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¿Cuál es la estabilidadrelevante de las proteínas?
R. Godoy-Ruiz, J.M. Sánchez-Ruiz,I.E. Sánchez
Laboratorio defisiología proteica
Sí, pero ¿a quiénle importa?
Dobson and Karplus 1999
Proteínas de 2 estados
E.T.
ΔGunfoldingΔGfolding
ΔGequilibrium
Proteínas de 2 estados
E.T.
ΔGunfoldingΔGfolding
ΔGequilibrium
Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)
Proteínas de 2 estados
E.T.
ΔGunfoldingΔGfolding
ΔGequilibrium
Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)
Estabilidad cinética(Godoy-Ruiz 2006)
Proteínas de 2 estados
E.T.
ΔGunfoldingΔGfolding
ΔGequilibrium
Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)
Estabilidad cinética(Godoy-Ruiz 2006)
Folding(Shakhnovich 1996)
Cómo medir presiones evolutivas(Steipe 1994)
• Las proteínas homólogas compartensimilares requerimientos evolutivos
• Cada posición del alineamiento evoluciona deforma independiente
• Las distribuciones de residuos han alcanzadoel equilibrio
!
""GevoluciónLeu22Ala = #RTln
fracciónFamiliaXAla22
fracciónFamiliaXLeu22
$
% & &
'
( ) )
Proteínas de 2 estados
22 proteínas, 583 mutaciones
Estabilidad Folding Unfolding
Proteínas de 2 estados
22 proteínas, 583 mutaciones
Estabilidad Folding Unfolding
Proteínas de 2 estados
22 proteínas, 583 mutaciones
Estabilidad Folding Unfolding
Fisiológicas No fisiológicas
Unfolding 5 proteínas, 139 mutaciones
Efecto de las mutaciones en distintascondiciones de desplegamiento
Proteínas de 3 estados
ΔGNU
ΔGIU
ΔGNI
Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)
Proteínas de 3 estados
ΔGNU
ΔGIU
ΔGNI
Estabilidad respecto al intermedio(Sancho 2002)
Estabilidad termodinámica(Steipe 1994)
Proteínas de 3 estados
N vs. U I vs. U N vs. I
4 proteínas, 61 mutaciones
Proteínas de 3 estados
N vs. U I vs. U N vs. I
4 proteínas, 61 mutaciones
Proteínas de 3 estados
N vs. U I vs. U N vs. I
4 proteínas, 61 mutaciones
Conclusiones
• Proteínas de 2 estados
• Proteínas de 3 estados
• ¡Queda mucho por explorar!
Estabilidad Folding Unfolding
N vs. U I vs. U N vs. I
Laboratorio defisiología proteica
www.proteinphysiologylab.tk
Universidad de Buenos Aires, FCEyN, Departamentode Química Biológica
Diego U. Ferreiro, Ignacio E. Sánchez
Objetivo: integrar información de secuencia, estructuray función para entender cómo las proteínasresponden de forma compleja a estímulos.
Folding