Upload
brent
View
49
Download
0
Embed Size (px)
DESCRIPTION
ODDĚLENÍ BIOFYZIKY. Členové oddělení : 6 Pracovníků Studenti (Ph.D., Mgr., Bc.) Sídlo: Ke Karlovu 5: blok pracoven a laboratoří ve 2. patře laboratoře ve 2. suterénu Domácí stránka: http://alma.karlov.mff.cuni.cz/biofyzika /. S. cerevisiae. VÝZKUMNÉ AKTIVITY. K. lactis. - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
ODDĚLENÍ BIOFYZIKYODDĚLENÍ BIOFYZIKY
Členové oddělení:6 Pracovníků
Studenti (Ph.D., Mgr., Bc.)
Sídlo:Ke Karlovu 5:
- blok pracoven a laboratoří ve 2. patře
- laboratoře ve 2. suterénu
Domácí stránka:http://alma.karlov.mff.cuni.cz/biofyzika/
VÝZKUMNÉ AKTIVITY
Transportní procesy v kvasinkáchMetody studia buněčných stěn kvasinekTransmembránový transport léčiv v buněčných liniíchVýzkum strukturně funkčních vlastností proteinů
S. cerevisiae K. lactis Buněčné linie – KBV buňky
FLUORESCENČNÍ SONDY
Látky vykazující silnou fluorescenci po ozáření excitačním světlem vhodné vlnové délky.
Sondují své okolí = citlivě reagují na změny prostředí.Reakce jsou opticky DETEGOVATELNÉ = změny emisních parametrů.
MIKROBIOLOGICKÉ LABORATOŘE možnost kultivace buněčných kultur (kvasinky,
buněčné linie)provádění biologických testů přímo ve Fyzikálním ústavu UK
Laboratoř pro kultivaci kvasinek a buněčných linií – 2.
patro
Laboratoř pro kultivaci kvasinek – 2. suterén
SPEKTROSKOPICKÉ LABORATOŘE
Laboratoře pro měření stacionární fluorescence
Laboratoř pro měření časově rozlišené fluorescence – 2.
suterén
2. patro 2.
suterén
POUŽÍVANÉ METODY
Ve spolupráci s dalšími pracovišti AFM (Atomic Force Microscopy) (ÚMCH) Konfokální mikroskopie (ÚEM)
Fluorescenční spektroskopie
stacionární časově rozlišená
Modelování biologických procesů
Vývoj experimentálních a analytických metod
Fluorescenční mikroskopie
Studium transportních Studium transportních procesů v membránách procesů v membránách
kvasinekkvasinek Regulace membránového potenciálu a vnitrobuněčného pH kvasinek
Vliv chemických stresorů na membránový potenciál a aktivitu MDR (Multidrug resistance) pump kvasinek: identifikace jejich inhibitorů
Interakce léčiv s povrchovými strukturami kvasinkových buněk (BS, PM): stanovení mechanismu a rychlosti účinku
Schematické znázornění membrán a vnitřní struktury kvasinek (vlevo), a jejich elektronově mikroskopický snímek (vpravo)
Studium MDR pump v rakovinných buňkách
•Aktivita MDR pump (P-glykoprotein, MRP1, BCRP) v buněčných liniích a identifikace jejich inhibitorů
•Studium mechanismů vyvolávajících buněčnou smrt rakovinných buněk
•Transmembránový transport léčiv v buněčných liniích
Fluorescence DiSC3(3) v KBV buňkách obsahujících P-glykoprotein
Studium buněčné stěny kvasinek Studium buněčné stěny kvasinek pomocí pomocí
fluorescenční mikroskopiefluorescenční mikroskopie aa AFMAFM
Fluorescenční mikroskopie stěny kvasinek S. cerevisiae barvených calcofluorem.
Vlevo je neobvyklé seskupení starých buněk, které ztratily schopnost dokončit proces dělení.
Zobrazení stěny kvasinky S. cerevisiae pomocí Atomic Force Microscopy (AFM):
jizvy po pučení – náhled (vlevo) a detailní snímek jedné z nich (vpravo).
5m 1m
Studium strukturně funkčních Studium strukturně funkčních vlastností proteinů, biosenzorvlastností proteinů, biosenzoryy, vývoj , vývoj pokročilých fluorescenčních technikpokročilých fluorescenčních technik
Rotaènì korelaèní èas (ns)
1 10 100
Am
plitu
da
0.00
0.01
0.02
0.03
0.04
0.05
Volný proteinKomplex proteinu se 14-3-3
Distribuce rotaènì korelaèních èasù
Vliv vazby glukózy a vápníku na dynamiku a termální stabilitu transportéru D-Galaktózy/D-Glukózy z Escherichia coli
Sledování vlivu vazby proteinu 14-3-3 na fosforylovaný mutant proteinu FoxO-SC s tryptofanem v pozici 183: tryptofanová fluorescence, časově korelované čítání fotonů, analýza metodou maximální entropie
Odezva fluorescence pyruvát kinázy na přítomnost sodíku: časově rozlišené měření ve frekvenční doméně
• Prof. B.D. Lemire, University of Alberta, Edmonton, AB, CANADA
• Prof. D. Stuart, University of Alberta, Edmonton, AB, CANADA
• Prof. J.C. Lee, UTMB, Galveston, Texas, USA
Prof. M. Hoefer, Dr. J. Ludwig, RFW University, Bonn, GERMANY
Prof. M. Ameloot, LUC Diepenbeek, BELGIUM
Prof. S. d’Auria, Inst. of Protein Biochemistry, CNR, Naples, ITALY
Prof. S. Milewski, Dept. of Pharmaceutical Technology and Biochemistry, Gdansk, POLAND
Prof. P. Miškovský, Dept. of Biophysics, P.J.Safarik University, Kosice, Slovakia
Prof. Y. Gbelská, Dept. of Microbiology and Virology, Bratislava, Slovakia
Zahraniční spolupráceZahraniční spolupráce
PřF UK
Dr. T. Obšil - struktury a funkce regulačních bílkovin (AFX, 14-3-3, Fosducin) Prof. Z. Palková - kvasinkové kolonie, příprava mutantních kmenů
AV ČR
Dr. K. Sigler, MBÚ - studium mnohočetné lékové rezistence a stresu u kvasinek Ing. A. Pichová, MBÚ - struktura buněčné stěny u kvasinek, replikativní stárnutí
buněk Dr. H. Sychrová, FgÚ - úloha transportních systémů K+ v regulaci
- mutantní kmeny, heterologní exprese genů z jiných organismů
Dr. V. Obšilová, MBÚ - molekulární biologie, proteinová chemie Dr. J. Malínský, ÚEM - procesy v buněčném jádře, membrány Dr. P. Ježek, FgÚ – Biplane FPALM mikroskopie a mitochondrie Dr. J. Janata, Dr. A. Matušková, MBÚ – regulace mitochondriální peptidázy
(MPP)
ÚHKT
Dr. A. Holoubek - časově rozlišená fluorescence Hella cells značených GFP
FÚ UK
Prof. J. Štěpánek – v rámci projektu „Nanobiofotonika pro medicínu budoucnosti“ … a další
Domácí spolupráceDomácí spolupráce