GenomskaGenomska selekcija pri rjavi pasmi selekcija pri rjavi pasmi

v Slovenijiv Sloveniji

doc. dr. Klemen Potočnik

Preska, četrtek, 18.12.2013

ZVEZA REJCEV GOVEDI RJAVE PASME SLOVENIJE

Biotehniška fakulteta

Univerza vLjubljani

Lastnosti povezane s kakovostjo proizvodovLastnosti povezane s kakovostjo proizvodov

A 30

Beta – laktoglobulin

Kapa kazein

Beta kazein

MK ω-3 : ω-6 = 1 : 2-3

Kapa kazeinKapa kazein

Možne genetske oblike alela: B, A, E,..

Rjava pasma praviloma le A in B

Primerjava genotipa AA : BB

◦ cca. 25 % daljši čas koagulacije

◦ cca. 50% manjša čvrstost koaguluma

◦ cca. 10% manjši izplen sira

Npr. 6000 l/lak × 5 lak = 30000 l ≈ 3000 kg sira

Razlika cca. 7 % = 210 kg sira × 5€ = 1000 €

Beta kazeinBeta kazein

◦ Original A2

◦ Mutacija A2 v A1 (nekaj 1000 let nazaj)

◦ Razlike med populacijami

◦ HOL 50-50

◦ GUE < 10% A1

◦ BSW ~ 25%

◦ SIM ????

Etiologija:

diabetes tipa 1,

ishemična bolezen srca,

kot modifikator nevroloških bolezni (avtizem)

InterGenomicsInterGenomics –– DGV DGV -- GEBVGEBV Lastnosti

◦ Enako kot za Interbull Mlečnost

Dolgoživost

Telesne lastnosti

Somatske celice

Iztok mleka

Servis

◦ Pomlad 2013 57 bikov – MD

◦ Trenutno v teku 34 bikov- MD

2 telički – MD

4 teličke - LD

120 € + DDV

80 € + DDV

Kapa kazein + 10 €

Beta kazein + 10 €

BH2?

Rezultati zadnjega obračunaRezultati zadnjega obračuna

DGV – direktne genomske PV

◦ PV po lastnostih

◦ Parametri genotipizacije

Dodatno

◦ Kapa kazein

◦ Beta kazein

Rezultat

◦ Genomski izvid

◦ Priloge – še v razvoju

Potek obračuna Potek obračuna

Zaključeno zbiranje vzorcev

◦ 1. teden oktobra

Posredovanje vzorcev v laboratorij

◦ 2. teden oktobra

Rezultati iz laboratorija

◦ 2. teden novembra (kazeini do 4. tedna novembra)

Obdelava in posredovanje na Interbull

◦ 3. teden novembra

Prejem rezultatov Interbull - Intergenomics

◦ 1. teden decembra

Obdelava in priprava genomskih izvidov

◦ 2. teden decembra

Podatki zadnjega obračuna Podatki zadnjega obračuna

40 vzorcev

◦ 34 bikcev – 56 K čip

◦ 2 telički – 56 K čip

◦ 4 teličke – LD čip

Rezultati

◦ Kapa kazein

◦ Beta kazein

◦ DGV obračun

Kapa in beta kazein

Povezava med IBM in SSI -

KK

Povezava med IBM in SSI -

BK

Povezava med som.cel. in SSI -

BK

Povezava med dolg. in SSI -

BK

Genomski izvid

Genomski izvid

PODATKOVNO SKLADIŠČEPODATKOVNO SKLADIŠČE

Dostop do podatkovnega skladiščaDostop do podatkovnega skladišča

http://rodica.bf.uni-lj.si

Dostop do podatkovnega skladiščaDostop do podatkovnega skladišča

http://rodica.bf.uni-lj.si/govedo

Informacije o

posamezni živali

nacionalni obračun(i)

Informacije o

posamezni živali

Interbull obračun(i)

Prva stran

Splošne informacije o

obračunih

Statično

Pred pripravljeni izpisi

Dinamično

Izpis na zahtevo

Pripravljamo izpis za Pripravljamo izpis za

uporabnike

http://rodica.bf.uni-lj.si/govedohttp://rodica.bf.uni-lj.si/govedohttp://rodica.bf.uni-lj.si/govedo

____ __ _____________ __ _________HVALA ZA POZORNOSTHVALA ZA POZORNOST