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Fundamentos do planejamento de fármacos Andrei Leitão SQM5811

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Fundamentos do planejamento

de fármacos

Andrei Leitão

SQM5811

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Um pouco de história:

Exemplo - Terapia da epilepsia

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✓ Perfurações no crânio para liberar os “maus espíritos”

✓ Romanos: injeção do sangue de gladiadores mortos em combate

✓ Idade média: ingestão de bile de cachorro, urinoterapia...

✓ Renascimento: busca pela “racionalização”

Castração (conotação sexual)

Vômito forçado seguido da ingestão de extrato de peônia

✓ Século 16: Metaloterapia (Cu, Hg...)

✓ Século 19: Estudos de compostos bioativos com atividade

anticonvulsiva. Brometo de potássio (KBr).

✓Século 20:

Introdução em 1912: Fenobarbital (barbitúricos)

Década de 50: Benzodiazepina

Década de 50-60: Ácido valpróico

✓ Descoberta dos receptores GABA

✓ Crescente compreensão do mecanismo de ação dos fármacos

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Algumas definições importantes

3

✓ O que é um “ligante”?

✓ É um composto que

interage quimicamente com

uma macromolécula e altera

sua atividade.

✓ O que é um alvo?

✓ Pode ser uma doença ou

uma macromolécula (proteína,

DNA) para a qual compostos

químicos serão planejados.

4-hidróxi-

tamoxifeno

Receptor

estrógeno

(ERα)

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O Fármaco

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✓ O que é um fármaco?

✓ Usando uma definição abrangente, é um composto químico usado

para o tratamento, cura, diagnóstico ou prevenção de uma doença.

✓ A maioria dos fármacos é composta por C, H, N, O, S, halogênio

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4-hidróxi-tamoxifeno-ERα

Propriedades dos compostos bioativos

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✓ Farmacodinâmica

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Propriedades dos compostos bioativos

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✓ Farmacocinética

A = absorção

D = distribuição

M = metabolismo

E = excreção

✓ Efeito tóxico

✓ Uso prolongado de tamoxifeno pode levar ao câncer de

endométrio

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A gênese planejada de fármacos

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FármacoLigantes

Alvo

biológicoMolécula

matriz

Descoberta

e Desenvol-

vimento

Identificação

e otimização

Estudos

clínicosAprovação

Estudo clínico

fase IVFases

I, II e III

0 5 15

Tempo médio (em anos)

Fase prévia ao

planejamento

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Número de compostos estudados

8

Número de moléculas

~106-8

~103-6

101

Estratégia

vHTS*

HTS

in vitro*

in vivo**

in vivo***

Moléculas

Coleções

virtuais/reais

Composto

matriz

Candidatos a

fármaco

Fármaco

*in vitro: ensaios enzimáticos e celulares

**ensaios in vivo em animais (testes pré-clínicos avançados)

***in vivo: ensaios em humanos (testes clínicos)

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Os compostos bioativos

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✓Qual o tipo de composto?

me-too?inovador?

SintéticoSemi-sintéticoProduto natural

Helleva® (Cristália) 6 anos de desenvolvimento

3 anos em estudos clínicos

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Estratégias de estudo

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✓ O que se conhece sobre a patologia (ou alvo macromolecular)?

✓ E os compostos bioativos?

A estrutura do alvo e do

ligante são conhecidas

Somente a estrutura do alvo é

conhecida

SBDD/SBVS e

LBDD/LBVS

SBDD/SBVS

de novo

Sem noção da estrutura do

ligante ou do alvo

Somente a estrutura do

ligante é conhecida

Química Combinatória

Ensaios biológicosLBDD/LBVS

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Alvos biológicos mais comuns

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Enzimas 28%

Número de alvos = 483

Hormônios e

Fatores 11%

Canais

Iônicos 5% Receptores

Nucleares 2%

Outros

Receptores 45%

Desconhecido 7%DNA 2%

Drews, J. Science 2000, 287 , 1960

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Farmacodinâmica

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✓ Estudo das interações intermoleculares entre o ligante

(fármaco ou não) e o alvo biológico de interesse

✓ Na farmacodinâmica determina-se o mecanismo de ação

(MOA) e o modo de interação (MOB)

✓ Alguns fármacos não possuem MOA ou MOB determinados

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Farmacodinâmica

Mecanismo de ação (MOA)

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✓ Os mecanismos de ação (MOA) mais comuns:

✓ agonista (ativador)

✓ agonista parcial

✓ antagonista (inibidor)

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Sítio de interação

Farmacodinâmica

Modo de interação (MOB)

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✓ Métodos espectroscópicos (cristalografia de raios-X, RMN)

Anti-HIV (transcriptase reversa)

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Farmacodinâmica

Modo de interação (MOB)

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✓ Métodos computacionais (modelagem molecular e docagem)

Co-complexo com a transcriptase reversa

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Farmacocinética

Regra dos cinco (Ro5) de Lipinski

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✓ 4 descritores múltiplos de 5:

Massa Molecular ≤ 500; ClogP ≤ 5;

Ligações hidrogênio: doadores ≤ 5 (HBD); receptores ≤ 10 (HBA)

Número de violações a regra ≤ 1

Exemplo: MM = 315,68

ClogP = 3,73

HBD = 1

HBA = 1

Violações = 0

Efavirenz

(antiviral)

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Descoberta do composto bioativo

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✓ Ensaio aleatório

✓ Ensaios em massa (HTS) e de elevado conteúdo

(HCS)

✓ Planejamento computacional & vHTS

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Descoberta do composto bioativoEnsaio aleatório

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✓ Foi a única estratégia disponível até a década de 1950-1960.

✓ Vantagem: pode identificar uma atividade biológica inesperada

para compostos químicos (serendipidade).

✓ Limitação: dispendioso (uso de animais) e difícil para otimização

do composto.

Taxol(antitumoral)

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Descoberta do composto bioativoEnsaio em massa (HTS)

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✓ Indústrias farmacêuticas implementaram diversos programas a

partir da década de 1990.

✓ Vantagem: rápido teste e identificação de grandes coleções de

moléculas (103-106). Serendipidade não é totalmente perdida.

✓ Limitação: problemas com a confiabilidade do ensaio. Número de

compostos de interesse é muito baixo.

Compostos antitumorais para o câncer de próstata

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Agonistas dos receptores estrógenos

Descoberta do composto bioativoEstudo computacional & vHTS

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✓ Os estudos que QSAR em 1960 com Hansch foram um marco

nesta área. Grande expansão com a evolução de métodos e

computadores a partir de 1980. vHTS na década de 90.

✓ Vantagem: baixo custo de manutenção. Rápido teste e geração

de novas hipóteses.

✓ Limitação: Dependência dos ensaios biológicos.

Inibidores da aromatase

H

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✓ De acordo com os grupos funcionais:

Grupo químico → Ação farmacológica

Virtude: fácil correlação entre estrutura química e atividade biológica.

Exemplos:

Sulfonamidas → antibacterianas

β-lactamas → antibacterianas

Classificação dos fármacos

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Problema: a classificação é falha em diversos casos.

✓ Várias classes de fármacos possuem sulfonamidas na estrutura:

✓ Fármacos anti-HIV (NNRTI):

Alguma correlação

entre as estruturas?

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Classificação dos fármacos

22

✓ De acordo com a patologia/atividade farmacológica:

Vantagem: pode ser usada em todos os casos.

Compostos antibacterianos

Inibidores do Inibidores da

metabolismo parede celular

sulfonamidas β-lactamas

Desvantagem: Relação entre estrutura-atividade é mais complexa

✓ É a mais comumente empregada atualmente.

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Principais mercados

farmacêuticos no mundo

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PaísVendas em junho

2009(bilhões de dólares)

Porcentagem

do mercado

mundial

Incremento em

vendas em um ano (%)

EUA 291,9 40,6 3,2

Japão 73,7 10,2 3,6

França 39,7 5,5 1,4

Alemanha 38,9 5,4 3,3

Itália 25,1 3,5 4,0

China 22,2 3,1 24,7

Espanha 21,4 3,0 6,5

Reino Unido 19,8 2,8 4,9

Canadá 17,7 2,5 6,1

Brasil 11,6 1,6 12,1

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Descoberta do composto bioativoReposicionamento de fármaco & me-too

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✓ O reposicionamento é uma estratégia baseada na identificação de

um novo uso terapêutico para um fármaco

✓ Vantagem: Reduzidos riscos para pesquisa e baixo custo. Rápida

identificação de fármacos para uma patologia

✓ Limitação: Não há inovação química

Ácido acetilsalicílico(antiinflamatório e antitrombótico)

✓ O me-too é considerado como uma cópia terapêutica de um

fármaco conhecido.

✓ Vantagem: Reduzidos riscos para pesquisa. A nova molécula

apresenta propriedades farmacológicas pré-otimizadas.

✓ Limitação: Inovação química limitada e possibilidade de observar

resistência cruzada ou efeitos colaterais similares.

Sildenafila Vardenafila

(Viagra®) (Levitra®)

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A indústria brasileira

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Exemplos: e Acheflan® (Aché)

Cordia Verbenacea DC

alfa-humuleno

Disfunção erétil Inflamação

Lodenafila

7 anos de estudo

Custos ~ R$ 15 milhões

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Outras propriedades de interesse

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✓ Solubilidade

✓ Acidez/basicidade e a ionização

✓ Estabilidade química

✓ Dissociação da formulação farmacêutica