18
Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI Tartu 01.02.2006

Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

  • Upload
    svea

  • View
    63

  • Download
    7

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI. Tartu 01.02.2006. Loomapopulatsioonide geneetilise analüüsi peamised markerid. mtDNA – emaliin Y-kromosoom – isaliin Mikrosatelliidid - biparentaalne. Materjal Eestist. - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

Lammaste, sealhulgas maalammaste

populatsioonigeneetiline analüüs

Urmas SaarmaTÜ ZHI

Tartu

01.02.2006

Page 2: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

Loomapopulatsioonide geneetilise analüüsi peamised markerid

• mtDNA – emaliin

• Y-kromosoom – isaliin

• Mikrosatelliidid - biparentaalne

Page 3: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 4: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

Materjal Eestist

• Eesti valgepealine – 14 karja, 30 isendit

• Eesti tumedapealine – 12 karja, 28 isendit

• Ruhnu populatsioon – 1 kari, 24 isendit

• Saaremaa populatsioonid – 7 karja, 21 isendit

Page 5: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

Metoodika

• Mikrosatelliitanalüüs, 21 lookust

• Bayesi klasterdusmeetod

• NJ (neighbour-joining) meetod

• PCoA (principal coordinates analysis)

Page 6: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

Tulemused

Page 7: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 8: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 9: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 10: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 11: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 12: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

Kokkuvõte

• Ruhnu kari moodustab geneetiliselt täiesti omaette populatsiooni. Kui teised analüüsid (peamiselt morfoloogiline) eristavad Ruhnu lambad samuti kultuurtõugudest, siis on meil alust lugeda see kari vähemalt ohustatud põliskarjaks (Ruhnu maalammas).

• Ohustatud põlistõug vs. ohustatud populatsioon/kari?

Page 13: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

Teised maalamba tunnustega isendid/karjad Eestis

• Saaremaa karjad: kolm karja seitsmest eristusid geneetiliselt kultuurtõugude esindajatest.

• Ülejäänud maalamba tunnustega isendid/karjad Eestis?

Page 14: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI

Kuidas edasi?

• Vajalik konsensus kõigi osapoolte vahel• Põliskarju ei tohiks koguda suurtesse karjadesse

ja omavahel valimatult ristata, enne kui on selgunud projekti tulemused

• Ruhnu maalammas? Kuidas käsitleda, kaitse, ristamisplaan (kui tekib inbriidingu oht), motivatsiooni loomine Ruhnu lammaste edasipidamiseks

• Teised aborigeensete tunnustega isendid/karjad? Vajalikud täiendavad uuringud (morfoloogia, geneetika)

Page 15: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 16: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 17: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI
Page 18: Lammaste, sealhulgas maalammaste populatsioonigeneetiline analüüs Urmas Saarma TÜ ZHI