Çıktıları İlişkileri

BTEC PO 1 PO 2 PO 3 PO 4 PO 5 PO 6 PO 7 PO 8 PO 9 PO 10

501 4 2 4 4 2 5 504 5 4 5 5 5 505 4 5 5 4 4

506 4 5 5 5 507 5 5 5 510 5 5 5 511 3 5 5 2

512 4 4 3 5 5 513 5 3 5 5 5 5

514 5 5 5 5

516 3 5 5 5 517 5 5 4 4

519 4 4 521 5 4 4 5 4

528 4 5 5 5 5

532 3 5 4 5 4 4

533 4 2 5 4 534 4 3 3 5 535 4 5 5 5 537 5 4 5 4 4 538 5 4 539 5 3 550 5 5 5 5 5 4 582 5 3 5 5 5 5

584 5 3 5 5 5 5

585 2 3 5 5 5 5 5 5 5

586 5 4 3 3 4 4 4

590 5 5 5

600 5 5 3 3 4 5 5 5 5 4

Documents

Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programının Amacı ve Hedefi ...fbe.yeditepe.edu.tr/files/Bologna Paketi Yeni/Biyoteknoloji/BTEC... · dermal ve oküler dozaj ekilleri, farmakokinetik