Fenotipo

Regolazionepost-trascrizionale

Regolazionepost-traduzionale

Citoplasma

ProteinaDNA RNA

Nucleo

Regolazionetrascrizionale

Stabilità TrasportoMaturazione

Traduzione

Modificazione

Modulazionefunzionale

Double Dimension Protein Gel

Quantizzazionedell’espressionegenica

REGOLAZIONE GENICA

Durante lo sviluppoIn risposta a stimoli ambientali

DIAGNOSTICA

Tessuti malati/tessuti sani

Profili di espressione dei tumori

Organizzazionedel genoma

Ibridazione genomica comparativa

Immunoprecipitazione della cromatina

Screening di mutazioni

Total RNA

Affinitypurification

mRNA

Reverse transcription

dNTP (33P, Cy3, Cy5, Biotin)

Affinitypurification

mRNA

T7 promoter - poliTpoliA

Reverse transcription

Transcription

T7 promoter Random primerLabeling

SIGNAL

AMPLIFICATION

DENDRIMERS

cDNA

Software: “sovrapposizione”

e “normalizzazione”

Marcaturaradioattivabiotina

IMMAGINE FINALE COMPUTERIZZATA ANALISI DEI DATI

Microarrays

NT

IRR

Controllo Condizione

<<<<<<<<<<<<<<<<<<

+1.99

-3 and less +3 and greater-1.99

RNR4

HSP26

CUP1

ADH1

ERG5

28S

HHF1

RNR2

RNR3

TTR1K

699

wt

DM

P1497

/2b rad53

YLL15

0 rad6

400 808080 NTNTNT

-4 -2 0 2 4 6 8

-4

-2

0

2

4

6

8

mR

NA

irra

diat

o/no

n ir

radi

ato

(Gen

e Fi

lter

mic

roar

rays

)mRNA irradiato/non irradiato (Northern Blot)

CUP1

NT 0 15'30'1h 2h 4h

0 50 100 150 200 250

0.5

1.0

1.5

2.0

2.5

3.0

3.5

CUP1

CYC7

RNR4

HSP26

mR

NA

irra

diat

o / n

on ir

radi

ato

tempo (min)

K-mean clustering

DNA-proteinCrosslink

Lisi Frammentazione

ImmunopurificazioneIdentificazione DNA purificato

Transcriptional regulatory networks in Saccharomyces cerevisiae.

Lee TI, Rinaldi NJ, Robert F, Odom DT, Bar-Joseph Z, Gerber GK, Hannett NM, Harbison CT, Thompson CM, Simon I, Zeitlinger J, Jennings EG, Murray HL, Gordon DB, Ren B, Wyrick JJ, Tagne JB, Volkert TL, Fraenkel E, Gifford DK, Young RA.

Science 2002 Oct 25;298(5594):763-4

enomica

unzionale e

roteomica

Facoltà di Scienze MMFFNN Centro di Ricerche di