FDT probabilisztikus traktográfia 3.

1

2

3

5

6

1: a már feldolgozott, BedpostX-bedpostX könyvtár útvonala

2: SEED maszk. Esetünkben a Harvard-Oxford atlasz egy régiója.

3: A "seed space is not diffusion" kapcsoló beállitásával ÉS a NONLINEAR bekapcsolása jelzi azt, hogy nemlináris transzformáció történt (warp).

4: Két, ún. warp-field megadása kötelező. Az egyik a referenciaképet regisztrálja a diffúziós képhez, a másik ennek inverze (invwarp parancs).

ref2diff-warpdiff2ref-warp

(javasolt nomenklatura)

5-6: Classification targets. Több TARGET kijelölése, amelyekhez egyenként kiszámolja a SEED voxeleinek kapcsolati valószinüségét.

A TARGET maszkok listán történő

megadása is lehetséges, egy egyszerü text file szerkesztésével.

7: Traktográfia kimenő könyvtára..

Cél: SEED terület klasszifikációja TARGET régiók alapján. Olyan képek előállitása, amelyek a TARGET-be való eljutás valószinüségét mutatják a SEED terület minden voxelén. Lehetővé teszi a konnektivitás-alapú szegmentációt (find_the_biggest parancs).

Eredmények

fdt_paths.nii.gz : MINDEN, a SEEDből származó tract.

seeds_to_TARGET.nii.gz : minden egyes TARGET-hez tartozó SEED valószinüségi térkép.

targets.txt: a TARGETek neve.

waytotal.txt: összesitett részecskeszám

4

7

Egy "seeds_to_target" kép (thalamus - precentral gyrus kapcsolat)