ENTEROBACTERIACEAE

LES ENTEROBACTERIACEAE

Hortense GONSU KAMGAFMSB / CHU-Yaoundé

GENERALITES SUR LA FAMILLIE DES ENTEROBACTERIACEAE

OBJECTIFS Etre capable de classer les Entérobactéries Connaître les caractères généraux des Entérobactéries Etudier le profil de sensibilité des Entérobactéries vis-à-vis des antibiotiques

PLAN

I- HABITATII-MORPHOLOGIEIII-CULTUREIV-CARACTERES BIOCHIMIQUESV- CARACTERES ANTIGENIQUESVI-CONCLUSION

I-HABITAT

-Bactéries généralement hôtes normaux ou pathologiques, suivant les espèces microbiennes , du tube digestif de l’homme et des animaux

-Certaines sont responsables d’infections humaines parfois sévères(fièvre typhoïde ,dysenterie bacillaire ,peste …)

-D’autres groupes prolifèrent en abondance dans l’environnement (sol , eau )

II- MORPHOLOGIE

-Bacilles asporulés à Gram négatif-2 à 4µm de long sur 0,4 à 0,6µm de large-Extrémités arrondies-Bactéries mobiles à ciliature péritriche-D’autres sont toujours immobiles

(Klebsiella ,shigella Yersinia pestis)-Présence d’une capsule visible au microscope

(Klebsiella)

III-CULTURE

- Cultivent facilement sur milieux ordinaires.- Exigences nutritionnelles généralement

réduites.- Sur milieux gélosés , les colonies sont

habituellement lisses ,brillantes de structure homogène de 2 à 3mm de diamètre.

IV-CARACTERES BIOCHIMIQUES

- Aérobies – anaérobies facultatifs.- Oxydase négative.- Réduisent les nitrates en nitrites.- Utilisent les sucres par métabolisme

fermentatif, avec ou sans production de gaz.- Catalase positive.

V-CARACTERES ANTIGENIQUES

Les Enterobactériaceae possèdent:- Un antigène commun (antigène de Kunin).- Des antigènes de paroi ou antigène O. »

tjrs présents »- Des antigènes de capsule ou de surface ou

antigène K. - Des antigènes flagellaires ou antigènes H.L’étude de ces différents antigènes permet

de classer en sérotypes les bactéries appartenant à une espèce ou à un genre.

SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES

SENSIBILITE HABITUELLE AUX ATB1-Résistance naturelle à certaines familles

d’ATB hydrophobesß-lactamines * PéniG/V* Péni MMacrolides: ErythromycineLincosamides : lincomycine, clindamycineSynergistines: pristinamycineGlycopeptides : teicoplanine, vancomycine


SENSIBILITE HABITUELLE AUX ATB2-Mais encore nombreux ATB actifsß-lactamines * Péni à large spectre* Inhibiteurs de ß-lactamases* Carbapénèmes * Céphalosporines 1G, 2G, 3G* MonobactameAminoglycosidesTétracyclines 1G, 2G, 3G


SENSIBILITE HABITUELLE AUX ATB2-Mais encore nombreux ATB actifsPhénicolés:

Chloramphénicol,ThiamphénicolQuinolones: classiques et

fluoroquinolonesSulfamides: SulfaméthoxazoleAutres : Trimethoprime,Co-trimoxazole,

Nitrofuranes, FosfomycinePolypeptides cycliques


PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLE*Intérêt taxonomique de l’antibiogramme*Grande diversité de sensibilité ou de résistance naturelle

selon les groupes ou espècesß-lactamines * Groupe1: E.coli, P.mirabilis, Salmonella,

Shigella * Groupe 2: pénicillinase (Pase) bas niveau K. pneumoniae, K. oxytoca,E. hermannii,

C.koseri (C.diversus, Levinia…)


PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLEß-lactamines * Groupe 3: E.cloacae, E.aerogenes,

S.marcescens, C.freundii, Morganella morganii Céphalosporinase(Case) avec diverses

expressions * Groupe 4: pénicillinase + céphalosporinase:

Yersinia enterocolitica (pathogène)* Groupe 5: BLSE de bas niveau:

P.vulgaris,P.penneri, Serratia fonticola, Kluyvera ascorbata,Rhanella aquatilis, Citrobacter sedlakii….

Céphalosporinase sensible à l’acide clavulanique


PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLEAutres ATB

* AminoglycosidesSensibles naturellement, sauf S.marcescens* QuinolonesSensibles naturellement avec un gradient

d’activité* Autres: Fosfomycine: moindre activité de

K. pneumoniae et de K.oxytoca


PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLEAutres ATB * Polypeptides cycliques: sensibles

naturellement sauf Proteus-Providencia-Morganella (résistance homogène)

Serratia marcescens (résistance hétérogène)

* Trimethoprime faible sensibilité des Proteus-Providencia

* Tétracyclines: sensibles naturellement sauf P.mirabilis


CONCLUSIONS Nécessaire à connaître dans la validation

biologique: cohérence ou incohérence avec identification proposée

Grande difficulté apparente d’autant qu’il y a divers phénotypes de résistance naturelle

Grande difficulté apparente d’autant qu’il y a aussi les phénotypes de résistance acquise

Systèmes – experts avec automates apparaissent une solution d’avenir (labo à grosse clientèle)

VI-CONCLUSIONL’étude des caractères morphologiques et

biochimiques permet de définir l’appartenance à la famille des Entérobactériaceae.

La famille des entérobactéries regroupe les genres suivants:

Escherichia coli-Alkalescens-Citrobacter-Levinea;

Klebsiella-Entérobacter-Serratia-Hafnia(groupe KESH)

Proteus;Salmonella;Shigella;Yersinia;

ESCHERICHIA COLI

OBJECTIF:Connaître les caractères d’identification

des Escherichia coli.

PLAN

I- HISTORIQUEII-HABITATIII- POUVOIR PATHOGENEIV-CARACTERES MORPHOLOGIQUESV-CARACTERES CULTUTAUXVI-CARACTERES BIOCHIMIQUESVII-PROPRIETES ANTIGENIQUESVIII- DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE

I-HISTORIQUELes Escherichia coli ou colibacilles ont été

découverts par Escherich en 1885.Ils sont à la fois de banals saprophytes de

l’intestin et d’indiscutables agents pathogènes

II-HABITAT-Hôtes normaux de l’intestin;-Peut également être retrouvé au niveau de

diverses muqueuses ;-Présent dans l’environnement

III-POUVOIR PATHOGENE

Espèce la plus fréquemment isolée dans le laboratoire de bactériologie

Infections de 2 types:♦ Infections extra-intestinales• voies urinaires+++• voies génitales et biliaires• septicémies

III-POUVOIR PATHOGENE

♦ Infections du tractus digestif dues à des souches particulières:

• Les ECEP: E.coli entéropathogènes responsables de gastroentérites infantiles

• Les ECEI: E.coli entéro-invasifs qui ont la propriété de pénétrer dans les cellules et de provoquer des syndromes dysentériformes

• Les ECET: E.coli entérotoxinogènes qui sécrètent des toxines de 2 types:ST (thermostable) et LT (thermolabile);possède des facteurs d’adhésion à la muqueuse intestinale, souches responsables de syndromes cholériformes.

IV-CARACTERES MORPHOLOGIQUES

Bacille Gram négatifGénéralement à mobilité péritriche2 à 6ùm de long1,5mm de diamètre des colonies en culture

V-CARACTERES BIOCHIMIQUES

Les E. coli sont:Oxydase -Nitrate réductase +Glucose +Lactose+Urée -Indole +Citrate-VP-

V-CARACTERES BIOCHIMIQUESLysine décarboxylase +ODC +ADH-

VI-CARACTERES CULTURAUXLa plupart des souches d’E.coli se

multiplient rapidement sur gélose ordinaire.Les colonies de 1,5 à 2mm de diamètre ont

un aspect : -Rond à bord régulier -Lisse

VI-CARACTERES CULTURAUXLes souches atypiques:2 à 3% des E coli forment des colonies

naines ; on parle dans ce cas des E coli thymine less.

Dans ce cas ils ne se multiplient que sur le Muller Hinton + 5% de sang (la pousse est normale)

>1% de E coli donnent des colonies muqueuses bombées avec une tendance à confluer.

Ces bactéries sont immobiles et entourées d’une capsule polysaccharidique.

VII-CARACTERES ANTIGENIQUES

Les Ag somatiques ou Ag O: ce sont les lypo polysaccarides de surface.

Les Ag flagellaires ou Ag H: valables pour les bacilles mobiles.

Les Ag capsulaires ou Ag K: Les Ag communs ou Ag F1 ou fimbriae type

1: Les souches qui produisent les Ag F1 sont hémagglutinantes

VIII- DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE

1) PRELEVEMENT

- Eviter toute contamination;- Respecter les règles de prélèvement- Généralement ne nécessite pas de milieu

de transport : car aéro-anaérobie facultative


2) EXAMEN DIRECT

- Etat frais (observer mobilité)-Coloration de Gram: bacille Gram négatif


3) ISOLEMENT

-Choix du milieu de culture en fonction du prélèvement .

CLED pour ECBUMac ConkeyDrigalskiEMB (reflet métallique)

VIII- DIAGNOSTIC BIOLOGIQUE4) IDENTIFICATION

-Tests biochimiques:Galerie classique (en tubes)Galerie API 20E

5) ANTIBIOGRAMMEBien choisir l’éventail d’antibiotiques

6) AUTRESPCRTests d’ amplification génique

MERCI

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