9
Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? Kristin Sæbø Pettersen PhD student Seksjon for Mattrygghet og Nye Helsetrusler Veterinærinstituttet

Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

  • Upload
    others

  • View
    1

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

Hvordan påvirkes Listeria

monocytogenes av synlig lys?

Kristin Sæbø Pettersen PhD student

Seksjon for Mattrygghet og Nye Helsetrusler

Veterinærinstituttet

Page 2: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

Hvorfor skal L. monocytogenes prioritere å reagere på lys – og hvorfor skal vi bry oss om det?

http://www.nature.com/ng/journal/v48/n3/full/ng.3515.html

https://ing.dk/sites/ing/files/topillustration/2017/09/fordampningenergi1.jpg

Page 3: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

Initielt eksperiment

https://www.slideshare.net/VaniJhaveri/vision-in-animals

Page 4: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

http://www.faculty.virginia.edu/rwoclass/astr1230/im/human-eye-crossec.jpg

Page 5: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

https://web.mst.edu/~microbio/BIO221_2010/L_monocytogenes.html

Page 6: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

Hvorfor ser vi dette? Hvilke gener bruker de når de utsettes for lys? (Transkriptomanalyse)

http://www.nature.com/scitable/content/ne0000/ne0000/ne0000/ne0000/105292327/44350_36a.jpg

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/pdb/2BKP

https://images.finncdn.no/dynamic/1280w/2017/8/vertical-5/30/6/103/375/_1447457110.jpg

https://www.spaniaidag.no/wp-content/uploads/2016/08/paella3-700x350.jpg

Page 7: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

2 409 signifikant regulerte gener, ca 80 %

Listeria monocytogenes

Hvordan finner vi hvilke gener bakterien uttrykker når den eksponeres for synlig lys?

Bearbeiding av sekvenser og sammenlikning med et referanse-genom

Sekvensering

Opptelling av antall sekvenser og statistisk analyse

Pathway function analysis

https://www.digikey.com/-/media/Images/Article%20Library/TechZone%20Articles/2017/July/Ultraviolet%20Radiation%20Attributes%20and%20Benefits/article-2017july-ultraviolet-radiation-fig1.jpg?ts=b76e4e6c-519f-45ce-a190-ffd45c8dc431&la=en-US

20 min = ca 8 s 180 min = ca 60 s

https://www.hegnar.no/var/hegnar/storage/images/8/3/1/2/1842138-1-nor-NO/55254_binary_12390_full_article.jpg

Page 8: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

Konklusjon

• Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning for

• Utvikling av nye bekjempelses-strategier for å

kontrollere L. monocytogenes i matindustrien • Tydelige responser – vi tror dette kan la seg utnytte • Vi jobber videre med å undersøke den praktiske nytteverdien

• Eksperimentell design – synlig lys er en vanskelig faktor å kontrollere, og den er ofte ikke tenkt på – potensiell bias! • Resultatene vi baserer oss på kan være påvirket av dette

Page 9: Hvordan påvirkes Listeria monocytogenes av synlig lys? · 2018. 11. 30. · Konklusjon •Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning

Acknowledgement

• Prosjektgruppen i Pathogens in the Food Chain, NFR 221663 –F40

• Medforfattere på «Shining Light on L. monocytogenes – a transcriptome analysis»

• Arvind YM Sundaram*, Taran Skjerdal **, Yngvild Wasteson ***, Toril Lindbäck ***, Anne Kijewski ***, Marina Aspholm ***

• *Norwegian Sequencing Centre, Department of Medical Genetics, Oslo University Hospital, Norway

• **Norwegian Veterinary Institute, Ullevålsveien 68, N-0450 Oslo, Norway

• ***Norwegian University of Life Sciences, Campus Adamstuen, Ullevålsveien 72, 0454 Oslo, Norway

• Terje Christensen, Statens Strålevern

• Ellen Christensen, Veterinærinstituttet

Food Micro, Berlin, September 2018; Posterpris på dette arbeidet