Upload
others
View
1
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Hvordan påvirkes Listeria
monocytogenes av synlig lys?
Kristin Sæbø Pettersen PhD student
Seksjon for Mattrygghet og Nye Helsetrusler
Veterinærinstituttet
Hvorfor skal L. monocytogenes prioritere å reagere på lys – og hvorfor skal vi bry oss om det?
http://www.nature.com/ng/journal/v48/n3/full/ng.3515.html
https://ing.dk/sites/ing/files/topillustration/2017/09/fordampningenergi1.jpg
Initielt eksperiment
https://www.slideshare.net/VaniJhaveri/vision-in-animals
http://www.faculty.virginia.edu/rwoclass/astr1230/im/human-eye-crossec.jpg
https://web.mst.edu/~microbio/BIO221_2010/L_monocytogenes.html
Hvorfor ser vi dette? Hvilke gener bruker de når de utsettes for lys? (Transkriptomanalyse)
http://www.nature.com/scitable/content/ne0000/ne0000/ne0000/ne0000/105292327/44350_36a.jpg
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/pdb/2BKP
https://images.finncdn.no/dynamic/1280w/2017/8/vertical-5/30/6/103/375/_1447457110.jpg
https://www.spaniaidag.no/wp-content/uploads/2016/08/paella3-700x350.jpg
2 409 signifikant regulerte gener, ca 80 %
Listeria monocytogenes
Hvordan finner vi hvilke gener bakterien uttrykker når den eksponeres for synlig lys?
Bearbeiding av sekvenser og sammenlikning med et referanse-genom
Sekvensering
Opptelling av antall sekvenser og statistisk analyse
Pathway function analysis
https://www.digikey.com/-/media/Images/Article%20Library/TechZone%20Articles/2017/July/Ultraviolet%20Radiation%20Attributes%20and%20Benefits/article-2017july-ultraviolet-radiation-fig1.jpg?ts=b76e4e6c-519f-45ce-a190-ffd45c8dc431&la=en-US
20 min = ca 8 s 180 min = ca 60 s
https://www.hegnar.no/var/hegnar/storage/images/8/3/1/2/1842138-1-nor-NO/55254_binary_12390_full_article.jpg
Konklusjon
• Bredspektret synlig lys induserer store endringer i L. monocytogenes og kan ha særlig betydning for
• Utvikling av nye bekjempelses-strategier for å
kontrollere L. monocytogenes i matindustrien • Tydelige responser – vi tror dette kan la seg utnytte • Vi jobber videre med å undersøke den praktiske nytteverdien
• Eksperimentell design – synlig lys er en vanskelig faktor å kontrollere, og den er ofte ikke tenkt på – potensiell bias! • Resultatene vi baserer oss på kan være påvirket av dette
Acknowledgement
• Prosjektgruppen i Pathogens in the Food Chain, NFR 221663 –F40
• Medforfattere på «Shining Light on L. monocytogenes – a transcriptome analysis»
• Arvind YM Sundaram*, Taran Skjerdal **, Yngvild Wasteson ***, Toril Lindbäck ***, Anne Kijewski ***, Marina Aspholm ***
• *Norwegian Sequencing Centre, Department of Medical Genetics, Oslo University Hospital, Norway
• **Norwegian Veterinary Institute, Ullevålsveien 68, N-0450 Oslo, Norway
• ***Norwegian University of Life Sciences, Campus Adamstuen, Ullevålsveien 72, 0454 Oslo, Norway
• Terje Christensen, Statens Strålevern
• Ellen Christensen, Veterinærinstituttet
Food Micro, Berlin, September 2018; Posterpris på dette arbeidet