MOLEKULARNA FILOGENIJA

7/24/2019 MOLEKULARNA FILOGENIJA

1/17

Molekularna filogenija


2/17

FILOGENIJA - znanstvena disciplina koja se avi prou!avanje"evolucijskog srodstva iz"e#u razli!iti$ grupacija organiza"a%tradicionalna i "olekularna filogenija&


3/17

MOLE'(LA)NA FILOGENIJA

prou!ava evolucijsku pro*lost organiza"a i "akro"olekula naosnovi podataka doiveni$ prou!avanji"a na "olekularno-iolo*koj razini+ te nji$ovo" statisti!ko" orado"


4/17

MI,OON.)IJ/'A .NA

Mito$ondrijska .NA %"t.NA& - kodira 01 proteinski$ "olekula+22 "olekule t)NA i 2 "olekule r)NA %03/ r)NA i 02/ r)NA&45roteinske podjedinice kodirane od strane "t.NA ez koje su"ito$ondriji nefunkcionalni su6 podjedinice I+ II i III citokro"

oksidaze + A,5 sintetaze 3 i 7+ NA.-de$idrogenaze 0-3 i 8L tepodjedinica apoenzi"a

lako9a izolacije+ veliki roja kopija %tisu9e do stotine tisu9akopija po stanici&+ nepostojanja genske reko"inacije+

naslje#ivanja po "aj!inoj liniji+ te relativno velike rzineevolucije oziro" na jezgrinu .NA


5/17

5reduvjet uspje*nogistra:ivanja filogenetski$ ievolucijski$ odnosa je izorprikladnog "olekularnogiljega+ odgovaraju9eg

stupnja varijailnosti+ kojina" o"ogu9ava dorurazlu!ivost na pojedinojtaksono"skoj razini

Na :ivotinjskoj "t.NAnajvi*e se koriste 8 parauniverzalni$ po!etnica %02/ i03/ r)NA+ ;OI i citokro" &


6/17

ME,O.E6

Izolacija .NA

("na:anje frag"enata lan!ano" reakcijo" poli"eraze %5;)&

Elektroforetsko odjeljivanje frag"enata .NA i nji$ovopro!i*9avanje

Odre#ivanje pri"arne strukture .NA %sekvenciranje&

)a!unalne analize


7/17

FILOGENE,/'A /,A


8/17

Kada elimo opisati pojedine dijelove filogenetskog stabla, odnosno

filogenetske odnose izmeu pojedinih taksonomskih jedinica

upotrebljavamo slijedee pojmove:

MONOFILE,/'A G)(5A =ona grupa u kojoj su svi!lanovi porijeklo" od jednogzajedni!kog pretka koji nijepredak niti jednoj drugoj

grupi organiza"a izvanopisane
http://en.wikipedia.org/wiki/Image:Monophyletic.pnghttp://en.wikipedia.org/wiki/Image:Monophyletic.png


9/17




5OLIFILE,/'A G)(5A =

ona grupa u kojoj sve vrstenisu porijeklo" od istogzajedni!kog pretka ve9 odvi*e nji$ koji su ujedno ipreci vrsta"a koje su

klasificirane u drugi"grupa"a
http://en.wikipedia.org/wiki/Image:Polyphyletic-mammals-birds.png


10/17




5A)AFILE,/'A G)(5A =

grupa koja sadr:i neke+ aline sve poto"ke naj"la#egzajedni!kog pretkauklju!uju9i i tog pretka
http://en.wikipedia.org/wiki/Image:Paraphyletic.png


11/17

MOLE'(LA)NI MA)'E)I ( FILOGENIJIAMINO'I/ELIN/'I ILI N('LEO,I.NI 5O.A;I>

Molekularni "arkeri u filogeniji6

04 N('LEIN/'E 'I/ELINE6 - pri"arna struktura %slijed nukleotida&

- 8 nukleotida - relativno jednostavan align"ent i analiza

24 5)O,EINI6 - pri"arna struktura = 2? a"inokiselinski$ ostataka - znatno ko"pleksniji align"ent i analize

/ekvence proteina i .NA pru:aju na" najjednostavniji inajnedvos"isleniji olik podataka u filogeniji


12/17

GLA@NI )ALOI 5)ELA/'A / MO)FOLOB'I NAMOLE'(LA)NE


13/17

na!i = nukleotidne sekvence evoluiraju r:e od proteina kojekodirajuC

Nukleotidne sekvence su olje za rje*avanje nedavni$filogenetski$ doga#aja

5roteinske sekvence su olje za odre#ivanje srodnosti na vi*i"

siste"atski" nivoi"a %porodica ili rodova&

5ri"jeri sa!uvaniji$ "olekularni$ "arkera %uglavno" nuklearnigeni& = aktin+ tuulin+ )NA-poli"eraza 0+ $istonski geni4444

5ri"jeri varijailniji$ "olekularni$ "arkera %uglavno"

"ito$ondrijski geni& = r)NA %02/+ 03/&+ NA.+ ;OI+ ;OII+ citokro"44444

Izor prikladnog "olekularnog iljega = osnovni preduvjetuspje*nog istra:ivanja filogenetski$ i evolucijski$ odnosaCC


14/17

MA,E)IJALNI .O'AI E@OL(;IJE

04 5ALEON,OLOB'I .O'AI

24 (/5O)E.NOANA,OM/'I .O'AI

14 FIIOLOB'I .O'AI

84 GENE,ID'I .O'AI4 .O'AI E@OL(;IJE I GEOG)AF/'E

)A/5)O/,)ANJENO/,I I@I


15/17

FO/ILI - paleontolo*ki dokazi evolucije 5ALEON,OLOGIJA = znanost koja se avi prou!avanje"

fosila

Nastanak fosila %fosilizacija&6

04 O'AMENJI@ANJE = 5E,)IFI'A;IJA %za"jena organski$ tvari"ineralni"& i IN')(/,A;IJA %oka"enjivanje+ tj4"ineralizacija sa"o povr*inskog dijela&

24 5O(GLJENJI@ANJE ili 'A)


16/17

)A@OJNI NIO@I = uzastopni prijelazni olici koji su povezani

u povijesno" i geolo*ko" nizu )azvojni niz konja %evolucija konja u /jevernoj A"erici+

nekoliko desetaka "ilijuna godina& i pu:a ogrca

5)IJELANI O


17/17

(/5O)E.NOANA,OM/'I .O'AI E@OL(;IJE6

OMOLOGNI O)GANI = jednaki po podrijetlu i polo:aju+ arazli!iti po funkciji %ruka !ovjeka+ prednja noga nekogvodoze"ca+ g"aza ili sisavca&

ANALOGNI O)GANI = i"aju istu funkciju+ a razli!iti po gra#i ipostanku %krilo ptice i krilo kukca&

)(.IMEN,A)NI O)GANI = zakr:ljali organi pa u organiz"une"aju nikakvu funkciju ili je ona svedena na "ini"u"

A,A@IMI = svojstveni davni" preci"a %javljaju se povre"eno&Hnpr4 neoi!na dlakavost kod !ovjeka ili ostatak repa

Documents

MOLEKULARNA FILOGENIJA