9
www.uib.no/mbi Ord fra leder 2011 er snart omme og vi kan se tilbake på nok et spennende år, både faglig og sosialt. Årets sosiale høydepunkt var vel blåturen til Lysøen, men sosialt samhold og godt forhold til kollegaene på MBI gjennom hele året er selvsagt et mål ledelsen alltid har, vel vitende om at dette er en forutsetning for god utførelse av de oppgaver hver enkelt av oss har. Jeg håper og mener at vi alle har bidratt til et godt arbeidsmiljø på MBI gjennom året som gikk. Jeg mener også at ut fra de rammebetingelser vi som institutt er gitt, så står vi faglig sterkt med potensiale til å utvikle oss videre med den motivasjon at vi skal utføre forskning og undervisning høyt internasjonalt nivå. Biofagevalueringen, som nettopp ble offentliggjort, var nok ikke like positiv som jeg er i så henseende, men vi skal være stolte av at vi har en rekke publikasjoner med impact factor over 4 og helt opp til 28. Over 40 % av alle publikasjonene i 2010 var i nivå 2 journaler. Denne trenden er videreført i 2011. Dette er absolutt noe å være stolte av! Vi gleder oss over at Thomas Arnesen har fått formalisert sin stipendkontrakt med BFS og at HelseVest fant midler til å støtte PhD-stipend til prosjektet hans. Flere tildelinger til grupper ved MBI fra Kreftforeningen gleder også. Gaver til forskningen blir mer og mer viktig for oss og da får vi heller ta utfordringen med at slike gaver ikke passer inn i universitetets økonomiske driftsmodell. Fra 1. januar 2012 overtar en ny instituttleder, jeg ønsker han all mulig suksess i sin gjerning. Jeg håper hele instituttet tar vel i mot han og støtter opp om hans arbeid. Johan Studienytt Mastereksamen 8.desember Thomas Karlsson kl.10:00 Tittel på oppgåva: Biochemical characterization of ErbB3-binding protein 1 (EBP1) as a phosphoinositide effector protein Ida Marie Rundgren kl.13:00 Tittel på oppgåva: Characteristics of BAMLET-like complexes and clues about how they attain their lethality Nye mastergrader Vi gratulerer Marie-Josee Porcheron og Rashmi Narawane med fullført mastereksamen! ”Åpen dagonsdag 14. mars 2012 I haust har framtidig rekruttering til matematisk- naturvitskaplege og teknologiske fag vore i søkjelyset. I samband med dette ønskjer MBI å ta opp tråden etter 10-års jubileumet i 2007 og arrangere Åpen dag ved instituttet. Programstyret diskuterte saka i møte tidlegare i haust og det er oppnemnt ein eigen planleggingskomité. Komiteen er sett saman av professor Kari E. Fladmark, stipendiat Johannes Rack, avdelingsingeniør Carol Issalene, Heliks-representant Kristin Gravdal og studiekonsulent Marielle Hauge. MBI vil arrangere Åpen dag onsdag 14.mars kl.10:00-15:00, så set av datoen! Målgruppa er elevar i 2. og 3.klasse vg. som tek biologi og/eller kjemi. Programmet vil vere lab demonstrasjonar/visning, populærvitskaplege føredrag og praktiske demonstrasjonar. Koordinatorar og kontaktperson for dei ulike aktivitetane: Kari: Labdemonstrasjonar/visningar Johannes: Populærvitskaplege seminar Carol: Praktiske demonstrasjonar Kristin: Heliks og studentstand Marielle: informasjonsarbeid og påmelding Diverse studienytt MBI hadde besøk av 20 elevar frå Steinerskulen måndag 7.november. Svein Støve og Sylvia Varland var flinke omvisarar for interesserte elevar. 25.november var det posterpresentasjon i MOL231 på lunsjrommet. Det var mange gode posterar, og mange som møtte fram for å med seg presentasjonane. Heliks serverte vafler. Det er totalt 12 søkjarar til masterprogram i molekylærbiologi (MAMN-MOL), der 10 søkjarar har MAMN-MOL på førsteprioritet. Vår 2011 var det totalt 8 søkjarar. MBI - nytt og nyttig Molekylærbiologisk institutt Nr. 8/2011 1. desember Bidrag sendes til: [email protected]

MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

  • Upload
    others

  • View
    0

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

www.uib.no/mbi

Ord fra leder

2011 er snart omme og vi kan se tilbake på nok et

spennende år, både faglig og sosialt. Årets sosiale

høydepunkt var vel blåturen til Lysøen, men

sosialt samhold og godt forhold til kollegaene på

MBI gjennom hele året er selvsagt et mål ledelsen

alltid har, vel vitende om at dette er en

forutsetning for god utførelse av de oppgaver hver

enkelt av oss har. Jeg håper og mener at vi alle har

bidratt til et godt arbeidsmiljø på MBI gjennom

året som gikk.

Jeg mener også at ut fra de rammebetingelser vi

som institutt er gitt, så står vi faglig sterkt med

potensiale til å utvikle oss videre med den

motivasjon at vi skal utføre forskning og

undervisning på høyt internasjonalt nivå.

Biofagevalueringen, som nettopp ble

offentliggjort, var nok ikke like positiv som jeg er

i så henseende, men vi skal være stolte av at vi har

en rekke publikasjoner med impact factor over 4

og helt opp til 28. Over 40 % av alle

publikasjonene i 2010 var i nivå 2 journaler.

Denne trenden er videreført i 2011. Dette er

absolutt noe å være stolte av!

Vi gleder oss over at Thomas Arnesen har fått

formalisert sin stipendkontrakt med BFS og at

HelseVest fant midler til å støtte PhD-stipend til

prosjektet hans. Flere tildelinger til grupper ved

MBI fra Kreftforeningen gleder også. Gaver til

forskningen blir mer og mer viktig for oss og da

får vi heller ta utfordringen med at slike gaver ikke

passer inn i universitetets økonomiske

driftsmodell.

Fra 1. januar 2012 overtar en ny instituttleder, jeg

ønsker han all mulig suksess i sin gjerning. Jeg

håper hele instituttet tar vel i mot han og støtter

opp om hans arbeid.

Johan

Studienytt

Mastereksamen

8.desember

Thomas Karlsson kl.10:00

Tittel på oppgåva: Biochemical characterization of

ErbB3-binding protein 1 (EBP1) as a

phosphoinositide effector protein

Ida Marie Rundgren kl.13:00 Tittel på oppgåva: Characteristics of BAMLET-like

complexes and clues about how they attain their

lethality

Nye mastergrader Vi gratulerer Marie-Josee Porcheron og Rashmi

Narawane med fullført mastereksamen!

”Åpen dag” onsdag 14. mars 2012

I haust har framtidig rekruttering til matematisk-

naturvitskaplege og teknologiske fag vore i

søkjelyset. I samband med dette ønskjer MBI å ta

opp tråden etter 10-års jubileumet i 2007 og

arrangere Åpen dag ved instituttet. Programstyret

diskuterte saka i møte tidlegare i haust og det er

oppnemnt ein eigen planleggingskomité. Komiteen

er sett saman av professor Kari E. Fladmark,

stipendiat Johannes Rack, avdelingsingeniør Carol

Issalene, Heliks-representant Kristin Gravdal og

studiekonsulent Marielle Hauge.

MBI vil arrangere Åpen dag onsdag 14.mars

kl.10:00-15:00, så set av datoen! Målgruppa er

elevar i 2. og 3.klasse vg. som tek biologi og/eller

kjemi. Programmet vil vere lab

demonstrasjonar/visning, populærvitskaplege

føredrag og praktiske demonstrasjonar.

Koordinatorar og kontaktperson for dei ulike

aktivitetane:

Kari: Labdemonstrasjonar/visningar

Johannes: Populærvitskaplege seminar

Carol: Praktiske demonstrasjonar

Kristin: Heliks og studentstand

Marielle: informasjonsarbeid og påmelding

Diverse studienytt MBI hadde besøk av 20 elevar frå Steinerskulen

måndag 7.november. Svein Støve og Sylvia Varland

var flinke omvisarar for interesserte elevar.

25.november var det posterpresentasjon i MOL231

på lunsjrommet. Det var mange gode posterar, og

mange som møtte fram for å få med seg

presentasjonane. Heliks serverte vafler.

Det er totalt 12 søkjarar til masterprogram i

molekylærbiologi (MAMN-MOL), der 10 søkjarar

har MAMN-MOL på førsteprioritet. Vår 2011 var

det totalt 8 søkjarar.

MBI - nytt og nyttig

Molekylærbiologisk institutt

Nr. 8/2011 – 1. desember

Bidrag sendes til:

[email protected]

Page 2: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

www.uib.no/mbi

MBI deltok på fagmesse ved Nordahl Grieg vgs

tirsdag 22. november. Sjølv om det kan verke som

om namnet på instituttet/faget kanskje ikkje er eit

trekkplaster i seg sjølv i desse dagar, var det ein

god del interesserte elevar som fekk ei innføring i

kva faget er og kva studietilbod dei kan finne ved

instituttet.

Forskerutdanningsnytt

Prøveforelesing/Trial lecture

Ole Jakob Nøstbakken will Monday December

5th present his trial lecture for the PhD-degree.

The topic given is: “Links between oxidative stress

and mitochondrial metabolite chemistry"

The lecture starts 10.15am, at N-terminalen.

Evaluating committee: Øyvind Halskau, Kari E.

Fladmark and Arnt J. Raae

Disputas/PhD-defence

Ole Jakob Nøstbakken will Monday December

19th defend his thesis entitled Interactions

between marine n-3 fatty acids and methylmercury

The defence will take place at Stort auditorium,

datablokken, Høyteknologisenteret at 10.15am

Evaluating committee: Øyvind Halskau (MBI,

leader), Nancy Denslow (University of Florida

Center for Environmental and Human Toxicology

& Department of Physiological Sciences) and

Kiron Viswanath (Faculty of Biosciences &

Aquaculture, Bodø University College)

Ole Jakob is a PhD-fellow at NIFES with Bente E.

Torstensten as his main supervisor, and is

associated to MBI through Anders Goksøyr’s

group.

Kick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural

Sciences will arrange a kick-off seminar for

new PhD-candidates next Tuesday, December

6th

. The seminar will be take place at AUD 3,

Realfagbygget, from 13.00-15.30pm

Forskningsnytt

Et godstog lastet med liv Et protein som kan fremme helse og lengre liv

hos honningbiene, kan også bidra til å løse

store økonomiske utfordringer for oss

mennesker? Les mer om resultatene fra Heli

Havukainens doktorgradsarbeid via linkene

under. Heli har vært stipendiat ved UMB på

Ås, hatt sin hovedveileder ved Institutt for

biomedisin, og Øyvind Halskau som biveileder.

Et godt eksempel på at tellekant-systemet

heldigvis ikke har klart å knekke viljen til å få til

gode prosjekter på tvers av institusjonsgrenser.

Les mer i Forskning.no i Science Daily og på

UMBs hjemmeside

Månedens publikasjoner

Abstracts/forsider av artiklene finner du i slutten av

dokumentet

Marine n-3 fatty acids alter the proteomic response to

methylmercury in Atlantic salmon kidney (ASK) cells. Nøstbakken OJ, Goksøyr A, Martin SA, Cash P,

Torstensen BE. Aquat Toxicol. 2011 Oct 18;106-107C:65-

75. [Epub ahead of print]

doi:10.1016/j.aquatox.2011.10.008

Immobilization onto gold nanoparticles alters α-

lactalbumin interaction with pure and mixed

phospholipid monolayers. Sina M. Lystvet, Sondre

Volden, Øyvind Halskau and Wilhelm R. Glomm, Soft

Matter, 2011, 7, 11501-11509 doi: 10.1039/C1SM06337E

Receptor for Activated Protein C Kinase 1 (RACK1)

Is Overexpressed in Papillary Thyroid Carcinoma. Myklebust LM, Akslen LA, Varhaug JE, Lillehaug JR.

Thyroid. 2011 Nov;21(11):1217-25. Epub 2011 Oct 18.

doi: 10.1089/thy.2010.0186

A monoclonal antibody distinguishes between two IgM

heavy chain isotypes in Atlantic salmon and brown

trout: protein characterization, 3D modeling and

epitope mapping. Kamil A, Falk K, Sharma A, Raae A,

Berven F, Koppang EO, Hordvik I. Mol Immunol. 2011

Sep;48(15-16):1859-67. Epub 2011 May 31.

doi:10.1016/j.molimm.2011.05.005

Konferanser The 2012 Jacques Monod conference on

'The translating ribosome: towards mature

proteins' For more info, see: http://www.cnrs.fr/insb/cjm/2012/Meinnel_e.htm

l

Miljøgiftkonferansen 2012 Hva skal til for å

stanse utslipp av helse- og miljøskadelige

kjemikalier innen 2020? Hva trengs av

forskning, virkemidler og organisering?

Konferansen finner sted onsdag 18.januar Se

lenke under for mer informasjon om

programmet og påmelding.

http://www.klif.no/Aktuelt/Nyheter/2011/No

vember-2011/Miljogiftkonferansen-2012/

The 28th ESCPB Congress (European

Society for Comparative Physiology and

Biochemistry) will be held in Bilbao,

Basque Country (Spain) from 2 to 5

September 2012. The main theme of the

congress is “Cellular and molecular

Page 3: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

www.uib.no/mbi

mechanisms for physiological

adaptation to multiple stress”. Please

find relevant information in the

attached file and in the following

webpage: http://www.ehu.es/escpb-

Bilbao2012.

Personalnytt

Uni Miljø leier lokaler ved lab 1 Uni Miljø inngår i disse dager en avtale med MBI

om leie av lokaler. Uni Miljø skal etablere et

Senter for anvendt bioteknologi. I etableringsfasen

(1 til 2 år) vil Uni Miljø leie en laboratoriebenk på

lab1 og et kontor. I første omgang er det forsker

Øyvind Larsen som skal starte opp dette arbeidet

nå i løpet av desember. Senere vil en til to andre

medarbeidere fra Uni Research kunne knytte seg

til senteret. Øyvind Larsen er vel kjent hos oss fra

tidligere prosjektsamarbeid med Uni Research.

MBI ønsker ham velkommen tilbake.

Utenlandsopphold Ph.d.-stipendiat Håvard Foyn har reist på et 8

måneders opphold (november 2011-juli 2012) hos

Professor Paul R. Thompson, The Scripps

Research Institute Florida (se bilde). Dette er en

del av et samarbeidsprosjekt mellom Paul R.

Thompson og Thomas Arnesen for å utvikle

småmolekylære hemmere mot N-terminale

acetyltransferaser.

Til tross for tilsynelatende litt kummerlige forhold,

ønsker vi Håvard lykke til med oppholdet i Florida!

A new medical center for employees and students at the University of Bergen A new Medical Centre at Vektertorget will offer

emergency treatment to UiB’s students and

international employees who do not have their

own family doctor in Bergen. The new Medical

Centre will open on 2nd January, 2012 and will

also offer a GP service. For questions, contact

Signe Knappskog, International Staff Services,

Department of Human Resources, +47 55 58 93 73,

[email protected]. Read more:

In English (or see bottom of the printed document):

http://www.uib.no/filearchive/medical-centre.pdf

In Norwegian (eller se nederst i den trykte utgaven):

http://www.uib.no/filearchive/legesenter-for-

studenter-og-ansatte.pdf

Annet

Møte i instituttrådet fredag 2. desember

Instituttrådet har møte i morgen 2. desember kl. 10-

12. Sakslisten finner dere her:

http://www.uib.no/filearchive/innkalling-

instituttraadsmote-11.12.02.pdf

Julebord 2. desember / Christmas party December 2nd Da er alt klart for morgendagens julebord! Vi sees i

Christiesgate 18 fra kl 19.

Then everything should be ready for tomorrow’s

christmas party! See you at Christiesgate 18 from

7pm. Christie’s gate is the street leading up to the

Museum of Natural History, and you’ll find the

building on the left hand side when your facing

towards the museum.

Lønningspils Husk også at det er lønningspils hver måned for alle

interesserte, vanligvis første torsdag etter lønning.

Da møtes vi for en hyggelig prat og litt drikke,

mange benytter også anledningen til å ta en middag

sammen før lønningspilsen.

Please also remember that anyone who is interested

meet up for a “Lønningspils” the first Thursday after

payment day each month. We gather for a nice talk,

something to drink – and some also take the

opportunity for a nice meal in pleasant company.

MBI Monday seminars

Monday December 5th

, Vandana Ardawatia (group Lewis): "Characterization of Topoisomerase

II α as a nuclear phosphoinositide effector protein"

The last seminar for the semester will be held

Monday Dec 12th

by Arne Taxt

MBI seminar room (N-terminalen), Fridays at 13.30

Page 4: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

Legesenter med akutt-tilbud til studenter og internasjonalt ansatte Et nytt legesenter på Vektertorget skal tilby akutt behandling til studenter og internasjonalt ansatte ved UiB som ikke har fastlege i Bergen. Det nye legesenteret åpner 2. januar 2012, og skal også tilby fastlegetjenester. Ordningen med akutt-timer er et samarbeid mellom Universitetet i Bergen (UiB),

Studentsamskipnaden i Bergen (SiB) og Bergen kommune, og er en del av fastlegenes

samfunnsmedisinske arbeid.

Universitetet i Bergen leier ut nyoppussede lokaler på Vektertorget, mens Bergen kommune har

tildelt tre nye fastlegehjemler til dette legesenteret.

Spesielt for internasjonalt ansatte og studenter Internasjonalt ansatte og studenter har ofte ikke fastlege i Norge, mens mange norske studenter har

fastlege andre steder i landet.

Tilbudet om akutt behandling er utarbeidet for

internasjonalt ansatte og studenter ved UiB som ikke har rett til fastlege, og deres familier.

studenter som ikke har fastlege i Bergen.

De tre legene, Nicolas Øyane, Shagun Bhatia og Esther Gundersen, behersker norsk, hindi, urdu,

engelsk, fransk og tysk.

Avtale om samfunnsmedisinsk arbeid Avtalen med legesenteret gjelder den delen av legenes arbeidstid som skal brukes til samfunnsmedisinsk arbeid, og omfatter akutt-tilbudet, forebyggende arbeid overfor studenter, og samarbeid med HMS-seksjonen ved UiB og helsetjenesten ved SiB.

Her finner du legesenteret Legene på Høyden, Christies gate 13. Nettside: www.lph.no - Kart

Page 5: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

Medical Centre offers emergency medical services to students and international

employees

A new Medical Centre at Vektertorget will offer emergency treatment to UiB’s students and

international employees who do not have their own family doctor in Bergen. The new

Medical Centre will open on 2nd

January, 2012 and will also offer a GP service.

The arrangement concerning emergency appointments is a collaboration between the

University of Bergen (UiB), the Student Welfare Organisation in Bergen (SiB) and Bergen

City Council, and is part of the GP’s community medical work.

The University of Bergen has rented premises at Vektortorget. These premises have recently

been redecorated and Bergen City Council has given three GP authorizations to the new

Medical Centre.

Specifically for the use of international employees and students

International employees and students do not usually have their own family doctor here in

Norway, whilst many Norwegian students have a family doctor – but in another part of the

country.

Emergency treatment will be offered to

Foreign employees and students at UiB who are not entitled to a GP , and their

families

Students who do not have a GP in Bergen.

The three doctors, Nicolas Øyane, Shagun Bhatia and Esther Gundersen, speak Norwegian,

Hindi, Urdu, English, French and German.

Agreement concerning community medical work

The agreement with the Medical Centre concerns the number of working hours that the

doctors will spend on treating patients, and includes emergency treatment, preventive

medicine for students and co-operation with the HSE section at UiB and the health services at

SiB.

How to find the Medical Centre Legene på Høyden, Christies gate 13, web page: www.lph.no

Page 6: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

Aquatic Toxicology 106– 107 (2012) 65– 75

Contents lists available at SciVerse ScienceDirect

Aquatic Toxicology

jou rn al h om epa ge: www.elsev ier .com/ locate /aquatox

Marine n−3 fatty acids alter the proteomic response to methylmercury inAtlantic salmon kidney (ASK) cells

Ole Jakob Nøstbakkena,b,∗, Anders Goksøyrc, Samuel A.M. Martind, Phillip Cashe, Bente E. Torstensena

a NIFES (National Institute of Nutrition and Seafood Research), Pb 2029 Nordnes, 5817 Bergen, Norwayb Department of Molecular Biology, University of Bergen, N-5020 Bergen, Norwayc Department of Biology, University of Bergen, N-5020 Bergen, Norwayd Institute of Biological and Environmental Sciences, University of Aberdeen, Aberdeen AB24 2TZ, UKe Division of Applied Medicine, University of Aberdeen, Aberdeen AB25 2ZD, UK

a r t i c l e i n f o

Article history:Received 24 August 2011Received in revised form 6 October 2011Accepted 11 October 2011

Keywords:MethylmercuryDocosahexaenoic acidEicosapentaenoic acidAtlantic salmonProteomics

a b s t r a c t

Fish based diets have been linked to the amelioration of methylmercury (MeHg) induced symptoms inseveral epidemiological studies, particularly due to their contents of marine n−3 fatty acids. It has beensuggested that n−3 fatty acids may mask the detrimental effects of MeHg due to their beneficial effecton the same biological functions which are negatively affected by MeHg. However, in vitro studies haveimplied that there may be direct interactions between the marine n−3 FAs and MeHg, which amelioratesMeHg toxicity through interactions at a biological level. To understand how marine n−3 FAs and MeHginteract in fish as a biological system, we wanted to investigate molecular interaction in a fish cell system.

Atlantic salmon kidney (ASK) cells were pre-incubated with the marine n−3 FAs docosahexaenoic acid(22:6n−3, DHA) and eicosapentaenoic acid (20:5n−3, EPA) before exposing them to MeHg. Modulatingeffects of the marine FAs on MeHg toxicity were subsequently assessed using the exploratory techniqueof proteomics, in a factorial design.

Thirty-four differentially regulated proteins were identified. From these; twenty-seven were shown tobe differentially regulated by MeHg, twelve were regulated by the fatty acids, and another eight showedinteraction effects between MeHg and the FAs. Several of the proteins were concomitantly affected byMeHg- and FA-main effects, as well as interaction effects. Functional annotations and pathway analysisof the proteins revealed that marine n−3 FAs and MeHg concurrently affected the abundance of pro-tein markers relating to such molecular mechanisms as: cell signaling, calcium homeostasis, structuralintegrity, apoptosis, and energy metabolism.

In conclusion, both marine n−3 FAs and MeHg can differentially affect the abundances of the sameproteins, indicating modulating effects of EPA and DHA on MeHg metabolism, and possibly on its toxicity.

© 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

1. Introduction

The marine n−3 fatty acids (FA) docosahexaenoic acid (22:6n−3;DHA) and eicosapentaenoic acid (20:5n−3; EPA) have proven to beof great importance in a healthy balanced diet (Calder et al., 2010).These essential FAs have shown beneficial effects on human healthsuch as: onset of coronary heart disease (Mozaffarian and Rimm,2006), pregnancy and infant development (Cetin and Koletzko,2008), cognitive health (Albanese et al., 2009; Hibbeln et al., 2007)and immune regulation (Calder, 2007). The source of marine n−3FAs for human consumption is mainly through a seafood based

∗ Corresponding author at: NIFES, Pb 2029 Nordnes, 5817 Bergen, Norway.Tel.: +47 94872636; fax: +47 55905298.

E-mail address: [email protected] (O.J. Nøstbakken).

diet, which unfortunately is prone to also contain environmen-tal contaminants. This has led to a debate whether the beneficialeffects of nutrients from seafood outweighs the harmful effects ofpossible toxicants (Bushkin-Bedient and Carpenter, 2010; Strömet al., 2011). There is however, another aspect of co-occurring nutri-ents with contaminants, specifically, they may directly interactand possibly alter the toxicology of the contaminant. Lately, stud-ies have emerged investigating the interactive effect of nutrientsand contaminants, demonstrating that selenium can ameliorateMeHg toxicity (Rooney, 2007), and marine n−3 FA oxidation prod-ucts protect endothelial cells against coplanar PCBs (Majkova et al.,2011). The mechanisms responsible for nutrient-mediated protec-tion against contaminants are also assessed, as for example theimportance of sufficient zinc levels in maintaining expression ofdetoxifying enzymes (Shen et al., 2008). Overall, the increasedinterest in nutrient effects on toxicants has emerged as a valuable

0166-445X/$ – see front matter © 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.doi:10.1016/j.aquatox.2011.10.008

Page 7: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange
Page 8: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

Mary Ann Liebert, Inc. - Thyroid - 21(11):1217

file:///C|/Documents%20and%20Settings/mbika/Desktop/Filer%20til%20MBI%20Nytt/thy.2010.0186.htm[01.12.2011 13:42:12]

Users who read this article also read

Predictors of Malignancy in Patients with Cytologically SuspiciousThyroid NodulesM. Regina Castro, Rachel P. Espiritu, Rebecca S. Bahn, Michael R. Henry, Hossein

Gharib, Pedro J. Caraballo, John C. Morris

Thyroid. November 2011: 1191-1198.

Abstract | Full Text PDF or HTML | Reprints & Permissions

Page 9: MBI - nytt og nyttig 1. desember - Universitetet i BergenKick-off seminar for new PhD-candidates at the Mat.nat. Faculty The Faculty of Mathematics and Natural Sciences will arrange

Molecular Immunology 48 (2011) 1859– 1867

Contents lists available at ScienceDirect

Molecular Immunology

jo u rn al hom epa ge: www.elsev ier .com/ locate /mol imm

A monoclonal antibody distinguishes between two IgM heavy chain isotypes inAtlantic salmon and brown trout: Protein characterization, 3D modeling andepitope mapping

Atif Kamila, Knut Falkb, Animesh Sharmac, Arnt Raaed, Frode Bervene,Erling Olaf Koppangf, Ivar Hordvika,∗

a University of Bergen, Department of Biology, N-5020 Bergen, Norwayb Norwegian Veterinary Institute, Department of Diagnostics, N-0106 Oslo, Norwayc University of Bergen, Department of Informatics, N-5020 Bergen, Norwayd University of Bergen, Department of Molecular Biology, N-5020 Bergen, Norwaye University of Bergen, Department of Biomedicine, PROBE, N-5020 Bergen, Norwayf The Norwegian School of Veterinary Science, BasAm, N-0033 Oslo, Norway

a r t i c l e i n f o

Article history:Received 8 March 2011Received in revised form 4 May 2011Accepted 9 May 2011Available online 31 May 2011

Keywords:IgMSalmonTroutSalmoTeleostTetraploidy

a b s t r a c t

Atlantic salmon (Salmo salar) and brown trout (Salmo trutta) possess two distinct subpopulations of IgMwhich can be separated by anion exchange chromatography. Accordingly, there are two isotypic � genesin these species, related to ancestral tetraploidy. In the present work it was verified by mass spectrometrythat IgM of peak 1 (subpopulation 1) have heavy chains previously designated as �B type whereas IgMof peak 2 (subpopulation 2) have heavy chains of �A type. Two adjacent cysteine residues are presentnear the C-terminal part of �B, in contrast to one cysteine residue in �A. Salmon IgM of both peak 1 andpeak 2 contain light chains of the two most common isotypes: IgL1 and IgL3. In contrast to salmon andbrown trout, IgM of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) is eluted in a single peak when subjected toanion exchange chromatography. Surprisingly, a monoclonal antibody MAb4C10 against rainbow troutIgM, reacted with �A in salmon, whereas in brown trout it reacted with �B. It is plausible to assumethat DNA has been exchanged between the paralogous A and B loci during evolution while maintainingthe two sub-variants, with and without the extra cysteine. MAb4C10 was conjugated to magnetic beadsand used to separate cells, demonstrating that � transcripts residing from captured cells were primarilyof A type in salmon and B type in brown trout. An analysis of amino acid substitutions in �A and �B ofsalmon and brown trout indicated that the third constant domain is essential for MAb4C10 binding. Thiswas supported by 3D modeling and was finally verified by studies of MAb4C10 reactivity with a series ofrecombinant �3 constructs.

© 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

1. Introduction

IgM is the primary systemic antibody in teleost fish. Teleost IgMis typically a tetramer (Acton et al., 1971), and each monomer con-sists of two identical heavy chains and two identical light chains.The heavy chain (�) of secreted IgM consists of one variable Igdomain and four constant Ig domains (�1, �2, �3 and �4). The

∗ Corresponding author. Tel.: +47 55584538; fax: +47 55584450.E-mail addresses: [email protected] (A. Kamil), [email protected] (K.

Falk), [email protected] (A. Sharma), [email protected] (A. Raae),[email protected] (F. Berven), [email protected] (E.O. Koppang),[email protected] (I. Hordvik).

membrane anchored form of IgM, i.e., the B-cell receptor, is oneIg domain shorter than the secreted form as a result of a specialsplicing pattern in teleosts which excludes �4 (Ross et al., 1998).

A J-chain homolog has been revealed in representatives of allvertebrates except cyclostomes and bony fish (Klimovich et al.,2008). Thus, presence of a J-chain appears to correlate with theability to form IgM pentamers; in mammals, amphibians, reptilesand cartilaginous fishes.

Purification of serum IgM from salmonid fish is usually per-formed by a combination of anion exchange chromatography andgel filtration, or by affinity chromatography employing specificantibodies against the IgM of interest (Kobayashi et al., 1982;Haavarstein et al., 1988; Fuda et al., 1991; Sanchez et al., 1993,1995; Magnadóttir et al., 1996, 1997). Only a small proportion of

0161-5890/$ – see front matter © 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.doi:10.1016/j.molimm.2011.05.005