Upload
duer
View
63
Download
1
Embed Size (px)
DESCRIPTION
Seminar Penelitian (KI-70Z2), 29 Agustus 2007. Haplogroup RFLP mtDNA Manusia Atas Dasar Posisi Mutasi Urutan Nukleotida Lengkap secara insilico. MASTURA NIM : 20504017. AGENDA PRESENTASI. Latar Belakang Tujuan Tinjauan Pustaka Metodologi Hasil dan Pembahasan Kesimpulan. Latar Belakang. - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
MASTURANIM : 20504017
Seminar Penelitian (KI-70Z2), 29 Agustus 2007
Latar Belakang Tujuan Tinjauan Pustaka Metodologi Hasil dan Pembahasan Kesimpulan
Peneliti terdahulu telah menggunakan metode RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism ) untuk menentukan haplogroup mtDNA manusia
Penelitian mengenai polimorfisme mtDNA manusia berdasarkan enzim restriksi telah berhasil mengelompokkan populasi asli Amerika menjadi haplogroup A, B, C, dan D (Torroni, et., al 1992).
Metode RFLP tidak menggunakan urutan nukleotida mtDNA manusia lengkap (16. 569 pb) dalam menentukan haplogroup
Penentuan haplogroup dengan RFLP hanya menggunakan daerah-daerah tertentu dari urutan nukleotida mtDNA
Contoh : daerah HVS I dan HVS II, daerah pengode (Coding region)
Reanalisis untuk haplogroup RFLP
Latar Belakang
Untuk melihat kesesuaian antara haplogroup RFLP dengan haplogroup yang ditentukan berdasarkan posisi mutasi dari urutan nukleotida lengkap menggunakan empat belas enzim restriksi endonuklase secara insilico
Mitokondria : organel sel eukariot organ respirasi ATP
Mitokondria Sifat genetik sendiri (mtDNA)
Polimorfisme yang tinggi laju mutasi tinggi
Pola pewarisannya spesifik, hanya dari ibu Sistem kode genetik mtDNA berbeda dengan
kode genetik DNA inti
DNA mitokondria manusia telah ditentukan urutannya secara lengkap oleh Anderson, 1981
Urutan ini dijadikan referensi atau acuan bagi penelitian-penelitian mtDNA : Cambridge Reference Sequence (CRS).
mtDNA manusia tersusun atas 16569-bp.
Genom mtDNA mengandung 37 gen yang terdiri atas 13 gen penyandi protein yang terlibat dalam fosforilasi oksidatif, 22 gen menyandi tRNA dan 2 gen menyandi rRNA (Arderson et al., 1981).
Tinjauan Pustaka
RFLP : analisis urutan DNA yang dipotong oleh enzim restriksi yang diketahui, enzim restriksi akan memeotong DNA pada lokasi yang tidak saling berhubungan.
Mutasi RFLP dilihat : hilangnya sisi pemotongan dari enzim restriksi tertentu(Loss) atau munculnya sisi pemotongan baru dari enzim restriksi (gain), yang dibandingkan dengan CRS
Haplogroup :cara pengelompokan berdasarkan perbedaan panjang pendeknya fragmen mtDNA yang dipotong oleh enzim resriksi
Tinjauan Pustaka
1.
2. Program MMA
Metode RFLP Loss (-)Gain (+)
Haplogroup
Urutan nukleotida lengkap mtDNA
Jenis dan posisi mutasi
Haplogroup Teoritis
Informasi tentang RFLP
Informasi ttng RFLP
Jumlah Haplogroup Jenis haplogroup Jumlah individu Sama dengan RFLP Tidak sama dengan RFLP
Satu haplogroupH dan F
H=120 & F =13133 95 38
Dua haplogroup
EH, HL, HV, HI, HU, HX, FH, DE (48, 46, 21, 5, 2, 2,
2, 2, 1) 129 107 22
Tiga haplogroupHJT, HIL, EHL, DEH, CEH
FHI, (80, 16, 15, 5, 2, 1)119 113 6
Empat haplogroup FHJT, HJLT, EHIL, EHJT,
AEHL, FHIL (19, 4, 3, 1,
1, 1)
29 29
584 individu
Dari 584 individu yang dianalisis : Yang sama dengan haplogroup RFLP :344
individu Yang tidak sama dengan haplpgroup RFLP :66
individu Yang tidak termasuk kehaplogroup manapun :
97 individu Terdapat 77 individu yang belum diketahui
suku bangsanya Dari semua sampel yang dianalisis yang paling
sesuai adalah individu yang memiliki satu haplogroup, yang lainnya tidak menunjukkan hasil yang spesifik