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DEPARTAMENTO DE INGENIERIA GENÉTICA Ariel Alvarez Morales Bioseguridad

DEPARTAMENTO DE INGENIERIA GENÉTICA - Consejo Nacional … · 2015-06-19 · DEPARTAMENTO DE INGENIERIA GENÉTICA En la Encuesta sobre Percepción Pública de la Ciencia y Tecnología

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Ariel Alvarez Morales Bioseguridad

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Generación de Productos Biotecnológicos en los Centros de

Investigación: Aspectos regulatorios.

Al contrario de las grandes corporaciones biotecnológicas cuyo objetivo

fundamental es generar bienes que produzcan riqueza, los Centros Públicos

de Investigación (CPI) en general están dedicados a: 1) la generación de

conocimiento científico/técnico, 2) la formación de recursos humanos y 3) la

obtención de productos que contribuyan con el desarrollo del país, ya sea

generando productos que requiera el Estado y que pueden tener un objetivo

social, o bien productos que generen nuevas empresas de base tecnológica.

Sin embargo en el caso de los CPI, además de tener que establecer sus

prioridades entre las tres actividades antes mencionadas, atendiendo a los

requerimientos propios del sistema, cuando abordan la posibilidad de generar

productos biotecnológicos, se encuentran ante una regulación hecha

principalmente para atender a las grandes corporaciones y no pensadas como

instrumento de fomento al desarrollo nacional. Esta problemática se discutirá

ampliamente durante la presentación.

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

En la Encuesta sobre Percepción Pública de la Ciencia y Tecnología en México, realizada por el INEGI y Conacyt en 2011, un 49 por ciento de los encuestados consideró que el desarrollo científico y tecnológico puede dañar al planeta, aunado a ello, 80 por ciento reconoció confiar demasiado en la fe y muy poco en la ciencia; sin embargo, 77 por ciento consideró que en México debería haber más personas trabajando en áreas de investigación.

PND 2013-2018 Estrategia 4.10.4. Impulsar el aprovechamiento sustentable de los recursos naturales Líneas de acción del país. Promover la tecnificación del riego y optimizar el uso del agua. Impulsar prácticas sustentables en las actividades agrícola, pecuaria, pesquera y acuícola. Establecer instrumentos para rescatar, preservar y potenciar los recursos genéticos. Aprovechar el desarrollo de la biotecnología, cuidando el medio ambiente y la salud humana.

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La Unidad Irapuato del CINVESTAV

En 1981 se crea la Unidad Irapuato del CINVESTAV

En 1986 se establece el Departamento de Ingeniería Genética

En 2005 se crea el Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad

En 2009 se ocupan las nuevas instalaciones del LANGEBIO

DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Misión: "Contribuir de manera destacada al desarrollo de la sociedad y la preservación del ambiente, mediante la investigación trascendente y la formación de investigadores y expertos en biología y biotecnología de plantas en su entorno” Visión: "Ser un grupo competitivo a nivel internacional en biología, genómica y biotecnología vegetal; contribuyendo a la solución de problemas nacionales”

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Número de liberaciones (y movilizaciones) experimentales: 17

Especies liberadas: 7

Maíz, Jitomate, Plátano, Papa, Arabidopsis, Tabaco, Trigo

Fenotipos: 5

Experimentación, Res. Virus, Res. Hongos, Prod. Vacunas,

Periodo: 1992 – 2004

1996 – última solicitud de liberación (excepto plátano)

Moratoria para el maíz - 1998

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Las obligaciones y prioridades de los investigadores en los CIP son:

Generación de conocimiento científico de vanguardia

Publicaciones en revistas arbitradas de alta calidad

Generación de estudiantes graduados

Obtención de fondos para investigación

Participar en programas de docencia

Participar en comités científicos

Las recompensas de llevar a cabo las actividades anteriores con calidad son:

Pertenecer al Sistema Nacional de Investigadores

Obtener y mantener becas y sobresueldos

Obtener reconocimientos y premios

Facilidad para obtener fondos para investigación

Facilidad para conseguir estudiantes

GENERALMENTE LOS DESARROLLOS TECNOLÓGICOS NO SON COMPATIBLES CON LAS ACTIVIDADES ACADÉMICAS QUE GENERAN VALOR DIRECTO A LOS CENTROS Y A LOS

INVESTIGADORES

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Generalmente se parte de una pregunta con propósito científico

¿Qué genes se expresan durante una infección con virus?

¿Cuáles genes están involucrados en la tolerancia a Al?

¿Qué genes participan en el proceso de maduración?

Se aborda el problema con herramientas y procedimientos científicos propios

de las instituciones académicas.

Se utilizan organismos modelo y elementos genéticos (incluyendo genes)

disponibles, comerciales o solicitados a colegas.

El trabajo lo hacen estudiantes de postgrado.

Los proyectos se restringen a la generación de conocimiento para elaborar

una tesis y un artículo.

Existe un tiempo determinado y un presupuesto finito para obtener los

resultados planteados.

No se contemplan opciones, ni de tiempo ni de recursos, para generar otro

tipo de información que no sea estrictamente necesaria para la obtención

de los resultados planteados

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Si la información científica básica sugiere la posibilidad de tener

una aplicación práctica, con lo que normalmente cuenta el

investigador es:

• Múltiples eventos de un organismo modelo GM con un fenotipo

interesante • Generalmente la construcción va a incluir un gen marcador utilizado

para seleccionar las plantas transformadas

• Utilización de elementos tales como el p35S y terminador NOS

• Amplio conocimiento del sistema (niveles de expresión, número de

copias, estabilidad, etc.) y los mecanismos de acción.

Con lo que normalmente NO cuenta el investigador es:

• Un organismos que pueda ser utilizado de manera comercial

• Una construcción genética que sea atractiva para los posibles

usuarios y para los reguladores • Datos tales como inocuidad (toxicidad/alergia), variedades homocigotas,

análisis proximales, efectos sobre organismos no-blanco, etc.

• Conocimiento para abordar la tramitología regulatoria

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Asumiendo que va a utilizar su organismo modelo para liberarlo al

campo y probar su concepto, las implicaciones son las siguientes:

Obtener nuevas transformantes con elementos cisgénicos y evitar el uso

de marcadores de selección.

Obtener variedades homocigotas

Datos de toxicidad/alergia

Análisis proximales

Caracterización fenológica completa

Efecto sobre organismos no-blanco

Si el investigador tiene 20 eventos independientes que ya filtró a

través de evaluaciones en condiciones de contención:

¿Deberá generar todos los datos anteriores para cada evento que

desee evaluar en campo?

¿Deberá generar solicitudes y pagar derechos para cada evento?

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Una investigación llevada a cabo en el Departamento de

Ingeniería Genética del Cinvestav Irapuato.

Laboratorio de Genética y Biología Molecular de la Interacción

Planta-patógeno

Investigador Responsable: Ariel Álvarez-Morales

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Pseudomonas syringae pv phaseolicola (Gram -)

Uno de 50-55 patovares descritos

Produce una toxina no específica de hospedero

Phaseolus vulgaris L.

Tizón de Halo

Enfermedad de climas templados

Importancia económica “media”

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Faseolotoxina: Toxina no-específica Mata los tejidos infectados Promueve la diseminación sistémica

(Mitchell, 1976)

Residuo

Sulfo diaminofosfinil

Ornitina alanina homoarginina

NH2+

| |

NH – C – NH2

|

NH2 NH3+ O CH3 O (CH2)4

| | | | | | | | |

-O3S – NH - P- NH - CH2 - CH2 - CH2 - CH - C – NH – CH – C – NH – CH – COO-

| |

O

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

PSOrn

[N-(N´-sulfo-diaminofosfinil)-L-ornitnina

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Síntesis de Citrulina

PSOrn

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Modo de acción de la faseolotoxina

Cloroplasto

Célula vegetal

Ornitina Citrulina

Carbamoilfosfato

OCTasa

Citrulina Arginina

Faseolotoxina

PSOrn

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Mecanismo de inmunidad a faseolotoxina

16-20°C

28-30°C

¿Son dos enzimas diferentes o una sola que sufre

alguna modificación postranscripcional?

R OCTasa

?

?

Ptx OCTasa S

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Banco genómico de P.syringae pv phaseolicola

Complementación de E. coli TB2 (argI argF) Arg-

Aislamiento de 2 tipos de clonas que complementaron el fenotipo Arg-

Tipo 1.- OCTasa sensible a faseolotoxina - argF

Tipo 2.- OCTasa resistente a faseolotoxina - argK

argK y argF no hibridan

argK presenta un contenido de G+C diferente al resto del genoma de P.s. phaseolicola

Transferencia horizontal

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

De la Fuente et al. 1992 Hatziloukas et al. 1992

El gen argK se modifica para su correcta expresión en plantas

• Transcripción a partir del promotor 35SCaMV y terminador NOS

• Péptido de tránsito para dirigir la OCTasaR al cloroplasto

Hoja de frijol Wt Hoja de frijol transgénica

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

SI K 1 2 3 4 5 6 7 8 D 10 11 12 13 Am 15 16 17 18 19 SI Tp B A

Sir

inc

Tp

Sir

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Solo hay una copia del gen argK en el frijol transformado La OCTasa es una enzima ubicua Aunque la expresión es constitutiva, la síntesis de citrulina y otros aminoácidos no se altera ya que la regulación de los aa es por producto final No hay antecedentes de que una enzima involucrada en el metabolismo primario pueda ser tóxica o alergénica El gen argK es de localización nuclear en frijol, pero la enzima se sintetiza en el citoplasma y se transporta al cloroplasto y allí actúa

En 1992 solo se reportaron tres plantas transformadas y se evalúo un solo evento en cámara de crecimiento

Actualmente se ha mejorado el sistema de regeneración in vitro de frijol y se pueden obtener muchos más eventos. Se requeriría llevar al campo al menos 15-20 eventos diferentes en la primera etapa de liberación en campo para seleccionar aquel (aquellos) evento(s) que pudieran usarse en un programa de fitomejoramiento.

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Para solicitar un permiso de liberación experimental para 20 eventos ¿Tendría que pagarse derechos por cada evento aunque se eliminen hasta el 80% de los mismos después de un solo ensayo? ¿Se debe obtener la caracterización molecular completa de los 20 eventos? ¿Se tienen que hacer análisis proximales para los 20 eventos? ¿Se tienen que hacer análisis de eficiencia en la fijación de nitrógeno para los 20 eventos?

¿Cuánto tiempo y recursos debe invertir el investigador para probar un concepto, que quizá NO se use?

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Las obligaciones y prioridades de los investigadores en los CIP son:

Generación de conocimiento científico de vanguardia

Publicaciones en revistas arbitradas de alta calidad

Generación de estudiantes graduados

Obtención de fondos para investigación

Participar en programas de docencia

Participar en comités científicos

Las recompensas de llevar a cabo las actividades anteriores con calidad son:

Pertenecer al Sistema Nacional de Investigadores

Obtener y mantener becas y sobresueldos

Obtener reconocimientos y premios

Facilidad para obtener fondos para investigación

Facilidad para conseguir estudiantes

En este contexto, ¿cuánto tiempo y recursos va a considerar invertir el investigador?

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

Las leyes, reglamento y normas ya están escritos (no todas pero las principales para las liberaciones en campo) Se tomaron en consideración ¿el PND, el PECTI, el mandato y la misión de los CIP, las recomendaciones de la OCDE? ¿Está alineado y siendo congruente el Gobierno Federal o cada instancia sólo ve sus intereses?

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DEPARTAMENTO

DE INGENIERIA

GENÉTICA

¿QUÉ PODEMOS HACER PARA QUE LA REGULACION NO SEA UN ELEMENTO QUE INHIBA, SINO QUE ESTIMULE EL DESARROLLO BIOTECNOLÓGICO? ¿CÓMO EQUILIBRAR EL OBJETO DE LA LEY CON LA REALIDAD DE NUESTROS CIP? ¿PODEMOS TENER UNA REGULACION QUE ESTÉ BASADA MÁS EN ELEMENTOS CIENTÍFICOS QUE ESTRICTAMENTE REGULATORIOS? ¿HASTA DONDE PUEDE SER FLEXIBLE LA REGLAMENTACIÓN? LOS CIP NO BUSCAN PRIVILEGIOS, BUSCAN AYUDA, COLABORACIÓN Y QUE SE ENTIENDA SU QUEHACER

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DE INGENIERIA

GENÉTICA

R. Ariel Alvarez Morales Laboratorio de Bioseguridad y Evaluación de Riesgo [email protected]