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Corso di laurea Magistrale in Biologia sperimentale ed applicata A. A. 2009/2010 Lucia Della Croce Dipartimento di Matematica - Università di Pavia MATEMATICA APPLICATA ALLA BIOLOGIA (II MODULO) Matematica applicata alla Biologia Lucia Della Croce

MATEMATICA APPLICATA ALLA BIOLOGIA -  · Matematica applicata alla Biologia - Lucia Della Croce. b, r, s, m sono parametri da identificare 0 20 40 60 0 50 100 150 200 b=20 r=10 s=3

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Corso di laurea Magistrale in Biologia sperimentale ed applicata

A. A. 2009/2010

Lucia Della Croce

Dipartimento di Matematica -

Università di Pavia

MATEMATICA APPLICATA

ALLA BIOLOGIA(II MODULO)

Matematica applicata alla Biologia –

Lucia Della Croce

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L’incubo della matematica

NUOVO utilizzo dello strumento matematico

attraverso la costruzione di MODELLI

MATEMATICA = Strumento investigativo -

indagine multidisciplinare

MODELLIZZAZIONE = interazione dinamica tra mondo reale

MATEMATICA e mondo matematico

Matematica applicata alla Biologia –

Lucia Della Croce

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Processo interdisciplinare con cui si intende

interpretare, simulare, predire

i fenomeni reali

MODELLIZZAZIONE MATEMATICA

PROBLEMA

REALE

PROBLEMA

MATEMATICO

SOLUZIONE

MATEMATICA

INTERPRETAZIONE

In realtà spesso è necessario idealizzare e/o semplificare …

Matematica applicata alla Biologia - Lucia

Della Croce

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Idealizzazione e Approssimazionebasate sull’esperienza e sulla

comprensione del fenomeno

MONDO

REALE

MODELLO del

mondo reale

CONCLUSIONI MODELLO

MATEMATICO

Rappresentazione

simbolica: operatori,

equazioni,variabili

parametri etc…

Soluzioni basate sull’

esperienza matematica

Confronto e

validazione

Passare dal fenomeno reale al suo modello matematico comporta un processo di

astrazione che consente di analizzare e descrivere il problema in modo oggettivo

utilizzando un linguaggio simbolico universale.Matematica applicata alla Biologia –

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DATI

SPERIMENTALI

OPPORTUNE

EQUAZIONI

FORMULAZIONE

DEL

PROBLEMA

ANALISI

MATEMATICA

DEL

MODELLO

UNICITA’

ESISTENZA

RISOLUBILITA’

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Della Croce

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SVILUPPO

DI UN

ALGORITMO

IMPLEMENTAZIONE

VALIDAZIONE

DEL

MODELLO

SIMULAZIONE

NUMERICA

TEST SU CASI

NOTI

*

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Modelli matematici

in medicina

comprendere la natura di certe malattie

studiare delle strategie per il loro

trattamentoMatematica applicata alla Biologia - Lucia

Della Croce

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MODELLO

DELLE CELLULE

DEL SANGUEMatematica applicata alla Biologia - Lucia

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FORMAZIONE E DISTRUZIONE DELLE CELLULE

DEL SANGUE

CELLULE PRIMITIVE

(pluripotenziali)

CELLULE FORMATIVE SPECIALIZZATE

(proliferanti)

MATURAZIONE

(non proliferanti)

CIRCOLAZIONE SANGUIGNA

MORTE

CONTROLLO

FEEDBACK

Matematica applicata alla Biologia –

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it 1it

ix 1ix

T0 unità di tempoii tt 1

n° di cellule al tempo tiix

MODELLO MATEMATICO

La popolazione di cellule del sangue

varia nel tempo

)()(1 iiii

xpxdxx

)(i

xd

)(i

xp

n° di cellule distrutte

n° di cellule prodotte

nell’intervallo di tempo

[ti , ti+1]Matematica applicata alla Biologia –

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La funzione deve essere “identificata”

sulla base di dati sperimentali

)(xd

iixcxd )(

c coefficiente di distruzione

Ad ogni intervallo di tempo viene distrutta una

frazione costante di popolazione

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La velocità di produzione aumenta quando

il numero di cellule è basso

La funzione deve essere “identificata”

sulla base di considerazioni fisiologiche

)(xp

p(x) cresce inizialmente e raggiunge un

massimoMatematica applicata alla Biologia - Lucia

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Esiste un livello critico al di sotto del quale

l’organismo non recupera

La funzione deve essere “identificata”

sulla base di considerazioni fisiologiche

)(xp

p(0) = 0

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La funzione deve essere “identificata”

sulla base di considerazioni fisiologiche

)(xp

La produzione diminuisce se il numero di cellule è

elevato.

Non è necessaria a livelli “super elevati” di cellule

0)(xp

p(x) decresce per x grande

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mm

m

x

xbxp )( Mackey-Glass

1971

0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 500

20

40

60

80

100

120Modello di Mackey-Glass

b=20

theta=10

m=3

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rsxsexbxp )( Lasota

1977

0 5 10 150

5

10

15

20

25

30

35

40

45Modello di Lasota

b=2

r=5

s=5

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b, r, s, m sono parametri da identificare

0 200 400 600 8000

50

100

150b=20theta=10

m=3

0 200 400 600 8000

2

4

6

b=2theta=5

m=3

0 200 400 600 8000

100

200

300

b=10theta=50m=3

0 200 400 600 8000

50

100

150

200

250b=30

theta=15

m=5

MODELLO

DI

MACKEY

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b, r, s, m sono parametri da identificare

0 20 40 600

50

100

150

200b=20

r=10

s=3

0 20 40 600

5000

10000

15000

b=2r=15

s=5

0 50 1000

5

10

15x 10

5

b=10r=50s=4

0 5 10 15 200

0.5

1

1.5x 10

-4

b=3

r=1

s=10

MODELLO

DI LASOTA

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IL MODELLO DIVENTA

)(1 iiii

xpxcxx

)(1 ii

xfx

)()1()( xpcxxf

che è della forma

Dove la funzione d’iterazione f è:

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LIVELLO STAZIONARIO

In condizioni normali, le cellule raggiungono un

livello stazionario al quale produzione e distruzione

avvengono alla stessa velocità

)()(: xpxdx

)(xfxMatematica applicata alla Biologia –

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LIVELLI STAZIONARI DI MACKEY

0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 500

20

40

60

80

100

120

140

160

180

200

tempo

num

ero

di cellu

leLivelli stazionari di Mackey - Glass

o

o

o

p(x) = d(x)

p(x)

d(x)

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LIVELLI STAZIONARI DI LASOTA

0 5 10 150

20

40

60

80

100

120

tempo

num

ero

di cellu

le

Livelli stazionari di Lasota

o

o

oo

o

o

p(x) = d(x)

p(x)

d(x)

Matematica applicata alla Biologia –

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Una malattia corrisponde, dal punto di vista

matematico, al fatto che alcuni dei

parametri del modello hanno valori che si

discostano da quelli che definiscono un

livello stazionario

Analisi della stabilità del

modello

Biomatematica .mhtMatematica applicata alla Biologia

- Lucia Della Croce

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Livelli stazionari possono essere stabili o instabili

Posizioni stazionarie di una pallina su un percorso collinare

Stabile ( Attrattori) esiste una zona tale che se la pallina viene spostata

in uno qualunque dei punti ritorna al punto iniziale

Instabile

Interpretazione intuitiva della stabilità di un sistema

Regione di attrazione

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